Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397TRZ0

Protein Details
Accession A0A397TRZ0    Localization Confidence Low Confidence Score 7.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
356-379TQQGQPTNSQKRQKTNKLNSDDICHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto_nucl 10, nucl 9.5, mito 8, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010347  Tdp1  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008081  F:phosphoric diester hydrolase activity  
GO:0006281  P:DNA repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF06087  Tyr-DNA_phospho  
CDD cd09122  PLDc_Tdp1_1  
Amino Acid Sequences MSHVVGTIRCVGSSSDSLNSRINRSSSDSLNSRINHSSIGFDGDYVKFEDLLQKDHLKNAFLSALDVDWDWLLTKLPENILIVIAKHWDSGQETEGVYILPDTNILLVHPPLSNTQIGCFHAKLMLLFFDGWMRVVVASGNLIPYDWETNENVIFVQDFPIVQATGSNHHNLHPFAKDIKDFILAIGLKNHIVNKLSQYDFSRAKAKLIASIPGAYKGIENMRKYGHGRLCKVVQEVCGPNENIILECQTSTISNLNADFLHEFYRSASGIDPLEISKPRAKKSQGVEISLPQITMVYPSNRIISFSKYPQAAGAALFFGKSDYERHAFPKEIIRNCVSKRDGILIHSKFVLARYTQQGQPTNSQKRQKTNKLNSDDICGSNEDKAEFTRKSYVSKETVMAPIRGWYYCGGKIYTSRETKGPQLRINNWELGVFFPIRGSDNNQGDWFTENGVPVPYRRPPGRYDLNETPWFSFN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.24
3 0.26
4 0.29
5 0.34
6 0.36
7 0.36
8 0.38
9 0.37
10 0.34
11 0.4
12 0.42
13 0.39
14 0.43
15 0.42
16 0.41
17 0.47
18 0.45
19 0.42
20 0.41
21 0.38
22 0.33
23 0.3
24 0.28
25 0.22
26 0.26
27 0.21
28 0.18
29 0.2
30 0.18
31 0.19
32 0.19
33 0.18
34 0.14
35 0.14
36 0.21
37 0.19
38 0.22
39 0.26
40 0.31
41 0.32
42 0.37
43 0.39
44 0.34
45 0.33
46 0.32
47 0.29
48 0.22
49 0.22
50 0.17
51 0.15
52 0.13
53 0.13
54 0.11
55 0.08
56 0.08
57 0.07
58 0.07
59 0.08
60 0.08
61 0.11
62 0.12
63 0.13
64 0.16
65 0.16
66 0.16
67 0.17
68 0.17
69 0.14
70 0.13
71 0.14
72 0.12
73 0.12
74 0.11
75 0.11
76 0.13
77 0.15
78 0.16
79 0.16
80 0.15
81 0.15
82 0.15
83 0.13
84 0.11
85 0.09
86 0.08
87 0.05
88 0.06
89 0.05
90 0.06
91 0.06
92 0.06
93 0.07
94 0.07
95 0.09
96 0.09
97 0.1
98 0.11
99 0.14
100 0.16
101 0.14
102 0.16
103 0.18
104 0.2
105 0.22
106 0.2
107 0.18
108 0.18
109 0.18
110 0.16
111 0.14
112 0.12
113 0.1
114 0.1
115 0.1
116 0.09
117 0.09
118 0.09
119 0.08
120 0.08
121 0.06
122 0.06
123 0.06
124 0.05
125 0.06
126 0.06
127 0.06
128 0.06
129 0.06
130 0.06
131 0.07
132 0.09
133 0.09
134 0.1
135 0.11
136 0.13
137 0.13
138 0.13
139 0.11
140 0.09
141 0.09
142 0.07
143 0.08
144 0.07
145 0.07
146 0.07
147 0.08
148 0.08
149 0.07
150 0.09
151 0.08
152 0.11
153 0.13
154 0.15
155 0.15
156 0.17
157 0.2
158 0.19
159 0.2
160 0.18
161 0.19
162 0.19
163 0.21
164 0.19
165 0.17
166 0.18
167 0.17
168 0.16
169 0.13
