Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397W1M7

Protein Details
Accession A0A397W1M7    Localization Confidence High Confidence Score 25.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
134-154TKEQGDSKKAKRKRVDSSDSEHydrophilic
161-180ATKNGSKKSIKKPINSQTKEHydrophilic
193-212DIPIFKRKGKTNGKKTTIIKHydrophilic
248-268EVKLEKKLPVKAKRKRNDSDSBasic
282-307KNVASVKKSDTQRKKKKEDSPDESMSHydrophilic
823-860KQLMEKEREKVRKKFEKDNEKLKEERQKPKSEKELRVLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
141-147KKAKRKR
226-263KLKSGKGKAAENKAKTGTGKEIEVKLEKKLPVKAKRKR
288-315KKSDTQRKKKKEDSPDESMSAKKRGKQK
446-459RKKNMSKEEKAKLK
786-803MKLKKSILALEPRLKKKR
829-855EREKVRKKFEKDNEKLKEERQKPKSEK
Subcellular Location(s) nucl 23, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011010  DNA_brk_join_enz  
IPR013034  DNA_topo_DNA_db_N_dom1  
IPR013030  DNA_topo_DNA_db_N_dom2  
IPR001631  TopoI  
IPR025834  TopoI_C_dom  
IPR014711  TopoI_cat_a-hlx-sub_euk  
IPR014727  TopoI_cat_a/b-sub_euk  
IPR013500  TopoI_cat_euk  
IPR008336  TopoI_DNA-bd_euk  
IPR036202  TopoI_DNA-bd_euk_N_sf  
IPR013499  TopoI_euk  
Gene Ontology GO:0005694  C:chromosome  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003917  F:DNA topoisomerase type I (single strand cut, ATP-independent) activity  
GO:0006265  P:DNA topological change  
Pfam View protein in Pfam  
PF14370  Topo_C_assoc  
PF01028  Topoisom_I  
PF02919  Topoisom_I_N  
CDD cd00659  Topo_IB_C  
cd00660  Topoisomer_IB_N  
Amino Acid Sequences MTGKKASTLATNGKIPAPKSGNKSKVKEEPDVSMEDAESTGSESDVPLAHRRSTSNGRKKGTVNGQNTAVKKEEKFDSEDPLKVPGRRKIRVIVSESENSSGSDSDVPLAKLKAKGPKSEDNTLNKGKSSSSLTKEQGDSKKAKRKRVDSSDSEYDDKNTATKNGSKKSIKKPINSQTKEDIEMKVSVSDEEDIPIFKRKGKTNGKKTTIIKEESEDSDSDVPLAKLKSGKGKAAENKAKTGTGKEIEVKLEKKLPVKAKRKRNDSDSEVDNKKQITKTASKNVASVKKSDTQRKKKKEDSPDESMSAKKRGKQKVKEEDSDNEEDEEFKWWNQQNNNNDGTDKWTTLEHNGVYFPPPYVPHKVRMKYDGRPITLEPEAEEVASFYAAMLGTDYVTNETFNRNFFKDWVKIMKKSKNNPPIKDFERDFEKCDFTPIYEYFEQEKERKKNMSKEEKAKLKEEKTKLEEKYGYCLLDGRKEKVGNFRIEPPGLFRGRGAHPKTGSLKLRVQPEQVTINIGKGAKIPSPPEGHKWAGVIHDPTVTWLATWKENVNDNIKYVFLAANSSLKGLSDMKKFDKARELKQHIGKIRKDYQANLRHKNTATRQMATAMYLIDRLALRAGNEKDKEEEADTVGCCSLRPEHVNLIPPNTVTFDFLGKDSIRYINTVEVEDQVFRNLGIFMKGKDEPDDLIFDRINTQELNKHLSSYMKGLTAKVFRTFNASYTFQKQLKELTKEDSSIAEKVFAYNQANRQVAILCNHQRSVSKAHGNQMSKIEDKIKALKYQRMKLKKSILALEPRLKKKRSDLLEEESDLDDKWIIEYEKQLMEKEREKVRKKFEKDNEKLKEERQKPKSEKELRVLLQEIDQKEKELAKERISGRVEPKKGLTVEKADERIQNLTAKIKETKLLKDDKESNKTTALGTSKINYIDPRISAAWCLKYKVPYEKIFNKSLRDKFKWAMDVVDADWEF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.4
3 0.43
4 0.41
5 0.43
6 0.47
7 0.56
8 0.61
9 0.67
10 0.71
11 0.71
12 0.74
13 0.73
14 0.74
15 0.66
16 0.62
17 0.56
18 0.54
19 0.47
20 0.39
21 0.32
22 0.25
23 0.21
24 0.15
25 0.12
26 0.1
27 0.09
28 0.08
