Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397UTN3

Protein Details
Accession A0A397UTN3    Localization Confidence High Confidence Score 23
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
131-150DTNLPEKRARGRPKKEVSNSHydrophilic
176-196NTNSSEKRRGRPKREEIKTTSHydrophilic
219-258ITSVVQKRTRGRPKKERGRPPISTEKRRPGRPKVTNQDVFHydrophilic
269-290NKITTSEKRGRGRPRKNPLLSQHydrophilic
306-326ISNGTPKPRGRPRKVATDKEVHydrophilic
378-405TVKASNGEPPKKRGRPKRDDQTEQGLTKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
137-167KRARGRPKKEVSNSVIEKSASKTRGRPKKDK
182-189KRRGRPKR
205-251KRGRGRPKQSESNRITSVVQKRTRGRPKKERGRPPISTEKRRPGRPK
276-319KRGRGRPRKNPLLSQVGKSKIAPKRVTSDKISNGTPKPRGRPRK
386-395PPKKRGRPKR
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 16
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR000637  HMGI/Y_DNA-bd_CS  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF02178  AT_hook  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00354  HMGI_Y  
Amino Acid Sequences MPPTPVLTDSQYKISVDSKTPNIIEESSSIYKSIELQSDISRQDHLRIFDPPNPTNEMNTNAKDDSTKDMATNEISDVATKLEVPVEKKTREGHKSQDSTSNNNDAETATLEKSQQGQEETEGPDNVNDKDTNLPEKRARGRPKKEVSNSVIEKSASKTRGRPKKDKLATITASNNTNSSEKRRGRPKREEIKTTSDDTANSIVKRGRGRPKQSESNRITSVVQKRTRGRPKKERGRPPISTEKRRPGRPKVTNQDVFDGPTKTDEEDNKITTSEKRGRGRPRKNPLLSQVGKSKIAPKRVTSDKISNGTPKPRGRPRKVATDKEVDASHSESVIVHTETSTVNEVQIEILAHNTNSNAIQDDPVEPSNAVALNEQETVKASNGEPPKKRGRPKRDDQTEQGLTKKVKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.32
3 0.31
4 0.34
5 0.34
6 0.38
7 0.38
8 0.37
9 0.36
10 0.33
11 0.3
12 0.25
13 0.28
14 0.25
15 0.25
16 0.24
17 0.21
18 0.2
19 0.22
20 0.25
21 0.21
22 0.2
23 0.22
24 0.26
25 0.31
26 0.33
27 0.3
28 0.3
29 0.27
30 0.31
31 0.33
32 0.32
33 0.3
34 0.33
35 0.37
36 0.39
37 0.45
38 0.41
39 0.4
40 0.44
41 0.42
42 0.39
43 0.37
44 0.38
45 0.36
46 0.36
47 0.36
48 0.3
49 0.3
50 0.28
51 0.27
52 0.28
53 0.26
54 0.24
55 0.21
56 0.21
57 0.22
58 0.22
59 0.22
60 0.16
61 0.14
62 0.13
63 0.13
64 0.12
65 0.11
66 0.1
67 0.09
68 0.09
69 0.1
70 0.13
71 0.15
72 0.24
73 0.29
74 0.3
75 0.34
76 0.4
77 0.46
78 0.49
79 0.51
80 0.52
81 0.55
82 0.58
83 0.57
84 0.6
85 0.54
86 0.54
87 0.54
88 0.52
89 0.41
90 0.37
91 0.35
92 0.26
93 0.24
94 0.2
95 0.18
96 0.11
97 0.12
98 0.13
99 0.14
100 0.16
101 0.17
102 0.18
103 0.17
104 0.17
105 0.17
106 0.21
107 0.22
108 0.22
109 0.2
110 0.18
111 0.18
112 0.19
113 0.18
114 0.17
115 0.14
116 0.13
117 0.17
118 0.19
119 0.26
120 0.26
