FuNGI

A0A397VYQ2

Protein Details

Accession

A0A397VYQ2

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-32	MSSKAIKSSKPKKSKAKRSGRCKNAIKTKVVV	Hydrophilic
106-125	AVYQKLPKDHKKSDPRQGTI	Hydrophilic
246-283	STGLGKPTRKERERKKREKEKERKEKDRKEKDSDRSKE	Basic
325-355	SYRERDREKIREKRKEREKQKLKEKQRAQVV	Basic
439-465	TSETKEHPFNRRRERDRSRKPSVDSKQ	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
6-25	IKSSKPKKSKAKRSGRCKNA
251-278	KPTRKERERKKREKEKERKEKDRKEKDS
315-351	KSKDRSKEKESYRERDREKIREKRKEREKQKLKEKQR

Subcellular Location(s)

nucl 22.5, cyto_nucl 12, mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR039722 Upf3 IPR005120 UPF3_dom
Gene Ontology	GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
Pfam	View protein in Pfam PF03467 Smg4_UPF3
CDD	cd12455 RRM_like_Smg4_UPF3

Amino Acid Sequences

MSSKAIKSSKPKKSKAKRSGRCKNAIKTKVVVRRLPPLLPENLFMESVKQWVNEETVDWCRFHQGRISKSKNKENIFSRAYFHFKSVEQVLEFHRGNENKAVVEFAVYQKLPKDHKKSDPRQGTIENDPDYLAFLESLKVDENKQAILKEPGSGLEGGATQLERLEARLTGAIAAAASNVIEKPKSTPLLDHLRAQKSGAKSKSPPPKQSQVTVLSPPGSPAKSSGSKSKQAQIRGIQVSEATFLSTGLGKPTRKERERKKREKEKERKEKDRKEKDSDRSKETKDEDITKGIEKGQEKVMDVIDERDQEKSNEKSKDRSKEKESYRERDREKIREKRKEREKQKLKEKQRAQVVSAKSETPVVTILTKPQVEEDIKTDAKDKEVKRSAPVKITIQQRQKDQIRQIIKESVKEPAVAESSAEISSQTTATPAASSASITSETKEHPFNRRRERDRSRKPSVDSKQPVQIQILTKSQSQVTSEEDATVSNTPLSTDTTDTTSNLDDQQHTSSNNIQHGGMPPLRQRGGRGYFGKRARW

