Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397V1T3

Protein Details
Accession A0A397V1T3    Localization Confidence Low Confidence Score 9.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1108-1129TYQANSRRTNQRGRKLLQHQGGHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 11.5, cyto 5.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR003890  MIF4G-like_typ-3  
IPR039762  Nmd2/UPF2  
IPR007193  Upf2/Nmd2_C  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
Pfam View protein in Pfam  
PF02854  MIF4G  
PF04050  Upf2  
Amino Acid Sequences KNLDSNIKKNTGFIKKCKAQLSAEYQQQLLKDIKTLTLEKYISEVVVAVIEGVQKCKASADVWAAVEVISALHQRFPDTFTPFLTHTLARSLAPPNKQPVILNTEQREKEESSRILKQRVLLRIAGELWLIGVLRNVEDGVAALNSGGAAVGEGGVNGVKDNVAGFVSSPIKEVKEFKETKTSGEGFMYTVLKDLFSHDNKHVNLPLAVSFVKYFGTEMIGTRRNLREVGSSTTVNDENNTATNDDRDIGLDNENELTDSDSDPIVSASQRMLFKNLLVEYFKGVETRLIKEHQKIKALDRNNHESYITRGEIPEETKQNYEKAVKTFEKFLQNAQILADSLDIEMPDLPEDEGTTKIGGSIIRDGTLPNEKEDNITNSIWEDEDARSFYESLIDLKTLVPGVLLEAKTGKKDDTDADKDDHSHDKDDKDDKEEDDKLSEDNQSDDIKNKATQDTDNEISNKSGASAQLDSLLSRLPNMVNRDLIDQAAVDFCYLNSKASRKKLIKTLVGVPRTRLDLLPYYSRLIATLNPHYPDVATAVLQALEGEFKSLQKKKTLDFLETKIKNIRMLSKLSKLRITSFFIIFHCLKVVIDDFANQNIDIACNLLETCGRFLFKSPETNVRMGNMLDIMMRKKSVQHLDNRQLLMVENAYYQCNPPDRTATVKKERSVMEQYIRKLIYSDLNKKTVEKVLKLLRKLNWDDKEVYKVVEKCFTKIWKIKYSNIHLMAILASGLHRYHSDFGVALVDRVIEDIRIELEQNIFKHNQRRIATVKYLGELYNYRMVDSPVIFDTLYTIVTLGHEFGRPSPTRINPVDAPNDFFRIRLCCTLLDTCGMCFDRGSSKKRLDDFLVFFQMYILTKQKLSMDIEFMIADLFEMLRPNMVLYKTYEEAAEEVDQKLLLNQKAFQQAGGIAKNQDESLEESELSSSSDEEDDDGHEYLGSAVEGEGSDEEVIQADTDEIEGVEDDTELVVHTNRQDKISLEEDEEFEREFSRMMTESMESRKYERKPAMLDVAIPMHPKSVDKTADQIDGSVSFTLLVRKGNKQQTKTIEVPAESALAVNTRSKQEAEREEQQQLKKLVLNYEEREEQNQRIALEQTLMRSGMRVTYQANSRRTNQRGRKLLQHQGGGGSGSYA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.64
2 0.65
3 0.72
4 0.74
5 0.69
6 0.63
7 0.64
8 0.65
9 0.62
10 0.62
11 0.57
12 0.52
13 0.49
14 0.44
15 0.4
16 0.34
17 0.26
18 0.24
19 0.23
20 0.25
21 0.28
22 0.3
23 0.29
24 0.33
25 0.32
26 0.28
27 0.31
28 0.29
29 0.23
30 0.21
31 0.18
32 0.1
33 0.1
34 0.1
35 0.06
36 0.06
37 0.1
38 0.11
39 0.12
40 0.14
41 0.14
42 0.14
43 0.15
44 0.16
45 0.13
46 0.18
47 0.22
48 0.25
49 0.25
50 0.26
51 0.24
52 0.22
53 0.21
54 0.16
55 0.1
56 0.07
57 0.09
58 0.1
59 0.12
60 0.13
61 0.15
62 0.16
63 0.21
64 0.25
65 0.27
66 0.28
67 0.28
68 0.31
69 0.3
70 0.32
71 0.31
72 0.26
73 0.22
74 0.24
75 0.23
76 0.2
