Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397ULH3

Protein Details
Accession A0A397ULH3    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
347-370YENWTSKRIRDWWYNKYRRPLLNTHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR033375  Cggbp1  
IPR000690  Matrin/U1-C_Znf_C2H2  
IPR003604  Matrin/U1-like-C_Znf_C2H2  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003690  F:double-stranded DNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50171  ZF_MATRIN  
Amino Acid Sequences MVSAAECRVETSEYKKNFYVDGQKLFCEFCQHVVNHTRKSIVDSHLKSEKHKANVNKAENLKSACQTTLDTANIKINDRELINIALVNAFTKADIPLYKIDKLKSFFLEYCKNGGAITSSNHLRVKYLPKIFDIEVSKLQNLVKDKQISITIDETTDACSRAVIHILFSFNNYTKLAKTKFITTVDSTSIAQLIIKTLQFQAENERISFIISEFTEERDSQPESHTLFAKTTQLTTARYRRMFNCYQSDIDKMNKLVAQIIHNSAGKVKIERDELDLISMKAAKRSKLEKEAVQTVIVNVEESRKLRISHKINPEEKEILLQLERYKNSPLLPKEFVNKLVEELSSYENWTSKRIRDWWYNKYRRPLLNT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.4
3 0.4
4 0.39
5 0.42
6 0.46
7 0.44
8 0.49
9 0.46
10 0.45
11 0.45
12 0.44
13 0.38
14 0.35
15 0.28
16 0.24
17 0.3
18 0.29
19 0.34
20 0.42
21 0.48
22 0.46
23 0.47
24 0.45
25 0.39
26 0.43
27 0.43
28 0.4
29 0.43
30 0.41
31 0.45
32 0.5
33 0.51
34 0.49
35 0.53
36 0.54
37 0.51
38 0.55
39 0.57
40 0.6
41 0.69
42 0.71
43 0.69
44 0.67
45 0.65
46 0.62
47 0.58
48 0.5
49 0.42
50 0.39
51 0.31
52 0.28
53 0.24
54 0.23
55 0.24
56 0.23
57 0.21
58 0.21
59 0.26
60 0.26
61 0.27
62 0.25
63 0.22
64 0.22
65 0.21
66 0.21
67 0.18
68 0.17
69 0.15
70 0.15
71 0.13
72 0.11
73 0.1
74 0.09
75 0.08
76 0.06
77 0.06
78 0.06
79 0.07
80 0.09
81 0.09
82 0.11
83 0.17
84 0.2
85 0.25
86 0.27
87 0.29
88 0.32
89 0.35
90 0.36
91 0.33
92 0.34
93 0.32
94 0.34
95 0.39
96 0.35
97 0.36
98 0.33
99 0.3
100 0.25
101 0.23
102 0.19
103 0.13
104 0.13
105 0.14
106 0.15
107 0.18
108 0.2
109 0.2
110 0.19
111 0.23
112 0.28
113 0.33
114 0.37
115 0.34
116 0.34
117 0.37
118 0.36
119 0.37
120 0.33
121 0.28
122 0.27
123 0.27
124 0.26
125 0.24
126 0.24
127 0.22
128 0.23
129 0.22
130 0.23
131 0.24
132 0.24
133 0.24
134 0.27
135 0.24
136 0.23
137 0.22
138 0.17
139 0.14
140 0.15
141 0.13
142 0.13
143 0.13
144 0.11
145 0.09
146 0.09
147 0.09
148 0.09
149 0.11
150 0.08
151 0.08
152 0.09
153 0.1
154 0.1
155 0.11
156 0.13
157 0.11
158 0.13
159 0.13
160 0.12
161 0.12
162 0.18
163 0.18
164 0.2
165 0.21
166 0.22
167 0.26
168 0.27
169 0.29
170 0.25
171 0.25
172 0.22
173 0.22
174 0.19
175 0.14
176 0.13
177 0.1
178 0.08
179 0.06
180 0.06
181 0.06
182 0.06
183 0.07
184 0.07
185 0.09
186 0.09
187 0.09
188 0.14
189 0.17
190 0.18
191 0.17
192 0.17
193 0.15
194 0.15
195 0.15
196 0.1
197 0.08
198 0.07
199 0.1
200 0.1
201 0.11
202 0.13
203 0.13
204 0.14
205 0.14
206 0.16
207 0.14
208 0.16
209 0.18
210 0.17
211 0.18
212 0.19
213 0.17
214 0.17
215 0.17
216 0.19
217 0.16
218 0.15
219 0.16
220 0.16
221 0.18
222 0.25
223 0.31
224 0.35
225 0.37
226 0.4
227 0.41
228 0.46
229 0.48
230 0.47
231 0.46
232 0.42
233 0.42
234 0.4
235 0.4
236 0.35
237 0.33
238 0.3
239 0.23
240 0.22
241 0.21
242 0.19
243 0.2
244 0.19
245 0.19
246 0.19
247 0.2
248 0.22
249 0.21
250 0.21
251 0.19
252 0.2
253 0.19
254 0.18
255 0.18
256 0.19
257 0.21
258 0.23
259 0.25
260 0.26
261 0.25
262 0.25
263 0.25
264 0.21
265 0.18
266 0.2
267 0.16
268 0.19
269 0.22
270 0.22
271 0.27
272 0.33
273 0.4
274 0.46
275 0.5
276 0.49
277 0.53
278 0.56
279 0.51
280 0.45
281 0.38
282 0.3
283 0.27
284 0.22
285 0.16
286 0.11
287 0.12
288 0.15
289 0.15
290 0.19
291 0.2
292 0.22
293 0.26
294 0.36
295 0.4
296 0.46
297 0.56
298 0.62
299 0.65
300 0.66
301 0.67
302 0.6
303 0.53
304 0.47
305 0.37
306 0.3
307 0.25
308 0.24
309 0.25
310 0.29
311 0.3
312 0.29
313 0.32
314 0.31
315 0.34
316 0.41
317 0.4
318 0.4
319 0.43
320 0.45
321 0.48
322 0.49
323 0.49
324 0.44
325 0.38
326 0.33
327 0.31
328 0.28
329 0.23
330 0.22
331 0.21
332 0.18
333 0.2
334 0.19
335 0.21
336 0.22
337 0.26
338 0.28
339 0.29
340 0.36
341 0.41
342 0.47
343 0.55
344 0.62
345 0.68
346 0.74
347 0.8
348 0.8
349 0.83
350 0.85