Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397VL90

Protein Details
Accession A0A397VL90    Localization Confidence High Confidence Score 18
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
119-164EMRKRVPDYKDERKRKPSKDPFRPYDVDERKKDRQKKQSASVSNKMBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
128-141KDERKRKPSKDPFR
148-152RKKDR
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MGIRPCVEIVRQFFGDKIDEVKELVLKQCLSADPSSYVNLETKPDGRVPRQLNCWMIFKTEFHKQITNQGLYEQICTTFNIPGKERLHMIGDIVKDYWNKMKVSEKAPFVKLAKEVDEEMRKRVPDYKDERKRKPSKDPFRPYDVDERKKDRQKKQSASVSNKMQDENLYLFGDPYFCYPYFCYPYFCDSYFCDPYNTNVVDFFSESFLHYTN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.29
3 0.24
4 0.23
5 0.19
6 0.18
7 0.18
8 0.19
9 0.19
10 0.19
11 0.2
12 0.21
13 0.19
14 0.19
15 0.21
16 0.21
17 0.21
18 0.2
19 0.2
20 0.18
21 0.2
22 0.2
23 0.18
24 0.18
25 0.17
26 0.17
27 0.17
28 0.17
29 0.17
30 0.18
31 0.23
32 0.27
33 0.28
34 0.36
35 0.38
36 0.41
37 0.45
38 0.48
39 0.47
40 0.45
41 0.46
42 0.38
43 0.37
44 0.32
45 0.28
46 0.26
47 0.3
48 0.31
49 0.3
50 0.34
51 0.31
52 0.38
53 0.43
54 0.41
55 0.33
56 0.3
57 0.31
58 0.27
59 0.28
60 0.19
61 0.14
62 0.13
63 0.13
64 0.14
65 0.13
66 0.16
67 0.17
68 0.18
69 0.25
70 0.25
71 0.26
72 0.26
73 0.24
74 0.23
75 0.2
76 0.19
77 0.15
78 0.14
79 0.13
80 0.12
81 0.13
82 0.11
83 0.12
84 0.15
85 0.16
86 0.15
87 0.17
88 0.23
89 0.26
90 0.3
91 0.34
92 0.33
93 0.34
94 0.34
95 0.36
96 0.3
97 0.28
98 0.26
99 0.22
100 0.19
101 0.17
102 0.17
103 0.18
104 0.24
105 0.23
106 0.24
107 0.25
108 0.24
109 0.24
110 0.3
111 0.28
112 0.3
113 0.38
114 0.46
115 0.54
116 0.63
117 0.7
118 0.74
119 0.81
120 0.79
121 0.82
122 0.82
123 0.82
124 0.84
125 0.86
126 0.8
127 0.78
128 0.74
129 0.66
130 0.66
131 0.65
132 0.62
133 0.58
134 0.6
135 0.62
136 0.7
137 0.76
138 0.74
139 0.76
140 0.78
141 0.8
142 0.82
143 0.83
144 0.83
145 0.82
146 0.8
147 0.76
148 0.7
149 0.64
150 0.55
151 0.46
152 0.37
153 0.32
154 0.26
155 0.22
156 0.18
157 0.16
158 0.15
159 0.15
160 0.14
161 0.12
162 0.12
163 0.14
164 0.13
165 0.16
166 0.17
167 0.24
168 0.29
169 0.3
170 0.32
171 0.3
172 0.36
173 0.38
174 0.37
175 0.33
176 0.32
177 0.38
178 0.39
179 0.38
180 0.35
181 0.31
182 0.34
183 0.39
184 0.35
185 0.28
186 0.24
187 0.24
188 0.23
189 0.24
190 0.21
191 0.15
192 0.15
193 0.16