77 0.22
78 0.27
79 0.31
80 0.35
81 0.4
82 0.43
83 0.45
84 0.46
85 0.44
86 0.42
87 0.44
88 0.44
89 0.46
90 0.45
91 0.5
92 0.5
93 0.51
94 0.5
95 0.44
96 0.44
97 0.45
98 0.45
99 0.42
100 0.5
101 0.53
102 0.54
103 0.53
104 0.53
105 0.53
106 0.54
107 0.51
108 0.44
109 0.39
110 0.37
111 0.35
112 0.3
113 0.22
114 0.15
115 0.12
116 0.1
117 0.09
118 0.06
119 0.07
120 0.07
121 0.07
122 0.08
123 0.08
124 0.07
125 0.07
126 0.07
127 0.06
128 0.06
129 0.05
130 0.05
131 0.05
132 0.04
133 0.04
134 0.04
135 0.03
136 0.03
137 0.03
138 0.03
139 0.03
140 0.03
141 0.04
142 0.04
143 0.04
144 0.05
145 0.05
146 0.04
147 0.05
148 0.05
149 0.06
150 0.06
151 0.06
152 0.06
153 0.11
154 0.14
155 0.14
156 0.16
157 0.17
158 0.18
159 0.21
160 0.25
161 0.25
162 0.32
163 0.34
164 0.36
165 0.45
166 0.44
167 0.44
168 0.47
169 0.44
170 0.36
171 0.35
172 0.32
173 0.22
174 0.25
175 0.23
176 0.15
177 0.16
178 0.14
179 0.12
180 0.12
181 0.15
182 0.2
183 0.22
184 0.27
185 0.29
186 0.36
187 0.37
188 0.41
189 0.4
190 0.34
191 0.32
192 0.29
193 0.26
194 0.21
195 0.2
196 0.17
197 0.14
198 0.12
199 0.12
200 0.11
201 0.1
202 0.08
203 0.11
204 0.1
205 0.12
206 0.19
207 0.23
208 0.24
209 0.29
210 0.31
211 0.3
212 0.31
213 0.3
214 0.29
215 0.28
216 0.33
217 0.31
218 0.29
219 0.27
220 0.3
221 0.3
222 0.24
223 0.21
224 0.16
225 0.14
226 0.15
227 0.16
228 0.13
229 0.13
230 0.14
231 0.14
232 0.13
233 0.12
234 0.11
235 0.12
236 0.12
237 0.14
238 0.13
239 0.13
240 0.13
241 0.13
242 0.12
243 0.1
244 0.11
245 0.09
246 0.1
247 0.1
248 0.09
249 0.09
250 0.09
251 0.09
252 0.08
253 0.08
254 0.08
255 0.08
256 0.13
257 0.16
258 0.17
259 0.19
260 0.19
261 0.19
262 0.23
263 0.23
264 0.21
265 0.19
266 0.19
267 0.18
268 0.19
269 0.19
270 0.14
271 0.14
272 0.16
273 0.17
274 0.2
275 0.21
276 0.24
277 0.28
278 0.35
279 0.42
280 0.42
281 0.47
282 0.46
283 0.5
284 0.53
285 0.57
286 0.57
287 0.57
288 0.6
289 0.55
290 0.54
291 0.47
292 0.4
293 0.36
294 0.35
295 0.29
296 0.22
297 0.19
298 0.2
299 0.22
300 0.24
301 0.26
302 0.23
303 0.24
304 0.26
305 0.28
306 0.27
307 0.3
308 0.31
309 0.29
310 0.28
311 0.34
312 0.35
313 0.35
314 0.39
315 0.4
316 0.43
317 0.4
318 0.39
319 0.39
320 0.36
321 0.34
322 0.3
323 0.25
324 0.18
325 0.17
326 0.15
327 0.07
328 0.07
329 0.07
330 0.06
331 0.06
332 0.06
333 0.06
334 0.06
335 0.06
336 0.06
337 0.05
338 0.06
339 0.07
340 0.07
341 0.08
