Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397VDR1

Protein Details
Accession A0A397VDR1    Localization Confidence High Confidence Score 18
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
73-142KLETLEKENTRKHRRSRSRSRSHSPKRRRSRSYSPHSSRRRNRSRSYSHERGRTRDRDRNRNRDRTRDSSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
80-138ENTRKHRRSRSRSRSHSPKRRRSRSYSPHSSRRRNRSRSYSHERGRTRDRDRNRNRDRT
Subcellular Location(s) nucl 25
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
IPR022967  S1_dom  
IPR003029  S1_domain  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00575  S1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50126  S1  
CDD cd05684  S1_DHX8_helicase  
Amino Acid Sequences MNPKYKNKEKETDASINGDITNNYSADEKARLFPSLALPDDPEAAIKHKEDVKVATEAMNQLEDLESLLRSKKLETLEKENTRKHRRSRSRSRSHSPKRRRSRSYSPHSSRRRNRSRSYSHERGRTRDRDRNRNRDRTRDSSRDQYRDRNGRDKKEDLDEKPILYKIYNGKVTKLKDFGAFVCLEGVKGRVEGMVHVSMLVTGSRVSHPSDVVSRNERVKVKVMSVAASRISLSMKDVDQETGRDLTPHLRVKTEDELLAEISRNPDRPFSFGKVPIIEDNDGPNSLKRLSSPERWELKQLIASGVLSASELSNYNEDQGQGLVEIMETEEELDIEIREDEPPFLRGQTKHTMQLSPIKVVKAPDGTLNRAALAGASLAKERRELRIKSD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.61
2 0.53
3 0.45
4 0.39
5 0.32
6 0.24
7 0.19
8 0.19
9 0.14
10 0.15
11 0.15
12 0.15
13 0.16
14 0.2
15 0.19
16 0.22
17 0.24
18 0.25
19 0.25
20 0.26
21 0.3
22 0.31
23 0.31
24 0.27
25 0.27
26 0.26
27 0.27
28 0.24
29 0.19
30 0.15
31 0.16
32 0.18
33 0.17
34 0.21
35 0.25
36 0.27
37 0.28
38 0.3
39 0.3
40 0.3
41 0.3
42 0.27
43 0.24
44 0.24
45 0.22
46 0.19
47 0.16
48 0.13
49 0.13
50 0.1
51 0.09
52 0.08
53 0.07
54 0.09
55 0.11
56 0.12
57 0.13
58 0.14
59 0.18
60 0.23
61 0.31
62 0.35
63 0.42
64 0.51
65 0.59
66 0.65
67 0.68
68 0.72
69 0.74
70 0.77
71 0.78
72 0.79
73 0.81
74 0.85
75 0.89
76 0.9
77 0.91
78 0.92
79 0.92
80 0.92
81 0.93
82 0.93
83 0.92
84 0.92
85 0.92
86 0.93
87 0.91
88 0.89
89 0.89
90 0.89
91 0.88
92 0.88
93 0.86
94 0.86
95 0.87
96 0.89
97 0.87
98 0.87
99 0.88
100 0.85
101 0.86
102 0.86
103 0.85
104 0.84
105 0.84
106 0.83
107 0.79
108 0.8
109 0.74
110 0.71
111 0.71
112 0.71
113 0.69
114 0.68
115 0.7
116 0.72
117 0.78
118 0.83
119 0.84
120 0.85
121 0.82
122 0.84
123 0.82
124 0.79
125 0.78
126 0.75
127 0.69
128 0.68
129 0.7
130 0.68
131 0.64
132 0.63
133 0.64
134 0.65
135 0.66
136 0.66
137 0.65
138 0.65
139 0.68
140 0.63
141 0.57
142 0.56
143 0.58
144 0.5
145 0.51
146 0.44
147 0.38
148 0.37
149 0.35
150 0.27
151 0.2
152 0.22
153 0.19
154 0.23
155 0.29
156 0.28
157 0.3
158 0.35
159 0.38
160 0.37
161 0.34
162 0.3
163 0.24
164 0.25
165 0.22
166 0.2
167 0.17
168 0.14
169 0.13
170 0.11
171 0.1
172 0.09
173 0.09
174 0.06
175 0.06
176 0.06
177 0.05
178 0.05
179 0.06
180 0.08
181 0.08
182 0.07
183 0.07
184 0.07
185 0.06
186 0.06
187 0.06
188 0.04
189 0.03
190 0.04
191 0.05
192 0.07
193 0.08
194 0.08
195 0.09
196 0.1
197 0.14
198 0.16
199 0.18
200 0.21
201 0.22
202 0.24
203 0.29
204 0.3
205 0.27
206 0.3
207 0.28
208 0.26
209 0.27
210 0.25
211 0.22
212 0.21
213 0.2
214 0.16
215 0.14
216 0.13
217 0.1
218 0.1
219 0.08
220 0.09
221 0.09
222 0.09
223 0.1
224 0.1
225 0.11
226 0.11
227 0.12
228 0.12
229 0.12
230 0.12
231 0.11
232 0.11
233 0.14
234 0.2
235 0.25
236 0.24
237 0.24
238 0.25
239 0.29
240 0.33
241 0.31
242 0.25
243 0.2
244 0.2
245 0.19
246 0.19
247 0.15
248 0.11
249 0.13
250 0.14
251 0.16
252 0.16
253 0.2
254 0.2
255 0.24
256 0.28
257 0.3
258 0.34
259 0.34
260 0.37
261 0.33
262 0.34
263 0.32
264 0.31
265 0.27
266 0.22
267 0.22
268 0.2
269 0.19
270 0.18
271 0.16
272 0.15
273 0.15
274 0.14
275 0.13
276 0.2
277 0.25
278 0.32
279 0.38
280 0.45
281 0.5
282 0.51
283 0.54
284 0.49
285 0.45
286 0.41
287 0.35
288 0.27
289 0.22
290 0.2
291 0.16
292 0.14
293 0.11
294 0.08
295 0.07
296 0.06
297 0.06
298 0.07
299 0.08
300 0.1
301 0.1
302 0.12
303 0.12
304 0.13
305 0.12
306 0.11
307 0.1
308 0.08
309 0.08
310 0.07
311 0.05
312 0.05
313 0.05
314 0.05
315 0.04
316 0.05
317 0.05
318 0.04
319 0.05
320 0.06
321 0.06
322 0.06
323 0.07
324 0.07
325 0.09
326 0.1
327 0.11
328 0.12
329 0.14
330 0.14
331 0.16
332 0.21
333 0.21
334 0.27
335 0.35
336 0.37
337 0.43
338 0.45
339 0.45
340 0.42
341 0.5
342 0.47
343 0.45
344 0.44
345 0.38
346 0.38
347 0.37
348 0.39
349 0.34
350 0.31
351 0.33
352 0.35
353 0.38
354 0.39
355 0.38
356 0.33
357 0.29
358 0.28
359 0.19
360 0.15
361 0.12
362 0.09
363 0.1
364 0.13
365 0.15
366 0.16
367 0.22
368 0.24
369 0.32
370 0.4