Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397W1M3

Protein Details
Accession A0A397W1M3    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
123-149KTTSALKIKKGAKKKYQNKSALKIKKEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
129-161KIKKGAKKKYQNKSALKIKKEVKEKYQNKSARK
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 14, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MEPKHTSVESSITEQKVTEFVKQVDLEELISLSNGVSRNNSRPTNQFKRPASRPGNIFSQFRSAVSKYATQKCIPGYKDQSMLLKVSSKLWEMTTEEHKDHFRKLAAEAERIHREKYPNYEFKTTSALKIKKGAKKKYQNKSALKIKKEVKEKYQNKSARKIEKETLQQEYFFAPNSDVFMTSGLEAPSQTHNELQQAYDFPFSPTYTSIFDDIDDTNIAIKNSASQQEFQPNDAIFDTIIPSFSALQQDFQTNITPSNSLLDTNMFITPPSYSALQQGFQTNDAISDISSMVYDFSLPRWNLPTDIRPCTYSTTSASSNLDYLFLSPGETNADFINLNPDNEGAVINDNFIRIKYSEPVVTIGSGSRVLNDISEFISVHSTISQKLSNTAYSEAEQLFSKLKERKNDIDNILYSQNVYAVGPDFQNDYSTPCIACWVAEPLNLSVMKQLSEVFDDKFDVVYYLVDIKGGNNNYGKDTNESVNRNGNISNLPNSDKTPTSKITKSFNTNKNIDNLREGDNDDDNDDDGGDYGGGDSDDYGSVNAKHKKIEISSDAKIESEDKKSQCFNITVHLWASIKLDSEFKDMNTLKFKIHLENCSTENLLSDQSHSLRDFACYYLESLDINVFPKEIMSKYNDKSPEPNNETSVLFDGLLSPPSFDGSPSPMLIDESSELNYRSFRINNESSESDEEFPIIMLKEEHTPFSSNNHMSISKTKENGKHIQMEVGMPQSIKMGFSHDTKDSQSSTATVKEWNMDFSFGSTNGVQWKYKFSGGDVFNIGEHRKSIRIDEPHRGHWRITNKVGGFCITITQVLGHTKKLNFFRKIASKEPELIKQYPKIVHKL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.29
3 0.3
4 0.3
5 0.29
6 0.28
7 0.28
8 0.34
9 0.35
10 0.35
11 0.31
12 0.3
13 0.25
14 0.2
15 0.19
16 0.12
17 0.11
18 0.1
19 0.07
20 0.1
21 0.1
22 0.11
23 0.16
24 0.22
25 0.29
26 0.37
27 0.41
28 0.42
29 0.5
30 0.59
31 0.63
32 0.67
33 0.7
34 0.7
35 0.76
36 0.78
37 0.8
38 0.77
39 0.75
40 0.7
41 0.65
42 0.66
43 0.61
44 0.57
45 0.49
46 0.48
47 0.41
48 0.38
49 0.39
50 0.31
51 0.31
52 0.32
53 0.37
54 0.38
55 0.46
56 0.5
57 0.45
58 0.48
59 0.5
60 0.54
61 0.49
62 0.5
63 0.49
64 0.49
65 0.51
66 0.5
67 0.49
68 0.44
69 0.42
70 0.35
71 0.32
72 0.28
73 0.28
74 0.28
75 0.25
76 0.25
77 0.24
78 0.26
79 0.23
80 0.28
81 0.32
82 0.34
83 0.33
84 0.35
85 0.4
86 0.4
87 0.41
88 0.41
89 0.36
90 0.33
91 0.34
92 0.4
93 0.37
94 0.4
95 0.4
96 0.42
97 0.48
98 0.47
99 0.47
100 0.43
101 0.44
102 0.44
103 0.49
104 0.52
105 0.52
106 0.56
107 0.61
108 0.57
109 0.54
110 0.57
111 0.49
112 0.46
113 0.47
114 0.45
115 0.41
116 0.49
117 0.56
118 0.56
119 0.64
120 0.68
121 0.68
122 0.76
123 0.83
124 0.86
125 0.87
126 0.89
127 0.88
128 0.87
129 0.87
130 0.85
131 0.79
132 0.77
133 0.75
134 0.72
135 0.73
136 0.7
137 0.7
138 0.72
139 0.75
140 0.75
141 0.77
142 0.77
143 0.74
144 0.77
145 0.76
146 0.75
147 0.73
148 0.72
149 0.68
150 0.68
151 0.71
152 0.65
153 0.64
154 0.55
155 0.49
156 0.44
157 0.4
158 0.33
159 0.25
160 0.21
161 0.14
162 0.13
163 0.15
164 0.14
165 0.12
166 0.12
167 0.12
168 0.11
169 0.11
170 0.12
171 0.1
172 0.1
173 0.09
174 0.11
175 0.14
176 0.16
177 0.16
178 0.16
179 0.17
180 0.2
181 0.21
182 0.19
183 0.18
184 0.17
185 0.18
186 0.18
187 0.17
