FuNGI

A0A397U5Y1

Protein Details

Accession

A0A397U5Y1

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
388-407	LADLKRKERARKNRIAQLRN	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
392-400	KRKERARKN

Subcellular Location(s)

nucl 25.5, cyto_nucl 14

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027417 P-loop_NTPase IPR003395 RecF/RecN/SMC_N IPR027131 SMC5 IPR010935 SMC_hinge IPR036277 SMC_hinge_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0030915 C:Smc5-Smc6 complex GO:0005524 F:ATP binding GO:0016887 F:ATP hydrolysis activity GO:0051276 P:chromosome organization GO:0007059 P:chromosome segregation GO:0000724 P:double-strand break repair via homologous recombination GO:0000278 P:mitotic cell cycle
Pfam	View protein in Pfam PF06470 SMC_hinge PF02463 SMC_N

Amino Acid Sequences

MSRRSRLKGKEILETESLSRQHSTGEDSHSEGENAIEKGVKRIKLDERISQEASVASSSRRSSNTEKHAKQKAYDEFQIGSIVRVCLKNFVTYDSVEFFPGPNLNMIIGPNGTGKSTIVCAIALGLGWNTSLLGRAKEISDFVKHGQERASIEIELKNKGRNVVITRMIRKSNNLSQWKLNGQPATHREVSSKVNSLNIQVDNLCQFLPQDKVCEFAQMSPSELLVQTQKAVGEKELIEWHEALIQLREEEKSLTTSIKTDSEQVENLEKRNSVLEKDVTRFREREAILKRIRLYELRIPFARYGVAKHLYDVAKQKRAEAHLEYQNLAKESEPASARKNELEDLVSRSAKEKKRCTELYSTKKRKMEEIATRLEQSEATSENIRKDLADLKRKERARKNRIAQLRNEIAELEERTSSPPLANDDSDIRRKNDDVVRRLRETQPQLNDNKYNQDEINLAARNVEREMQMIKQQLKELDDVKRRRLETIRRVDYDTFRAYEWLQQNKDKLSGRVFGPVCMEINIKDMQYADAIENALGNNNKIFVCETEQDYHTITRELCDNRRMRINVFSPKATMDSFPPPIPHQQLRSYGFVSYLLDLIEAPPRLQAALCDMSKLHAIPLARNESDINHDIIKGNRAFFKYYAGETSYSVSFSKYGQRFSQVLTNRIKPSRFFTATMNIEEKYELEKQLQECQMKLSRFDQQLSDLRKEYGNLQKSIELLYGERNALTEEKRKNQLALREFERLKVRLDSKRDQLQRELEQPASMMDEENALRRDFSKIAKKRGQLVTQIKKIMEECMQLFSGRILATLKHMQASSDLNALERQTQDRDEALKQAHIKFSEADARFNSAKSVAKRLLNEANAGVEGLDAETTRAVQELSHGMTLEELEDAVASERAKADLHYAINPSVIETYETRKAEIDSIKSRLSIKTSRLTKLTSDLATFREKWEPRLNSLVKEISQGFSNAFDRIGCVGEVRVSPHEDYDKWGIDILVKFRDNERLQALTGQRQSGGERSVSTIMYLMALQELSKTPFRVVDEINQGMDPRNERLVHSQMVQTACRPNTSQYFLITPKLLPDLQYHERMKILCIYNGEWQPETMNWKKYIADKKRSNN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.5
2	0.44
3	0.41
4	0.39
5	0.31
6	0.3
7	0.25
8	0.24
9	0.23
10	0.26
11	0.24
12	0.29
13	0.29
14	0.3
15	0.33
16	0.32
17	0.31
18	0.25
19	0.23
20	0.21
21	0.19
22	0.17
23	0.18
24	0.17
25	0.25
26	0.31
27	0.34
28	0.31
29	0.39
30	0.47
31	0.53
32	0.58
33	0.58
34	0.59
35	0.62
36	0.62
37	0.54
38	0.47
39	0.37
40	0.33
41	0.27
42	0.2
43	0.15
44	0.18
45	0.2
46	0.23
47	0.25
48	0.3
49	0.36
