Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397VX68

Protein Details
Accession A0A397VX68    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
956-979NVSSSNTPPKHNPRNNQRSHTMHTHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 16
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013860  AreA_GATA  
IPR039355  Transcription_factor_GATA  
IPR000679  Znf_GATA  
IPR013088  Znf_NHR/GATA  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
GO:0043565  F:sequence-specific DNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF08550  DUF1752  
PF00320  GATA  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00344  GATA_ZN_FINGER_1  
PS50114  GATA_ZN_FINGER_2  
CDD cd00202  ZnF_GATA  
Amino Acid Sequences MIVAYNQPTSFAHHQSSETFEDIKNNNSSNLLGTFNVVKNCDSPYNNCTIQGNLSEQPPQHVQHSTGSRQQIFGSSTSRQYNNKNIRTSTTLSSSNTTTNRNNFNDTQIFTTEHLANLRSGRNNNNRSNSNIGKNLNMGHNVGGLNFKETTKNVKNDSTKLKYCDIIFEQVDFPSRCFDDNEKDDGFDDSKKDPLGTSNWRLYTKAKDALENGRRLENISWRMMFLKSKNAERPQIKHQSPNDSNAVAPNNCSIVNNFTSSTKNNKQYKNSKSGIFLQQKNISNLKDAENNVEPTLLNLDMDMEDSLNKIDRHLNVDMDHDDYNAILVDDPTHAPFVMSPADTSASNTDDNLSVYNSTPSPVLTSSTIPAIPIPASSASNNYNPPLTTSPTIEFITPDGFRFQNSQNIRRNYMNFSAGKPMYSGRSFAVPRSQIFNSTGTHGLNSKKTLKPQQIFPSPISSITIPSDTADDSDVELPESMSSSATTTSTNTQYTLTTFNPTFDQASLDYSSSLISSSAPTYSYASFCEIAAPDGLNDNNSISYNQSTVSTPITPADNTGFYFDFNSGSDLNADSFFYYMQGSSPHINPSLLSTSPNAIYDFMQHDQNPNSGGKNKNSNSFEFDNHSSNGTSKIKRHSLDGISSSAIVDMNCINKNNSLNSLNSSPILASGETSESDTSNALPCKRQRSSSRTLPTIPTNSSSNSTSNNIKSPSSPPKDGCNNNNNNNNNSSNSNGNNGSSSKNAMSTTCTNCHTQTTPLWRRNPEGQPLCNACGLFLKLHGVVRPLSLKTDTIKKRNRNGGAVSAGKNPAKGVKGTVQLGPGGASMGVIGKRMSLSSNSMATRTQNGNSPAPAPVLSTPVSTAQFTNRFNGRHQMVGAMPKRRRFSGDEQQLNSQTSRPSEVQQSQNYGVIKHPFSSSGEQTKIQHVLEMVRAPDNNSSPSVSSSNGYNNTFTPSNVSSSNTPPKHNPRNNQRSHTMHTPSTSSQSILVHYPIVQSALSSENDNMIPSNGNFTTRPGMLIRHRSYV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.34
3 0.39
4 0.35
5 0.32
6 0.3
7 0.27
8 0.32
9 0.32
10 0.36
11 0.35
12 0.33
13 0.32
14 0.31
15 0.31
16 0.26
17 0.27
18 0.23
19 0.18
20 0.18
21 0.22
22 0.25
23 0.27
24 0.26
25 0.25
26 0.24
27 0.29
28 0.33
29 0.31
30 0.33
31 0.35
32 0.41
33 0.4
34 0.41
35 0.37
36 0.33
37 0.33
38 0.3
39 0.31
40 0.26
41 0.27
42 0.3
43 0.29
44 0.32
45 0.33
46 0.32
47 0.31
48 0.31
49 0.32
50 0.35
51 0.41
52 0.42
53 0.44
54 0.5
55 0.47
56 0.45
57 0.44
58 0.41
59 0.36
60 0.33
61 0.31
62 0.27
63 0.31
64 0.36
65 0.4
66 0.4
67 0.45
68 0.53
69 0.58
70 0.63
71 0.64
72 0.61
73 0.61
74 0.61
75 0.59
76 0.53
77 0.48
78 0.44
79 0.4
80 0.41
81 0.37
82 0.38
83 0.37
84 0.38
85 0.39
86 0.42
87 0.48
88 0.49
89 0.53
90 0.49
91 0.52
92 0.52
93 0.47
94 0.43
95 0.37
96 0.36
97 0.3
98 0.33
99 0.27
100 0.24
101 0.24
102 0.21
103 0.21
104 0.23
105 0.27
106 0.28
107 0.31
108 0.39
109 0.48
110 0.56
111 0.62
112 0.66
113 0.64
114 0.63
115 0.68
116 0.64
117 0.6
118 0.58
119 0.51
120 0.45
121 0.45
122 0.43
123 0.38
124 0.34
125 0.29
126 0.22
127 0.23
128 0.21
129 0.19
130 0.2
131 0.16
132 0.16
133 0.17
134 0.17
135 0.18
136 0.19
137 0.28
138 0.32
139 0.38
140 0.4
141 0.47
142 0.52
143 0.56
144 0.65
145 0.64
146 0.62
147 0.6
148 0.59
149 0.54
150 0.49
151 0.48
152 0.42
153 0.4
154 0.34
155 0.32
156 0.3
157 0.27
158 0.33
159 0.27
160 0.24
161 0.22
162 0.22
163 0.21
164 0.23
165 0.27
166 0.29
167 0.33
168 0.38
169 0.34
170 0.34
171 0.33
172 0.33
173 0.3
174 0.23
175 0.23
176 0.19
177 0.21
178 0.21
179 0.21
180 0.18
181 0.2
182 0.24
183 0.29
184 0.34
185 0.38
186 0.42
187 0.42
188 0.44
189 0.44
190 0.44
191 0.42
192 0.43
193 0.38
194 0.37
195 0.4
196 0.49
197 0.53
198 0.5
199 0.45
200 0.4
201 0.39
202 0.39
203 0.38
204 0.35
205 0.33
206 0.32
207 0.31
208 0.29
209 0.31
210 0.3
211 0.32
212 0.26
213 0.31
214 0.31
215 0.37
216 0.45
217 0.49
218 0.56
219 0.57
220 0.6
221 0.6
222 0.67
223 0.62
224 0.63
225 0.62
226 0.63
227 0.6
228 0.6
229 0.54
230 0.44
231 0.42
232 0.37
233 0.37
234 0.26
235 0.24
236 0.2
237 0.18
238 0.18
239 0.18
240 0.15
241 0.15
242 0.16
243 0.17
244 0.17
245 0.17
246 0.2
247 0.22
248 0.3
249 0.34
250 0.42
251 0.48
252 0.54
253 0.62
254 0.69
255 0.75
256 0.75
257 0.71
258 0.64
259 0.6
260 0.6
261 0.6
262 0.59
263 0.54
264 0.52
265 0.56
266 0.57
267 0.57
268 0.54
269 0.45
270 0.4
271 0.38
272 0.34
273 0.32
274 0.29
275 0.29
276 0.29
277 0.3
278 0.26
279 0.25
280 0.21
281 0.17
282 0.18
283 0.13
284 0.09
285 0.07
286 0.08
287 0.07
288 0.08
289 0.08
290 0.05
291 0.05
292 0.06
293 0.07
294 0.1
295 0.09
296 0.1
297 0.15
298 0.16
299 0.21
300 0.22
301 0.24
302 0.21
303 0.24
304 0.23
305 0.21
306 0.2
307 0.15
308 0.13
309 0.11
310 0.1
311 0.08
312 0.07
313 0.04
314 0.04
315 0.05
316 0.06
317 0.07
318 0.08
319 0.08
320 0.08
321 0.08
322 0.08
323 0.09
324 0.1
325 0.09
326 0.09
327 0.09
328 0.11
329 0.11
330 0.12
331 0.11
332 0.11
333 0.11
334 0.11
335 0.11
336 0.11
337 0.11
338 0.11
339 0.1
340 0.09
341 0.09
342 0.11
343 0.1
344 0.1
345 0.09
346 0.09
347 0.1
348 0.09
349 0.11
350 0.1
351 0.11
352 0.12
353 0.13
354 0.13
355 0.11
356 0.11
357 0.1
358 0.08
359 0.07
360 0.08
361 0.08
362 0.09
363 0.09
364 0.12
365 0.14
366 0.17
367 0.18
368 0.17
369 0.17
370 0.16
371 0.19
372 0.18
373 0.19
374 0.18
375 0.19
376 0.19
377 0.21
378 0.22
379 0.18
380 0.16
381 0.14
382 0.16
383 0.13
384 0.13
385 0.12
386 0.12
387 0.12
388 0.16
389 0.16
390 0.21
391 0.26
392 0.33
393 0.39
394 0.43
395 0.46
396 0.46
397 0.47
398 0.43
399 0.42
400 0.39
401 0.32
402 0.3
403 0.33
404 0.3
405 0.27
406 0.23
407 0.21
408 0.19
409 0.19