29 0.08
30 0.07
31 0.09
32 0.11
33 0.14
34 0.19
35 0.22
36 0.25
37 0.28
38 0.3
39 0.36
40 0.44
41 0.53
42 0.56
43 0.62
44 0.64
45 0.67
46 0.68
47 0.7
48 0.7
49 0.69
50 0.64
51 0.6
52 0.62
53 0.62
54 0.61
55 0.55
56 0.48
57 0.43
58 0.38
59 0.39
60 0.38
61 0.36
62 0.41
63 0.39
64 0.44
65 0.44
66 0.46
67 0.41
68 0.42
69 0.44
70 0.42
71 0.47
72 0.46
73 0.52
74 0.53
75 0.57
76 0.58
77 0.62
78 0.65
79 0.63
80 0.61
81 0.57
82 0.58
83 0.55
84 0.49
85 0.4
86 0.33
87 0.29
88 0.22
89 0.18
90 0.14
91 0.13
92 0.14
93 0.16
94 0.16
95 0.18
96 0.19
97 0.22
98 0.24
99 0.29
100 0.36
101 0.38
102 0.44
103 0.48
104 0.57
105 0.59
106 0.65
107 0.67
108 0.65
109 0.69
110 0.68
111 0.63
112 0.54
113 0.49
114 0.4
115 0.36
116 0.37
117 0.37
118 0.35
119 0.41
120 0.43
121 0.47
122 0.49
123 0.54
124 0.53
125 0.52
126 0.54
127 0.56
128 0.63
129 0.65
130 0.72
131 0.73
132 0.75
133 0.79
134 0.81
135 0.81
136 0.78
137 0.8
138 0.78
139 0.73
140 0.67
141 0.56
142 0.48
143 0.41
144 0.34
145 0.28
146 0.21
147 0.2
148 0.22
149 0.27
150 0.34
151 0.38
152 0.47
153 0.53
154 0.61
155 0.68
156 0.74
157 0.75
158 0.75
159 0.79
160 0.8
161 0.82
162 0.77
163 0.72
164 0.7
165 0.66
166 0.62
167 0.55
168 0.46
169 0.37
170 0.34
171 0.3
172 0.23
173 0.2
174 0.16
175 0.15
176 0.14
177 0.12
178 0.11
179 0.11
180 0.1
181 0.12
182 0.19
183 0.18
184 0.22
185 0.28
186 0.34
187 0.44
188 0.55
189 0.64
190 0.68
191 0.77
192 0.78
193 0.8
194 0.78
195 0.77
196 0.73
197 0.66
198 0.57
199 0.49
200 0.47
201 0.41
202 0.39
203 0.29
204 0.25
205 0.23
206 0.21
207 0.18
208 0.16
209 0.14
210 0.15
211 0.15
212 0.14
213 0.15
214 0.18
215 0.27
216 0.28
217 0.33
218 0.33
219 0.41
220 0.46
221 0.54
222 0.6
223 0.53
224 0.55
225 0.52
226 0.51
227 0.44
228 0.4
229 0.35
230 0.29
231 0.29
232 0.29
233 0.29
234 0.3
235 0.34
236 0.32
237 0.29
238 0.33
239 0.34
240 0.34
241 0.39
242 0.45
243 0.5
244 0.6
245 0.65
246 0.7
247 0.76
248 0.82
249 0.81
250 0.79
251 0.77
252 0.73
253 0.7
254 0.65
255 0.64
256 0.58
257 0.52
258 0.47
259 0.39
260 0.38
261 0.33
262 0.32
263 0.3
264 0.35
265 0.41
266 0.48
267 0.54
268 0.5
269 0.52
270 0.56
271 0.57
272 0.5
273 0.45
274 0.4
275 0.4
276 0.46
277 0.53
278 0.57
279 0.6
280 0.7
281 0.77
282 0.82
283 0.84
284 0.87
285 0.88
286 0.87
287 0.84
288 0.81
289 0.75
290 0.67
291 0.59
292 0.54
293 0.46
294 0.43
295 0.38
296 0.35
297 0.4
298 0.48
299 0.57
300 0.63
301 0.7
302 0.73
303 0.78
304 0.79
305 0.74
306 0.69
307 0.65
308 0.58
309 0.48
310 0.38
311 0.31
312 0.25
313 0.21
314 0.19
315 0.13
316 0.11
317 0.17
318 0.19
319 0.24
320 0.3
321 0.37
322 0.4
323 0.45
324 0.48
325 0.41
326 0.39
327 0.33
328 0.33
329 0.27
330 0.21
331 0.16
332 0.15
333 0.16
334 0.17
335 0.2
336 0.15
337 0.14
338 0.14
339 0.14
340 0.14
341 0.14