188 0.15
189 0.17
190 0.16
191 0.15
192 0.15
193 0.16
194 0.16
195 0.17
196 0.17
197 0.15
198 0.15
199 0.15
200 0.15
201 0.14
202 0.12
203 0.1
204 0.11
205 0.12
206 0.12
207 0.1
208 0.1
209 0.11
210 0.14
211 0.19
212 0.18
213 0.18
214 0.22
215 0.3
216 0.31
217 0.3
218 0.3
219 0.25
220 0.25
221 0.24
222 0.21
223 0.12
224 0.12
225 0.12
226 0.08
227 0.09
228 0.07
229 0.07
230 0.08
231 0.09
232 0.13
233 0.12
234 0.14
235 0.14
236 0.16
237 0.16
238 0.16
239 0.18
240 0.14
241 0.15
242 0.15
243 0.14
244 0.13
245 0.14
246 0.14
247 0.11
248 0.11
249 0.1
250 0.1
251 0.11
252 0.12
253 0.09
254 0.09
255 0.09
256 0.08
257 0.08
258 0.09
259 0.09
260 0.09
261 0.13
262 0.15
263 0.15
264 0.17
265 0.19
266 0.18
267 0.18
268 0.18
269 0.13
270 0.12
271 0.12
272 0.1
273 0.07
274 0.07
275 0.06
276 0.06
277 0.06
278 0.05
279 0.05
280 0.05
281 0.06
282 0.05
283 0.06
284 0.13
285 0.13
286 0.14
287 0.17
288 0.18
289 0.2
290 0.22
291 0.29
292 0.28
293 0.32
294 0.32
295 0.3
296 0.31
297 0.33
298 0.32
299 0.26
300 0.23
301 0.22
302 0.22
303 0.23
304 0.23
305 0.19
306 0.18
307 0.16
308 0.14
309 0.11
310 0.1
311 0.09
312 0.07
313 0.08
314 0.07
315 0.07
316 0.09
317 0.09
318 0.09
319 0.08
320 0.09
321 0.08
322 0.08
323 0.15
324 0.13
325 0.13
326 0.13
327 0.13
328 0.12
329 0.12
330 0.12
331 0.06
332 0.07
333 0.07
334 0.07
335 0.08
336 0.08
337 0.08
338 0.07
339 0.09
340 0.07
341 0.09
342 0.1
343 0.12
344 0.12
345 0.13
346 0.15
347 0.13
348 0.13
349 0.11
350 0.1
351 0.09
352 0.09
353 0.08
354 0.07
355 0.08
356 0.07
357 0.07
358 0.07
359 0.07
360 0.06
361 0.07
362 0.07
363 0.06
364 0.07
365 0.07
366 0.07
367 0.08
368 0.08
369 0.08
370 0.1
371 0.11
372 0.1
373 0.13
374 0.14
375 0.14
376 0.15
377 0.15
378 0.14
379 0.14
380 0.16
381 0.13
382 0.12
383 0.11
384 0.11
385 0.11
386 0.1
387 0.15
388 0.19
389 0.22
390 0.28
391 0.33
392 0.37
393 0.4
394 0.46
395 0.42
396 0.4
397 0.37
398 0.34
399 0.29
400 0.23
401 0.19
402 0.13
403 0.11
404 0.07
405 0.07
406 0.05
407 0.05
408 0.06
409 0.06
410 0.06
411 0.07
412 0.07
413 0.08
414 0.08
415 0.09
416 0.1
417 0.1
418 0.1
419 0.08
420 0.1
421 0.09
422 0.08
423 0.07
424 0.09
425 0.09
426 0.1
427 0.11
428 0.1
429 0.13
430 0.13
431 0.12
432 0.1
433 0.1
434 0.1
435 0.09
436 0.1
437 0.08
438 0.1
439 0.11
440 0.1
441 0.1
442 0.1
443 0.1
444 0.09
445 0.09
446 0.07
447 0.06
448 0.06
449 0.06
450 0.06
451 0.06
452 0.06
453 0.06
454 0.06
455 0.1
456 0.11
457 0.13
458 0.14
459 0.15
460 0.17
461 0.18
462 0.19
463 0.17
464 0.18
465 0.19
466 0.23
467 0.24
468 0.24
469 0.28
470 0.28
471 0.26
472 0.24
473 0.22
474 0.19
475 0.18
476 0.19
477 0.16
478 0.17
479 0.18
480 0.19
481 0.2
482 0.19
483 0.21
484 0.22
485 0.24
486 0.27
487 0.3
488 0.32
489 0.36
490 0.39
491 0.45
492 0.5
493 0.53
494 0.55
495 0.54
496 0.52
497 0.52
498 0.51
499 0.44
500 0.38
501 0.32
502 0.29
503 0.28
504 0.27
505 0.22