410 0.19
411 0.12
412 0.18
413 0.18
414 0.18
415 0.24
416 0.22
417 0.22
418 0.26
419 0.25
420 0.22
421 0.24
422 0.24
423 0.19
424 0.19
425 0.2
426 0.15
427 0.16
428 0.16
429 0.17
430 0.17
431 0.2
432 0.24
433 0.25
434 0.3
435 0.38
436 0.44
437 0.44
438 0.49
439 0.54
440 0.54
441 0.55
442 0.5
443 0.47
444 0.38
445 0.35
446 0.29
447 0.21
448 0.16
449 0.14
450 0.13
451 0.09
452 0.09
453 0.1
454 0.08
455 0.08
456 0.08
457 0.07
458 0.07
459 0.08
460 0.08
461 0.07
462 0.07
463 0.07
464 0.06
465 0.06
466 0.06
467 0.05
468 0.05
469 0.05
470 0.06
471 0.06
472 0.07
473 0.07
474 0.1
475 0.12
476 0.12
477 0.12
478 0.12
479 0.12
480 0.13
481 0.15
482 0.13
483 0.14
484 0.14
485 0.14
486 0.14
487 0.15
488 0.14
489 0.11
490 0.12
491 0.09
492 0.11
493 0.11
494 0.1
495 0.09
496 0.09
497 0.09
498 0.07
499 0.07
500 0.05
501 0.04
502 0.05
503 0.05
504 0.06
505 0.06
506 0.07
507 0.08
508 0.09
509 0.09
510 0.09
511 0.11
512 0.11
513 0.1
514 0.11
515 0.09
516 0.09
517 0.09
518 0.08
519 0.06
520 0.07
521 0.07
522 0.06
523 0.06
524 0.06
525 0.06
526 0.06
527 0.07
528 0.07
529 0.07
530 0.07
531 0.07
532 0.08
533 0.08
534 0.09
535 0.11
536 0.1
537 0.1
538 0.1
539 0.11
540 0.1
541 0.1
542 0.1
543 0.1
544 0.1
545 0.11
546 0.11
547 0.1
548 0.1
549 0.1
550 0.09
551 0.08
552 0.1
553 0.08
554 0.08
555 0.08
556 0.08
557 0.08
558 0.08
559 0.07
560 0.06
561 0.06
562 0.05
563 0.06
564 0.05
565 0.05
566 0.05
567 0.06
568 0.08
569 0.1
570 0.11
571 0.12
572 0.13
573 0.13
574 0.12
575 0.14
576 0.15
577 0.13
578 0.13
579 0.12
580 0.13
581 0.14
582 0.14
583 0.12
584 0.1
585 0.1
586 0.11
587 0.14
588 0.13
589 0.15
590 0.15
591 0.17
592 0.18
593 0.18
594 0.18
595 0.16
596 0.17
597 0.2
598 0.24
599 0.24
600 0.33
601 0.34
602 0.4
603 0.42
604 0.41
605 0.41
606 0.4
607 0.38
608 0.33
609 0.34
610 0.29
611 0.27
612 0.26
613 0.21
614 0.19
615 0.24
616 0.24
617 0.24
618 0.25
619 0.32
620 0.36
621 0.36
622 0.39
623 0.39
624 0.37
625 0.37
626 0.36
627 0.3
628 0.24
629 0.24
630 0.21
631 0.15
632 0.12
633 0.08
634 0.07
635 0.07
636 0.1
637 0.11
638 0.12
639 0.13
640 0.15
641 0.18
642 0.18
643 0.21
644 0.2
645 0.19
646 0.22
647 0.23
648 0.21
649 0.19
650 0.18
651 0.13
652 0.12
653 0.12
654 0.08
655 0.07
656 0.07
657 0.08
658 0.08
659 0.09
660 0.09
661 0.08
662 0.09
663 0.09
664 0.08
665 0.11
666 0.14
667 0.14
668 0.2
669 0.24
670 0.32
671 0.34
672 0.41
673 0.45
674 0.5
675 0.57
676 0.62
677 0.64
678 0.6
679 0.6
680 0.56
681 0.53
682 0.49
683 0.42
684 0.35
685 0.3
686 0.28
687 0.28
688 0.26
689 0.23
690 0.22
691 0.23
692 0.25
693 0.26
694 0.28
695 0.28
696 0.26
697 0.27
698 0.31
699 0.39
700 0.4
701 0.42
702 0.4
703 0.46
704 0.54
705 0.58
706 0.58
707 0.58
708 0.6