342 0.08
343 0.07
344 0.07
345 0.08
346 0.08
347 0.09
348 0.12
349 0.12
350 0.12
351 0.12
352 0.12
353 0.14
354 0.21
355 0.2
356 0.18
357 0.19
358 0.19
359 0.21
360 0.23
361 0.24
362 0.2
363 0.2
364 0.18
365 0.17
366 0.17
367 0.15
368 0.13
369 0.11
370 0.08
371 0.1
372 0.1
373 0.1
374 0.11
375 0.11
376 0.1
377 0.1
378 0.1
379 0.1
380 0.1
381 0.09
382 0.09
383 0.09
384 0.1
385 0.08
386 0.07
387 0.06
388 0.05
389 0.06
390 0.1
391 0.1
392 0.09
393 0.12
394 0.13
395 0.14
396 0.15
397 0.14
398 0.11
399 0.12
400 0.16
401 0.22
402 0.26
403 0.27
404 0.28
405 0.29
406 0.29
407 0.3
408 0.32
409 0.25
410 0.24
411 0.24
412 0.24
413 0.29
414 0.34
415 0.32
416 0.31
417 0.31
418 0.3
419 0.32
420 0.33
421 0.29
422 0.24
423 0.23
424 0.19
425 0.19
426 0.19
427 0.14
428 0.12
429 0.14
430 0.14
431 0.15
432 0.16
433 0.15
434 0.16
435 0.17
436 0.18
437 0.17
438 0.17
439 0.18
440 0.2
441 0.25
442 0.24
443 0.25
444 0.24
445 0.23
446 0.22
447 0.21
448 0.16
449 0.11
450 0.1
451 0.08
452 0.1
453 0.09
454 0.09
455 0.12
456 0.12
457 0.11
458 0.1
459 0.11
460 0.08
461 0.08
462 0.09
463 0.07
464 0.11
465 0.14
466 0.15
467 0.16
468 0.17
469 0.18
470 0.18
471 0.17
472 0.13
473 0.09
474 0.08
475 0.07
476 0.06
477 0.05
478 0.04
479 0.04
480 0.08
481 0.08
482 0.09
483 0.11
484 0.15
485 0.21
486 0.27
487 0.36
488 0.36
489 0.4
490 0.47
491 0.51
492 0.5
493 0.47
494 0.51
495 0.48
496 0.5
497 0.46
498 0.4
499 0.35
500 0.33
501 0.31
502 0.22
503 0.18
504 0.16
505 0.18
506 0.2
507 0.2
508 0.19
509 0.19
510 0.18
511 0.16
512 0.13
513 0.13
514 0.13
515 0.17
516 0.18
517 0.19
518 0.19
519 0.18
520 0.18
521 0.16
522 0.13
523 0.09
524 0.07
525 0.06
526 0.06
527 0.06
528 0.06
529 0.05
530 0.04
531 0.04
532 0.04
533 0.04
534 0.04
535 0.06
536 0.12
537 0.17
538 0.19
539 0.24
540 0.26
541 0.27
542 0.35
543 0.35
544 0.34
545 0.33
546 0.35
547 0.39
548 0.38
549 0.38
550 0.34
551 0.33
552 0.3
553 0.28
554 0.29
555 0.22
556 0.26
557 0.28
558 0.32
559 0.35
560 0.34
561 0.36
562 0.32
563 0.33
564 0.32
565 0.33
566 0.27
567 0.25
568 0.24
569 0.21
570 0.25
571 0.22
572 0.18
573 0.15
574 0.12
575 0.11
576 0.1
577 0.1
578 0.07
579 0.06
580 0.08
581 0.08
582 0.09
583 0.09
584 0.08
585 0.08
586 0.07
587 0.07
588 0.06
589 0.06
590 0.05
591 0.04
592 0.04
593 0.04
594 0.05
595 0.05
596 0.07
597 0.07
598 0.08
599 0.08
600 0.09
601 0.14
602 0.15
603 0.2
604 0.21
