Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A397VQD5

Protein Details
Accession A0A397VQD5    Localization Confidence High Confidence Score 17.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
177-198TNKNLVEKRRRIRKNPYPTRAPHydrophilic
252-287SSSRHNSKSLTKRQRSKLRNKTKRSVTERKRKGNSLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
184-191KRRRIRKN
261-284LTKRQRSKLRNKTKRSVTERKRKG
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR007526  SWIRM  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF04433  SWIRM  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50934  SWIRM  
Amino Acid Sequences MSSCYNSIATPLISPPPSPPDECSTFTDDQKVPLNGELNQFQTESSNKLDLTKIEITNYAPGSQHRFRMRVCDVPKELMDLIKASEKIPRNSSKATTALTTGNMTESSDIVGSTKDTTSIPTTIPTTIPTTIPTTLPNNDRVTSTPNQTHNHQTHNQTHNQTHNQTHNQTHTHNQSTNKNLVEKRRRIRKNPYPTRAPSKSSPGITLKVDVFTPFKEDPQALLHSDDPPPSDPGTPLLFSDIFSSADETSESSSRHNSKSLTKRQRSKLRNKTKRSVTERKRKGNSLARVMADRGLLEATFTPVTNEGETTTTSTKTIRIPPPPPMQFEELMENIDQLDLDTDLLDRINPKVNWKGQPLTISHLPHYNSLHQKEAHVASTLRLTPVQYLTSKNTLVSSARRYTQRSLPFRKSDAQKLLRIDVNKASKLWEFFMQVKWI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.24
3 0.29
4 0.32
5 0.33
6 0.34
7 0.36
8 0.39
9 0.42
10 0.43
11 0.44
12 0.43
13 0.43
14 0.46
15 0.4
16 0.39
17 0.42
18 0.39
19 0.33
20 0.34
21 0.35
22 0.3
23 0.34
24 0.33
25 0.29
26 0.29
27 0.27
28 0.23
29 0.24
30 0.23
31 0.21
32 0.21
33 0.22
34 0.21
35 0.23
36 0.25
37 0.22
38 0.27
39 0.31
40 0.28
41 0.27
42 0.28
43 0.27
44 0.3
45 0.31
46 0.26
47 0.2
48 0.22
49 0.29
50 0.31
51 0.37
52 0.38
53 0.41
54 0.4
55 0.47
56 0.49
57 0.5
58 0.5
59 0.52
60 0.49
61 0.49
62 0.49
63 0.43
64 0.39
65 0.31
66 0.29
67 0.2
68 0.18
69 0.19
70 0.19
71 0.16
72 0.23
73 0.27
74 0.31
75 0.38
76 0.43
77 0.43
78 0.47
79 0.5
80 0.47
81 0.44
82 0.41
83 0.35
84 0.31
85 0.27
86 0.24
87 0.22
88 0.17
89 0.15
90 0.13
91 0.12
92 0.11
93 0.09
94 0.09
95 0.08
96 0.07
97 0.07
98 0.07
99 0.07
100 0.09
101 0.08
102 0.09
103 0.09
104 0.11
105 0.14
106 0.15
107 0.15
108 0.15
109 0.17
110 0.16
111 0.17
112 0.16
113 0.16
114 0.16
115 0.16
116 0.16
117 0.18
118 0.18
119 0.18
120 0.19
121 0.19
122 0.23
123 0.25
124 0.28
125 0.28
126 0.27
127 0.28
128 0.27
129 0.29
130 0.28
131 0.3
132 0.31
133 0.35
134 0.37
135 0.39
136 0.46
137 0.43
138 0.46
139 0.47
140 0.47
141 0.5
142 0.53
143 0.56
144 0.52
145 0.53
146 0.53
147 0.54
148 0.51
149 0.46
150 0.48
151 0.48
152 0.47