709 0.64
710 0.7
711 0.66
712 0.6
713 0.58
714 0.52
715 0.44
716 0.38
717 0.32
718 0.28
719 0.26
720 0.27
721 0.23
722 0.22
723 0.21
724 0.21
725 0.2
726 0.17
727 0.19
728 0.16
729 0.17
730 0.17
731 0.15
732 0.19
733 0.23
734 0.27
735 0.28
736 0.29
737 0.29
738 0.3
739 0.33
740 0.3
741 0.27
742 0.29
743 0.36
744 0.43
745 0.49
746 0.54
747 0.53
748 0.56
749 0.62
750 0.62
751 0.61
752 0.58
753 0.53
754 0.53
755 0.54
756 0.51
757 0.44
758 0.38
759 0.28
760 0.24
761 0.24
762 0.17
763 0.14
764 0.15
765 0.14
766 0.16
767 0.17
768 0.15
769 0.15
770 0.17
771 0.19
772 0.18
773 0.19
774 0.19
775 0.19
776 0.21
777 0.3
778 0.36
779 0.42
780 0.51
781 0.57
782 0.65
783 0.73
784 0.75
785 0.71
786 0.67
787 0.63
788 0.6
789 0.56
790 0.49
791 0.43
792 0.43
793 0.37
794 0.34
795 0.29
796 0.27
797 0.24
798 0.22
799 0.22
800 0.23
801 0.28
802 0.3
803 0.31
804 0.28
805 0.26
806 0.25
807 0.22
808 0.16
809 0.11
810 0.08
811 0.06
812 0.05
813 0.07
814 0.07
815 0.08
816 0.08
817 0.08
818 0.08
819 0.09
820 0.11
821 0.1
822 0.15
823 0.17
824 0.22
825 0.22
826 0.23
827 0.24
828 0.24
829 0.28
830 0.27
831 0.25
832 0.27
833 0.31
834 0.32
835 0.32
836 0.32
837 0.27
838 0.26
839 0.24
840 0.2
841 0.16
842 0.17
843 0.16
844 0.15
845 0.15
846 0.17
847 0.19
848 0.18
849 0.18
850 0.22
851 0.28
852 0.29
853 0.33
854 0.35
855 0.35
856 0.37
857 0.45
858 0.4
859 0.36
860 0.35
861 0.32
862 0.3
863 0.37
864 0.4
865 0.41
866 0.44
867 0.48
868 0.51
869 0.5
870 0.52
871 0.5
872 0.53
873 0.55
874 0.61
875 0.62
876 0.61
877 0.65
878 0.64
879 0.59
880 0.51
881 0.42
882 0.34
883 0.28
884 0.31
885 0.26
886 0.27
887 0.33
888 0.4
889 0.45
890 0.47
891 0.5
892 0.47
893 0.49
894 0.47
895 0.39
896 0.36
897 0.35
898 0.31
899 0.27
900 0.26
901 0.24
902 0.28
903 0.33
904 0.34
905 0.36
906 0.37
907 0.39
908 0.4
909 0.44
910 0.44
911 0.38
912 0.33
913 0.27
914 0.26
915 0.27
916 0.28
917 0.24
918 0.23
919 0.24
920 0.24
921 0.28
922 0.28
923 0.27
924 0.25
925 0.26
926 0.23
927 0.26
928 0.26
929 0.22
930 0.21
931 0.21
932 0.27
933 0.3
934 0.3
935 0.28
936 0.28
937 0.32
938 0.32
939 0.29
940 0.28
941 0.24
942 0.25
943 0.25
944 0.28
945 0.26
946 0.33
947 0.43
948 0.41
949 0.44
950 0.5
951 0.59
952 0.67
953 0.73
954 0.75
955 0.76
956 0.84
957 0.89
958 0.87
959 0.85
960 0.81
961 0.79
962 0.78
963 0.73
964 0.65
965 0.59
966 0.57
967 0.5
968 0.49
969 0.43
970 0.34
971 0.31
972 0.28
973 0.28
974 0.25
975 0.24
976 0.19
977 0.19
978 0.19
979 0.17
980 0.17
981 0.14
982 0.11
983 0.12
984 0.14
985 0.15
986 0.15
987 0.15
988 0.17
989 0.18
990 0.18
991 0.17
992 0.15
993 0.17
994 0.15
995 0.21
996 0.19
997 0.22
998 0.22
999 0.25
1000 0.29
1001 0.26
1002 0.28
1003 0.23
1004 0.3
1005 0.36
1006 0.46