605 0.29
606 0.32
607 0.33
608 0.32
609 0.28
610 0.27
611 0.22
612 0.19
613 0.11
614 0.08
615 0.07
616 0.08
617 0.09
618 0.08
619 0.08
620 0.08
621 0.1
622 0.16
623 0.22
624 0.26
625 0.33
626 0.42
627 0.49
628 0.54
629 0.52
630 0.46
631 0.39
632 0.35
633 0.27
634 0.18
635 0.11
636 0.07
637 0.08
638 0.09
639 0.09
640 0.09
641 0.11
642 0.14
643 0.15
644 0.16
645 0.19
646 0.19
647 0.26
648 0.33
649 0.39
650 0.44
651 0.47
652 0.47
653 0.49
654 0.49
655 0.47
656 0.45
657 0.42
658 0.39
659 0.4
660 0.39
661 0.4
662 0.38
663 0.33
664 0.28
665 0.25
666 0.25
667 0.27
668 0.35
669 0.34
670 0.38
671 0.38
672 0.38
673 0.4
674 0.39
675 0.35
676 0.28
677 0.3
678 0.35
679 0.39
680 0.41
681 0.44
682 0.41
683 0.45
684 0.48
685 0.51
686 0.46
687 0.44
688 0.45
689 0.41
690 0.42
691 0.35
692 0.31
693 0.28
694 0.27
695 0.26
696 0.3
697 0.29
698 0.26
699 0.3
700 0.32
701 0.34
702 0.37
703 0.42
704 0.44
705 0.48
706 0.53
707 0.56
708 0.6
709 0.6
710 0.57
711 0.51
712 0.41
713 0.37
714 0.31
715 0.22
716 0.15
717 0.07
718 0.04
719 0.05
720 0.05
721 0.05
722 0.05
723 0.07
724 0.09
725 0.09
726 0.1
727 0.09
728 0.09
729 0.12
730 0.12
731 0.1
732 0.09
733 0.08
734 0.07
735 0.08
736 0.08
737 0.04
738 0.04
739 0.04
740 0.05
741 0.06
742 0.06
743 0.07
744 0.09
745 0.12
746 0.13
747 0.16
748 0.17
749 0.21
750 0.28
751 0.31
752 0.37
753 0.36
754 0.41
755 0.42
756 0.45
757 0.45
758 0.43
759 0.4
760 0.32
761 0.32
762 0.27
763 0.25
764 0.2
765 0.2
766 0.21
767 0.2
768 0.19
769 0.19
770 0.19
771 0.19
772 0.18
773 0.17
774 0.11
775 0.12
776 0.11
777 0.1
778 0.11
779 0.1
780 0.09
781 0.07
782 0.07
783 0.06
784 0.07
785 0.07
786 0.07
787 0.07
788 0.08
789 0.08
790 0.1
791 0.17
792 0.17
793 0.21
794 0.26
795 0.28
796 0.34
797 0.35
798 0.39
799 0.36
800 0.39
801 0.43
802 0.37
803 0.38
804 0.33
805 0.35
806 0.3
807 0.26
808 0.24
809 0.21
810 0.22
811 0.21
812 0.21
813 0.18
814 0.21
815 0.23
816 0.22
817 0.21
818 0.19
819 0.16
820 0.19
821 0.19
822 0.16
823 0.14
824 0.14
825 0.21
826 0.27
827 0.32
828 0.35
829 0.4
830 0.46
831 0.49
832 0.51
833 0.46
834 0.47
835 0.47
836 0.44
837 0.42
838 0.36
839 0.33
840 0.3
841 0.27
842 0.2
843 0.19
844 0.17
845 0.14
846 0.14
847 0.16
848 0.18
849 0.2
850 0.23
851 0.22
852 0.21
853 0.2
854 0.21
855 0.19
856 0.17
857 0.13
858 0.1
859 0.08
860 0.05
861 0.04
862 0.04
863 0.05
864 0.05
865 0.06
866 0.06
867 0.07
