Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397VR60

Protein Details
Accession A0A397VR60    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-30MKSPIKERKLKSRNSRKQKKPPNRFILYRTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
5-22IKERKLKSRNSRKQKKPP
Subcellular Location(s) nucl 15, mito_nucl 11.999, cyto_nucl 11.333, mito 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MKSPIKERKLKSRNSRKQKKPPNRFILYRTYHLKNNPRFNNPDSPMDMRTLSRLISSQWANEPQYVKSYWDNVAAREKLKEYINGEYHNKIDMSISVSTINEFRSTTFINSTINTLTNVSDHYHSRSLENCTNSAISNYSDDPFLTTEHSDGFRFLGENSISPDSSLGALPSINDVYLPPLPPLFEFGRY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.88
2 0.93
3 0.92
4 0.94
5 0.95
6 0.95
7 0.95
8 0.95
9 0.94
10 0.91
11 0.85
12 0.79
13 0.78
14 0.72
15 0.67
16 0.63
17 0.56
18 0.53
19 0.57
20 0.62
21 0.6
22 0.65
23 0.66
24 0.66
25 0.68
26 0.68
27 0.69
28 0.63
29 0.59
30 0.53
31 0.49
32 0.43
33 0.4
34 0.36
35 0.26
36 0.25
37 0.21
38 0.16
39 0.14
40 0.13
41 0.12
42 0.16
43 0.17
44 0.16
45 0.19
46 0.23
47 0.23
48 0.26
49 0.26
50 0.21
51 0.24
52 0.23
53 0.22
54 0.19
55 0.21
56 0.19
57 0.24
58 0.24
59 0.23
60 0.29
61 0.28
62 0.27
63 0.25
64 0.25
65 0.21
66 0.22
67 0.23
68 0.19
69 0.23
70 0.25
71 0.27
72 0.28
73 0.26
74 0.25
75 0.23
76 0.21
77 0.15
78 0.12
79 0.1
80 0.11
81 0.09
82 0.1
83 0.09
84 0.09
85 0.09
86 0.1
87 0.1
88 0.07
89 0.07
90 0.07
91 0.09
92 0.1
93 0.11
94 0.12
95 0.12
96 0.12
97 0.12
98 0.13
99 0.12
100 0.11
101 0.11
102 0.1
103 0.1
104 0.09
105 0.1
106 0.1
107 0.11
108 0.12
109 0.15
110 0.18
111 0.18
112 0.2
113 0.21
114 0.27
115 0.3
116 0.3
117 0.27
118 0.25
119 0.26
120 0.24
121 0.22
122 0.17
123 0.13
124 0.13
125 0.14
126 0.13
127 0.13
128 0.13
129 0.13
130 0.12
131 0.12
132 0.12
133 0.11
134 0.11
135 0.13
136 0.15
137 0.14
138 0.13
139 0.13
140 0.11
141 0.11
142 0.11
143 0.14
144 0.13
145 0.14
146 0.18
147 0.2
148 0.19
149 0.19
150 0.19
151 0.14
152 0.15
153 0.14
154 0.1
155 0.08
156 0.08
157 0.08
158 0.1
159 0.1
160 0.09
161 0.09
162 0.09
163 0.13
164 0.16
165 0.17
166 0.15
167 0.16
168 0.17
169 0.17
170 0.22