121 0.3
122 0.31
123 0.38
124 0.45
125 0.5
126 0.59
127 0.61
128 0.67
129 0.73
130 0.78
131 0.81
132 0.79
133 0.78
134 0.71
135 0.7
136 0.64
137 0.55
138 0.49
139 0.39
140 0.34
141 0.29
142 0.31
143 0.25
144 0.25
145 0.31
146 0.38
147 0.48
148 0.55
149 0.61
150 0.63
151 0.7
152 0.74
153 0.73
154 0.69
155 0.68
156 0.61
157 0.56
158 0.51
159 0.42
160 0.38
161 0.32
162 0.27
163 0.2
164 0.21
165 0.18
166 0.21
167 0.28
168 0.31
169 0.38
170 0.48
171 0.56
172 0.64
173 0.73
174 0.78
175 0.78
176 0.8
177 0.8
178 0.75
179 0.73
180 0.66
181 0.59
182 0.5
183 0.4
184 0.33
185 0.27
186 0.26
187 0.2
188 0.17
189 0.16
190 0.16
191 0.18
192 0.21
193 0.27
194 0.33
195 0.4
196 0.47
197 0.54
198 0.6
199 0.67
200 0.69
201 0.72
202 0.66
203 0.63
204 0.57
205 0.49
206 0.43
207 0.4
208 0.43
209 0.41
210 0.41
211 0.41
212 0.46
213 0.54
214 0.64
215 0.67
216 0.69
217 0.72
218 0.79
219 0.84
220 0.88
221 0.89
222 0.88
223 0.87
224 0.8
225 0.77
226 0.77
227 0.75
228 0.74
229 0.71
230 0.72
231 0.7
232 0.75
233 0.75
234 0.74
235 0.76
236 0.76
237 0.79
238 0.78
239 0.81
240 0.78
241 0.72
242 0.65
243 0.55
244 0.48
245 0.41
246 0.33
247 0.23
248 0.19
249 0.18
250 0.15
251 0.18
252 0.18
253 0.21
254 0.23
255 0.25
256 0.24
257 0.23
258 0.24
259 0.22
260 0.29
261 0.31
262 0.36
263 0.4
264 0.47
265 0.58
266 0.68
267 0.76
268 0.78
269 0.8
270 0.83
271 0.82
272 0.8
273 0.75
274 0.75
275 0.67
276 0.61
277 0.57
278 0.5
279 0.47
280 0.42
281 0.44
282 0.39
283 0.45
284 0.44
285 0.4
286 0.45
287 0.51
288 0.55
289 0.52
290 0.54
291 0.52
292 0.53
293 0.52
294 0.51
295 0.49
296 0.52
297 0.54
298 0.52
299 0.55
300 0.62
301 0.7
302 0.72
303 0.77
304 0.75
305 0.78
306 0.81
307 0.8
308 0.76
309 0.73
310 0.67
311 0.59
312 0.55
313 0.45
314 0.37
315 0.31
316 0.25
317 0.17
318 0.16
319 0.12
320 0.13
321 0.14
322 0.13
323 0.11
324 0.1
325 0.11
326 0.11
327 0.14
328 0.15
329 0.12
330 0.12
331 0.12
332 0.13
333 0.11
334 0.12
335 0.11
336 0.08
337 0.1
338 0.1
339 0.1
340 0.11
341 0.11
342 0.11
343 0.11
344 0.12
345 0.12
346 0.11
347 0.13
348 0.13
349 0.15
350 0.17
351 0.17
352 0.18
353 0.16
354 0.15
355 0.17
356 0.17
357 0.16
358 0.13
359 0.13
360 0.14
361 0.17
362 0.17
363 0.15
364 0.15
365 0.16
366 0.16
367 0.18
368 0.16
369 0.21
370 0.31
371 0.39
372 0.43
373 0.49
374 0.59
375 0.66
376 0.76
377 0.79
378 0.81
379 0.82
380 0.88
381 0.91
382 0.91
383 0.91
384 0.87
385 0.86
386 0.83
387 0.76
388 0.69
389 0.65