50	0.45
51	0.54
52	0.6
53	0.65
54	0.7
55	0.77
56	0.75
57	0.71
58	0.71
59	0.69
60	0.66
61	0.64
62	0.57
63	0.49
64	0.46
65	0.45
66	0.36
67	0.28
68	0.23
69	0.2
70	0.2
71	0.21
72	0.21
73	0.23
74	0.24
75	0.28
76	0.26
77	0.29
78	0.28
79	0.27
80	0.29
81	0.26
82	0.26
83	0.22
84	0.21
85	0.18
86	0.18
87	0.19
88	0.17
89	0.15
90	0.15
91	0.14
92	0.15
93	0.15
94	0.14
95	0.12
96	0.12
97	0.13
98	0.12
99	0.12
100	0.12
101	0.12
102	0.11
103	0.13
104	0.13
105	0.12
106	0.11
107	0.1
108	0.1
109	0.1
110	0.08
111	0.08
112	0.06
113	0.05
114	0.05
115	0.05
116	0.05
117	0.05
118	0.09
119	0.11
120	0.12
121	0.13
122	0.15
123	0.16
124	0.17
125	0.19
126	0.18
127	0.2
128	0.22
129	0.23
130	0.3
131	0.3
132	0.3
133	0.31
134	0.32
135	0.31
136	0.32
137	0.32
138	0.24
139	0.25
140	0.28
141	0.27
142	0.29
143	0.29
144	0.29
145	0.29
146	0.31
147	0.31
148	0.32
149	0.35
150	0.37
151	0.43
152	0.46
153	0.5
154	0.53
155	0.56
156	0.52
157	0.52
158	0.53
159	0.53
160	0.55
161	0.57
162	0.55
163	0.55
164	0.59
165	0.58
166	0.55
167	0.52
168	0.45
169	0.39
170	0.44
171	0.43
172	0.44
173	0.42
174	0.38
175	0.35
176	0.35
177	0.39
178	0.35
179	0.36
180	0.3
181	0.31
182	0.31
183	0.33
184	0.34
185	0.29
186	0.26
187	0.22
188	0.23
189	0.19
190	0.19
191	0.16
192	0.11
193	0.11
194	0.12
195	0.16
196	0.15
197	0.19
198	0.18
199	0.21
200	0.21
201	0.25
202	0.23
203	0.21
204	0.26
205	0.22
206	0.25
207	0.22
208	0.22
209	0.19
210	0.18
211	0.16
212	0.13
213	0.13
214	0.11
215	0.12
216	0.13
217	0.13
218	0.15
219	0.14
220	0.15
221	0.15
222	0.17
223	0.19
224	0.19
225	0.19
226	0.18
227	0.17
228	0.16
229	0.17
230	0.15
231	0.13
232	0.12
233	0.12
234	0.13
235	0.13
236	0.12
237	0.12
238	0.12
239	0.13
240	0.13
241	0.14
242	0.13
243	0.15
244	0.16
245	0.18
246	0.18
247	0.2
248	0.21
249	0.22
250	0.23
251	0.23
252	0.29
253	0.28
254	0.29
255	0.28
256	0.25
257	0.23
258	0.27
259	0.26
260	0.2
261	0.23
262	0.26
263	0.28
264	0.32
265	0.37
266	0.37
267	0.4
268	0.39
269	0.36
270	0.39
271	0.35
272	0.4
273	0.4
274	0.44
275	0.44
276	0.48
277	0.48
278	0.43
279	0.45
280	0.39
281	0.38
282	0.37
283	0.38
284	0.39
285	0.38
286	0.38
287	0.36
288	0.34
289	0.31
290	0.23
291	0.21
292	0.22
293	0.25
294	0.22
295	0.22
296	0.28
297	0.26
298	0.29
299	0.36
300	0.37
301	0.4
302	0.4
303	0.42
304	0.41
305	0.43
306	0.44
307	0.39
308	0.4
309	0.39
310	0.4
311	0.38
312	0.35
313	0.34
314	0.3
315	0.26
316	0.18
317	0.15
318	0.14
319	0.18
