Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397V5V3

Protein Details
Accession A0A397V5V3    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
128-156SKIHELASRKQKRKKKQKKHPLANFKLTTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
129-148KIHELASRKQKRKKKQKKHP
Subcellular Location(s) nucl 19.5, mito_nucl 12.666, cyto_nucl 12.333, mito 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
Amino Acid Sequences MSRQFTTHVTSSRRYPTPNFSTFTPPINLPFPPNIKAADIVDRRNSKQLTMKSPNAFFIYRKAFLDHLSATYQDLKMTDVSKLVGICWRNEPEIVKDEYRKLSREVEIELNNKRQKNVSFRRVVWKNSKIHELASRKQKRKKKQKKHPLANFKLTTPDYSAQQYIFYEFIPNPSDSTSESTSDSTSGPTTDTTPMASPTTEDTSPFFTNSIVDIAYEATDNDVGHKYNRIHEDSEISPVVECVDPGTDIYNTMDVNSFYEFYNVISQTNFYEFTE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.51
3 0.54
4 0.57
5 0.59
6 0.55
7 0.5
8 0.54
9 0.51
10 0.5
11 0.43
12 0.36
13 0.34
14 0.34
15 0.32
16 0.27
17 0.32
18 0.32
19 0.31
20 0.32
21 0.3
22 0.28
23 0.29
24 0.27
25 0.3
26 0.3
27 0.32
28 0.38
29 0.41
30 0.42
31 0.48
32 0.46
33 0.41
34 0.45
35 0.48
36 0.5
37 0.53
38 0.58
39 0.56
40 0.57
41 0.56
42 0.52
43 0.46
44 0.37
45 0.36
46 0.35
47 0.31
48 0.31
49 0.3
50 0.27
51 0.27
52 0.3
53 0.24
54 0.2
55 0.18
56 0.18
57 0.17
58 0.19
59 0.18
60 0.15
61 0.14
62 0.13
63 0.14
64 0.14
65 0.13
66 0.11
67 0.11
68 0.12
69 0.12
70 0.11
71 0.14
72 0.14
73 0.15
74 0.19
75 0.2
76 0.2
77 0.21
78 0.22
79 0.21
80 0.25
81 0.27
82 0.25
83 0.25
84 0.28
85 0.33
86 0.33
87 0.32
88 0.3
89 0.3
90 0.3
91 0.29
92 0.28
93 0.27
94 0.29
95 0.31
96 0.32
97 0.36
98 0.38
99 0.37
100 0.35
101 0.35
102 0.35
103 0.41
104 0.47
105 0.48
106 0.49
107 0.5
108 0.6
109 0.6
110 0.61
111 0.59
112 0.57
113 0.53
114 0.49
115 0.52
116 0.42
117 0.4
118 0.42
119 0.39
120 0.37
121 0.44
122 0.51
123 0.54
124 0.62
125 0.68
126 0.71
127 0.78
128 0.83
129 0.83
130 0.85
131 0.89
132 0.92
133 0.95
134 0.94
135 0.94
136 0.9
137 0.87
138 0.77
139 0.66
140 0.6
141 0.49
142 0.4
143 0.33
144 0.27
145 0.2
146 0.2
147 0.2
148 0.15
149 0.16
150 0.15
151 0.12
152 0.11
153 0.1
154 0.1
155 0.09
156 0.11
157 0.13
158 0.13
159 0.12
160 0.13
161 0.13
162 0.13
163 0.17
164 0.16
165 0.15
166 0.16
167 0.16
168 0.16
169 0.16
170 0.15
171 0.12
172 0.11
173 0.1
174 0.09
175 0.09
176 0.11
177 0.11
178 0.12
179 0.12
180 0.12
181 0.14
182 0.14
183 0.13
184 0.12
185 0.13
186 0.17
187 0.16
188 0.16
189 0.16
190 0.2
191 0.21
192 0.21
193 0.18
194 0.14
195 0.14
196 0.15
197 0.14
198 0.09
199 0.08
200 0.07
201 0.07
202 0.08
203 0.07
204 0.06
205 0.06
206 0.07
207 0.07
208 0.1
209 0.11
210 0.12
211 0.13
212 0.19
213 0.2
214 0.26
215 0.32
216 0.33
217 0.33
218 0.34
219 0.38
220 0.33
221 0.36
222 0.3
223 0.24
224 0.21
225 0.19
226 0.19
227 0.14
228 0.12
229 0.08
230 0.09
231 0.09
232 0.09
233 0.12
234 0.1
235 0.11
236 0.13
237 0.14
238 0.13
239 0.13
240 0.15
241 0.13
242 0.14
243 0.15
244 0.15
245 0.13
246 0.14
247 0.13
248 0.13
249 0.19
250 0.18
251 0.17
252 0.17
253 0.18
254 0.19
255 0.22