Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397UE40

Protein Details
Accession A0A397UE40    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-29MLKTIKPKNARTKRILKKREPKVEENVKTHydrophilic
247-271YKIATKVPKTLKPKKVKNIDVNEIGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
6-22KPKNARTKRILKKREPK
Subcellular Location(s) nucl 17, mito_nucl 13.333, cyto_nucl 9.833, mito 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007109  Brix  
IPR039770  Rpf2  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:0000470  P:maturation of LSU-rRNA  
GO:0000027  P:ribosomal large subunit assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF04427  Brix  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50833  BRIX  
Amino Acid Sequences MLKTIKPKNARTKRILKKREPKVEENVKTAIFVRGSTTSQVVNDALSDLCRLRRTNSINFTKKNNVHPFDDDTSLNFYCSKNDASLFVIGSHSKKRPHNLVFGRMFDGQLLDMIEVGIEKAITMNEIKSQKCSVGMKPLFIFNGDLFETSQVHKTFKNMMLDFFRGQNLESINISGLEYVISITATGSIVDSDSTAPSTSDGKIFFRVYTIQMTKSGQKAPRVELEEMGPSYDFKLRRTKFANEEVYKIATKVPKTLKPKKVKNIDVNEIGDKVGHIHVGRQDLGKLQTRKMKGLKRMTEDDQTEDWSQRIEGVFLDIQHVEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.9
2 0.9
3 0.9
4 0.9
5 0.91
6 0.93
7 0.9
8 0.85
9 0.85
10 0.85
11 0.8
12 0.74
13 0.66
14 0.55
15 0.49
16 0.43
17 0.37
18 0.27
19 0.22
20 0.21
21 0.2
22 0.22
23 0.22
24 0.22
25 0.19
26 0.19
27 0.21
28 0.17
29 0.14
30 0.13
31 0.12
32 0.1
33 0.1
34 0.11
35 0.1
36 0.14
37 0.18
38 0.19
39 0.21
40 0.29
41 0.35
42 0.42
43 0.51
44 0.58
45 0.62
46 0.64
47 0.68
48 0.69
49 0.68
50 0.69
51 0.69
52 0.63
53 0.58
54 0.59
55 0.59
56 0.52
57 0.5
58 0.39
59 0.31
60 0.32
61 0.28
62 0.25
63 0.21
64 0.17
65 0.17
66 0.19
67 0.19
68 0.15
69 0.16
70 0.17
71 0.17
72 0.18
73 0.17
74 0.15
75 0.15
76 0.15
77 0.17
78 0.21
79 0.23
80 0.28
81 0.32
82 0.38
83 0.46
84 0.49
85 0.56
86 0.56
87 0.61
88 0.58
89 0.55
90 0.52
91 0.43
92 0.39
93 0.29
94 0.24
95 0.14
96 0.11
97 0.1
98 0.06
99 0.05
100 0.05
101 0.05
102 0.04
103 0.04
104 0.03
105 0.02
106 0.02
107 0.03
108 0.03
109 0.04
110 0.05
111 0.05
112 0.11
113 0.15
114 0.16
115 0.18
116 0.19
117 0.18
118 0.22
119 0.24
120 0.2
121 0.27
122 0.27
123 0.27
124 0.27
125 0.28
126 0.24
127 0.22
128 0.21
129 0.1
130 0.12
131 0.1
132 0.1
133 0.09
134 0.09
135 0.1
136 0.1
137 0.14
138 0.13
139 0.14
140 0.14
141 0.16
142 0.2
143 0.23
144 0.28
145 0.24
146 0.26
147 0.27
148 0.29
149 0.28
150 0.23
151 0.2
152 0.14
153 0.14
154 0.13
155 0.11
156 0.1
157 0.09
158 0.09
159 0.08
160 0.08
161 0.08
162 0.06
163 0.05
164 0.04
165 0.04
166 0.04
167 0.03
168 0.03
169 0.03
170 0.03
171 0.04
172 0.04
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.04
178 0.04
179 0.05
180 0.05
181 0.05
182 0.06
183 0.06
184 0.07
185 0.08
186 0.09
187 0.1
188 0.11
189 0.12
190 0.16
191 0.16
192 0.15
193 0.15
194 0.16
195 0.15
196 0.21
197 0.21
198 0.19
199 0.2
200 0.22
201 0.25
202 0.26
203 0.31
204 0.29
205 0.33
206 0.35
207 0.36
208 0.41
209 0.42
210 0.39
211 0.34
212 0.32
213 0.29
214 0.26
215 0.23
216 0.17
217 0.12
218 0.13
219 0.17
220 0.16
221 0.16
222 0.27
223 0.27
224 0.35
225 0.4
226 0.45
227 0.47
228 0.55
229 0.62
230 0.53
231 0.55
232 0.5
233 0.48
234 0.41
235 0.35
236 0.31
237 0.25
238 0.24
239 0.28
240 0.33
241 0.38
242 0.48
243 0.58
244 0.64
245 0.7
246 0.79
247 0.82
248 0.85
249 0.86
250 0.86
251 0.84
252 0.82
253 0.77
254 0.7
255 0.62
256 0.52
257 0.42
258 0.32
259 0.24
260 0.19
261 0.13
262 0.13
263 0.11
264 0.14
265 0.17
266 0.21
267 0.23
268 0.22
269 0.22
270 0.24
271 0.29
272 0.34
273 0.34
274 0.36
275 0.43
276 0.45
277 0.52
278 0.57
279 0.6
280 0.61
281 0.69
282 0.71
283 0.71
284 0.74
285 0.71
286 0.71
287 0.65
288 0.6
289 0.51
290 0.48
291 0.43
292 0.37
293 0.32
294 0.25
295 0.23
296 0.2
297 0.19
298 0.15
299 0.13
300 0.16
301 0.18
302 0.17
303 0.2