Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397VH55

Protein Details
Accession A0A397VH55    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
3-49KRTANARKTNPKTINGRNKTTPKSKQRINKKNKEKKRREISMMYYEQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
9-40RKTNPKTINGRNKTTPKSKQRINKKNKEKKRR
Subcellular Location(s) nucl 17, mito_nucl 12.833, cyto_nucl 10.333, mito 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011335  Restrct_endonuc-II-like  
IPR007560  Restrct_endonuc_IV_Mrr  
IPR011856  tRNA_endonuc-like_dom_sf  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0004519  F:endonuclease activity  
GO:0009307  P:DNA restriction-modification system  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF04471  Mrr_cat  
Amino Acid Sequences MVKRTANARKTNPKTINGRNKTTPKSKQRINKKNKEKKRREISMMYYEQMDFNQSIEVPVLGSLISPVKLNWNWTYRSSGPVYKSKSPVYESRSPVYKSSRADSWSRARIDDLGLKSKQSTNYKDGHNFENRIVKLLSRNGIISNSFSCRQGDNGIDIIATLDQQQILIECKSHKNPIGIDIIKKFQSSISRFEKGTLSIIVYNSKKLKQRFLTGPAEDWWKAECPQIKIVNEKMIVDCIKNSLASKSPKIKSHDTVSYNNISDMKIDRVSREHLMDKPTIFCIERETVWCINDLNNYNYNYETINNEQVQVHIID
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.78
2 0.8
3 0.82
4 0.78
5 0.78
6 0.77
7 0.79
8 0.8
9 0.8
10 0.8
11 0.8
12 0.82
13 0.82
14 0.83
15 0.85
16 0.88
17 0.89
18 0.89
19 0.9
20 0.91
21 0.94
22 0.95
23 0.95
24 0.95
25 0.94
26 0.93
27 0.89
28 0.87
29 0.83
30 0.82
31 0.74
32 0.64
33 0.55
34 0.46
35 0.38
36 0.3
37 0.25
38 0.15
39 0.12
40 0.12
41 0.1
42 0.1
43 0.1
44 0.1
45 0.07
46 0.07
47 0.07
48 0.05
49 0.05
50 0.06
51 0.07
52 0.07
53 0.07
54 0.07
55 0.14
56 0.15
57 0.2
58 0.24
59 0.27
60 0.3
61 0.31
62 0.38
63 0.32
64 0.36
65 0.35
66 0.35
67 0.35
68 0.4
69 0.44
70 0.44
71 0.47
72 0.45
73 0.45
74 0.44
75 0.46
76 0.46
77 0.48
78 0.46
79 0.46
80 0.49
81 0.47
82 0.47
83 0.47
84 0.44
85 0.38
86 0.38
87 0.37
88 0.35
89 0.36
90 0.38
91 0.4
92 0.41
93 0.4
94 0.37
95 0.34
96 0.32
97 0.32
98 0.31
99 0.26
100 0.25
101 0.24
102 0.24
103 0.25
104 0.27
105 0.31
106 0.32
107 0.34
108 0.33
109 0.38
110 0.42
111 0.46
112 0.46
113 0.45
114 0.44
115 0.4
116 0.38
117 0.4
118 0.36
119 0.32
120 0.3
121 0.25
122 0.23
123 0.25
124 0.24
125 0.17
126 0.18
127 0.16
128 0.17
129 0.16
130 0.14
131 0.12
132 0.14
133 0.14
134 0.14
135 0.14
136 0.14
137 0.14
138 0.15
139 0.14
140 0.12
141 0.12
142 0.11
143 0.1
144 0.09
145 0.09
146 0.06
147 0.05
148 0.04
149 0.04
150 0.04
151 0.04
152 0.04
153 0.04
154 0.06
155 0.06
156 0.07
157 0.09
158 0.12
159 0.15
160 0.18
161 0.2
162 0.21
163 0.21
164 0.24
165 0.29
166 0.27
167 0.28
168 0.27
169 0.27
170 0.25
171 0.25
172 0.21
173 0.16
174 0.23
175 0.23
176 0.28
177 0.32
178 0.34
179 0.34
180 0.36
181 0.34
182 0.28
183 0.27
184 0.2
185 0.15
186 0.14
187 0.15
188 0.19
189 0.18
190 0.21
191 0.22
192 0.26
193 0.31
194 0.32
195 0.4
196 0.39
197 0.46
198 0.48
199 0.52
200 0.55
201 0.5
202 0.49
203 0.42
204 0.42
205 0.35
206 0.3
207 0.24
208 0.19
209 0.19
210 0.21
211 0.24
212 0.23
213 0.3
214 0.35
215 0.35
216 0.38
217 0.4
218 0.41
219 0.37
220 0.35
221 0.28
222 0.27
223 0.26
224 0.22
225 0.19
226 0.15
227 0.15
228 0.16
229 0.16
230 0.15
231 0.2
232 0.25
233 0.32
234 0.39
235 0.43
236 0.49
237 0.54
238 0.58
239 0.57
240 0.59
241 0.6
242 0.56
243 0.55
244 0.53
245 0.52
246 0.46
247 0.42
248 0.36
249 0.28
250 0.25
251 0.23
252 0.23
253 0.22
254 0.23
255 0.23
256 0.25
257 0.3
258 0.31
259 0.33
260 0.33
261 0.33
262 0.36
263 0.37
264 0.36
265 0.33
266 0.32
267 0.31
268 0.28
269 0.24
270 0.25
271 0.25
272 0.25
273 0.26
274 0.29
275 0.28
276 0.28
277 0.29
278 0.24
279 0.23
280 0.29
281 0.3
282 0.29
283 0.32
284 0.33
285 0.33
286 0.33
287 0.31
288 0.25
289 0.23
290 0.24
291 0.23
292 0.29
293 0.28
294 0.3
295 0.29
296 0.28