Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397V8J4

Protein Details
Accession A0A397V8J4    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
161-181SENNRICKKRRWDERDQNGNEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
245-250KKRRKR
Subcellular Location(s) nucl 25, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013907  Sds3  
Gene Ontology GO:0005654  C:nucleoplasm  
Pfam View protein in Pfam  
PF08598  Sds3  
Amino Acid Sequences MSRSLDKRLDKQSDNQELFKAGSTFPFEKEARAQSNSQISTDNESEVRKPDSDKEEQTKTEKNGIKSKAWKVVAGEETNGDVIKESNGTTIQHASSDSPDNKTSDKLDSPTSSSTPNDSSEMSSLSESPSLLHDDPKLKISNIITTSITSEDESSSKMDASENNRICKKRRWDERDQNGNEDDEHDENDKPRVEVQEDLKMIERDFVQLRDQLYREQIQELEKEIAEIKQGVHPDQISCMDEIDKKRRKRSEITSSRKRYQELHCQKQYEESEYRTYRQFWSDRYALKRHILDDLENRRFKLIREKNNLDDSSRIEPLHTGDIDEDFALMGISKETLVQVHDPSPSSTSPQISTISRPNISDNNNNPFLSQECLDVCSLGDRFSYLGQSFKKGDAVLVIDSTSGQYAAKFLSATDSEVVIQRPDGSKPRIQMNLLKEGKYQIQLKDLKES
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.71
2 0.65
3 0.56
4 0.5
5 0.47
6 0.41
7 0.32
8 0.22
9 0.21
10 0.26
11 0.26
12 0.26
13 0.32
14 0.29
15 0.31
16 0.37
17 0.41
18 0.4
19 0.42
20 0.42
21 0.41
22 0.5
23 0.47
24 0.42
25 0.38
26 0.34
27 0.36
28 0.35
29 0.32
30 0.25
31 0.26
32 0.28
33 0.28
34 0.3
35 0.26
36 0.28
37 0.33
38 0.38
39 0.43
40 0.49
41 0.52
42 0.55
43 0.57
44 0.6
45 0.59
46 0.56
47 0.59
48 0.56
49 0.55
50 0.57
51 0.57
52 0.6
53 0.61
54 0.64
55 0.63
56 0.59
57 0.55
58 0.49
59 0.52
60 0.5
61 0.43
62 0.37
63 0.28
64 0.27
65 0.26
66 0.23
67 0.15
68 0.1
69 0.08
70 0.08
71 0.09
72 0.08
73 0.09
74 0.11
75 0.12
76 0.14
77 0.16
78 0.16
79 0.15
80 0.16
81 0.15
82 0.17
83 0.24
84 0.24
85 0.25
86 0.27
87 0.28
88 0.29
89 0.3
90 0.29
91 0.27
92 0.28
93 0.26
94 0.29
95 0.29
96 0.31
97 0.32
98 0.31
99 0.28
100 0.26
101 0.27
102 0.24
103 0.24
104 0.22
105 0.19
106 0.2
107 0.18
108 0.18
109 0.16
110 0.14
111 0.13
112 0.12
113 0.12
114 0.1
115 0.1
116 0.1
117 0.14
118 0.14
119 0.15
120 0.18
121 0.21
122 0.22
123 0.26
124 0.26
125 0.22
126 0.25
127 0.24
128 0.27
129 0.25
130 0.26
131 0.23
132 0.21
133 0.22
134 0.19
135 0.19
136 0.12
137 0.12
138 0.1
139 0.1
140 0.11
141 0.11
142 0.1
143 0.09
144 0.09
145 0.1
146 0.13
147 0.19
148 0.28
149 0.3
150 0.35
151 0.4
152 0.43
153 0.46
154 0.51
155 0.55
156 0.55
157 0.62
158 0.65
159 0.71
160 0.79
161 0.86
162 0.88
163 0.79
164 0.73
165 0.63
166 0.56
167 0.44
