Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397VUS3

Protein Details
Accession A0A397VUS3    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
256-280LPVRQLLSRKQKRPKNSQTKRSGTSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
264-288RKQKRPKNSQTKRSGTSAPQRKRKG
Subcellular Location(s) nucl 18, mito_nucl 12.833, cyto_nucl 10.833, mito 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR007526  SWIRM  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF04433  SWIRM  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50934  SWIRM  
Amino Acid Sequences MSTPYKSFPFMSSIISPPPSPKKYPIILPPLKFPFEFRNDETVDSATLESTKQQNTMENTLFPPIKQQSKYRMRLLDAPTDLLDYIEKSKPTTVRSPPSHCLSRFSLSNAKSSPLELNHPVPSLTLGSTGISSYPIPMNINQDKNDLITHKISVGRNRNARKNPYPLRAPTMSSPGITFKVDMYTPVLKDPMAILRSNEETKNNNNNNSTSSNQSNQSNQEFFGMLSPPASEQCESQPSSPSADDTTFKIQETNSLPVRQLLSRKQKRPKNSQTKRSGTSAPQRKRKGNSLARVMADRGLLESVFNADITSNDIKSVRIPPPPSMQFDELMNSINSLSLDTSVLEKMSPEITWKGQPLSIAHLPHYDALHPTEAHVVSVLRLTPVQYLTGKHTLVSAAQRYSQRALPFRKSDAQKLLRIDVNKASKLWEFFQQVKWI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.33
3 0.31
4 0.34
5 0.43
6 0.44
7 0.45
8 0.48
9 0.51
10 0.54
11 0.6
12 0.62
13 0.63
14 0.65
15 0.63
16 0.65
17 0.63
18 0.61
19 0.54
20 0.48
21 0.46
22 0.45
23 0.49
24 0.44
25 0.46
26 0.44
27 0.46
28 0.44
29 0.36
30 0.3
31 0.25
32 0.21
33 0.14
34 0.13
35 0.12
36 0.14
37 0.18
38 0.19
39 0.2
40 0.22
41 0.27
42 0.32
43 0.39
44 0.36
45 0.34
46 0.33
47 0.37
48 0.36
49 0.29
50 0.32
51 0.32
52 0.38
53 0.4
54 0.45
55 0.5
56 0.6
57 0.67
58 0.66
59 0.65
60 0.6
61 0.65
62 0.63
63 0.6
64 0.51
65 0.46
66 0.38
67 0.34
68 0.31
69 0.23
70 0.19
71 0.12
72 0.15
73 0.16
74 0.17
75 0.17
76 0.22
77 0.25
78 0.3
79 0.37
80 0.4
81 0.47
82 0.54
83 0.6
84 0.6
85 0.64
86 0.67
87 0.59
88 0.56
89 0.51
90 0.47
91 0.42
92 0.41
93 0.41
94 0.35
95 0.4
96 0.35
97 0.33
98 0.29
99 0.3
100 0.29
101 0.23
102 0.27
103 0.25
104 0.28
105 0.27
106 0.27
107 0.25
108 0.21
109 0.2
110 0.16
111 0.13
112 0.1
113 0.09
114 0.08
115 0.09
116 0.09
117 0.07
118 0.08
119 0.07
120 0.08
121 0.09
122 0.09
123 0.11
124 0.12
125 0.2
126 0.25
127 0.29
128 0.28
129 0.29
130 0.28
131 0.28
132 0.28
133 0.22
134 0.18
135 0.16
136 0.15
137 0.16
138 0.21
139 0.23
140 0.3
141 0.37
142 0.41
143 0.48
144 0.54
145 0.61
146 0.63
147 0.68
148 0.67
149 0.68
150 0.69
151 0.67
152 0.67
153 0.61
154 0.59
155 0.53