320	0.18
321	0.18
322	0.22
323	0.25
324	0.26
325	0.25
326	0.26
327	0.22
328	0.21
329	0.21
330	0.19
331	0.2
332	0.23
333	0.22
334	0.2
335	0.23
336	0.3
337	0.35
338	0.41
339	0.45
340	0.47
341	0.56
342	0.59
343	0.6
344	0.63
345	0.66
346	0.69
347	0.71
348	0.74
349	0.72
350	0.73
351	0.69
352	0.63
353	0.59
354	0.58
355	0.56
356	0.54
357	0.52
358	0.5
359	0.5
360	0.46
361	0.39
362	0.3
363	0.21
364	0.16
365	0.12
366	0.12
367	0.15
368	0.16
369	0.17
370	0.18
371	0.17
372	0.15
373	0.15
374	0.21
375	0.25
376	0.33
377	0.36
378	0.4
379	0.48
380	0.53
381	0.61
382	0.63
383	0.67
384	0.67
385	0.74
386	0.76
387	0.77
388	0.81
389	0.77
390	0.71
391	0.69
392	0.63
393	0.53
394	0.46
395	0.37
396	0.29
397	0.26
398	0.23
399	0.15
400	0.11
401	0.11
402	0.12
403	0.13
404	0.13
405	0.1
406	0.11
407	0.13
408	0.15
409	0.15
410	0.15
411	0.18
412	0.22
413	0.28
414	0.29
415	0.27
416	0.26
417	0.27
418	0.32
419	0.33
420	0.37
421	0.38
422	0.45
423	0.48
424	0.5
425	0.53
426	0.5
427	0.52
428	0.5
429	0.49
430	0.46
431	0.46
432	0.47
433	0.48
434	0.48
435	0.42
436	0.42
437	0.36
438	0.33
439	0.27
440	0.25
441	0.21
442	0.18
443	0.22
444	0.16
445	0.15
446	0.14
447	0.14
448	0.14
449	0.14
450	0.14
451	0.09
452	0.1
453	0.11
454	0.11
455	0.15
456	0.19
457	0.21
458	0.21
459	0.22
460	0.23
461	0.23
462	0.24
463	0.23
464	0.27
465	0.33
466	0.34
467	0.38
468	0.41
469	0.4
470	0.43
471	0.46
472	0.47
473	0.49
474	0.57
475	0.57
476	0.54
477	0.56
478	0.54
479	0.5
480	0.45
481	0.37
482	0.27
483	0.21
484	0.2
485	0.18
486	0.22
487	0.25
488	0.27
489	0.28
490	0.3
491	0.32
492	0.32
493	0.37
494	0.32
495	0.28
496	0.25
497	0.25
498	0.23
499	0.29
500	0.28
501	0.24
502	0.23
503	0.21
504	0.19
505	0.17
506	0.16
507	0.09
508	0.11
509	0.11
510	0.1
511	0.09
512	0.09
513	0.08
514	0.08
515	0.09
516	0.06
517	0.06
518	0.06
519	0.06
520	0.06
521	0.05
522	0.07
523	0.07
524	0.07
525	0.06
526	0.07
527	0.07
528	0.07
529	0.08
530	0.07
531	0.11
532	0.12
533	0.14
534	0.15
535	0.16
536	0.17
537	0.17
538	0.17
539	0.14
540	0.14
541	0.11
542	0.09
543	0.14
544	0.16
545	0.17
546	0.24
547	0.26
548	0.26
549	0.32
550	0.33
551	0.29
552	0.33
553	0.36
554	0.36
555	0.36
556	0.35
557	0.29
558	0.29
559	0.29
560	0.23
561	0.18
562	0.13
563	0.15
564	0.17
565	0.17
566	0.17
567	0.17
568	0.21
569	0.25
570	0.25
571	0.24
572	0.26
573	0.32
574	0.34
575	0.35
576	0.31
577	0.27
578	0.25
579	0.22
580	0.18
581	0.12
582	0.09
583	0.07
