Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397UMH6

Protein Details
Accession A0A397UMH6    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
366-409IDGQDKTGPHRRKNRNRKSHDPSIQSKHRKSRKRNVAKFDSSNSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
374-400PHRRKNRNRKSHDPSIQSKHRKSRKRN
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 15
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000467  G_patch_dom  
IPR043560  ZGPAT  
Gene Ontology GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0045892  P:negative regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF01585  G-patch  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50174  G_PATCH  
CDD cd20384  Tudor_ZGPAT  
Amino Acid Sequences MSVKTNLSTTEIERSLKENEESLREIRELLVLSPEDPELNNLAGDLQSMMEVQRQQLLLSKKKDLLALIGCPAETLHDDIGHTIETQSDIQTYTEENPINTNTETDSLHIGDKCCIPFTHPENQKVYFLPGLIQSINSDANTHNILILTPITPSARMCKKYLSNQCVSPCPRGHSHGEEISSDLVAPYELLHIGQIDAYKVGSNCWAKYENDEVWYMAKLVGIEAGGNGFRVIYKGYENEHPHGVVVGPDEIIPVRGLDDMEEDNEDDGDDNSSQSDYSNYESDSFSDDIDSPPKEPKDFEDIHIFNSSNDEIRFAEWEKHTKGIASKLMAKMGYKMGEGLGKNSNGITNPIEVKVYDKVISLDNIDGQDKTGPHRRKNRNRKSHDPSIQSKHRKSRKRNVAKFDSSNSVEIFELQHPTVFDYLNSSLNKGDGKQSTHVSQRPRNSSETNHNIALYQIQQQLNQTNRELQKAKESLQRNEKKDPTMAKHFREKISQIEVTCKALKRKEQEIQNGIDKAKGRKKMTIF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.33
3 0.34
4 0.33
5 0.29
6 0.3
7 0.33
8 0.35
9 0.34
10 0.33
11 0.29
12 0.29
13 0.25
14 0.24
15 0.2
16 0.17
17 0.2
18 0.17
19 0.17
20 0.18
21 0.18
22 0.15
23 0.15
24 0.16
25 0.13
26 0.13
27 0.13
28 0.11
29 0.11
30 0.1
31 0.1
32 0.09
33 0.06
34 0.06
35 0.07
36 0.07
37 0.1
38 0.12
39 0.12
40 0.16
41 0.16
42 0.16
43 0.22
44 0.3
45 0.35
46 0.38
47 0.43
48 0.42
49 0.44
50 0.46
51 0.41
52 0.39
53 0.34
54 0.31
55 0.29
56 0.25
57 0.23
58 0.21
59 0.2
60 0.15
61 0.13
62 0.13
63 0.11
64 0.12
65 0.12
66 0.13
67 0.14
68 0.13
69 0.12
70 0.09
71 0.09
72 0.1
73 0.11
74 0.11
75 0.1
76 0.11
77 0.11
78 0.11
79 0.13
80 0.13
81 0.18
82 0.18
83 0.18
84 0.19
85 0.21
86 0.23
87 0.21
88 0.2
89 0.15
90 0.17
91 0.17
92 0.15
93 0.16
94 0.14
95 0.17
96 0.19
97 0.18
98 0.19
99 0.22
100 0.21
101 0.21
102 0.2
103 0.19
104 0.25
105 0.29
106 0.37
107 0.4
108 0.46
109 0.48
110 0.5
111 0.5
112 0.43
113 0.41
114 0.32
115 0.25
116 0.2
117 0.17
118 0.17
119 0.15
120 0.14
121 0.11
122 0.12
123 0.13
124 0.12
125 0.12
126 0.1
127 0.12
128 0.13
129 0.13
130 0.11
131 0.1
132 0.1
133 0.1
134 0.1
135 0.08
136 0.07
137 0.08
138 0.08
139 0.09
140 0.09
141 0.16
142 0.23
143 0.25
144 0.27
145 0.32
146 0.37
147 0.47
148 0.56
149 0.55
150 0.52
151 0.54
152 0.56
153 0.57
154 0.55
155 0.52
156 0.44
157 0.41
158 0.4
159 0.39
160 0.41
161 0.38
162 0.39
163 0.36
164 0.35
165 0.31
166 0.29
167 0.25
168 0.2
169 0.15
170 0.1
171 0.07
172 0.05
173 0.05
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.04
178 0.05
179 0.05
180 0.05
181 0.06
182 0.06
183 0.05
184 0.05
185 0.06
186 0.07
