Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397W6M2

Protein Details
Accession A0A397W6M2    Localization Confidence Medium Confidence Score 14
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
280-304EKVREREDIRQERRKEREREYRLSRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
240-246KEWKERR
Subcellular Location(s) nucl 15, mito 6, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017862  SKI-int_prot_SKIP  
IPR004015  SKI-int_prot_SKIP_SNW-dom  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF02731  SKIP_SNW  
Amino Acid Sequences MATLAGRQLLNSEQQNQFERKFDKLIVTKQKELPLPYGKRVGWKPKSLDDFGDGGAFPEIPIAHKYSDRATKKPFFPQGPSGGALSLQVDAEGNIKYDAIARQGHTESRIVHSQFKDLVPVNQRSDIEQINLDRPNEDEVKETTEKAREALEKIYKAHRHHQHLYYILLPVRYQLRNNKNRSFLRVYPWKNAKGYTIPLDKRLAADGRGLQEHFFTADRHAREEVRQRALMRVKLAQKEKEWKERRLRMLAQKAREERAGISSTTLNAFESESDSESEEEKVREREDIRQERRKEREREYRLSRMGAEQRAKYLAREQNRDISEKIALGLAKPTLSKDSLYDSRLFNQSEGLSSGFKDDEEVYLIGWEGEPQPVSLSTGTSRGTVPGFR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.43
3 0.45
4 0.45
5 0.46
6 0.45
7 0.43
8 0.43
9 0.4
10 0.43
11 0.45
12 0.53
13 0.56
14 0.6
15 0.63
16 0.64
17 0.68
18 0.64
19 0.6
20 0.58
21 0.57
22 0.56
23 0.54
24 0.56
25 0.51
26 0.55
27 0.6
28 0.63
29 0.61
30 0.63
31 0.63
32 0.64
33 0.7
34 0.64
35 0.58
36 0.51
37 0.45
38 0.37
39 0.33
40 0.25
41 0.18
42 0.16
43 0.14
44 0.1
45 0.1
46 0.09
47 0.09
48 0.11
49 0.13
50 0.14
51 0.16
52 0.18
53 0.23
54 0.33
55 0.36
56 0.4
57 0.47
58 0.53
59 0.56
60 0.64
61 0.66
62 0.61
63 0.62
64 0.62
65 0.59
66 0.53
67 0.5
68 0.41
69 0.32
70 0.27
71 0.22
72 0.16
73 0.11
74 0.08
75 0.06
76 0.06
77 0.06
78 0.08
79 0.07
80 0.08
81 0.07
82 0.07
83 0.07
84 0.1
85 0.1
86 0.13
87 0.15
88 0.15
89 0.19
90 0.21
91 0.22
92 0.22
93 0.23
94 0.21
95 0.23
96 0.28
97 0.26
98 0.31
99 0.3
100 0.31
101 0.32
102 0.3
103 0.31
104 0.26
105 0.3
106 0.3
107 0.34
108 0.33
109 0.34
110 0.34
111 0.31
112 0.33
113 0.28
114 0.23
115 0.21
116 0.2
117 0.21
118 0.23
119 0.22
120 0.19
121 0.18
122 0.21
123 0.2
124 0.19
125 0.17
126 0.15
127 0.21
128 0.22
129 0.22
130 0.21
131 0.22
132 0.22
133 0.2
134 0.22
135 0.18
136 0.19
137 0.24
138 0.27
139 0.25
140 0.27
141 0.34
142 0.37
143 0.38
144 0.45
145 0.47
146 0.5
147 0.55
148 0.57
149 0.53
150 0.49
151 0.47
152 0.39
153 0.34
154 0.27
155 0.21
156 0.17
157 0.14
158 0.17
159 0.17
160 0.19
161 0.26
162 0.36
163 0.44
164 0.51
165 0.55
166 0.58
167 0.59
168 0.62
169 0.59
170 0.51
171 0.5
172 0.52
173 0.5
174 0.5
175 0.54
176 0.51
177 0.45
178 0.44
179 0.38
180 0.32
181 0.31
182 0.28
183 0.3
184 0.27
185 0.29
186 0.29
187 0.27
188 0.25
189 0.25
190 0.21
191 0.14
192 0.15
193 0.14
194 0.14
195 0.15
196 0.15
197 0.13
198 0.12
199 0.11
200 0.11
201 0.09
202 0.08
203 0.11
204 0.16
205 0.16
206 0.18
207 0.2
208 0.2
209 0.23
210 0.32
211 0.34
212 0.34
213 0.36
214 0.34
215 0.39
216 0.43
217 0.4
218 0.34
219 0.33
220 0.35
221 0.39
222 0.43
223 0.4
224 0.4
225 0.48
226 0.52
227 0.57
228 0.58
229 0.6
230 0.65
231 0.69
232 0.71
233 0.69
234 0.7
235 0.69
236 0.73
237 0.7
238 0.65
239 0.65
240 0.62
241 0.57
242 0.51
243 0.42
244 0.32
245 0.31
246 0.27
247 0.2
248 0.18
249 0.16
250 0.16
251 0.16
252 0.15
253 0.11
254 0.09
255 0.09
256 0.08
257 0.1
258 0.1
259 0.1
260 0.11
261 0.12
262 0.12
263 0.13
264 0.14
265 0.14
266 0.14
267 0.16
268 0.17
269 0.17
270 0.21
271 0.22
272 0.29
273 0.37
274 0.47
275 0.53
276 0.6
277 0.66
278 0.71
279 0.79
280 0.8
281 0.78
282 0.77
283 0.79
284 0.78
285 0.81
286 0.79
287 0.79
288 0.72
289 0.67
290 0.58
291 0.54
292 0.53
293 0.51
294 0.49
295 0.41
296 0.4
297 0.42
298 0.42
299 0.36
300 0.38
301 0.37
302 0.4
303 0.45
304 0.46
305 0.5
306 0.52
307 0.54
308 0.45
309 0.4
310 0.34
311 0.28
312 0.25
313 0.19
314 0.17
315 0.14
316 0.16
317 0.14
318 0.13
319 0.13
320 0.15
321 0.16
322 0.17
323 0.17
324 0.17
325 0.24
326 0.27
327 0.3
328 0.32
329 0.31
330 0.34
331 0.39
332 0.38
333 0.31
334 0.3
335 0.27
336 0.25
337 0.25
338 0.22
339 0.17
340 0.16
341 0.19
342 0.15
343 0.14
344 0.14
345 0.13
346 0.13
347 0.15
348 0.15
349 0.13
350 0.13
351 0.13
352 0.11
353 0.1
354 0.11
355 0.08
356 0.11
357 0.11
358 0.11
359 0.13
360 0.13
361 0.16
362 0.14
363 0.16
364 0.15
365 0.19
366 0.19
367 0.19
368 0.19
369 0.19