868 0.1
869 0.11
870 0.12
871 0.14
872 0.19
873 0.19
874 0.2
875 0.19
876 0.16
877 0.16
878 0.17
879 0.16
880 0.13
881 0.12
882 0.12
883 0.12
884 0.12
885 0.14
886 0.17
887 0.17
888 0.17
889 0.18
890 0.23
891 0.3
892 0.3
893 0.28
894 0.23
895 0.24
896 0.27
897 0.27
898 0.24
899 0.18
900 0.19
901 0.2
902 0.18
903 0.15
904 0.12
905 0.14
906 0.16
907 0.16
908 0.16
909 0.15
910 0.16
911 0.15
912 0.15
913 0.11
914 0.08
915 0.08
916 0.08
917 0.08
918 0.08
919 0.08
920 0.09
921 0.11
922 0.11
923 0.1
924 0.09
925 0.1
926 0.09
927 0.09
928 0.07
929 0.05
930 0.05
931 0.05
932 0.05
933 0.06
934 0.06
935 0.06
936 0.06
937 0.06
938 0.06
939 0.06
940 0.06
941 0.05
942 0.06
943 0.05
944 0.05
945 0.05
946 0.05
947 0.04
948 0.05
949 0.05
950 0.05
951 0.05
952 0.05
953 0.05
954 0.05
955 0.05
956 0.05
957 0.06
958 0.06
959 0.08
960 0.12
961 0.19
962 0.2
963 0.22
964 0.24
965 0.24
966 0.29
967 0.32
968 0.3
969 0.26
970 0.26
971 0.27
972 0.27
973 0.27
974 0.22
975 0.18
976 0.17
977 0.14
978 0.12
979 0.11
980 0.12
981 0.12
982 0.12
983 0.14
984 0.14
985 0.18
986 0.23
987 0.27
988 0.25
989 0.29
990 0.36
991 0.38
992 0.46
993 0.48
994 0.49
995 0.49
996 0.54
997 0.57
998 0.5
999 0.47
1000 0.4
1001 0.37
1002 0.32
1003 0.29
1004 0.24
1005 0.18
1006 0.18
1007 0.18
1008 0.2
1009 0.24
1010 0.26
1011 0.26
1012 0.31
1013 0.33
1014 0.36
1015 0.35
1016 0.31
1017 0.25
1018 0.23
1019 0.23
1020 0.17
1021 0.13
1022 0.1
1023 0.1
1024 0.13
1025 0.14
1026 0.18
1027 0.21
1028 0.28
1029 0.37
1030 0.47
1031 0.55
1032 0.56
1033 0.63
1034 0.65
1035 0.69
1036 0.65
1037 0.63
1038 0.58
1039 0.5
1040 0.48
1041 0.4
1042 0.33
1043 0.25
1044 0.21
1045 0.15
1046 0.11
1047 0.12
1048 0.14
1049 0.16
1050 0.18
1051 0.21
1052 0.22
1053 0.26
1054 0.34
1055 0.41
1056 0.45
1057 0.5
1058 0.52
1059 0.57
1060 0.62
1061 0.62
1062 0.61
1063 0.53
1064 0.49
1065 0.45
1066 0.43
1067 0.42
1068 0.41
1069 0.45
1070 0.41
1071 0.46
1072 0.48
1073 0.46
1074 0.49
1075 0.47
1076 0.44
1077 0.43
1078 0.42
1079 0.36
1080 0.33
1081 0.33
1082 0.28
1083 0.27
1084 0.26
1085 0.22
1086 0.22
1087 0.22
1088 0.19
1089 0.18
1090 0.18
1091 0.18
1092 0.18
1093 0.18
1094 0.18
1095 0.24
1096 0.32
1097 0.4
1098 0.46
1099 0.47
1100 0.53
1101 0.6
1102 0.66
1103 0.71
1104 0.72
1105 0.75
1106 0.78
1107 0.78
1108 0.81
1109 0.8
1110 0.82
1111 0.78
1112 0.72
1113 0.63
1114 0.56
1115 0.52
1116 0.42