Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397VMI3

Protein Details
Accession A0A397VMI3    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
240-264GAGAKSKNKRASRQYSKKPKGKSMEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
241-261AGAKSKNKRASRQYSKKPKGK
Subcellular Location(s) nucl 13.5, mito_nucl 11, mito 7.5, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039905  CD2BP2/Lin1  
Gene Ontology GO:0005682  C:U5 snRNP  
Amino Acid Sequences MRTHMAVHKQLFMINFQITFQVTAQSIQDVEDDFEFDHDNVLESAKKRRGAVKLEGYASDETDTSDDDGTDRFKRRKGDIKEKTTENDLDDMFAEDEPVSKQKEVYDIDKKKIRYLESDEIVGHDYSSKDTFDYESGEPMIEAFNMKAELEEGKFDEAGNYIRNKKDPEAFHDNWLQGISSKDIEKARIAHEKKEQERKLKEAQEASNVPMDRISIWKELLTIMKRGEKLLDTFQRLGGGAGAKSKNKRASRQYSKKPKGKSMEVSQPPEQKELSAEEIEQQQRKKSIERLTDLSDKMMALGHFSVYEDTWEQILENLKKEAFDKVYQTTYFILQL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.22
3 0.18
4 0.2
5 0.18
6 0.19
7 0.17
8 0.16
9 0.14
10 0.15
11 0.16
12 0.15
13 0.14
14 0.13
15 0.14
16 0.12
17 0.13
18 0.11
19 0.12
20 0.11
21 0.12
22 0.13
23 0.12
24 0.12
25 0.1
26 0.12
27 0.11
28 0.12
29 0.15
30 0.16
31 0.25
32 0.29
33 0.32
34 0.34
35 0.41
36 0.46
37 0.49
38 0.56
39 0.57
40 0.57
41 0.55
42 0.53
43 0.49
44 0.42
45 0.36
46 0.28
47 0.18
48 0.14
49 0.12
50 0.12
51 0.1
52 0.1
53 0.09
54 0.09
55 0.1
56 0.13
57 0.18
58 0.25
59 0.27
60 0.32
61 0.37
62 0.44
63 0.53
64 0.59
65 0.65
66 0.68
67 0.73
68 0.75
69 0.73
70 0.68
71 0.63
72 0.55
73 0.45
74 0.38
75 0.29
76 0.23
77 0.2
78 0.19
79 0.15
80 0.12
81 0.11
82 0.08
83 0.09
84 0.09
85 0.12
86 0.12
87 0.12
88 0.13
89 0.13
90 0.19
91 0.21
92 0.27
93 0.35
94 0.37
95 0.43
96 0.48
97 0.48
98 0.47
99 0.48
100 0.43
101 0.39
102 0.42
103 0.43
104 0.39
105 0.4
106 0.35
107 0.32
108 0.31
109 0.25
110 0.17
111 0.11
112 0.1
113 0.1
114 0.11
115 0.1
116 0.08
117 0.09
118 0.1
119 0.1
120 0.13
121 0.12
122 0.12
123 0.12
124 0.12
125 0.11
126 0.1
127 0.09
128 0.05
129 0.06
130 0.04
131 0.05
132 0.05
133 0.05
134 0.05
135 0.05
136 0.06
137 0.06
138 0.07
139 0.07
140 0.08
141 0.08
142 0.08
143 0.07
144 0.07
145 0.08
146 0.1
147 0.12
148 0.14
149 0.16
150 0.18
151 0.2
152 0.21
153 0.27
154 0.26
155 0.3
156 0.36
157 0.36
158 0.37
159 0.39
160 0.36
161 0.3
162 0.29
163 0.21
164 0.13
165 0.12
166 0.11
167 0.09
168 0.09
169 0.12
170 0.13
171 0.14
172 0.15
173 0.16
174 0.19
175 0.27
176 0.28
177 0.29
178 0.36
179 0.43
180 0.48
181 0.57
182 0.58
183 0.58
184 0.6
185 0.61
186 0.62
187 0.59
188 0.56
189 0.51
190 0.47
191 0.44
192 0.42
193 0.38
194 0.35
195 0.29
196 0.25
197 0.2
198 0.18
199 0.12
200 0.13
201 0.15
202 0.12
203 0.12
204 0.13
205 0.13
206 0.14
207 0.18
208 0.18
209 0.18
210 0.18
211 0.23
212 0.23
213 0.23
214 0.24
215 0.2
216 0.21
217 0.27
218 0.3
219 0.3
220 0.31
221 0.31
222 0.3
223 0.28
224 0.26
225 0.19
226 0.14
227 0.1
228 0.15
229 0.18
230 0.21
231 0.24
232 0.31
233 0.38
234 0.42
235 0.51
236 0.55
237 0.63
238 0.71
239 0.78
240 0.83
241 0.85
242 0.9
243 0.88
244 0.85
245 0.83
246 0.8
247 0.77
248 0.75
249 0.71
250 0.71
251 0.72
252 0.71
253 0.69
254 0.67
255 0.61
256 0.55
257 0.47
258 0.37
259 0.31
260 0.29
261 0.26
262 0.21
263 0.19
264 0.19
265 0.26
266 0.31
267 0.34
268 0.33
269 0.33
270 0.37
271 0.4
272 0.42
273 0.43
274 0.47
275 0.51
276 0.55
277 0.54
278 0.56
279 0.6
280 0.55
281 0.48
282 0.4
283 0.31
284 0.26
285 0.24
286 0.18
287 0.13
288 0.13
289 0.12
290 0.11
291 0.12
292 0.13
293 0.11
294 0.14
295 0.12
296 0.13
297 0.12
298 0.12
299 0.12
300 0.13
301 0.22
302 0.22
303 0.24
304 0.26
305 0.26
306 0.27
307 0.28
308 0.33
309 0.29
310 0.3
311 0.32
312 0.34
313 0.39
314 0.39
315 0.4
316 0.34