342 0.12
343 0.11
344 0.12
345 0.15
346 0.22
347 0.24
348 0.31
349 0.39
350 0.43
351 0.44
352 0.5
353 0.51
354 0.49
355 0.56
356 0.54
357 0.47
358 0.45
359 0.43
360 0.39
361 0.35
362 0.3
363 0.2
364 0.17
365 0.15
366 0.13
367 0.12
368 0.08
369 0.07
370 0.07
371 0.06
372 0.03
373 0.04
374 0.04
375 0.04
376 0.04
377 0.04
378 0.04
379 0.05
380 0.05
381 0.05
382 0.06
383 0.06
384 0.07
385 0.1
386 0.1
387 0.12
388 0.15
389 0.16
390 0.16
391 0.18
392 0.23
393 0.22
394 0.25
395 0.33
396 0.34
397 0.39
398 0.46
399 0.52
400 0.55
401 0.6
402 0.67
403 0.67
404 0.71
405 0.69
406 0.66
407 0.66
408 0.61
409 0.6
410 0.51
411 0.44
412 0.44
413 0.4
414 0.38
415 0.33
416 0.33
417 0.26
418 0.28
419 0.25
420 0.18
421 0.21
422 0.18
423 0.21
424 0.18
425 0.2
426 0.19
427 0.22
428 0.24
429 0.24
430 0.32
431 0.31
432 0.35
433 0.4
434 0.43
435 0.49
436 0.56
437 0.64
438 0.62
439 0.66
440 0.7
441 0.71
442 0.68
443 0.65
444 0.62
445 0.57
446 0.58
447 0.54
448 0.53
449 0.5
450 0.55
451 0.51
452 0.5
453 0.47
454 0.39
455 0.4
456 0.34
457 0.3
458 0.22
459 0.24
460 0.19
461 0.23
462 0.24
463 0.22
464 0.24
465 0.24
466 0.26
467 0.32
468 0.36
469 0.32
470 0.32
471 0.34
472 0.33
473 0.32
474 0.31
475 0.25
476 0.25
477 0.23
478 0.21
479 0.17
480 0.18
481 0.21
482 0.29
483 0.29
484 0.28
485 0.28
486 0.32
487 0.35
488 0.37
489 0.37
490 0.33
491 0.36
492 0.35
493 0.41
494 0.38
495 0.37
496 0.32
497 0.31
498 0.29
499 0.23
500 0.22
501 0.16
502 0.15
503 0.15
504 0.14
505 0.12
506 0.11
507 0.13
508 0.12
509 0.14
510 0.15
511 0.17
512 0.21
513 0.22
514 0.24
515 0.28
516 0.27
517 0.26
518 0.25
519 0.22
520 0.19
521 0.2
522 0.17
523 0.12
524 0.12
525 0.11
526 0.12
527 0.12
528 0.1
529 0.08
530 0.09
531 0.1
532 0.11
533 0.12
534 0.12
535 0.13
536 0.17
537 0.2
538 0.22
539 0.21
540 0.21
541 0.2
542 0.19
543 0.17
544 0.14
545 0.12
546 0.07
547 0.08
548 0.08
549 0.09
550 0.09
551 0.09
552 0.08
553 0.08
554 0.09
555 0.11
556 0.15
557 0.17
558 0.2
559 0.22
560 0.31
561 0.31
562 0.32
563 0.39
564 0.39
565 0.44
566 0.51
567 0.55
568 0.54
569 0.6
570 0.64
571 0.61
572 0.64
573 0.58
574 0.55
575 0.56
576 0.55
577 0.51
578 0.49
579 0.52
580 0.54
581 0.59
582 0.6
583 0.55
584 0.54
585 0.53
586 0.57
587 0.52
588 0.52
589 0.47
590 0.41
591 0.38
592 0.36
593 0.35
594 0.28
595 0.24
596 0.14
597 0.1
598 0.09
599 0.08
600 0.08
601 0.07
602 0.07
603 0.07
604 0.07
605 0.08
606 0.14
607 0.16
608 0.22
609 0.23
610 0.24
611 0.25
612 0.25
613 0.27
614 0.21
615 0.2
616 0.14
617 0.15
618 0.14
619 0.13
620 0.12
621 0.11
622 0.09
623 0.1
624 0.1
625 0.12
626 0.15
627 0.17
628 0.21
629 0.24
630 0.31
631 0.31
632 0.32
633 0.29
634 0.27
635 0.24
636 0.22
637 0.19
638 0.14
639 0.14
640 0.12
641 0.12
642 0.12
643 0.14
644 0.12
