Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397VSA5

Protein Details
Accession A0A397VSA5    Localization Confidence High Confidence Score 23.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
124-172EFALKKHEKPPKIEKKSNKLHNTKKPKVGKTEKKSPKKYVKTNRTLVIEHydrophilic
174-194LPKDVNRKKIYKRVRKFGDVEBasic
772-791QSEKIFRNDKSNNNLKRKVEHydrophilic
793-827IKSEDQAKKRMKTFHKKSPKSPVNGKTIRNRHKLIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
109-164ELKKVKFRGQRTLKLEFALKKHEKPPKIEKKSNKLHNTKKPKVGKTEKKSPKKYVK
180-186RKKIYKR
630-649KNLGKESIKKFKEEVKHGKR
799-825AKKRMKTFHKKSPKSPVNGKTIRNRHK
Subcellular Location(s) nucl 25, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR003954  RRM_dom_euk  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12416  RRM4_RBM28_like  
cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MQDEIPQNEQNTKDSSLLSPTYSKTTLFVRKIPYDATDSEFEAFFSEIGPLRSCFIIKETKNSDHTLDDSLQKDNTDSSQPYTGEKEQNRGFGFVQYVLNQDAERALKELKKVKFRGQRTLKLEFALKKHEKPPKIEKKSNKLHNTKKPKVGKTEKKSPKKYVKTNRTLVIEGLPKDVNRKKIYKRVRKFGDVEDIIFPIEEGKNIARITFKTERDAAEGLKRLDGHIFHESKMNAKFLAEKKASVDKKCRLIVRNIPWEYQEPELLKIFSAHGKVVEINLPRKHPNGPLRGFAYIQYKKVDEAERAINAMNETVHHGRTIAVDWSLPKDKYLEAMKSQQGKHDYEQNNDHDIDSCTEESEEEPEELSENETDESENQNEKGDSDSYENSLMDIDESEIDSVEDRSKNKNSVKKKNNTLSEDTVLFIRNISFEATDEELSDIFRPFGPLRYCVITRDDTTGRSRGTGFVSFEQKKHADACLEEAKSVGNIGFDSIERPESLTNEKKRKGIIYKSVLTADPSNSQAHKFTLHGRVLSIVKAVDRDEAHRLTEENKNKKQKEDRRNIYLIKEGVIFPNTPDAALLTSSEVAKRSTSFSTRKNLLAKNPNLFISKTRLSVRNLPLSVDEKKLKNLGKESIKKFKEEVKHGKRGDLTKTEKSEGWDKLVHIKQAKIVRSKDRIDSTMQKLRSKGYGFLEYTQHSHALAALRYLNNNPDIFGEKRRLIVEFSIENNIILKKRAELSKNRNSNIRKCNKVDGNNSNGIEVTKLNGNSQSEKIFRNDKSNNNLKRKVEMIKSEDQAKKRMKTFHKKSPKSPVNGKTIRNRHKLI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.28
3 0.29
4 0.29
5 0.28
6 0.28
7 0.27
8 0.31
9 0.3
10 0.29
11 0.25
12 0.32
13 0.39
14 0.4
15 0.43
16 0.45
17 0.48
18 0.5
19 0.5
20 0.45
21 0.4
22 0.38
23 0.37
24 0.31
25 0.29
26 0.28
27 0.26
28 0.22
29 0.19
30 0.17
31 0.12
32 0.1
33 0.11
34 0.12
35 0.14
36 0.16
37 0.15
38 0.17
39 0.18
40 0.18
41 0.17
42 0.19
43 0.26
44 0.26
45 0.35
46 0.4
47 0.46
48 0.5
49 0.52
50 0.5
51 0.43
52 0.43
53 0.38
54 0.34
55 0.33
56 0.31
57 0.31
58 0.29
59 0.27
60 0.25
61 0.23
62 0.22
63 0.23
64 0.23
65 0.24
66 0.28
67 0.29
68 0.31
69 0.35
70 0.38
71 0.41
72 0.42
73 0.47
74 0.44
75 0.51
76 0.5
77 0.46
78 0.41
79 0.35
80 0.35
81 0.29
82 0.28
83 0.22
84 0.22
85 0.21
86 0.21
87 0.17
88 0.16
89 0.16
90 0.15
91 0.15
92 0.15
93 0.18
94 0.2
95 0.27
96 0.35
97 0.38
98 0.47
99 0.51
100 0.59
101 0.64
102 0.67
103 0.72
104 0.73
105 0.76
106 0.72
107 0.74
108 0.66
109 0.59
110 0.6
111 0.54
112 0.48
113 0.49
114 0.48
115 0.48
116 0.55
117 0.61
118 0.6
119 0.63
120 0.7
121 0.71
122 0.76
123 0.79
124 0.8
125 0.82
126 0.87
127 0.89
128 0.88
129 0.87
130 0.87
131 0.89
132 0.9
133 0.88
134 0.87
135 0.87
136 0.83
137 0.84
138 0.85
139 0.85
140 0.83
141 0.85
142 0.86
143 0.87
144 0.89
145 0.89
146 0.88
147 0.88
148 0.89
149 0.89
150 0.9
