Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397UPF1

Protein Details
Accession A0A397UPF1    Localization Confidence Low Confidence Score 9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
170-189NAPYCKRHYHKLNNSLCRNCHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 9.333, cyto 3, plas 3, cyto_mito 2.833, pero 2, E.R. 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR037987  FHL2/3/5  
IPR001781  Znf_LIM  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00412  LIM  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00478  LIM_DOMAIN_1  
PS50023  LIM_DOMAIN_2  
Amino Acid Sequences MTKGISDDSKELFEGGFDDLMEDLMREMDNMQTPSSRTNSSGGQHLGHVKNKSSSGRKEVHICAYCNSPIDSSPMWALNKAWHSYHLLCTQCHKPIDPNVGHVEKNEKVYCPSDFANLFLPKCRRCHLPVEREAVSASDGKLEGKWHVKCFNCHTCSKPFPDKSFYVFNNAPYCKRHYHKLNNSLCRNCDDAIEGPCAQTIEGWRYHPKCFVCFVSILIHYLLMIANYIKIKYSHTST
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.12
3 0.1
4 0.09
5 0.09
6 0.08
7 0.09
8 0.09
9 0.07
10 0.06
11 0.06
12 0.06
13 0.06
14 0.07
15 0.09
16 0.14
17 0.15
18 0.16
19 0.17
20 0.18
21 0.22
22 0.25
23 0.23
24 0.21
25 0.22
26 0.26
27 0.26
28 0.3
29 0.28
30 0.26
31 0.26
32 0.33
33 0.34
34 0.36
35 0.37
36 0.33
37 0.35
38 0.38
39 0.43
40 0.43
41 0.44
42 0.45
43 0.47
44 0.48
45 0.51
46 0.51
47 0.53
48 0.49
49 0.45
50 0.39
51 0.38
52 0.36
53 0.31
54 0.28
55 0.2
56 0.16
57 0.19
58 0.17
59 0.15
60 0.15
61 0.18
62 0.17
63 0.17
64 0.17
65 0.17
66 0.2
67 0.21
68 0.2
69 0.18
70 0.22
71 0.23
72 0.27
73 0.28
74 0.27
75 0.26
76 0.3
77 0.32
78 0.32
79 0.32
80 0.28
81 0.26
82 0.29
83 0.37
84 0.33
85 0.32
86 0.33
87 0.34
88 0.33
89 0.3
90 0.29
91 0.22
92 0.26
93 0.24
94 0.19
95 0.19
96 0.21
97 0.21
98 0.19
99 0.18
100 0.16
101 0.15
102 0.16
103 0.19
104 0.2
105 0.19
106 0.21
107 0.25
108 0.24
109 0.27
110 0.28
111 0.26
112 0.27
113 0.38
114 0.42
115 0.47
116 0.5
117 0.53
118 0.51
119 0.48
120 0.45
121 0.35
122 0.27
123 0.19
124 0.13
125 0.09
126 0.08
127 0.08
128 0.08
129 0.09
130 0.11
131 0.17
132 0.2
133 0.22
134 0.28
135 0.3
136 0.34
137 0.41
138 0.47
139 0.44
140 0.44
141 0.45
142 0.47
143 0.49
144 0.52
145 0.54
146 0.5
147 0.5
148 0.53
149 0.51
150 0.47
151 0.5
152 0.43
153 0.41
154 0.37
155 0.37
156 0.39
157 0.39
158 0.38
159 0.33
160 0.37
161 0.38
162 0.4
163 0.45
164 0.47
165 0.57
166 0.64
167 0.72
168 0.77
169 0.79
170 0.84
171 0.79
172 0.71
173 0.63
174 0.56
175 0.45
176 0.37
177 0.3
178 0.26
179 0.23
180 0.26
181 0.23
182 0.2
183 0.2
184 0.2
185 0.16
186 0.14
187 0.14
188 0.15
189 0.17
190 0.21
191 0.29
192 0.32
193 0.35
194 0.4
195 0.39
196 0.38
197 0.4
198 0.4
199 0.34
200 0.32
201 0.31
202 0.3
203 0.28
204 0.27
205 0.22
206 0.18
207 0.15
208 0.14
209 0.13
210 0.08
211 0.08
212 0.07
213 0.09
214 0.11
215 0.12
216 0.13
217 0.14
218 0.18