187 0.07
188 0.07
189 0.13
190 0.14
191 0.14
192 0.17
193 0.2
194 0.18
195 0.22
196 0.26
197 0.21
198 0.21
199 0.22
200 0.19
201 0.18
202 0.18
203 0.15
204 0.1
205 0.09
206 0.07
207 0.06
208 0.06
209 0.05
210 0.05
211 0.04
212 0.05
213 0.04
214 0.04
215 0.04
216 0.03
217 0.03
218 0.04
219 0.05
220 0.05
221 0.06
222 0.08
223 0.1
224 0.17
225 0.2
226 0.22
227 0.22
228 0.21
229 0.2
230 0.19
231 0.17
232 0.1
233 0.08
234 0.06
235 0.05
236 0.05
237 0.06
238 0.05
239 0.06
240 0.05
241 0.04
242 0.04
243 0.05
244 0.05
245 0.05
246 0.06
247 0.06
248 0.07
249 0.07
250 0.06
251 0.06
252 0.06
253 0.06
254 0.05
255 0.05
256 0.05
257 0.05
258 0.05
259 0.05
260 0.05
261 0.05
262 0.05
263 0.06
264 0.06
265 0.08
266 0.09
267 0.09
268 0.11
269 0.11
270 0.11
271 0.14
272 0.13
273 0.11
274 0.11
275 0.11
276 0.1
277 0.13
278 0.13
279 0.11
280 0.15
281 0.16
282 0.16
283 0.16
284 0.18
285 0.23
286 0.24
287 0.25
288 0.29
289 0.29
290 0.3
291 0.32
292 0.29
293 0.21
294 0.22
295 0.2
296 0.13
297 0.13
298 0.12
299 0.11
300 0.11
301 0.13
302 0.12
303 0.17
304 0.17
305 0.22
306 0.22
307 0.23
308 0.23
309 0.23
310 0.24
311 0.23
312 0.25
313 0.22
314 0.26
315 0.25
316 0.27
317 0.26
318 0.24
319 0.21
320 0.21
321 0.19
322 0.14
323 0.13
324 0.12
325 0.15
326 0.15
327 0.16
328 0.17
329 0.16
330 0.16
331 0.16
332 0.16
333 0.13
334 0.15
335 0.13
336 0.12
337 0.13
338 0.14
339 0.14
340 0.13
341 0.15
342 0.15
343 0.15
344 0.14
345 0.13
346 0.13
347 0.14
348 0.15
349 0.14
350 0.12
351 0.12
352 0.13
353 0.13
354 0.12
355 0.11
356 0.13
357 0.13
358 0.17
359 0.25
360 0.31
361 0.38
362 0.49
363 0.6
364 0.68
365 0.79
366 0.86
367 0.87
368 0.9
369 0.92
370 0.9
371 0.9
372 0.87
373 0.83
374 0.81
375 0.79
376 0.8
377 0.79
378 0.78
379 0.78
380 0.79
381 0.81
382 0.83
383 0.84
384 0.86
385 0.87
386 0.88
387 0.88
388 0.89
389 0.87
390 0.81
391 0.74
392 0.69
393 0.6
394 0.53
395 0.43
396 0.34
397 0.26
398 0.22
399 0.21
400 0.16
401 0.16
402 0.15
403 0.16
404 0.14
405 0.16
406 0.17
407 0.14
408 0.12
409 0.14
410 0.16
411 0.2
412 0.21
413 0.2
414 0.19
415 0.2
416 0.22
417 0.18
418 0.23
419 0.22
420 0.26
421 0.29
422 0.33
423 0.36
424 0.42
425 0.46
426 0.48
427 0.51
428 0.56
429 0.6
430 0.6
431 0.61
432 0.58
433 0.6
434 0.61
435 0.62
436 0.57
437 0.51
438 0.47
439 0.41
440 0.37
441 0.33
442 0.25
443 0.23
444 0.25
445 0.24
446 0.26
447 0.29
448 0.36
449 0.38
450 0.39
451 0.35
452 0.37
453 0.39
454 0.45
455 0.45
456 0.4
457 0.45
458 0.45
459 0.48
460 0.47
461 0.51
462 0.53
463 0.61
464 0.68
465 0.64
466 0.7
467 0.71
468 0.67
469 0.68
470 0.67
471 0.64
472 0.66
473 0.69
474 0.65
475 0.7
476 0.73
477 0.7
478 0.68
479 0.63
480 0.59
481 0.58
482 0.56
483 0.47
484 0.48
485 0.47
486 0.44
487 0.47
488 0.45
489 0.45
490 0.48
491 0.55
492 0.55
493 0.62
494 0.65
495 0.68
496 0.73
497 0.72
498 0.71
499 0.7
500 0.67
501 0.58
502 0.54
503 0.49
504 0.49
505 0.51
506 0.54
507 0.51