Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397VFB9

Protein Details
Accession A0A397VFB9    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
44-63GDKFKNGKGKKKPPNAFILFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
49-56NGKGKKKP
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 13, cyto 6.5, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF09011  HMG_box_2  
Amino Acid Sequences MSAMPPTKEFLFINECGKKQQSKTSPPKDLEIEFPPTFDFNELGDKFKNGKGKKKPPNAFILFRTKYNEALHRRGQFSPMKVVSGWARDAWNLLPLYQKQEYERFATRAASLYQEWALHSPTNHSQTNRIRNKRIRSANGYEASTTNRPSNMPVQEPPQSPPLLASPASPILSADESNNEAESPILQNLTGPIHAGIFHPVLIPVESVPYDLNANIYNNFFLYNIDDFGIFNPVNYDPEVIYDYNDVLSELSD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.37
3 0.39
4 0.45
5 0.46
6 0.44
7 0.52
8 0.53
9 0.58
10 0.68
11 0.73
12 0.77
13 0.73
14 0.74
15 0.68
16 0.61
17 0.55
18 0.49
19 0.46
20 0.37
21 0.35
22 0.31
23 0.27
24 0.26
25 0.22
26 0.18
27 0.11
28 0.2
29 0.2
30 0.22
31 0.22
32 0.24
33 0.25
34 0.28
35 0.36
36 0.32
37 0.41
38 0.49
39 0.59
40 0.67
41 0.76
42 0.8
43 0.76
44 0.82
45 0.78
46 0.72
47 0.66
48 0.66
49 0.57
50 0.52
51 0.51
52 0.42
53 0.4
54 0.39
55 0.43
56 0.39
57 0.43
58 0.48
59 0.48
60 0.5
61 0.47
62 0.49
63 0.45
64 0.41
65 0.43
66 0.36
67 0.32
68 0.28
69 0.3
70 0.26
71 0.24
72 0.22
73 0.15
74 0.15
75 0.14
76 0.15
77 0.14
78 0.15
79 0.13
80 0.12
81 0.15
82 0.15
83 0.2
84 0.21
85 0.22
86 0.2
87 0.24
88 0.26
89 0.26
90 0.29
91 0.25
92 0.24
93 0.24
94 0.22
95 0.19
96 0.18
97 0.16
98 0.13
99 0.13
100 0.12
101 0.12
102 0.12
103 0.11
104 0.12
105 0.1
106 0.1
107 0.12
108 0.15
109 0.2
110 0.21
111 0.21
112 0.28
113 0.34
114 0.45
115 0.51
116 0.52
117 0.56
118 0.61
119 0.67
120 0.68
121 0.69
122 0.64
123 0.62
124 0.61
125 0.6
126 0.56
127 0.49
128 0.41
129 0.34
130 0.32
131 0.27
132 0.23
133 0.17
134 0.15
135 0.15
136 0.17
137 0.22
138 0.21
139 0.22
140 0.23
141 0.26
142 0.31
143 0.32
144 0.31
145 0.29
146 0.26
147 0.23
148 0.22
149 0.2
150 0.16
151 0.15
152 0.14
153 0.12
154 0.14
155 0.15
156 0.14
157 0.12
158 0.12
159 0.13
160 0.12
161 0.1
162 0.1
163 0.11
164 0.12
165 0.12
166 0.1
167 0.09
168 0.08
169 0.09
170 0.09
171 0.08
172 0.08
173 0.07
174 0.08
175 0.09
176 0.1
177 0.09
178 0.08
179 0.08
180 0.08
181 0.09
182 0.09
183 0.11
184 0.1
185 0.1
186 0.09
187 0.1
188 0.1
189 0.1
190 0.1
191 0.07
192 0.09
193 0.09
194 0.09
195 0.09
196 0.09
197 0.1
198 0.09
199 0.11
200 0.11
201 0.13
202 0.14
203 0.15
204 0.14
205 0.13
206 0.14
207 0.12
208 0.11
209 0.13
210 0.13
211 0.13
212 0.13
213 0.13
214 0.13
215 0.13
216 0.18
217 0.14
218 0.12
219 0.14
220 0.14
221 0.16
222 0.17
223 0.17
224 0.12
225 0.15
226 0.18
227 0.16
228 0.16
229 0.16
230 0.16
231 0.15
232 0.15
233 0.13