Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397VUD8

Protein Details
Accession A0A397VUD8    Localization Confidence Low Confidence Score 9.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-26MMMTQPRKQSRKRVDTQKKIGPMQRGHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 11, mito 7, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
Amino Acid Sequences MMMTQPRKQSRKRVDTQKKIGPMQRGQQKIKLLMNKPRGVLPPLPLPFPPQVQLQKMVAKLASKPKLARFPNAFIMYRNEYVQFLKVKGLHLSMTELSPMIAAAWRQEPEYVKDAYTRLSSDAEKLYVRMAANVQPEIKYKFPAQRHPTFNDYTNEETNTTTTFIRKENERSNNNDNVIKFGNNFATEYTQLLQSSSIPDLKGYPRNVNNESNSRTSTFFERSSSSSTSSTNYDGRDLSVINATMNMNGQNFDQSFMKQENCFIQETPYIPYTQIPNISPTSSRSSPTDSLLCGEIRFPSSEELIFGSLPSPALTTPCSEISFPFSPPCINCSRHYYDQNFTASFENESSPVQSSDFYPLSPVSPTLTFDESPMQSPTFNDFDITTDLYYVIDSALSFDPYGIPTSRSV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.88
2 0.91
3 0.92
4 0.9
5 0.87
6 0.84
7 0.8
8 0.78
9 0.74
10 0.72
11 0.71
12 0.72
13 0.68
14 0.66
15 0.67
16 0.64
17 0.65
18 0.65
19 0.64
20 0.64
21 0.69
22 0.68
23 0.63
24 0.61
25 0.58
26 0.54
27 0.5
28 0.44
29 0.44
30 0.42
31 0.42
32 0.37
33 0.38
34 0.36
35 0.34
36 0.32
37 0.3
38 0.35
39 0.36
40 0.4
41 0.39
42 0.41
43 0.39
44 0.39
45 0.33
46 0.29
47 0.32
48 0.37
49 0.39
50 0.39
51 0.43
52 0.47
53 0.55
54 0.57
55 0.59
56 0.55
57 0.55
58 0.58
59 0.59
60 0.53
61 0.45
62 0.48
63 0.44
64 0.39
65 0.36
66 0.28
67 0.25
68 0.25
69 0.28
70 0.24
71 0.2
72 0.23
73 0.24
74 0.25
75 0.25
76 0.25
77 0.21
78 0.19
79 0.22
80 0.18
81 0.17
82 0.15
83 0.13
84 0.11
85 0.1
86 0.09
87 0.06
88 0.06
89 0.06
90 0.08
91 0.11
92 0.11
93 0.12
94 0.15
95 0.17
96 0.2
97 0.23
98 0.22
99 0.2
100 0.22
101 0.22
102 0.21
103 0.21
104 0.17
105 0.16
106 0.17
107 0.17
108 0.18
109 0.19
110 0.19
111 0.17
112 0.17
113 0.16
114 0.16
115 0.16
116 0.14
117 0.14
118 0.16
119 0.18
120 0.2
121 0.2
122 0.18
123 0.21
124 0.22
125 0.22
126 0.2
127 0.22
128 0.28
129 0.32
130 0.41
131 0.46
132 0.51
133 0.56
134 0.57
135 0.58
136 0.53
137 0.52
138 0.45
139 0.41
140 0.37
141 0.33
142 0.3
143 0.26
144 0.23
145 0.2
146 0.18
147 0.16
148 0.12
149 0.12
150 0.13
151 0.14
152 0.16
153 0.2
154 0.25
155 0.33
156 0.41
157 0.44
158 0.48
159 0.52
160 0.54
161 0.52
162 0.49
163 0.4
164 0.34
165 0.32
166 0.26
167 0.2
168 0.17
169 0.16
170 0.13
171 0.14
172 0.11
173 0.12
174 0.12
175 0.12
176 0.11
177 0.1
178 0.1
179 0.1
180 0.09
181 0.08
182 0.09
183 0.09
184 0.1
185 0.09
186 0.09
187 0.11
188 0.14
189 0.19
190 0.2
191 0.25
192 0.27
193 0.33
194 0.37
195 0.39
196 0.39
197 0.39
198 0.4
199 0.36
200 0.33
201 0.3
202 0.27
203 0.25
204 0.25
205 0.23
206 0.2
207 0.19
208 0.2
209 0.2
210 0.23
211 0.23
212 0.22
213 0.2
214 0.2
215 0.2
216 0.19
217 0.2
218 0.18
219 0.17
220 0.16
221 0.15
222 0.15
223 0.14
224 0.13
225 0.11
226 0.1
227 0.1
228 0.08
229 0.09
230 0.09
231 0.08
232 0.09
233 0.09
234 0.08
235 0.08
236 0.08
237 0.1
238 0.1
239 0.11
240 0.12
241 0.11
242 0.13
243 0.15
244 0.17
245 0.15
246 0.17
247 0.19
248 0.2
249 0.21
250 0.19
251 0.19
252 0.19
253 0.2
254 0.21
255 0.18
256 0.16
257 0.15
258 0.17
259 0.17
260 0.17
261 0.19
262 0.17
263 0.19
264 0.2
265 0.21
266 0.2
267 0.21
268 0.26
269 0.24
270 0.25
271 0.24
272 0.29
273 0.29
274 0.32
275 0.3
276 0.23
277 0.23
278 0.23
279 0.21
280 0.16
281 0.15
282 0.13
283 0.13
284 0.13
285 0.13
286 0.13
287 0.13
288 0.13
289 0.13
290 0.13
291 0.12
292 0.11
293 0.1
294 0.09
295 0.08
296 0.08
297 0.07
298 0.07
299 0.06
300 0.08
301 0.09
302 0.1
303 0.13
304 0.15
305 0.16
306 0.16
307 0.16
308 0.22
309 0.23
310 0.23
311 0.22
312 0.2
313 0.22
314 0.23
315 0.26
316 0.26
317 0.27
318 0.29
319 0.36
320 0.42
321 0.46
322 0.54
323 0.54
324 0.52
325 0.55
326 0.55
327 0.48
328 0.42
329 0.37
330 0.3
331 0.27
332 0.24
333 0.19
334 0.16
335 0.17
336 0.17
337 0.16
338 0.16
339 0.15
340 0.14
341 0.15
342 0.2
343 0.2
344 0.18
345 0.18
346 0.18
347 0.18
348 0.19
349 0.18
350 0.15
351 0.15
352 0.18
353 0.19
354 0.22
355 0.21
356 0.22
357 0.28
358 0.25
359 0.27
360 0.27
361 0.24
362 0.21
363 0.23
364 0.26
365 0.23
366 0.21
367 0.2
368 0.18
369 0.2
370 0.22
371 0.23
372 0.18
373 0.15
374 0.15
375 0.14
376 0.13
377 0.11
378 0.08
379 0.06
380 0.06
381 0.09
382 0.1
383 0.12
384 0.12
385 0.12
386 0.13
387 0.14
388 0.17
389 0.15