151 0.88
152 0.87
153 0.83
154 0.76
155 0.67
156 0.57
157 0.52
158 0.46
159 0.37
160 0.34
161 0.29
162 0.25
163 0.32
164 0.36
165 0.38
166 0.39
167 0.46
168 0.5
169 0.59
170 0.7
171 0.73
172 0.78
173 0.8
174 0.81
175 0.81
176 0.77
177 0.72
178 0.71
179 0.61
180 0.54
181 0.45
182 0.38
183 0.3
184 0.25
185 0.2
186 0.12
187 0.11
188 0.09
189 0.09
190 0.1
191 0.14
192 0.14
193 0.15
194 0.15
195 0.15
196 0.24
197 0.29
198 0.3
199 0.3
200 0.33
201 0.33
202 0.35
203 0.36
204 0.29
205 0.28
206 0.31
207 0.27
208 0.26
209 0.25
210 0.22
211 0.23
212 0.22
213 0.2
214 0.24
215 0.25
216 0.23
217 0.28
218 0.27
219 0.29
220 0.31
221 0.28
222 0.2
223 0.19
224 0.26
225 0.24
226 0.33
227 0.29
228 0.28
229 0.3
230 0.39
231 0.44
232 0.43
233 0.48
234 0.45
235 0.52
236 0.56
237 0.58
238 0.52
239 0.55
240 0.59
241 0.59
242 0.63
243 0.58
244 0.54
245 0.5
246 0.49
247 0.43
248 0.35
249 0.3
250 0.2
251 0.21
252 0.21
253 0.19
254 0.17
255 0.15
256 0.15
257 0.14
258 0.14
259 0.12
260 0.11
261 0.12
262 0.12
263 0.13
264 0.16
265 0.17
266 0.22
267 0.25
268 0.28
269 0.29
270 0.31
271 0.33
272 0.36
273 0.4
274 0.44
275 0.43
276 0.44
277 0.44
278 0.44
279 0.41
280 0.36
281 0.37
282 0.31
283 0.3
284 0.28
285 0.26
286 0.25
287 0.29
288 0.28
289 0.2
290 0.21
291 0.22
292 0.21
293 0.21
294 0.2
295 0.17
296 0.14
297 0.13
298 0.1
299 0.07
300 0.11
301 0.12
302 0.12
303 0.11
304 0.12
305 0.12
306 0.12
307 0.13
308 0.1
309 0.08
310 0.09
311 0.09
312 0.14
313 0.17
314 0.16
315 0.15
316 0.16
317 0.15
318 0.19
319 0.23
320 0.21
321 0.2
322 0.26
323 0.3
324 0.35
325 0.36
326 0.36
327 0.36
328 0.36
329 0.34
330 0.39
331 0.37
332 0.35
333 0.4
334 0.38
335 0.37
336 0.34
337 0.33
338 0.25
339 0.23
340 0.21
341 0.17
342 0.14
343 0.11
344 0.11
345 0.11
346 0.09
347 0.1
348 0.09
349 0.07
350 0.07
351 0.07
352 0.07
353 0.07
354 0.08
355 0.06
356 0.06
357 0.06
358 0.06
359 0.06
360 0.07
361 0.09
362 0.1
363 0.11
364 0.11
365 0.12
366 0.11
367 0.11
368 0.12
369 0.11
370 0.1
371 0.12
372 0.12
373 0.12
374 0.13
375 0.13
376 0.11
377 0.1
378 0.09
379 0.06
380 0.06
381 0.05
382 0.04
383 0.05
384 0.04
385 0.04
386 0.04
387 0.05
388 0.05
389 0.08
390 0.09
391 0.11
392 0.16
393 0.18
394 0.24
395 0.3
396 0.37
397 0.44
398 0.53
399 0.61
400 0.65
401 0.72
402 0.73
403 0.75
404 0.72
405 0.67
406 0.6
407 0.52
408 0.44
409 0.35
410 0.28
411 0.21
412 0.16
413 0.11
414 0.08
415 0.06
416 0.06
417 0.06
418 0.06
419 0.06
420 0.08
421 0.09
422 0.09
423 0.09
424 0.09
425 0.08
426 0.08
427 0.09
428 0.07
429 0.06
430 0.06
431 0.08
432 0.08
433 0.14
434 0.15
435 0.16
436 0.18
437 0.21
438 0.21
439 0.2
440 0.23
441 0.2
442 0.2
443 0.22
444 0.21
445 0.21
446 0.23
447 0.25
448 0.22
449 0.2
450 0.2
451 0.17
452 0.19
453 0.19
454 0.18
455 0.18
456 0.26
457 0.27
458 0.26
459 0.29
460 0.27
461 0.25
462 0.25
463 0.23
464 0.16
465 0.15
466 0.2
467 0.22
468 0.21
469 0.2
470 0.19
471 0.17
472 0.16
473 0.16
474 0.11
475 0.05
476 0.04
477 0.05
478 0.05
479 0.05