156 0.48
157 0.4
158 0.38
159 0.32
160 0.26
161 0.24
162 0.2
163 0.19
164 0.17
165 0.16
166 0.1
167 0.11
168 0.11
169 0.11
170 0.13
171 0.14
172 0.14
173 0.14
174 0.15
175 0.13
176 0.13
177 0.13
178 0.14
179 0.13
180 0.13
181 0.12
182 0.14
183 0.17
184 0.19
185 0.19
186 0.18
187 0.19
188 0.24
189 0.34
190 0.35
191 0.37
192 0.36
193 0.36
194 0.36
195 0.37
196 0.32
197 0.26
198 0.25
199 0.24
200 0.25
201 0.25
202 0.24
203 0.24
204 0.26
205 0.23
206 0.21
207 0.19
208 0.17
209 0.15
210 0.14
211 0.11
212 0.08
213 0.08
214 0.07
215 0.07
216 0.07
217 0.09
218 0.08
219 0.07
220 0.1
221 0.14
222 0.15
223 0.16
224 0.18
225 0.18
226 0.2
227 0.19
228 0.18
229 0.15
230 0.15
231 0.15
232 0.15
233 0.19
234 0.17
235 0.17
236 0.17
237 0.15
238 0.2
239 0.22
240 0.25
241 0.22
242 0.23
243 0.23
244 0.24
245 0.26
246 0.22
247 0.24
248 0.28
249 0.37
250 0.45
251 0.54
252 0.61
253 0.66
254 0.72
255 0.79
256 0.81
257 0.81
258 0.82
259 0.84
260 0.85
261 0.86
262 0.8
263 0.73
264 0.66
265 0.61
266 0.61
267 0.61
268 0.6
269 0.62
270 0.66
271 0.68
272 0.69
273 0.71
274 0.72
275 0.7
276 0.69
277 0.68
278 0.66
279 0.6
280 0.56
281 0.48
282 0.39
283 0.3
284 0.22
285 0.15
286 0.11
287 0.09
288 0.08
289 0.07
290 0.07
291 0.07
292 0.07
293 0.06
294 0.05
295 0.06
296 0.11
297 0.12
298 0.11
299 0.12
300 0.12
301 0.13
302 0.16
303 0.22
304 0.22
305 0.26
306 0.29
307 0.31
308 0.4
309 0.43
310 0.45
311 0.44
312 0.41
313 0.36
314 0.34
315 0.33
316 0.24
317 0.23
318 0.18
319 0.13
320 0.11
321 0.11
322 0.1
323 0.08
324 0.08
325 0.07
326 0.07
327 0.07
328 0.09
329 0.09
330 0.09
331 0.08
332 0.08
333 0.09
334 0.1
335 0.09
336 0.11
337 0.14
338 0.17
339 0.2
340 0.22
341 0.23
342 0.22
343 0.24
344 0.22
345 0.27
346 0.28
347 0.26
348 0.26
349 0.26
350 0.26
351 0.26
352 0.26
353 0.2
354 0.17
355 0.19
356 0.21
357 0.19
358 0.19
359 0.22
360 0.21
361 0.2
362 0.19
363 0.16
364 0.13
365 0.15
366 0.15
367 0.1
368 0.1
369 0.11
370 0.13
371 0.14
372 0.17
373 0.17
374 0.19
375 0.24
376 0.3
377 0.29
378 0.26
379 0.26
380 0.23
381 0.25
382 0.3
383 0.28
384 0.25
385 0.3
386 0.34
387 0.36
388 0.39
389 0.4
390 0.4
391 0.44
392 0.49
393 0.53
394 0.55
395 0.58
396 0.63
397 0.64
398 0.66
399 0.68
400 0.67
401 0.64
402 0.63
403 0.62
404 0.58
405 0.55
406 0.51
407 0.49
408 0.5
409 0.46
410 0.42
411 0.4
412 0.4
413 0.41
414 0.4
415 0.39
416 0.37
417 0.39