Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397TXN0

Protein Details
Accession A0A397TXN0    Localization Confidence High Confidence Score 17
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
236-280QPASVQRRKLHAKKENVDPTEMKMRKKRSTTKRAHNLPRNILRNEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
242-251RRKLHAKKEN
254-268PTEMKMRKKRSTTKR
Subcellular Location(s) nucl 21, mito 3, cyto 3, cyto_mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007527  Znf_SWIM  
Gene Ontology GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF04434  SWIM  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50966  ZF_SWIM  
Amino Acid Sequences MERFYERRLIAIANRHPGRLELSKRFLSPGWQQIDQQKIYFDNSSNTYVVPSANTDESYIVDPSVGTCTCLAALGGTPCKHQAAVAIKYQAGSFNFIPALSLDDCVTYRYIACGMVAEDPAFYAPLRAFSGEQNSEITNKRGIDITSHQGIETPVEHIDASEDDMSARILSVENFFKRILNDIKNNGQILAGIENFKKGYEKSESISMGKLSSYLFQQNSTSQAETVRSGGKIKVQPASVQRRKLHAKKENVDPTEMKMRKKRSTTKRAHNLPRNILRNEQN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.45
3 0.43
4 0.41
5 0.42
6 0.41
7 0.43
8 0.41
9 0.47
10 0.49
11 0.5
12 0.51
13 0.45
14 0.42
15 0.42
16 0.42
17 0.4
18 0.39
19 0.41
20 0.45
21 0.52
22 0.48
23 0.41
24 0.35
25 0.31
26 0.33
27 0.32
28 0.27
29 0.23
30 0.25
31 0.27
32 0.25
33 0.24
34 0.21
35 0.19
36 0.18
37 0.15
38 0.13
39 0.13
40 0.14
41 0.14
42 0.14
43 0.14
44 0.15
45 0.16
46 0.14
47 0.11
48 0.1
49 0.09
50 0.09
51 0.12
52 0.11
53 0.09
54 0.09
55 0.09
56 0.09
57 0.1
58 0.09
59 0.05
60 0.07
61 0.09
62 0.14
63 0.14
64 0.15
65 0.16
66 0.17
67 0.16
68 0.15
69 0.18
70 0.21
71 0.24
72 0.27
73 0.27
74 0.26
75 0.27
76 0.27
77 0.24
78 0.17
79 0.18
80 0.15
81 0.14
82 0.14
83 0.14
84 0.14
85 0.11
86 0.13
87 0.09
88 0.1
89 0.08
90 0.09
91 0.1
92 0.1
93 0.1
94 0.07
95 0.07
96 0.07
97 0.08
98 0.07
99 0.07
100 0.06
101 0.07
102 0.07
103 0.08
104 0.07
105 0.06
106 0.06
107 0.06
108 0.06
109 0.05
110 0.05
111 0.04
112 0.07
113 0.07
114 0.08
115 0.09
116 0.1
117 0.15
118 0.15
119 0.15
120 0.14
121 0.14
122 0.16
123 0.16
124 0.17
125 0.14
126 0.14
127 0.14
128 0.14
129 0.14
130 0.14
131 0.16
132 0.18
133 0.18
134 0.18
135 0.17
136 0.16
137 0.16
138 0.14
139 0.11
140 0.09
141 0.07
142 0.08
143 0.07
144 0.06
145 0.07
146 0.06
147 0.08
148 0.07
149 0.06
150 0.06
151 0.06
152 0.07
153 0.06
154 0.05
155 0.04
156 0.04
157 0.05
158 0.08
159 0.12
160 0.12
161 0.14
162 0.14
163 0.15
164 0.15
165 0.2
166 0.23
167 0.25
168 0.29
169 0.32
170 0.37
171 0.38
172 0.38
173 0.33
174 0.27
175 0.22
176 0.18
177 0.15
178 0.12
179 0.11
180 0.1
181 0.12
182 0.12
183 0.12
184 0.13
185 0.11
186 0.15
187 0.19
188 0.21
189 0.22
190 0.28
191 0.3
192 0.29
193 0.3
194 0.26
195 0.2
196 0.18
197 0.16
198 0.11
199 0.11
200 0.12
201 0.16
202 0.16
203 0.17
204 0.19
205 0.2
206 0.23
207 0.25
208 0.23
209 0.18
210 0.19
211 0.2
212 0.19
213 0.2
214 0.18
215 0.16
216 0.18
217 0.19
218 0.24
219 0.26
220 0.29
221 0.31
222 0.3
223 0.34
224 0.42
225 0.52
226 0.52
227 0.56
228 0.56
229 0.6
230 0.7
231 0.72
232 0.74
233 0.72
234 0.75
235 0.73
236 0.8
237 0.81
238 0.73
239 0.71
240 0.61
241 0.58
242 0.58
243 0.55
244 0.52
245 0.51
246 0.57
247 0.61
248 0.69
249 0.74
250 0.75
251 0.82
252 0.85
253 0.88
254 0.9
255 0.92
256 0.93
257 0.92
258 0.91
259 0.9
260 0.9
261 0.86
262 0.79