Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397VW06

Protein Details
Accession A0A397VW06    Localization Confidence High Confidence Score 16.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
54-75NDPEFLKKLKHPKNPKANSEQIHydrophilic
177-203LFCQMDIKRRRPTKRFRAPENYGKSRYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
185-191RRRPTKR
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007133  RNA_pol_II-assoc_Paf1  
Gene Ontology GO:0016593  C:Cdc73/Paf1 complex  
GO:0016570  P:histone modification  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF03985  Paf1  
Amino Acid Sequences MTQHISASETVHQGNNTEKTMESRMATSKVNKMDLKQSHEEQITAIEESFKIANDPEFLKKLKHPKNPKANSEQILFIFPDFEYMLWLYRLVLIMTLGKDFPWKTMKIVGKIETSEFLLKDYQILDRMMIVKDITNINGLETMLQIRIKIQRILNCYLWNATLTKVKQMKKRWFMFLFCQMDIKRRRPTKRFRAPENYGKSRYLKCSYEIPTDEKESQLRLLKKERLRDYEIECIMKKRRRIERNF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.29
3 0.27
4 0.25
5 0.24
6 0.26
7 0.29
8 0.31
9 0.25
10 0.24
11 0.27
12 0.29
13 0.32
14 0.33
15 0.36
16 0.37
17 0.43
18 0.41
19 0.4
20 0.47
21 0.49
22 0.52
23 0.51
24 0.49
25 0.49
26 0.47
27 0.45
28 0.35
29 0.32
30 0.26
31 0.21
32 0.18
33 0.12
34 0.11
35 0.13
36 0.13
37 0.1
38 0.09
39 0.09
40 0.1
41 0.11
42 0.14
43 0.16
44 0.19
45 0.21
46 0.23
47 0.28
48 0.38
49 0.45
50 0.53
51 0.6
52 0.67
53 0.77
54 0.82
55 0.83
56 0.81
57 0.79
58 0.72
59 0.63
60 0.55
61 0.45
62 0.38
63 0.31
64 0.23
65 0.16
66 0.12
67 0.12
68 0.09
69 0.08
70 0.08
71 0.08
72 0.09
73 0.08
74 0.09
75 0.07
76 0.08
77 0.08
78 0.07
79 0.06
80 0.06
81 0.07
82 0.07
83 0.08
84 0.07
85 0.07
86 0.09
87 0.09
88 0.12
89 0.14
90 0.15
91 0.15
92 0.23
93 0.26
94 0.28
95 0.31
96 0.31
97 0.28
98 0.28
99 0.28
100 0.21
101 0.19
102 0.15
103 0.12
104 0.11
105 0.1
106 0.09
107 0.09
108 0.09
109 0.08
110 0.09
111 0.09
112 0.08
113 0.08
114 0.1
115 0.09
116 0.09
117 0.09
118 0.07
119 0.09
120 0.09
121 0.09
122 0.09
123 0.08
124 0.08
125 0.09
126 0.08
127 0.07
128 0.07
129 0.07
130 0.07
131 0.07
132 0.07
133 0.08
134 0.13
135 0.15
136 0.19
137 0.21
138 0.25
139 0.3
140 0.34
141 0.34
142 0.31
143 0.29
144 0.26
145 0.24
146 0.2
147 0.16
148 0.13
149 0.17
150 0.16
151 0.24
152 0.3
153 0.35
154 0.42
155 0.51
156 0.59
157 0.63
158 0.67
159 0.68
160 0.65
161 0.63
162 0.61
163 0.61
164 0.55
165 0.45
166 0.46
167 0.38
168 0.43
169 0.46
170 0.47
171 0.47
172 0.52
173 0.61
174 0.65
175 0.76
176 0.79
177 0.83
178 0.85
179 0.85
180 0.86
181 0.84
182 0.85
183 0.84
184 0.8
185 0.73
186 0.68
187 0.64
188 0.59
189 0.58
190 0.55
191 0.47
192 0.42
193 0.46
194 0.47
195 0.5
196 0.48
197 0.45
198 0.43
199 0.47
200 0.45
201 0.4
202 0.37
203 0.31
204 0.33
205 0.37
206 0.37
207 0.38
208 0.45
209 0.51
210 0.56
211 0.63
212 0.66
213 0.66
214 0.67
215 0.67
216 0.64
217 0.64
218 0.63
219 0.58
220 0.51
221 0.51
222 0.54
223 0.55
224 0.56
225 0.56
226 0.63