506 0.2
507 0.2
508 0.17
509 0.15
510 0.11
511 0.1
512 0.09
513 0.07
514 0.05
515 0.05
516 0.04
517 0.04
518 0.03
519 0.03
520 0.03
521 0.03
522 0.03
523 0.04
524 0.04
525 0.04
526 0.05
527 0.05
528 0.08
529 0.15
530 0.21
531 0.21
532 0.22
533 0.24
534 0.27
535 0.28
536 0.31
537 0.31
538 0.31
539 0.32
540 0.32
541 0.31
542 0.27
543 0.26
544 0.24
545 0.21
546 0.21
547 0.25
548 0.24
549 0.27
550 0.29
551 0.3
552 0.31
553 0.3
554 0.25
555 0.25
556 0.25
557 0.23
558 0.22
559 0.23
560 0.2
561 0.18
562 0.19
563 0.14
564 0.13
565 0.13
566 0.15
567 0.13
568 0.18
569 0.17
570 0.16
571 0.24
572 0.24
573 0.27
574 0.3
575 0.3
576 0.26
577 0.3
578 0.31
579 0.31
580 0.34
581 0.35
582 0.34
583 0.36
584 0.37
585 0.34
586 0.33
587 0.25
588 0.22
589 0.18
590 0.16
591 0.13
592 0.14
593 0.14
594 0.15
595 0.18
596 0.17
597 0.17
598 0.15
599 0.17
600 0.16
601 0.14
602 0.15
603 0.12
604 0.13
605 0.12
606 0.12
607 0.1
608 0.1
609 0.1
610 0.1
611 0.1
612 0.1
613 0.09
614 0.08
615 0.09
616 0.1
617 0.1
618 0.12
619 0.16
620 0.23
621 0.25
622 0.32
623 0.35
624 0.35
625 0.4
626 0.43
627 0.48
628 0.47
629 0.48
630 0.44
631 0.43
632 0.41
633 0.37
634 0.33
635 0.23
636 0.16
637 0.14
638 0.13
639 0.11
640 0.13
641 0.12
642 0.1
643 0.09
644 0.11
645 0.11
646 0.1
647 0.11
648 0.12
649 0.14
650 0.14
651 0.15
652 0.13
653 0.15
654 0.14
655 0.14
656 0.11
657 0.1
658 0.12
659 0.13
660 0.13
661 0.13
662 0.14
663 0.14
664 0.17
665 0.18
666 0.19
667 0.26
668 0.29
669 0.31
670 0.36
671 0.36
672 0.35
673 0.37
674 0.37
675 0.3
676 0.26
677 0.24
678 0.18
679 0.17
680 0.15
681 0.11
682 0.09
683 0.08
684 0.09
685 0.16
686 0.17
687 0.19
688 0.19
689 0.21
690 0.21
691 0.25
692 0.32
693 0.27
694 0.27
695 0.29
696 0.28
697 0.28
698 0.35
699 0.38
700 0.36
701 0.39
702 0.44
703 0.47
704 0.53
705 0.59
706 0.57
707 0.57
708 0.52
709 0.51
710 0.45
711 0.4
712 0.35
713 0.3
714 0.25
715 0.18
716 0.17
717 0.15
718 0.14
719 0.14
720 0.12
721 0.13
722 0.15
723 0.18
724 0.22
725 0.23
726 0.25
727 0.27
728 0.31
729 0.28
730 0.27
731 0.25
732 0.23
733 0.23
734 0.23
735 0.22
736 0.21
737 0.21
738 0.24
739 0.24
740 0.26
741 0.24
742 0.23
743 0.22
744 0.21
745 0.22
746 0.18
747 0.2
748 0.16
749 0.17
750 0.22
751 0.25
752 0.25
753 0.23
754 0.3
755 0.3
756 0.33
757 0.32
758 0.28
759 0.34
760 0.33
761 0.36
762 0.32
763 0.29
764 0.27
765 0.29
766 0.28
767 0.21
768 0.21
769 0.19
770 0.21
771 0.22
772 0.27
773 0.32
774 0.41
775 0.46
776 0.55
777 0.58
778 0.63
779 0.7
780 0.67
781 0.6
782 0.58
783 0.6
784 0.58
785 0.58
786 0.57
787 0.52
788 0.53
789 0.52
790 0.47
791 0.39
792 0.31
793 0.28
794 0.2
795 0.18
796 0.14
797 0.13
798 0.14
799 0.21
800 0.22
801 0.24
802 0.29
803 0.31
804 0.39
805 0.48
806 0.54
807 0.52
808 0.54
809 0.6
810 0.63
811 0.67
812 0.68
813 0.65
814 0.6
815 0.62
816 0.64
817 0.63
818 0.59
819 0.58
820 0.56
821 0.55
822 0.57
823 0.56