645 0.13
646 0.13
647 0.15
648 0.14
649 0.14
650 0.15
651 0.16
652 0.16
653 0.17
654 0.16
655 0.14
656 0.15
657 0.15
658 0.14
659 0.11
660 0.1
661 0.09
662 0.09
663 0.08
664 0.08
665 0.1
666 0.11
667 0.11
668 0.15
669 0.17
670 0.17
671 0.19
672 0.19
673 0.17
674 0.17
675 0.21
676 0.17
677 0.19
678 0.18
679 0.16
680 0.17
681 0.16
682 0.16
683 0.12
684 0.13
685 0.14
686 0.16
687 0.22
688 0.2
689 0.21
690 0.21
691 0.23
692 0.23
693 0.22
694 0.22
695 0.19
696 0.2
697 0.2
698 0.24
699 0.25
700 0.26
701 0.28
702 0.27
703 0.23
704 0.29
705 0.29
706 0.27
707 0.28
708 0.29
709 0.28
710 0.32
711 0.39
712 0.35
713 0.35
714 0.34
715 0.37
716 0.41
717 0.43
718 0.41
719 0.39
720 0.39
721 0.39
722 0.38
723 0.33
724 0.28
725 0.24
726 0.22
727 0.19
728 0.16
729 0.16
730 0.17
731 0.18
732 0.19
733 0.22
734 0.27
735 0.32
736 0.33
737 0.32
738 0.31
739 0.29
740 0.28
741 0.27
742 0.3
743 0.29
744 0.31
745 0.32
746 0.32
747 0.32
748 0.33
749 0.36
750 0.36
751 0.38
752 0.38
753 0.45
754 0.51
755 0.51
756 0.51
757 0.5
758 0.47
759 0.39
760 0.39
761 0.36
762 0.31
763 0.33
764 0.37
765 0.36
766 0.39
767 0.43
768 0.48
769 0.52
770 0.58
771 0.64
772 0.66
773 0.68
774 0.68
775 0.72
776 0.69
777 0.66
778 0.63
779 0.6
780 0.59
781 0.61
782 0.61
783 0.61
784 0.66
785 0.69
786 0.65
787 0.63
788 0.63
789 0.65
790 0.63
791 0.63
792 0.6
793 0.59
794 0.62
795 0.6
796 0.53
797 0.45
798 0.39
799 0.29
800 0.23
801 0.16
802 0.11
803 0.1
804 0.11
805 0.11
806 0.12
807 0.15
808 0.18
809 0.22
810 0.23
811 0.25
812 0.27
813 0.33
814 0.37
815 0.42
816 0.48
817 0.53
818 0.61
819 0.67
820 0.72
821 0.76
822 0.77
823 0.8
824 0.81
825 0.83
826 0.83
827 0.85
828 0.83
829 0.78
830 0.75
831 0.72
832 0.72
833 0.7
834 0.72
835 0.7
836 0.73
837 0.74
838 0.8
839 0.83
840 0.82
841 0.81
842 0.78
843 0.79
844 0.7
845 0.68
846 0.6
847 0.5
848 0.46
849 0.44
850 0.39
851 0.36
852 0.34
853 0.31
854 0.32
855 0.34
856 0.33
857 0.36
858 0.39
859 0.36
860 0.44
861 0.44
862 0.5
863 0.5
864 0.51
865 0.52
866 0.57
867 0.56
868 0.52
869 0.53
870 0.51
871 0.5
872 0.49
873 0.45
874 0.42
875 0.45
876 0.48
877 0.48
878 0.45
879 0.46
880 0.43
881 0.4
882 0.36
883 0.34
884 0.3
885 0.33
886 0.32
887 0.34
888 0.35
889 0.35
890 0.38
891 0.38
892 0.43
893 0.44
894 0.5
895 0.49
896 0.54
897 0.61
898 0.65
899 0.7
900 0.66
901 0.62
902 0.56
903 0.54
904 0.46
905 0.43
906 0.36
907 0.3
908 0.29
909 0.29
910 0.29
911 0.29
912 0.31
913 0.27
914 0.29
915 0.3
916 0.28
917 0.3
918 0.28
919 0.27
920 0.29
921 0.32
922 0.35
923 0.34
924 0.37
925 0.36
926 0.4
927 0.46
928 0.52
929 0.54
930 0.54
931 0.61
932 0.67
933 0.68
934 0.71
935 0.69
936 0.68
937 0.7
938 0.71
939 0.72
940 0.69
941 0.7
942 0.66
943 0.7
944 0.67
945 0.58
946 0.52
947 0.45
948 0.41
949 0.35