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.92
2	0.92
3	0.93
4	0.93
5	0.93
6	0.94
7	0.93
8	0.93
9	0.91
10	0.9
11	0.9
12	0.87
13	0.81
14	0.76
15	0.76
16	0.74
17	0.73
18	0.69
19	0.62
20	0.64
21	0.63
22	0.59
23	0.54
24	0.5
25	0.49
26	0.44
27	0.42
28	0.35
29	0.33
30	0.31
31	0.26
32	0.24
33	0.18
34	0.2
35	0.19
36	0.17
37	0.17
38	0.18
39	0.2
40	0.17
41	0.18
42	0.19
43	0.24
44	0.26
45	0.25
46	0.24
47	0.31
48	0.31
49	0.32
50	0.35
51	0.35
52	0.42
53	0.53
54	0.61
55	0.62
56	0.7
57	0.78
58	0.79
59	0.76
60	0.75
61	0.71
62	0.7
63	0.66
64	0.6
65	0.53
66	0.5
67	0.51
68	0.44
69	0.4
70	0.34
71	0.29
72	0.32
73	0.31
74	0.29
75	0.24
76	0.25
77	0.26
78	0.31
79	0.3
80	0.27
81	0.32
82	0.29
83	0.31
84	0.33
85	0.32
86	0.25
87	0.25
88	0.25
89	0.17
90	0.18
91	0.17
92	0.14
93	0.18
94	0.17
95	0.18
96	0.2
97	0.26
98	0.32
99	0.39
100	0.46
101	0.49
102	0.59
103	0.7
104	0.75
105	0.8
106	0.82
107	0.76
108	0.73
109	0.7
110	0.64
111	0.6
112	0.57
113	0.47
114	0.38
115	0.35
116	0.29
117	0.25
118	0.21
119	0.14
120	0.09
121	0.07
122	0.08
123	0.08
124	0.09
125	0.09
126	0.1
127	0.11
128	0.14
129	0.15
130	0.16
131	0.17
132	0.17
133	0.18
134	0.22
135	0.21
136	0.19
137	0.18
138	0.17
139	0.17
140	0.16
141	0.13
142	0.09
143	0.09
144	0.08
145	0.08
146	0.07
147	0.05
148	0.05
149	0.06
150	0.05
151	0.06
152	0.07
153	0.06
154	0.08
155	0.08
156	0.08
157	0.08
158	0.08
159	0.07
160	0.06
161	0.05
162	0.04
163	0.03
164	0.03
165	0.04
166	0.04
167	0.05
168	0.05
169	0.06
170	0.09
171	0.14
172	0.17
173	0.17
174	0.18
175	0.23
176	0.33
177	0.35
178	0.37
179	0.4
180	0.4
181	0.4
182	0.4
183	0.38
184	0.33
185	0.39
186	0.37
187	0.34
188	0.35
189	0.43
190	0.52
191	0.55
192	0.58
193	0.57
194	0.63
195	0.61
196	0.61
197	0.59
198	0.53
199	0.48
200	0.43
201	0.38
202	0.3
203	0.27
204	0.25
205	0.21
206	0.17
207	0.14
208	0.13
209	0.17
210	0.2
211	0.22
212	0.3
213	0.32
214	0.38
215	0.41
216	0.46
217	0.45
218	0.44
219	0.47
220	0.42
221	0.44
222	0.39
223	0.37
224	0.3
225	0.26
226	0.23
227	0.19
228	0.15
229	0.08
230	0.06
231	0.06
232	0.06
233	0.06
234	0.06
235	0.08
236	0.12
237	0.12
238	0.14
239	0.23
240	0.32
241	0.37
242	0.47
243	0.55
244	0.63
245	0.74
246	0.83
247	0.85
248	0.87
249	0.91
250	0.94
251	0.93
252	0.93
253	0.93
254	0.92
255	0.92
256	0.92
257	0.91
258	0.91
259	0.91
260	0.87
261	0.85
262	0.84
263	0.82
264	0.82
265	0.76
266	0.72
267	0.67
268	0.62
269	0.59
270	0.53
271	0.49
272	0.41
273	0.42
274	0.36
275	0.33
276	0.32
277	0.27
278	0.25
279	0.2
280	0.21
281	0.17
282	0.17
283	0.18
284	0.19
285	0.19
286	0.19
287	0.18
288	0.15
289	0.15
290	0.15
291	0.12
292	0.12
293	0.12
294	0.13
295	0.14
296	0.14
297	0.19
298	0.22
299	0.28
300	0.33
301	0.34
302	0.4
303	0.48
304	0.57
305	0.59
306	0.61
307	0.61
308	0.63
309	0.68
310	0.71
311	0.71
312	0.69
313	0.69
314	0.71
315	0.67
316	0.67
317	0.67
318	0.66
319	0.69
320	0.7
321	0.73
322	0.75
323	0.78
324	0.79
325	0.84
326	0.84
327	0.84
328	0.85
329	0.85
330	0.84
331	0.89
332	0.89
333	0.88
334	0.87
335	0.85
336	0.81
337	0.8
338	0.73
339	0.65
340	0.61
341	0.54
342	0.48
343	0.43
344	0.36
345	0.27
346	0.26
347	0.23
348	0.16
349	0.15
350	0.11
351	0.11
352	0.11
353	0.14
354	0.16
355	0.17
356	0.16
357	0.16
358	0.2
359	0.19
360	0.2
361	0.2
362	0.22
363	0.22
364	0.23
365	0.26
366	0.22
367	0.25
368	0.31
369	0.3
370	0.34
371	0.41
372	0.42
373	0.45
374	0.51
375	0.51
376	0.5
377	0.52
378	0.46
379	0.46
380	0.53
381	0.54
382	0.56
383	0.56
384	0.55
385	0.61
386	0.63
387	0.63
388	0.62
389	0.62
390	0.6
391	0.58
392	0.57
393	0.56
394	0.51
395	0.48
396	0.43
397	0.39
398	0.33
399	0.31
400	0.27
401	0.22
402	0.22
403	0.18
404	0.17
405	0.13
406	0.14
407	0.13
408	0.13
409	0.09
410	0.08
411	0.09
412	0.09
413	0.08
414	0.07
415	0.07
416	0.07
417	0.07
418	0.07
419	0.07
420	0.07
421	0.08
422	0.08
423	0.09
424	0.11
425	0.11
426	0.12
427	0.14
428	0.16
429	0.19
430	0.25
431	0.28
432	0.36
433	0.45
434	0.54
435	0.62
436	0.71
437	0.75
438	0.79
439	0.86
440	0.87
441	0.89
442	0.89
443	0.88
444	0.85
445	0.83
446	0.83
447	0.8
448	0.8
449	0.76
450	0.71
451	0.69
452	0.65
453	0.62
454	0.54
455	0.52
456	0.45
457	0.42
458	0.43
459	0.36
460	0.34
461	0.34
462	0.33
463	0.3
464	0.28
465	0.25
466	0.24
467	0.26
468	0.25
469	0.24
470	0.22
471	0.2
472	0.2
473	0.2
474	0.16
475	0.12
476	0.11
477	0.11
478	0.12
479	0.15
480	0.15
481	0.16
482	0.17
483	0.19
484	0.21
485	0.21
486	0.22
487	0.2
488	0.2
489	0.21
490	0.23
491	0.22
492	0.23
493	0.27
494	0.29
495	0.28
496	0.29
497	0.32
498	0.34
499	0.36
500	0.35
501	0.31
502	0.3
503	0.33
504	0.37
505	0.33
506	0.33
507	0.34
508	0.41
509	0.44
510	0.42
511	0.42
512	0.45
513	0.48
514	0.52
515	0.54
516	0.53
517	0.59

A0A397VYQ2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer