Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397VVL8

Protein Details
Accession A0A397VVL8    Localization Confidence High Confidence Score 17.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
212-263ARSESHSRSRSRSRSRRRSRSRHRSRSQRRSRSRRRSRSKHRGYDRYEPSYRBasic
268-295HSSRERDNSSSRRHSHRRKRSRSTSHSQBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
211-255RARSESHSRSRSRSRSRRRSRSRHRSRSQRRSRSRRRSRSKHRGY
270-289SRERDNSSSRRHSHRRKRSR
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005037  PRP38  
Gene Ontology GO:0071011  C:precatalytic spliceosome  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF03371  PRP38  
Amino Acid Sequences MANRTVSDAIAIHGTNPQYLIEKIIRTRIYESLYWKESCFGLTAETLIDRAVVLTSFGGQYGNQKPTEFLCLTLKLLQLQPGKEIIIEFIKNEEYKYLRALGAFYLRLVGTSLEIYQYLEPLLNDYRKLRKRTIDGEFTIVHMDEFIDELLREDRVCDTIMPRITKRYVLEENGELQPRESALEDLLDEEDDDDDTNSDRFIPSDNDKRYRARSESHSRSRSRSRSRRRSRSRHRSRSQRRSRSRRRSRSKHRGYDRYEPSYRNNREHSSRERDNSSSRRHSHRRKRSRSTSHSQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.15
3 0.15
4 0.15
5 0.15
6 0.15
7 0.2
8 0.2
9 0.23
10 0.25
11 0.33
12 0.34
13 0.33
14 0.37
15 0.36
16 0.37
17 0.36
18 0.4
19 0.39
20 0.42
21 0.4
22 0.37
23 0.34
24 0.3
25 0.27
26 0.23
27 0.16
28 0.13
29 0.12
30 0.12
31 0.11
32 0.11
33 0.1
34 0.08
35 0.08
36 0.06
37 0.06
38 0.06
39 0.05
40 0.05
41 0.05
42 0.06
43 0.06
44 0.07
45 0.07
46 0.07
47 0.14
48 0.19
49 0.23
50 0.23
51 0.24
52 0.25
53 0.26
54 0.32
55 0.26
56 0.22
57 0.22
58 0.22
59 0.24
60 0.26
61 0.25
62 0.21
63 0.21
64 0.26
65 0.25
66 0.24
67 0.24
68 0.22
69 0.22
70 0.2
71 0.19
72 0.14
73 0.13
74 0.13
75 0.12
76 0.12
77 0.14
78 0.14
79 0.14
80 0.16
81 0.14
82 0.15
83 0.16
84 0.17
85 0.15
86 0.15
87 0.16
88 0.14
89 0.15
90 0.14
91 0.12
92 0.11
93 0.11
94 0.1
95 0.1
96 0.09
97 0.06
98 0.07
99 0.07
100 0.06
101 0.06
102 0.07
103 0.07
104 0.07
105 0.06
106 0.06
107 0.06
108 0.08
109 0.11
110 0.11
111 0.12
112 0.15
113 0.25
114 0.31
115 0.35
116 0.37
117 0.4
118 0.45
119 0.5
120 0.53
121 0.5
122 0.44
123 0.43
124 0.39
125 0.34
126 0.29
127 0.22
128 0.15
129 0.09
130 0.08
131 0.04
132 0.04
133 0.04
134 0.03
135 0.03
136 0.04
137 0.05
138 0.05
139 0.05
140 0.05
141 0.06
142 0.07
143 0.07
144 0.07
145 0.08
146 0.12
147 0.16
148 0.18
149 0.18
150 0.21
151 0.22
152 0.24
153 0.24
154 0.26
155 0.25
156 0.25
157 0.27
158 0.24
159 0.26
160 0.26
161 0.26
162 0.2
163 0.17
164 0.15
165 0.13
166 0.13
167 0.1
168 0.08
169 0.06
170 0.07
171 0.07
172 0.07
173 0.07
174 0.06
175 0.06
176 0.05
177 0.05
178 0.05
179 0.05
180 0.05
181 0.05
182 0.06
183 0.06
184 0.06
185 0.06
186 0.06
187 0.06
188 0.08
189 0.12
190 0.18
191 0.27
192 0.33
193 0.38
194 0.42
195 0.46
196 0.5
197 0.52
198 0.49
199 0.45
200 0.48
201 0.54
202 0.61
203 0.66
204 0.69
205 0.65
206 0.69
207 0.74
208 0.75
209 0.75
210 0.76
211 0.77
212 0.8
213 0.88
214 0.92
215 0.94
216 0.95
217 0.95
218 0.96
219 0.96
220 0.96
221 0.95
222 0.95
223 0.95
224 0.95
225 0.95
226 0.95
227 0.94
228 0.95
229 0.96
230 0.96
231 0.96
232 0.96
233 0.96
234 0.96
235 0.96
236 0.96
237 0.96
238 0.95
239 0.94
240 0.93
241 0.89
242 0.89
243 0.86
244 0.83
245 0.77
246 0.7
247 0.68
248 0.69
249 0.68
250 0.65
251 0.63
252 0.62
253 0.64
254 0.68
255 0.68
256 0.67
257 0.69
258 0.68
259 0.67
260 0.64
261 0.67
262 0.67
263 0.68
264 0.68
265 0.66
266 0.7
267 0.75
268 0.82
269 0.84
270 0.87
271 0.88
272 0.89
273 0.94
274 0.95
275 0.95