Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397VFA1

Protein Details
Accession A0A397VFA1    Localization Confidence High Confidence Score 15.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
171-228LDGDERTHEKKKKKKHKHDSDYDSERKRKHKHDREHRKSSADGEYKKKKRKKGKERYNBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
82-90RKLTKNHKK
179-226EKKKKKKHKHDSDYDSERKRKHKHDREHRKSSADGEYKKKKRKKGKER
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 14.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013942  Mediator_Med19_fun  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Amino Acid Sequences METSDLNNFFYYIKPQETSSNISQGTASDLSETNLNDFDLTAIYDRFVRPYKEKRVELDPTYFPYINKLPGKVKIIPDKSLRKLTKNHKKWGEKYPPEKYPLDAKTIEHNMLNLLKPGQIPGFNPAEFGLDDEKKSYSTSCSTSTHNNNSRSSTKSSSNSNLELASNTANLDGDERTHEKKKKKKHKHDSDYDSERKRKHKHDREHRKSSADGEYKKKKRKKGKERYN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.25
3 0.3
4 0.33
5 0.38
6 0.36
7 0.38
8 0.35
9 0.34
10 0.32
11 0.27
12 0.27
13 0.21
14 0.18
15 0.13
16 0.14
17 0.14
18 0.17
19 0.17
20 0.13
21 0.13
22 0.13
23 0.11
24 0.11
25 0.1
26 0.08
27 0.08
28 0.08
29 0.08
30 0.08
31 0.1
32 0.1
33 0.14
34 0.18
35 0.22
36 0.28
37 0.37
38 0.47
39 0.54
40 0.57
41 0.57
42 0.61
43 0.63
44 0.59
45 0.55
46 0.47
47 0.42
48 0.44
49 0.41
50 0.33
51 0.31
52 0.29
53 0.32
54 0.32
55 0.31
56 0.29
57 0.33
58 0.38
59 0.38
60 0.42
61 0.43
62 0.44
63 0.46
64 0.5
65 0.53
66 0.53
67 0.58
68 0.55
69 0.5
70 0.56
71 0.62
72 0.65
73 0.66
74 0.7
75 0.7
76 0.76
77 0.77
78 0.79
79 0.79
80 0.76
81 0.76
82 0.74
83 0.69
84 0.65
85 0.6
86 0.51
87 0.48
88 0.41
89 0.37
90 0.31
91 0.27
92 0.28
93 0.3
94 0.29
95 0.21
96 0.19
97 0.16
98 0.17
99 0.16
100 0.11
101 0.09
102 0.09
103 0.09
104 0.1
105 0.09
106 0.08
107 0.09
108 0.12
109 0.14
110 0.13
111 0.14
112 0.13
113 0.13
114 0.12
115 0.13
116 0.13
117 0.11
118 0.12
119 0.12
120 0.13
121 0.12
122 0.12
123 0.12
124 0.11
125 0.13
126 0.15
127 0.18
128 0.2
129 0.21
130 0.28
131 0.34
132 0.41
133 0.46
134 0.47
135 0.46
136 0.49
137 0.49
138 0.46
139 0.45
140 0.4
141 0.38
142 0.37
143 0.4
144 0.42
145 0.42
146 0.4
147 0.36
148 0.33
149 0.27
150 0.24
151 0.2
152 0.15
153 0.11
154 0.1
155 0.09
156 0.08
157 0.08
158 0.08
159 0.07
160 0.07
161 0.12
162 0.15
163 0.2
164 0.29
165 0.36
166 0.44
167 0.52
168 0.63
169 0.7
170 0.78
171 0.84
172 0.87
173 0.92
174 0.93
175 0.95
176 0.93
177 0.91
178 0.89
179 0.87
180 0.84
181 0.8
182 0.75
183 0.74
184 0.74
185 0.75
186 0.77
187 0.78
188 0.81
189 0.86
190 0.91
191 0.92
192 0.93
193 0.89
194 0.82
195 0.74
196 0.68
197 0.67
198 0.65
199 0.61
200 0.61
201 0.66
202 0.71
203 0.79
204 0.81
205 0.81
206 0.83
207 0.88
208 0.89