Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397TVB8

Protein Details
Accession A0A397TVB8    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
98-119TMNNKFRRPSPKPELPKEKARNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
103-143FRRPSPKPELPKEKARNLQRSFRRPSPKTNRFSEFRRPSPK
Subcellular Location(s) nucl 15, mito_nucl 13.333, mito 10.5, cyto_nucl 8.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039024  RTC4  
IPR028094  RTC4_C  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF14474  RTC4  
Amino Acid Sequences MSRPLLFQKRGKRTLVVASRYNSINSIKASSKKNLSSKENISPEPFKPSNSLSSSLTHKFANLKLDMHSDSDCEVIEINSVDKSQKVTRDPFSKNTYTMNNKFRRPSPKPELPKEKARNLQRSFRRPSPKTNRFSEFRRPSPKSNKFSEFRRSSQNIRASSPQFIDLTKDYQETTPKKYRNGFRAPSPTKGRYINLPKLDLLSDEGTPEPNDMHRNRKDSADLKKKCPYCNETLPDPLPPRIRAYLESPSKMPSSSLIAGHSSNIVDQFEFCRLHDAESHIVPDGLQKNYPLVIDFNILPNRIKTLFPELLEVATGKIKSLFRDLAMDAYNELGKARARKPTVVMGRFQKFLPGYYGSKGSSVIFSTLVSLFIESKRLTLDMTKPQEPLEYLNQVLVPETAIRLIAQDRGGITLREARKIMEDSREFGMYVHDVEEEDI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.65
2 0.66
3 0.62
4 0.58
5 0.54
6 0.54
7 0.52
8 0.48
9 0.41
10 0.34
11 0.31
12 0.27
13 0.29
14 0.31
15 0.36
16 0.41
17 0.45
18 0.5
19 0.55
20 0.6
21 0.64
22 0.65
23 0.66
24 0.67
25 0.7
26 0.68
27 0.63
28 0.61
29 0.58
30 0.53
31 0.53
32 0.48
33 0.4
34 0.38
35 0.38
36 0.4
37 0.38
38 0.4
39 0.32
40 0.35
41 0.39
42 0.39
43 0.37
44 0.3
45 0.28
46 0.29
47 0.31
48 0.34
49 0.3
50 0.28
51 0.28
52 0.33
53 0.32
54 0.3
55 0.27
56 0.21
57 0.19
58 0.19
59 0.16
60 0.12
61 0.11
62 0.08
63 0.09
64 0.09
65 0.09
66 0.09
67 0.1
68 0.1
69 0.11
70 0.15
71 0.18
72 0.24
73 0.29
74 0.35
75 0.42
76 0.5
77 0.54
78 0.57
79 0.6
80 0.57
81 0.52
82 0.51
83 0.51
84 0.52
85 0.55
86 0.58
87 0.58
88 0.6
89 0.63
90 0.66
91 0.68
92 0.66
93 0.68
94 0.67
95 0.71
96 0.75
97 0.8
98 0.83
99 0.78
100 0.83
101 0.8
102 0.79
103 0.77
104 0.77
105 0.77
106 0.71
107 0.75
108 0.74
109 0.76
110 0.75
111 0.75
112 0.76
113 0.69
114 0.75
115 0.77
116 0.77
117 0.74
118 0.74
119 0.71
120 0.65
121 0.68
122 0.68
123 0.65
124 0.64
125 0.67
126 0.65
127 0.68
128 0.75
129 0.79
130 0.74
131 0.73
132 0.72
133 0.66
134 0.67
135 0.68
136 0.63
137 0.56
138 0.59
139 0.56
140 0.53
141 0.57
142 0.58
143 0.5
144 0.47
145 0.5
146 0.43
147 0.42
148 0.38
149 0.31
150 0.25
151 0.22
152 0.23
153 0.18
154 0.18
155 0.16
156 0.16
157 0.15