153 0.47
154 0.44
155 0.41
156 0.39
157 0.41
158 0.4
159 0.39
160 0.39
161 0.4
162 0.41
163 0.43
164 0.45
165 0.41
166 0.4
167 0.39
168 0.45
169 0.51
170 0.54
171 0.58
172 0.64
173 0.7
174 0.72
175 0.79
176 0.79
177 0.81
178 0.83
179 0.81
180 0.79
181 0.76
182 0.78
183 0.71
184 0.65
185 0.56
186 0.53
187 0.5
188 0.43
189 0.42
190 0.35
191 0.34
192 0.3
193 0.29
194 0.22
195 0.18
196 0.17
197 0.14
198 0.13
199 0.1
200 0.15
201 0.13
202 0.13
203 0.14
204 0.14
205 0.14
206 0.15
207 0.17
208 0.13
209 0.14
210 0.14
211 0.15
212 0.15
213 0.15
214 0.13
215 0.13
216 0.14
217 0.13
218 0.13
219 0.12
220 0.13
221 0.14
222 0.13
223 0.12
224 0.13
225 0.12
226 0.11
227 0.13
228 0.11
229 0.1
230 0.1
231 0.11
232 0.09
233 0.09
234 0.09
235 0.08
236 0.08
237 0.1
238 0.1
239 0.1
240 0.15
241 0.18
242 0.2
243 0.22
244 0.23
245 0.3
246 0.4
247 0.5
248 0.55
249 0.6
250 0.68
251 0.75
252 0.84
253 0.84
254 0.85
255 0.86
256 0.86
257 0.88
258 0.87
259 0.87
260 0.86
261 0.86
262 0.85
263 0.84
264 0.83
265 0.84
266 0.86
267 0.86
268 0.82
269 0.76
270 0.76
271 0.74
272 0.71
273 0.68
274 0.63
275 0.54
276 0.5
277 0.46
278 0.39
279 0.29
280 0.22
281 0.14
282 0.1
283 0.09
284 0.08
285 0.07
286 0.08
287 0.08
288 0.08
289 0.09
290 0.1
291 0.11
292 0.11
293 0.11
294 0.1
295 0.1
296 0.11
297 0.14
298 0.14
299 0.13
300 0.14
301 0.14
302 0.16
303 0.2
304 0.28
305 0.31
306 0.37
307 0.4
308 0.48
309 0.57
310 0.58
311 0.57
312 0.52
313 0.49
314 0.42
315 0.41
316 0.36
317 0.27
318 0.25
319 0.21
320 0.17
321 0.13
322 0.12
323 0.1
324 0.06
325 0.06
326 0.05
327 0.05
328 0.05
329 0.05
330 0.06
331 0.06
332 0.07
333 0.07
334 0.09
335 0.17
336 0.18
337 0.23
338 0.31
339 0.38
340 0.43
341 0.48
342 0.49
343 0.45
344 0.49
345 0.45
346 0.44
347 0.43
348 0.4
349 0.36
350 0.37
351 0.36
352 0.35
353 0.37
354 0.38
355 0.41
356 0.42
357 0.46
358 0.41
359 0.41
360 0.43
361 0.42
362 0.35
363 0.3
364 0.27
365 0.23
366 0.27
367 0.27
368 0.22
369 0.21
370 0.2
371 0.2
372 0.22
373 0.25
374 0.22
375 0.25
376 0.28
377 0.32
378 0.32
379 0.29
380 0.28
381 0.27
382 0.29
383 0.3
384 0.33
385 0.33
386 0.39
387 0.43
388 0.47
389 0.5
390 0.55
391 0.6
392 0.62
393 0.66
394 0.7
395 0.71
396 0.71
397 0.74
398 0.73
399 0.72
400 0.73
401 0.7
402 0.67
403 0.65
404 0.66
405 0.62
406 0.56
407 0.51
408 0.49
409 0.5
410 0.46
411 0.42
412 0.4
413 0.4
414 0.4
415 0.39
416 0.35
417 0.32
418 0.33