170 0.16
171 0.14
172 0.14
173 0.15
174 0.14
175 0.13
176 0.13
177 0.14
178 0.11
179 0.12
180 0.12
181 0.14
182 0.19
183 0.19
184 0.2
185 0.22
186 0.26
187 0.27
188 0.28
189 0.31
190 0.25
191 0.26
192 0.27
193 0.24
194 0.25
195 0.24
196 0.24
197 0.18
198 0.2
199 0.2
200 0.18
201 0.18
202 0.12
203 0.11
204 0.11
205 0.15
206 0.18
207 0.18
208 0.19
209 0.2
210 0.23
211 0.24
212 0.3
213 0.3
214 0.31
215 0.33
216 0.34
217 0.35
218 0.34
219 0.34
220 0.28
221 0.24
222 0.23
223 0.22
224 0.2
225 0.2
226 0.18
227 0.17
228 0.16
229 0.15
230 0.1
231 0.09
232 0.08
233 0.06
234 0.06
235 0.06
236 0.05
237 0.05
238 0.06
239 0.07
240 0.07
241 0.08
242 0.08
243 0.08
244 0.08
245 0.09
246 0.08
247 0.07
248 0.09
249 0.09
250 0.09
251 0.08
252 0.1
253 0.09
254 0.1
255 0.09
256 0.09
257 0.09
258 0.09
259 0.09
260 0.08
261 0.11
262 0.11
263 0.13
264 0.17
265 0.2
266 0.23
267 0.29
268 0.32
269 0.36
270 0.39
271 0.47
272 0.45
273 0.45
274 0.44
275 0.39
276 0.39
277 0.32
278 0.28
279 0.17
280 0.14
281 0.1
282 0.1
283 0.11
284 0.09
285 0.11
286 0.12
287 0.15
288 0.15
289 0.18
290 0.17
291 0.21
292 0.24
293 0.24
294 0.28
295 0.26
296 0.26
297 0.24
298 0.24
299 0.18
300 0.15
301 0.12
302 0.08
303 0.08
304 0.08
305 0.07
306 0.06
307 0.06
308 0.06
309 0.08
310 0.12
311 0.14
312 0.15
313 0.19
314 0.22
315 0.23
316 0.24
317 0.32
318 0.35
319 0.37
320 0.4
321 0.4
322 0.43
323 0.43
324 0.49
325 0.41
326 0.36
327 0.33
328 0.34
329 0.32
330 0.29
331 0.37
332 0.3
333 0.3
334 0.28
335 0.27
336 0.22
337 0.22
338 0.22
339 0.13
340 0.17
341 0.21
342 0.25
343 0.27
344 0.33
345 0.38
346 0.38
347 0.45
348 0.5
349 0.55
350 0.58
351 0.64
352 0.64
353 0.69
354 0.77
355 0.79
356 0.8
357 0.81
358 0.83
359 0.82
360 0.83
361 0.73
362 0.7
363 0.62
364 0.52
365 0.43
366 0.35
367 0.29
368 0.24
369 0.24
370 0.18
371 0.16
372 0.17
373 0.21
374 0.2
375 0.22
376 0.28
377 0.28
378 0.32
379 0.35
380 0.4
381 0.37
382 0.39
383 0.38
384 0.33
385 0.39
386 0.37
387 0.34
388 0.28
389 0.27
390 0.27
391 0.25
392 0.23
393 0.19
394 0.2
395 0.22
396 0.24
397 0.22
398 0.21
399 0.27
400 0.31
401 0.38
402 0.38
403 0.38
404 0.4
405 0.42
406 0.49
407 0.53
408 0.54
409 0.52
410 0.57
411 0.61
412 0.62
413 0.64
414 0.58
415 0.49
416 0.43
417 0.37
418 0.29
419 0.27
420 0.21
421 0.16
422 0.13
423 0.14
424 0.15
425 0.17
426 0.22
427 0.27
428 0.3
429 0.33
430 0.34
431 0.33
432 0.32
433 0.32
434 0.27
435 0.21
436 0.19
437 0.16
438 0.17
439 0.19
440 0.19
441 0.19
442 0.25
443 0.28
444 0.34
445 0.38
446 0.41
447 0.43
448 0.51
449 0.59
450 0.59
451 0.62
452 0.63
453 0.67
454 0.69
455 0.67