158 0.16
159 0.24
160 0.24
161 0.3
162 0.36
163 0.38
164 0.43
165 0.5
166 0.54
167 0.56
168 0.62
169 0.57
170 0.56
171 0.63
172 0.61
173 0.61
174 0.61
175 0.54
176 0.49
177 0.48
178 0.42
179 0.4
180 0.46
181 0.45
182 0.41
183 0.4
184 0.37
185 0.35
186 0.34
187 0.26
188 0.2
189 0.14
190 0.11
191 0.1
192 0.1
193 0.1
194 0.1
195 0.1
196 0.07
197 0.08
198 0.14
199 0.15
200 0.24
201 0.28
202 0.31
203 0.32
204 0.33
205 0.37
206 0.37
207 0.45
208 0.47
209 0.47
210 0.48
211 0.54
212 0.56
213 0.54
214 0.54
215 0.5
216 0.45
217 0.5
218 0.48
219 0.44
220 0.45
221 0.42
222 0.4
223 0.37
224 0.34
225 0.29
226 0.26
227 0.26
228 0.24
229 0.25
230 0.22
231 0.25
232 0.29
233 0.3
234 0.31
235 0.28
236 0.28
237 0.27
238 0.26
239 0.22
240 0.14
241 0.15
242 0.15
243 0.15
244 0.14
245 0.15
246 0.15
247 0.15
248 0.15
249 0.1
250 0.09
251 0.09
252 0.08
253 0.06
254 0.07
255 0.08
256 0.11
257 0.12
258 0.11
259 0.16
260 0.16
261 0.17
262 0.19
263 0.21
264 0.2
265 0.2
266 0.2
267 0.15
268 0.15
269 0.13
270 0.17
271 0.17
272 0.16
273 0.16
274 0.15
275 0.16
276 0.17
277 0.17
278 0.13
279 0.1
280 0.1
281 0.11
282 0.11
283 0.15
284 0.17
285 0.18
286 0.17
287 0.17
288 0.19
289 0.19
290 0.18
291 0.16
292 0.22
293 0.24
294 0.24
295 0.27
296 0.24
297 0.22
298 0.22
299 0.2
300 0.13
301 0.12
302 0.12
303 0.09
304 0.13
305 0.14
306 0.15
307 0.2
308 0.21
309 0.19
310 0.22
311 0.22
312 0.21
313 0.21
314 0.2
315 0.15
316 0.15
317 0.14
318 0.11
319 0.1
320 0.09
321 0.11
322 0.17
323 0.2
324 0.28
325 0.3
326 0.33
327 0.36
328 0.44
329 0.51
330 0.47
331 0.5
332 0.5
333 0.51
334 0.5
335 0.46
336 0.43
337 0.34
338 0.32
339 0.31
340 0.27
341 0.26
342 0.27
343 0.3
344 0.25
345 0.25
346 0.24
347 0.21
348 0.18
349 0.17
350 0.15
351 0.13
352 0.12
353 0.14
354 0.13
355 0.13
356 0.11
357 0.11
358 0.11
359 0.11
360 0.16
361 0.14
362 0.14
363 0.15
364 0.15
365 0.15
366 0.19
367 0.25
368 0.3
369 0.37
370 0.39
371 0.38
372 0.39
373 0.4
374 0.36
375 0.35
376 0.31
377 0.29
378 0.26
379 0.27
380 0.27
381 0.24
382 0.24
383 0.19
384 0.13
385 0.1
386 0.1
387 0.09
388 0.09
389 0.09
390 0.1
391 0.11
392 0.14
393 0.14
394 0.15
395 0.15
396 0.18
397 0.19
398 0.18
399 0.19
400 0.24
401 0.26
402 0.29
403 0.29
404 0.27
405 0.31
406 0.35
407 0.37
408 0.38
409 0.38
410 0.37
411 0.4
412 0.39
413 0.34
414 0.3
415 0.29
416 0.21
417 0.19
418 0.17
419 0.14