168 0.35
169 0.27
170 0.17
171 0.16
172 0.14
173 0.14
174 0.14
175 0.17
176 0.16
177 0.14
178 0.15
179 0.16
180 0.16
181 0.19
182 0.21
183 0.24
184 0.24
185 0.24
186 0.24
187 0.23
188 0.21
189 0.19
190 0.17
191 0.12
192 0.13
193 0.14
194 0.13
195 0.15
196 0.16
197 0.17
198 0.17
199 0.16
200 0.18
201 0.2
202 0.19
203 0.17
204 0.17
205 0.16
206 0.16
207 0.17
208 0.15
209 0.12
210 0.12
211 0.12
212 0.1
213 0.09
214 0.09
215 0.08
216 0.09
217 0.1
218 0.1
219 0.11
220 0.11
221 0.1
222 0.11
223 0.12
224 0.11
225 0.1
226 0.1
227 0.1
228 0.13
229 0.18
230 0.26
231 0.33
232 0.37
233 0.45
234 0.51
235 0.55
236 0.59
237 0.64
238 0.66
239 0.69
240 0.74
241 0.76
242 0.78
243 0.78
244 0.73
245 0.66
246 0.6
247 0.56
248 0.58
249 0.58
250 0.6
251 0.59
252 0.58
253 0.56
254 0.57
255 0.52
256 0.47
257 0.4
258 0.33
259 0.35
260 0.35
261 0.37
262 0.32
263 0.32
264 0.28
265 0.31
266 0.31
267 0.26
268 0.3
269 0.33
270 0.36
271 0.39
272 0.42
273 0.39
274 0.42
275 0.41
276 0.36
277 0.36
278 0.31
279 0.29
280 0.34
281 0.4
282 0.43
283 0.43
284 0.42
285 0.39
286 0.39
287 0.37
288 0.39
289 0.39
290 0.41
291 0.5
292 0.55
293 0.58
294 0.65
295 0.65
296 0.55
297 0.48
298 0.41
299 0.36
300 0.33
301 0.28
302 0.2
303 0.2
304 0.2
305 0.23
306 0.18
307 0.15
308 0.13
309 0.14
310 0.14
311 0.13
312 0.11
313 0.06
314 0.06
315 0.05
316 0.05
317 0.04
318 0.04
319 0.04
320 0.04
321 0.04
322 0.05
323 0.06
324 0.07
325 0.1
326 0.11
327 0.13
328 0.15
329 0.16
330 0.17
331 0.2
332 0.19
333 0.2
334 0.22
335 0.22
336 0.21
337 0.22
338 0.24
339 0.23
340 0.26
341 0.3
342 0.33
343 0.32
344 0.32
345 0.34
346 0.37
347 0.4
348 0.45
349 0.44
350 0.46
351 0.49
352 0.48
353 0.44
354 0.39
355 0.35
356 0.3
357 0.24
358 0.19
359 0.15
360 0.17
361 0.17
362 0.16
363 0.14
364 0.15
365 0.14
366 0.13
367 0.12
368 0.1
369 0.11
370 0.12
371 0.17
372 0.13
373 0.19
374 0.2
375 0.25
376 0.27
377 0.27
378 0.29
379 0.24
380 0.24
381 0.21
382 0.21
383 0.18
384 0.16
385 0.15
386 0.12
387 0.12
388 0.12
389 0.1
390 0.08
391 0.07
392 0.06
393 0.07
394 0.08
395 0.09
396 0.09
397 0.08
398 0.13
399 0.14
400 0.16
401 0.16
402 0.16
403 0.16
404 0.19
405 0.2
406 0.16
407 0.15
408 0.17
409 0.18
410 0.22
411 0.29
412 0.32
413 0.36
414 0.4
415 0.47
416 0.49
417 0.51
418 0.53
419 0.51
420 0.56
421 0.55
422 0.52
423 0.46
424 0.45
425 0.46
426 0.45
427 0.45
428 0.37
429 0.43
430 0.47