Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397UPU5

Protein Details
Accession A0A397UPU5    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
183-208LKCSFNPQQKRGPKPRKKTRLDMSNWHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
192-200KRGPKPRKK
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 14, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
IPR036864  Zn2-C6_fun-type_DNA-bd_sf  
IPR001138  Zn2Cys6_DnaBD  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0000981  F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PF00172  Zn_clus  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
PS50048  ZN2_CY6_FUNGAL_2  
CDD cd00067  GAL4  
Amino Acid Sequences MVLYHADQFVDDHFFSEGLQLPTDFNSESYTMGIVTTSFDCEFGNMDASAETTPMLIQDPYQQPSYIKPSFPPIIDIDDLVKPKVTKPSRPPNAFLIYRKAYIKELQSRGINLGMTQISPMVSESWKQEPEIVKQEYKKLAKAAENRANKIKSSQACSNCQKSKVKCNYLGNDPCKRCIERELKCSFNPQQKRGPKPRKKTRLDMSNWAAFQRLDQDYTQKALKLGFGVRRIVECSNNLGTLIPNCNTTLPMDVHPSPLPISSSDCETSNSSVSIWTDNYQLNQWNNGTEIDPTLLSLYPNFHF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.14
3 0.17
4 0.2
5 0.16
6 0.17
7 0.17
8 0.17
9 0.18
10 0.2
11 0.18
12 0.13
13 0.14
14 0.14
15 0.14
16 0.14
17 0.13
18 0.11
19 0.1
20 0.1
21 0.07
22 0.09
23 0.09
24 0.11
25 0.11
26 0.11
27 0.11
28 0.12
29 0.13
30 0.12
31 0.13
32 0.1
33 0.1
34 0.1
35 0.11
36 0.11
37 0.09
38 0.08
39 0.06
40 0.06
41 0.06
42 0.07
43 0.06
44 0.07
45 0.15
46 0.2
47 0.22
48 0.24
49 0.24
50 0.23
51 0.28
52 0.36
53 0.31
54 0.27
55 0.26
56 0.31
57 0.34
58 0.33
59 0.32
60 0.25
61 0.26
62 0.26
63 0.25
64 0.21
65 0.21
66 0.22
67 0.19
68 0.19
69 0.15
70 0.17
71 0.27
72 0.29
73 0.34
74 0.43
75 0.54
76 0.62
77 0.65
78 0.66
79 0.62
80 0.65
81 0.6
82 0.53
83 0.5
84 0.42
85 0.41
86 0.39
87 0.35
88 0.3
89 0.29
90 0.34
91 0.35
92 0.35
93 0.37
94 0.37
95 0.36
96 0.35
97 0.32
98 0.25
99 0.16
100 0.16
101 0.11
102 0.1
103 0.09
104 0.08
105 0.07
106 0.07
107 0.07
108 0.06
109 0.06
110 0.08
111 0.11
112 0.14
113 0.15
114 0.15
115 0.19
116 0.2
117 0.24
118 0.3
119 0.3
120 0.3
121 0.31
122 0.35
123 0.38
124 0.37
125 0.35
126 0.29
127 0.3
128 0.32
129 0.38
130 0.42
131 0.44
132 0.46
133 0.47
134 0.51
135 0.48
136 0.42
137 0.37
138 0.34
139 0.28
140 0.3
141 0.34
142 0.33
143 0.39
144 0.44
145 0.5
146 0.47
147 0.5
148 0.51
149 0.47
150 0.54
151 0.56
152 0.57
153 0.56
154 0.59
155 0.58
156 0.6
157 0.64
158 0.6
159 0.6
160 0.55
161 0.51
162 0.48
163 0.46
164 0.38
165 0.39
166 0.42
167 0.39
168 0.47
169 0.48
170 0.48
171 0.48
172 0.53
173 0.5
174 0.51
175 0.52
176 0.48
177 0.53
178 0.57
179 0.66
180 0.71
181 0.76
182 0.77
183 0.81
184 0.87
185 0.88
186 0.87
187 0.87
188 0.85
189 0.84
190 0.8
191 0.77
192 0.72
193 0.66
194 0.59
195 0.5
196 0.41
197 0.31
198 0.26
199 0.23
200 0.19
201 0.16
202 0.16
203 0.2
204 0.2
205 0.23
206 0.24
207 0.19
208 0.18
209 0.17
210 0.17
211 0.16
212 0.2
213 0.22
214 0.24
215 0.25
216 0.25
217 0.26
218 0.28
219 0.27
220 0.25
221 0.22
222 0.24
223 0.23
224 0.22
225 0.21
226 0.18
227 0.17
228 0.18
229 0.2
230 0.16
231 0.15
232 0.16
233 0.16
234 0.17
235 0.16
236 0.17
237 0.16
238 0.17
239 0.22
240 0.22
241 0.25
242 0.25
243 0.25
244 0.22
245 0.21
246 0.2
247 0.16
248 0.2
249 0.18
250 0.22
251 0.22
252 0.22
253 0.23
254 0.25
255 0.26
256 0.23
257 0.22
258 0.17
259 0.18
260 0.18
261 0.18
262 0.18
263 0.16
264 0.19
265 0.2
266 0.22
267 0.23
268 0.28
269 0.28
270 0.31
271 0.31
272 0.28
273 0.28
274 0.27
275 0.25
276 0.19
277 0.19
278 0.16
279 0.14
280 0.14
281 0.14
282 0.13
283 0.13
284 0.13