480 0.06
481 0.07
482 0.07
483 0.07
484 0.08
485 0.08
486 0.1
487 0.16
488 0.23
489 0.31
490 0.39
491 0.42
492 0.43
493 0.45
494 0.49
495 0.5
496 0.5
497 0.51
498 0.49
499 0.49
500 0.49
501 0.48
502 0.42
503 0.37
504 0.31
505 0.23
506 0.18
507 0.17
508 0.18
509 0.17
510 0.18
511 0.17
512 0.17
513 0.16
514 0.16
515 0.19
516 0.25
517 0.26
518 0.25
519 0.24
520 0.26
521 0.25
522 0.24
523 0.2
524 0.12
525 0.11
526 0.12
527 0.12
528 0.12
529 0.12
530 0.14
531 0.18
532 0.19
533 0.19
534 0.19
535 0.19
536 0.19
537 0.27
538 0.34
539 0.38
540 0.46
541 0.55
542 0.56
543 0.64
544 0.71
545 0.73
546 0.75
547 0.77
548 0.77
549 0.75
550 0.78
551 0.73
552 0.64
553 0.6
554 0.49
555 0.39
556 0.33
557 0.25
558 0.21
559 0.2
560 0.18
561 0.12
562 0.17
563 0.15
564 0.14
565 0.13
566 0.11
567 0.11
568 0.11
569 0.11
570 0.07
571 0.08
572 0.08
573 0.09
574 0.1
575 0.1
576 0.11
577 0.11
578 0.14
579 0.17
580 0.23
581 0.28
582 0.32
583 0.39
584 0.42
585 0.46
586 0.5
587 0.5
588 0.52
589 0.57
590 0.57
591 0.54
592 0.53
593 0.5
594 0.45
595 0.42
596 0.36
597 0.33
598 0.3
599 0.29
600 0.32
601 0.34
602 0.36
603 0.45
604 0.48
605 0.49
606 0.47
607 0.44
608 0.42
609 0.42
610 0.4
611 0.37
612 0.37
613 0.3
614 0.32
615 0.38
616 0.38
617 0.39
618 0.41
619 0.43
620 0.48
621 0.56
622 0.6
623 0.64
624 0.62
625 0.59
626 0.57
627 0.56
628 0.55
629 0.56
630 0.6
631 0.59
632 0.67
633 0.65
634 0.68
635 0.66
636 0.62
637 0.59
638 0.57
639 0.55
640 0.53
641 0.56
642 0.54
643 0.5
644 0.49
645 0.5
646 0.42
647 0.4
648 0.35
649 0.32
650 0.39
651 0.41
652 0.42
653 0.38
654 0.37
655 0.39
656 0.43
657 0.48
658 0.46
659 0.49
660 0.52
661 0.56
662 0.59
663 0.6
664 0.59
665 0.55
666 0.53
667 0.55
668 0.54
669 0.55
670 0.56
671 0.52
672 0.48
673 0.49
674 0.49
675 0.43
676 0.41
677 0.38
678 0.41
679 0.39
680 0.41
681 0.42
682 0.37
683 0.37
684 0.34
685 0.29
686 0.21
687 0.19
688 0.19
689 0.18
690 0.17
691 0.17
692 0.19
693 0.2
694 0.22
695 0.23
696 0.24
697 0.24
698 0.24
699 0.22
700 0.2
701 0.24
702 0.24
703 0.28
704 0.31
705 0.28
706 0.32
707 0.32
708 0.31
709 0.29
710 0.29
711 0.29
712 0.26
713 0.27
714 0.28
715 0.27
716 0.26
717 0.25
718 0.26
719 0.22
720 0.21
721 0.2
722 0.19
723 0.25
724 0.32
725 0.37
726 0.45
727 0.53
728 0.61
729 0.69
730 0.69
731 0.72
732 0.72
733 0.75
734 0.75
735 0.75
736 0.73
737 0.69
738 0.76
739 0.76
740 0.77
741 0.77
742 0.75
743 0.72
744 0.71
745 0.67
746 0.57
747 0.48
748 0.4
749 0.31
750 0.23
751 0.18
752 0.16
753 0.17
754 0.18
755 0.22
756 0.26
757 0.28
758 0.31
759 0.35
760 0.33
761 0.35
762 0.39
763 0.42
764 0.42
765 0.48
766 0.52
767 0.55
768 0.61
769 0.68
770 0.73
771 0.75
772 0.8
773 0.73
774 0.7
775 0.68
776 0.66
777 0.65
778 0.63
779 0.6
780 0.6
781 0.61
782 0.65
783 0.66
784 0.61
785 0.62
786 0.62
787 0.63
788 0.61
789 0.67
790 0.69
791 0.73
792 0.79
793 0.82
794 0.84
795 0.85
796 0.88
797 0.89
798 0.88
799 0.85
800 0.86
801 0.83
802 0.83
803 0.82
804 0.8
805 0.79
806 0.81
807 0.82