Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397VCP9

Protein Details
Accession A0A397VCP9    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-28MSITGTSENKRKRKRSRWDQPGSTTTKEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
10-16KRKRKRS
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 11, mito 6, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000467  G_patch_dom  
IPR040169  SUGP1/2  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01585  G-patch  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50174  G_PATCH  
Amino Acid Sequences MSITGTSENKRKRKRSRWDQPGSTTTKETLTTPSLDSLSNFGTDNNTGETEISQLVPSTNQSTTPTLATNAQPISQQIYTTADKRKFVKYSDTYKPGMVRVGSKWVYPEDEITDGGTWEHKKRAEEMKKTAEQAALLTAQAEAKRAHHIADFLPKDELEKFEQKVKAVKSGETPPEFEDYSTNKLDQSNIGFKMLMKQGWQAGSGLGKTGEGIAAPINKADTRPANAGLGQTKPEGVDEEDDEFEIYRKRMMLAYRFRPNPLCIYVFLRDLFLCTTNHLPFLEQSSSTILLKQLAGLSDQNVLS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.88
2 0.91
3 0.93
4 0.94
5 0.94
6 0.92
7 0.89
8 0.87
9 0.82
10 0.74
11 0.65
12 0.55
13 0.47
14 0.4
15 0.33
16 0.29
17 0.26
18 0.25
19 0.23
20 0.24
21 0.23
22 0.22
23 0.22
24 0.19
25 0.18
26 0.16
27 0.15
28 0.13
29 0.15
30 0.15
31 0.16
32 0.15
33 0.15
34 0.14
35 0.14
36 0.14
37 0.13
38 0.12
39 0.12
40 0.09
41 0.09
42 0.09
43 0.1
44 0.12
45 0.13
46 0.13
47 0.14
48 0.17
49 0.19
50 0.2
51 0.2
52 0.19
53 0.18
54 0.2
55 0.19
56 0.21
57 0.19
58 0.18
59 0.18
60 0.17
61 0.2
62 0.18
63 0.17
64 0.14
65 0.18
66 0.19
67 0.23
68 0.31
69 0.3
70 0.33
71 0.36
72 0.42
73 0.4
74 0.4
75 0.46
76 0.45
77 0.49
78 0.54
79 0.56
80 0.5
81 0.49
82 0.49
83 0.4
84 0.36
85 0.29
86 0.23
87 0.19
88 0.26
89 0.24
90 0.23
91 0.23
92 0.21
93 0.22
94 0.2
95 0.2
96 0.14
97 0.14
98 0.14
99 0.13
100 0.12
101 0.1
102 0.1
103 0.11
104 0.12
105 0.13
106 0.16
107 0.18
108 0.19
109 0.24
110 0.35
111 0.41
112 0.45
113 0.5
114 0.54
115 0.54
116 0.55
117 0.51
118 0.41
119 0.32
120 0.25
121 0.2
122 0.12
123 0.09
124 0.08
125 0.07
126 0.07
127 0.07
128 0.09
129 0.08
130 0.08
131 0.12
132 0.12
133 0.12
134 0.12
135 0.13
136 0.12
137 0.2
138 0.2
139 0.17
140 0.18
141 0.17
142 0.17
143 0.17
144 0.18
145 0.14
146 0.17
147 0.17
148 0.23
149 0.24
150 0.24
151 0.29
152 0.28
153 0.31
154 0.28
155 0.28
156 0.26
157 0.3
158 0.35
159 0.31
160 0.31
161 0.26
162 0.27
163 0.26
164 0.23
165 0.21
166 0.17
167 0.2
168 0.2
169 0.19
170 0.17
171 0.18
172 0.18
173 0.17
174 0.18
175 0.19
176 0.19
177 0.19
178 0.19
179 0.18
180 0.23
181 0.23
182 0.19
183 0.15
184 0.16
185 0.18
186 0.18
187 0.19
188 0.14
189 0.12
190 0.13
191 0.12
192 0.11
193 0.08
194 0.07
195 0.07
196 0.07
197 0.06
198 0.04
199 0.05
200 0.06
201 0.07
202 0.08
203 0.08
204 0.09
205 0.09
206 0.1
207 0.14
208 0.15
209 0.18
210 0.2
211 0.22
212 0.22
213 0.22
214 0.24
215 0.22
216 0.21
217 0.19
218 0.17
219 0.16
220 0.14
221 0.14
222 0.13
223 0.12
224 0.13
225 0.13
226 0.16
227 0.16
228 0.16
229 0.15
230 0.14
231 0.14
232 0.14
233 0.13
234 0.12
235 0.12
236 0.13
237 0.16
238 0.22
239 0.3
240 0.36
241 0.45
242 0.52
243 0.54
244 0.56
245 0.57
246 0.54
247 0.51
248 0.46
249 0.39
250 0.32
251 0.35
252 0.34
253 0.33
254 0.31
255 0.27
256 0.22
257 0.22
258 0.21
259 0.18
260 0.16
261 0.17
262 0.23
263 0.22
264 0.24
265 0.23
266 0.22
267 0.22
268 0.27
269 0.26
270 0.2
271 0.21
272 0.22
273 0.24
274 0.23
275 0.23
276 0.19
277 0.18
278 0.18
279 0.18
280 0.16
281 0.15
282 0.17
283 0.16
284 0.17