Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397UH50

Protein Details
Accession A0A397UH50    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
4-25PDVPERPKYRAGRKPTAVKIYTHydrophilic
278-297SEETKSKTTSEREPKKRRRIBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
289-297REPKKRRRI
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 14.333, mito_nucl 11.999
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR039599  RBM48  
IPR034264  RBM48_RRM  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12442  RRM_RBM48  
Amino Acid Sequences MSDPDVPERPKYRAGRKPTAVKIYTVNHESRYLVVENVPALGLSKELLELFSLYGTIEEYRYLDDYPCEKFTDVYWIKFQSIAEARVAKRKVDDHSFFSSYLRVRYGPEYETIEDTRQKLQDRRKVVAIKTREHDENKDVKSTTTPNTTTFPSAYSTTESISSSTTLPYPQIYDHTNYMYSNYYYSYPYSTYYSQEPPIPGVDYQHNQEPPIPGVGYQHSQEPPIPGITSVDYESTSFAAKSYPQPYDSQSSTVLSIRQRLKEVSTVPTTLPQSNTQSEETKSKTTSEREPKKRRRI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.69
2 0.72
3 0.76
4 0.81
5 0.81
6 0.82
7 0.73
8 0.66
9 0.64
10 0.58
11 0.56
12 0.52
13 0.45
14 0.38
15 0.38
16 0.37
17 0.31
18 0.3
19 0.24
20 0.2
21 0.19
22 0.18
23 0.16
24 0.15
25 0.14
26 0.1
27 0.1
28 0.09
29 0.08
30 0.06
31 0.06
32 0.07
33 0.07
34 0.07
35 0.07
36 0.07
37 0.07
38 0.07
39 0.07
40 0.06
41 0.06
42 0.07
43 0.07
44 0.07
45 0.07
46 0.08
47 0.09
48 0.11
49 0.11
50 0.11
51 0.14
52 0.16
53 0.19
54 0.2
55 0.21
56 0.2
57 0.19
58 0.19
59 0.27
60 0.27
61 0.26
62 0.28
63 0.28
64 0.28
65 0.29
66 0.28
67 0.25
68 0.26
69 0.25
70 0.24
71 0.27
72 0.28
73 0.34
74 0.35
75 0.28
76 0.28
77 0.3
78 0.32
79 0.36
80 0.39
81 0.36
82 0.41
83 0.42
84 0.4
85 0.36
86 0.34
87 0.27
88 0.25
89 0.21
90 0.16
91 0.16
92 0.19
93 0.2
94 0.18
95 0.19
96 0.21
97 0.2
98 0.22
99 0.22
100 0.21
101 0.22
102 0.22
103 0.23
104 0.23
105 0.26
106 0.3
107 0.38
108 0.42
109 0.45
110 0.46
111 0.49
112 0.51
113 0.49
114 0.51
115 0.47
116 0.44
117 0.42
118 0.43
119 0.41
120 0.38
121 0.38
122 0.36
123 0.38
124 0.35
125 0.35
126 0.32
127 0.28
128 0.28
129 0.28
130 0.25
131 0.22
132 0.22
133 0.21
134 0.23
135 0.23
136 0.22
137 0.19
138 0.17
139 0.15
140 0.15
141 0.14
142 0.14
143 0.13
144 0.12
145 0.13
146 0.13
147 0.11
148 0.1
149 0.1
150 0.09
151 0.09
152 0.09
153 0.08
154 0.08
155 0.08
156 0.09
157 0.08
158 0.1
159 0.12
160 0.14
161 0.15
162 0.15
163 0.16
164 0.15
165 0.16
166 0.15
167 0.14
168 0.12
169 0.12
170 0.12
171 0.12
172 0.13
173 0.13
174 0.12
175 0.13
176 0.16
177 0.16
178 0.17
179 0.2
180 0.22
181 0.22
182 0.24
183 0.23
184 0.2
185 0.2
186 0.2
187 0.16
188 0.16
189 0.19
190 0.18
191 0.2
192 0.25
193 0.24
194 0.23
195 0.25
196 0.25
197 0.21
198 0.22
199 0.19
200 0.14
201 0.16
202 0.18
203 0.17
204 0.16
205 0.19
206 0.18
207 0.19
208 0.2
209 0.2
210 0.19
211 0.18
212 0.18
213 0.14
214 0.15
215 0.14
216 0.14
217 0.13
218 0.12
219 0.11
220 0.11
221 0.12
222 0.11
223 0.11
224 0.09
225 0.08
226 0.09
227 0.11
228 0.17
229 0.21
230 0.24
231 0.25
232 0.27
233 0.31
234 0.36
235 0.35
236 0.31
237 0.28
238 0.26
239 0.26
240 0.26
241 0.26
242 0.22
243 0.28
244 0.32
245 0.33
246 0.35
247 0.35
248 0.37
249 0.39
250 0.4
251 0.38
252 0.36
253 0.34
254 0.32
255 0.36
256 0.36
257 0.34
258 0.34
259 0.32
260 0.34
261 0.37
262 0.39
263 0.37
264 0.37
265 0.37
266 0.41
267 0.41
268 0.4
269 0.38
270 0.38
271 0.41
272 0.43
273 0.5
274 0.54
275 0.61
276 0.67
277 0.77