584	0.06
585	0.06
586	0.06
587	0.08
588	0.08
589	0.07
590	0.07
591	0.07
592	0.08
593	0.08
594	0.07
595	0.08
596	0.13
597	0.12
598	0.13
599	0.13
600	0.13
601	0.14
602	0.14
603	0.1
604	0.08
605	0.08
606	0.09
607	0.14
608	0.18
609	0.17
610	0.17
611	0.18
612	0.17
613	0.21
614	0.21
615	0.17
616	0.13
617	0.14
618	0.15
619	0.15
620	0.19
621	0.16
622	0.16
623	0.18
624	0.19
625	0.2
626	0.19
627	0.23
628	0.19
629	0.19
630	0.19
631	0.18
632	0.17
633	0.16
634	0.18
635	0.13
636	0.13
637	0.12
638	0.11
639	0.1
640	0.1
641	0.18
642	0.18
643	0.21
644	0.21
645	0.25
646	0.25
647	0.26
648	0.32
649	0.27
650	0.31
651	0.32
652	0.37
653	0.37
654	0.4
655	0.4
656	0.35
657	0.36
658	0.38
659	0.37
660	0.33
661	0.31
662	0.35
663	0.36
664	0.37
665	0.34
666	0.26
667	0.23
668	0.22
669	0.2
670	0.15
671	0.15
672	0.14
673	0.13
674	0.16
675	0.17
676	0.24
677	0.29
678	0.26
679	0.24
680	0.28
681	0.33
682	0.3
683	0.31
684	0.26
685	0.29
686	0.3
687	0.31
688	0.27
689	0.27
690	0.33
691	0.35
692	0.36
693	0.29
694	0.28
695	0.28
696	0.27
697	0.28
698	0.3
699	0.3
700	0.29
701	0.29
702	0.29
703	0.29
704	0.29
705	0.24
706	0.16
707	0.11
708	0.13
709	0.13
710	0.12
711	0.12
712	0.11
713	0.11
714	0.13
715	0.15
716	0.2
717	0.23
718	0.29
719	0.35
720	0.36
721	0.38
722	0.39
723	0.45
724	0.43
725	0.43
726	0.41
727	0.43
728	0.43
729	0.44
730	0.45
731	0.38
732	0.35
733	0.36
734	0.38
735	0.37
736	0.44
737	0.45
738	0.47
739	0.55
740	0.58
741	0.55
742	0.54
743	0.54
744	0.51
745	0.51
746	0.47
747	0.38
748	0.33
749	0.3
750	0.25
751	0.2
752	0.15
753	0.1
754	0.07
755	0.09
756	0.09
757	0.13
758	0.14
759	0.12
760	0.12
761	0.13
762	0.16
763	0.16
764	0.23
765	0.3
766	0.36
767	0.45
768	0.52
769	0.54
770	0.59
771	0.64
772	0.62
773	0.61
774	0.64
775	0.64
776	0.63
777	0.63
778	0.54
779	0.49
780	0.45
781	0.39
782	0.31
783	0.25
784	0.2
785	0.2
786	0.2
787	0.18
788	0.18
789	0.15
790	0.14
791	0.11
792	0.1
793	0.09
794	0.08
795	0.13
796	0.17
797	0.18
798	0.18
799	0.18
800	0.17
801	0.19
802	0.22
803	0.18
804	0.17
805	0.16
806	0.15
807	0.16
808	0.16
809	0.17
810	0.15
811	0.17
812	0.16
813	0.18
814	0.18
815	0.2
816	0.22
817	0.21
818	0.24
819	0.23
820	0.25
821	0.28
822	0.29
823	0.31
824	0.29
825	0.29
826	0.25
827	0.27
828	0.31
829	0.28
830	0.28
831	0.25
832	0.29
833	0.28
834	0.27
835	0.26
836	0.2
837	0.24
838	0.24
839	0.3
840	0.3
841	0.34
842	0.35
843	0.4
844	0.43
845	0.39
846	0.38
847	0.31
848	0.27
849	0.22
850	0.21
851	0.15
852	0.08
853	0.07
854	0.05
855	0.05
856	0.04
857	0.04
858	0.05
859	0.05
860	0.05
861	0.05
862	0.05
863	0.05
864	0.07
865	0.1
866	0.12
867	0.13
868	0.13
869	0.12
870	0.12
871	0.13
872	0.11
873	0.07
874	0.05
875	0.04
876	0.04
877	0.05
878	0.06
879	0.07
880	0.07
881	0.08
882	0.08
883	0.09
884	0.1
885	0.1
886	0.12
887	0.15
888	0.17
889	0.19
890	0.21
891	0.21
892	0.21
893	0.21
894	0.18
895	0.15
896	0.13
897	0.13
898	0.12
899	0.17
900	0.23
901	0.24
902	0.23
903	0.24
904	0.25
905	0.28
906	0.32
907	0.34
908	0.32
909	0.36
910	0.36
911	0.36
912	0.37
913	0.34
914	0.35
915	0.34
916	0.34
917	0.39
918	0.44
919	0.46
920	0.47
921	0.47
922	0.43
923	0.42
924	0.42
925	0.34
926	0.31
927	0.28
928	0.28
929	0.32
930	0.3
931	0.28
932	0.32
933	0.32
934	0.36
935	0.45
936	0.45
937	0.44
938	0.54
939	0.53
940	0.47
941	0.51
942	0.48
943	0.38
944	0.39
945	0.35
946	0.26
947	0.25
948	0.23
949	0.19
950	0.19
951	0.19
952	0.16
953	0.15
954	0.14
955	0.14
956	0.14
957	0.15
958	0.11
959	0.1
960	0.1
961	0.13
962	0.14
963	0.16
964	0.17
965	0.19
966	0.2
967	0.23
968	0.26
969	0.24
970	0.28
971	0.31
972	0.3
973	0.27
974	0.27
975	0.24
976	0.25
977	0.27
978	0.26
979	0.27
980	0.26
981	0.27
982	0.28
983	0.38
984	0.35
985	0.36
986	0.37
987	0.32
988	0.32
989	0.37
990	0.39
991	0.37
992	0.39
993	0.35
994	0.32
995	0.31
996	0.33
997	0.3
998	0.29
999	0.22
1000	0.2
1001	0.23
1002	0.24
1003	0.22
1004	0.21
1005	0.17
1006	0.14
1007	0.14
1008	0.12
1009	0.09
1010	0.07
1011	0.07
1012	0.07
1013	0.08
1014	0.11
1015	0.14
1016	0.17
1017	0.18
1018	0.19
1019	0.23
1020	0.26
1021	0.29
1022	0.29
1023	0.33
1024	0.37
1025	0.38
1026	0.38
1027	0.35
1028	0.32
1029	0.31
1030	0.32
1031	0.27
1032	0.23
1033	0.28
1034	0.28
1035	0.3
1036	0.36
1037	0.38
1038	0.37
1039	0.37
1040	0.36
1041	0.35
1042	0.37
1043	0.36
1044	0.33
1045	0.36
1046	0.34
1047	0.34
1048	0.34
1049	0.35
1050	0.38
1051	0.43
1052	0.41
1053	0.36
1054	0.4
1055	0.39
1056	0.41
1057	0.37
1058	0.3
1059	0.27
1060	0.3
1061	0.28
1062	0.24
1063	0.26
1064	0.3
1065	0.34
1066	0.42
1067	0.42
1068	0.4
1069	0.43
1070	0.41
1071	0.39
1072	0.39
1073	0.37
1074	0.32
1075	0.33
1076	0.34
1077	0.39
1078	0.43
1079	0.44
1080	0.36
1081	0.33
1082	0.32
1083	0.32
1084	0.37
1085	0.36
1086	0.38
1087	0.36
1088	0.38
1089	0.4
1090	0.47
1091	0.55
1092	0.57
1093	0.61

A0A397U5Y1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer