FuNGI

A0A397VHD9

Protein Details

Accession

A0A397VHD9

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
87-109	QPVHRNHRSLFRQKKRQALETNE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 15, mito 4, cyto 3, pero 2, E.R. 1, golg 1, cysk 1

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013929 RNA_pol_II_AP1_C IPR039913 RPAP1/Rba50
Gene Ontology	GO:0006366 P:transcription by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF08620 RPAP1_C

Amino Acid Sequences

MSEEDLLRLQEEFFAKNTRPAATVRAQRFNLDLEENVREHEPISKKVLDLRSHTTGIVRGVTENISNGPVIAPSFPNVSAPIDGFPQPVHRNHRSLFRQKKRQALETNENVKAGDSNIYGNQKIEGSKQNISSSTKLNINHQDPSPKTFESEDSMLLEMKKKFYPDTPIEYEKLEWMGVDFKNDKAQSSCEPQKKDHGSSVTTPLDSPEASYRFDFNGKIIDKNSTVPSYIGLHHHGAEPDRAGYTLDELLHLMRSVVPSQRTIPLNVIGRIIRKVRAGYYGVETGRRIIDWAIKLKLPTYLRIALDDKFETVIIAAIDTISAWIIGGPKEFYQEEKLWGKVGRLYRGCEFVSLGVRNDAQTKKYFGIEISAYEAEEEYDTMETHVKLASKDLIAGLISMDITHRLLYLLESVRLPRVTNEQILLMLVRFARHSRKTAKIIFECHRLLDVVHNKFLCVAWPPTNNDDSSNESRYPNLAAAKLIHILCQSSKKISKEIINRYMNTFLRYIAINPASFSNEFEMTIGYNFFQETLCIYQTLAAYGLYHEIFSQTYCIVNWYLVREILYSLTPPWEWKNSDNYQMQQKLGIATSFFRLLEIWIRVQDTESGNIKECGAQPSEIIRDSVDFLANWMNTFSFSLLSQNLDIHEDYEKTLNLISSVTRYIATWCKYLGEHHLKDISEIQGIWEKLCLACWPSSHLCNYLRHQLTNQIQNTQKLSRDEIWQISNLSGAYHSSTYKYISETISISIICDTYLSYVSLIYQTCQLLSNDNNFSLKALEMIKSSIPIEPLQLYSVKNSVKGDWLDFFNRMHTYLLYEWMIAISMLIDNIGTNEIKFQNLTSLLHDALIIMPNILPGDEKMALDVLGRIVNGISSKSPDTSMRECINILISFYERLIVTNNNDNRENYTLLWDNGTSDGLPLLKNWIWTPIDILYSKKSDLVMDTEVRIEIVRNCLTLVCEVMKICKNITNSSTVKFIMDPITMIISIMKIFMLDGEIYRAPDIEQRIEKIISSFTFQQSSANNTKLIKQFLEDTAGVLAVPFYQFFTDFSAAYAAGSYGNKSFAQLLILPITSIYPVDFKHLVWSDLHDILGTIGIEYKDVICLEPLNSYFWPLESNTTILQAYVGAVIHCKVTREKAPFMYWLAIHHLNGYVFFKDWEVSENDHQKRIDISNAIIKSKKSIVINDWIKYTSRNFGEEVGELVKMPQCFMDVEEEVQRRIEIIKTFKIELDEEIF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.24
2	0.24
3	0.3
4	0.32
5	0.3
6	0.3
7	0.3
8	0.34
9	0.37
10	0.45
11	0.46
12	0.52
13	0.51
14	0.51
15	0.51
16	0.47
17	0.43
18	0.36
19	0.31
20	0.26
21	0.29
22	0.28
23	0.28
24	0.26
25	0.22
26	0.2
27	0.27
28	0.27
29	0.27
30	0.33
31	0.33
32	0.33
33	0.41
34	0.48
35	0.46
36	0.47
37	0.5
38	0.49
39	0.49
40	0.48
41	0.42
42	0.37
43	0.34
44	0.3
45	0.24
46	0.19
47	0.19
48	0.2
49	0.19
50	0.18
51	0.16
52	0.15
53	0.14
54	0.13
55	0.11
56	0.11
57	0.11
58	0.12
59	0.11
60	0.12
61	0.15
62	0.15
63	0.16
64	0.17
65	0.18
66	0.17
67	0.17
68	0.17
69	0.17
70	0.18
71	0.18
72	0.17
73	0.23
74	0.26
75	0.33
76	0.4
77	0.44
78	0.49
79	0.51
80	0.6
81	0.62
82	0.68
83	0.72
84	0.74
85	0.79
86	0.8
87	0.87
88	0.83
89	0.83
90	0.81
91	0.8
92	0.79
93	0.78
94	0.78
95	0.71
96	0.64
97	0.54
98	0.45
99	0.37
100	0.28
101	0.21
102	0.15
103	0.15
104	0.2
105	0.24
106	0.25
107	0.24
108	0.24
109	0.23
110	0.23
111	0.26
112	0.29
113	0.3
114	0.35
115	0.38
116	0.4
117	0.42
118	0.45
119	0.43
120	0.38
121	0.38
122	0.38
123	0.36
124	0.4
125	0.45
126	0.44
127	0.46
128	0.46
129	0.5
130	0.47
131	0.51
132	0.48
133	0.39
134	0.38
135	0.35
136	0.34
137	0.3
138	0.3
139	0.26
140	0.23
141	0.24
142	0.23
143	0.22
144	0.26
145	0.22
146	0.23
147	0.24
148	0.25
149	0.26
150	0.29
151	0.37
152	0.37
153	0.43
154	0.46
155	0.48
156	0.48
157	0.47
158	0.43
159	0.36
160	0.31
161	0.23
162	0.16
163	0.13
164	0.17
165	0.16
166	0.21
167	0.2
168	0.2
169	0.28
170	0.29
171	0.3
172	0.26
173	0.3
174	0.29
175	0.37
176	0.45
177	0.45
178	0.49
179	0.5
180	0.58
181	0.61
182	0.6
183	0.57
184	0.52
185	0.49
186	0.49
187	0.53
188	0.46
189	0.39
190	0.35
191	0.29
192	0.27
193	0.23
194	0.21
195	0.21
196	0.2
197	0.21
198	0.23
199	0.23
200	0.23
201	0.26
202	0.24
203	0.18
204	0.25
205	0.24
206	0.26
207	0.26
208	0.27
209	0.26
210	0.29
211	0.32
212	0.25
213	0.25
214	0.22
215	0.22
216	0.21
217	0.22
218	0.21
219	0.21
220	0.21
221	0.21
222	0.23
223	0.23
224	0.22
225	0.21
226	0.2
227	0.17
228	0.16
229	0.15
230	0.14
231	0.12
232	0.13
233	0.13
234	0.12
235	0.11
236	0.11
237	0.12
238	0.11
239	0.11
240	0.09
241	0.08
242	0.1
243	0.12
244	0.16
245	0.17
246	0.19
247	0.21
248	0.27
249	0.28
250	0.28
251	0.28
252	0.29
253	0.32
254	0.3
255	0.31
256	0.26
257	0.27
258	0.29
259	0.29
260	0.26
261	0.24
262	0.25
263	0.24
264	0.27
265	0.27
266	0.25
267	0.27
268	0.29
269	0.27
270	0.27
271	0.26
272	0.23
273	0.22
274	0.19
275	0.16
276	0.12
277	0.17
278	0.19
279	0.24
280	0.25
281	0.25
282	0.26
283	0.25
284	0.31
285	0.26
286	0.25
287	0.26
288	0.29
289	0.28
290	0.32
291	0.33
292	0.27
293	0.3
294	0.27
295	0.22
296	0.17
297	0.17
298	0.13
299	0.11
300	0.11
301	0.07
302	0.06
303	0.05
304	0.05
305	0.05
306	0.04
307	0.04
308	0.03
309	0.03
310	0.03
311	0.04
312	0.05
313	0.06
314	0.07
315	0.08
316	0.09
317	0.12
318	0.13
319	0.14
320	0.18
321	0.19
322	0.25
323	0.26
324	0.27
325	0.26
326	0.27
327	0.26
328	0.26
329	0.29
330	0.31
331	0.31
332	0.34
333	0.33
334	0.36
335	0.36
336	0.31
337	0.27
338	0.21
339	0.24
340	0.21
341	0.2
342	0.18
343	0.18
344	0.18
345	0.23
346	0.23
347	0.2
348	0.21
349	0.24
350	0.24
351	0.24
352	0.24
353	0.18
354	0.2
355	0.18
356	0.16
357	0.17
358	0.16
359	0.14
360	0.14
361	0.14
362	0.1
363	0.1
364	0.09
365	0.05
366	0.06
367	0.06
368	0.07
369	0.09
370	0.08
371	0.09
372	0.1
373	0.11
374	0.1
375	0.12
376	0.14
377	0.12
378	0.13
379	0.12
380	0.11
381	0.1
382	0.1
383	0.08
384	0.05
385	0.05
386	0.04
387	0.04
388	0.05
389	0.05
390	0.05
391	0.05
392	0.05
393	0.06
394	0.06
395	0.1
396	0.11
397	0.12
398	0.12
399	0.13
400	0.15
401	0.16
402	0.16
403	0.13
404	0.18
405	0.2
406	0.21
407	0.2
408	0.18
409	0.18
410	0.17
411	0.16
412	0.1
413	0.08
414	0.07
415	0.07
416	0.07
417	0.1
418	0.17
419	0.2
420	0.26
421	0.31
422	0.38
423	0.44
424	0.49
425	0.55
426	0.51
427	0.56
428	0.54
429	0.54
430	0.47
431	0.41
432	0.36
433	0.27
434	0.24
435	0.25
436	0.29
437	0.25
438	0.28
439	0.28
440	0.27
441	0.27
442	0.27
443	0.2
444	0.15
445	0.16
446	0.17
447	0.21
448	0.24
449	0.26
450	0.28
451	0.27
452	0.26
453	0.25
454	0.27
455	0.28
456	0.28
457	0.27
458	0.25
459	0.26
460	0.24
461	0.23
462	0.19
463	0.17
464	0.14
465	0.13
466	0.13
467	0.14
468	0.17
469	0.15
470	0.14
471	0.12
472	0.12
473	0.13
474	0.17
475	0.17
476	0.19
477	0.24
478	0.25
479	0.27
480	0.3
481	0.36
482	0.4
483	0.47
484	0.52
485	0.51
486	0.5
487	0.5
488	0.52
489	0.46
490	0.39
491	0.31
492	0.21
493	0.18
494	0.17
495	0.16
496	0.15
497	0.16
498	0.14
499	0.14
500	0.14
501	0.15
502	0.15
503	0.15
504	0.13
505	0.11
506	0.11
507	0.11
508	0.1
509	0.08
510	0.08
511	0.08
512	0.06
513	0.05
514	0.05
515	0.06
516	0.05
517	0.05
518	0.06
519	0.07
520	0.08
521	0.08
522	0.08
523	0.1
524	0.1
525	0.1
526	0.09
527	0.07
528	0.07
529	0.07
530	0.08
531	0.06
532	0.06
533	0.06
534	0.06
535	0.06
536	0.06
537	0.07
538	0.06
539	0.06
540	0.06
541	0.07
542	0.07
543	0.08
544	0.08
545	0.09
546	0.1
547	0.1
548	0.1
549	0.09
550	0.09
551	0.09
552	0.09
553	0.07
554	0.07
555	0.08
556	0.08
557	0.09
558	0.1
559	0.13
560	0.15
561	0.17
562	0.24
563	0.25
564	0.32
565	0.33
566	0.33
567	0.37
568	0.37
569	0.35
570	0.28
571	0.26
572	0.2
573	0.18
574	0.16
575	0.09
576	0.08
577	0.09
578	0.09
579	0.08
580	0.07
581	0.07
582	0.07
583	0.1
584	0.11
585	0.11
586	0.11
587	0.11
588	0.11
589	0.11
590	0.14
591	0.11
592	0.13
593	0.15
594	0.15
595	0.16
596	0.16
597	0.16
598	0.15
599	0.15
600	0.14
601	0.13
602	0.12
603	0.11
604	0.13
605	0.14
606	0.13
607	0.12
608	0.09
609	0.09
610	0.1
611	0.1
612	0.09
613	0.07
614	0.07
615	0.09
616	0.09
617	0.09
618	0.08
619	0.07
620	0.07
621	0.08
622	0.07
623	0.05
624	0.05
625	0.07
626	0.07
627	0.08
628	0.08
629	0.08
630	0.08
631	0.09
632	0.09
633	0.08
634	0.09
635	0.08
636	0.09
637	0.1
638	0.09
639	0.08
640	0.08
641	0.07
642	0.07
643	0.07
644	0.06
645	0.06
646	0.07
647	0.07
648	0.07
649	0.07
650	0.1
651	0.14
652	0.16
653	0.15
654	0.15
655	0.15
656	0.16
657	0.17
658	0.23
659	0.27
660	0.26
661	0.27
662	0.3
663	0.29
664	0.29
665	0.3
666	0.22
667	0.14
668	0.13
669	0.12
670	0.13
671	0.13
672	0.13
673	0.11
674	0.1
675	0.09
676	0.1
677	0.1
678	0.07
679	0.08
680	0.09
681	0.13
682	0.15
683	0.17
684	0.18
685	0.22
686	0.23
687	0.26
688	0.29
689	0.33
690	0.32
691	0.31
692	0.31
693	0.35
694	0.36
695	0.4
696	0.38
697	0.34
698	0.35
699	0.37
700	0.4
701	0.34
702	0.33
703	0.26
704	0.29
705	0.26
706	0.27
707	0.28
708	0.27
709	0.26
710	0.23
711	0.22
712	0.18
713	0.17
714	0.13
715	0.1
716	0.08
717	0.07
718	0.07
719	0.08
720	0.08
721	0.09
722	0.1
723	0.11
724	0.12
725	0.13
726	0.13
727	0.13
728	0.14
729	0.13
730	0.13
731	0.12
732	0.11
733	0.1
734	0.09
735	0.08
736	0.06
737	0.06
738	0.05
739	0.05
740	0.06
741	0.06
742	0.06
743	0.06
744	0.06
745	0.08
746	0.09
747	0.08
748	0.09
749	0.09
750	0.1
751	0.11
752	0.11
753	0.12
754	0.14
755	0.19
756	0.18
757	0.19
758	0.19
759	0.17
760	0.17
761	0.15
762	0.13
763	0.1
764	0.1
765	0.1
766	0.1
767	0.11
768	0.11
769	0.11
770	0.12
771	0.11
772	0.11
773	0.1
774	0.11
775	0.11
776	0.11
777	0.12
778	0.13
779	0.12
780	0.12
781	0.17
782	0.16
783	0.17
784	0.18
785	0.17
786	0.2
787	0.2
788	0.2
789	0.18
790	0.21
791	0.2
792	0.2
793	0.2
794	0.18
795	0.18
796	0.17
797	0.16
798	0.13
799	0.14
800	0.14
801	0.16
802	0.14
803	0.13
804	0.12
805	0.11
806	0.11
807	0.07
808	0.06
809	0.04
810	0.03
811	0.03
812	0.03
813	0.03
814	0.03
815	0.04
816	0.05
817	0.05
818	0.05
819	0.08
820	0.09
821	0.1
822	0.1
823	0.1
824	0.12
825	0.13
826	0.14
827	0.13
828	0.14
829	0.14
830	0.14
831	0.14
832	0.11
833	0.1
834	0.1
835	0.08
836	0.06
837	0.06
838	0.06
839	0.06
840	0.06
841	0.06
842	0.04
843	0.08
844	0.09
845	0.09
846	0.09
847	0.09
848	0.1
849	0.09
850	0.1
851	0.07
852	0.06
853	0.06
854	0.06
855	0.06
856	0.06
857	0.07
858	0.07
859	0.07
860	0.09
861	0.1
862	0.11
863	0.13
864	0.15
865	0.21
866	0.23
867	0.28
868	0.27
869	0.27
870	0.27
871	0.26
872	0.26
873	0.2
874	0.18
875	0.13
876	0.12
877	0.12
878	0.12
879	0.13
880	0.09
881	0.09
882	0.11
883	0.13
884	0.15
885	0.23
886	0.27
887	0.29
888	0.31
889	0.31
890	0.33
891	0.33
892	0.32
893	0.23
894	0.25
895	0.24
896	0.22
897	0.23
898	0.19
899	0.17
900	0.16
901	0.16
902	0.11
903	0.08
904	0.09
905	0.08
906	0.08
907	0.07
908	0.12
909	0.12
910	0.14
911	0.14
912	0.18
913	0.19
914	0.18
915	0.21
916	0.17
917	0.19
918	0.19
919	0.21
920	0.19
921	0.2
922	0.21
923	0.2
924	0.19
925	0.17
926	0.17
927	0.19
928	0.19
929	0.19
930	0.19
931	0.18
932	0.17
933	0.17
934	0.15
935	0.13
936	0.11
937	0.15
938	0.15
939	0.15
940	0.15
941	0.15
942	0.16
943	0.15
944	0.15
945	0.11
946	0.12
947	0.12
948	0.17
949	0.2
950	0.2
951	0.21
952	0.24
953	0.25
954	0.28
955	0.29
956	0.32
957	0.3
958	0.31
959	0.33
960	0.28
961	0.26
962	0.23
963	0.23
964	0.18
965	0.16
966	0.15
967	0.12
968	0.13
969	0.12
970	0.12
971	0.1
972	0.08
973	0.07
974	0.07
975	0.06
976	0.05
977	0.05
978	0.05
979	0.06
980	0.06
981	0.06
982	0.1
983	0.11
984	0.12
985	0.12
986	0.12
987	0.11
988	0.15
989	0.18
990	0.2
991	0.22
992	0.23
993	0.27
994	0.27
995	0.26
996	0.24
997	0.24
998	0.19
999	0.21
1000	0.22
1001	0.21
1002	0.23
1003	0.22
1004	0.25
1005	0.23
1006	0.3
1007	0.31
1008	0.29
1009	0.3
1010	0.29
1011	0.35
1012	0.37
1013	0.38
1014	0.31
1015	0.28
1016	0.3
1017	0.29
1018	0.33
1019	0.26
1020	0.22
1021	0.19
1022	0.18
1023	0.16
1024	0.12
1025	0.1
1026	0.06
1027	0.06
1028	0.05
1029	0.06
1030	0.06
1031	0.07
1032	0.08
1033	0.14
1034	0.15
1035	0.14
1036	0.15
1037	0.15
1038	0.15
1039	0.14
1040	0.13
1041	0.08
1042	0.09
1043	0.09
1044	0.1
1045	0.1
1046	0.13
1047	0.13
1048	0.13
1049	0.14
1050	0.13
1051	0.15
1052	0.15
1053	0.16
1054	0.16
1055	0.16
1056	0.14
1057	0.13
1058	0.13
1059	0.11
1060	0.1
1061	0.08
1062	0.08
1063	0.09
1064	0.15
1065	0.15
1066	0.15
1067	0.23
1068	0.25
1069	0.25
1070	0.24
1071	0.28
1072	0.27
1073	0.27
1074	0.27
1075	0.18
1076	0.17
1077	0.16
1078	0.17
1079	0.12
1080	0.07
1081	0.09
1082	0.09
1083	0.09
1084	0.1
1085	0.1
1086	0.1
1087	0.11
1088	0.11
1089	0.09
1090	0.11
1091	0.11
1092	0.15
1093	0.16
1094	0.17
1095	0.17
1096	0.19
1097	0.19
1098	0.18
1099	0.19
1100	0.16
1101	0.2
1102	0.18
1103	0.2
1104	0.18
1105	0.2
1106	0.2
1107	0.17
1108	0.16
1109	0.12
1110	0.1
1111	0.09
1112	0.09
1113	0.07
1114	0.08
1115	0.09
1116	0.12
1117	0.12
1118	0.14
1119	0.17
1120	0.23
1121	0.31
1122	0.36
1123	0.41
1124	0.44
1125	0.46
1126	0.47
1127	0.47
1128	0.44
1129	0.37
1130	0.33
1131	0.34
1132	0.31
1133	0.28
1134	0.26
1135	0.25
1136	0.21
1137	0.23
1138	0.24
1139	0.18
1140	0.16
1141	0.17
1142	0.16
1143	0.14
1144	0.15
1145	0.16
1146	0.17
1147	0.21
1148	0.29
1149	0.39
1150	0.41
1151	0.46
1152	0.46
1153	0.44
1154	0.45
1155	0.42
1156	0.39
1157	0.32
1158	0.32
1159	0.35
1160	0.38
1161	0.4
1162	0.39
1163	0.37
1164	0.35
1165	0.37
1166	0.39
1167	0.34
1168	0.37
1169	0.38
1170	0.45
1171	0.51
1172	0.49
1173	0.47
1174	0.44
1175	0.41
1176	0.39
1177	0.38
1178	0.36
1179	0.32
1180	0.32
1181	0.3
1182	0.32
1183	0.34
1184	0.3
1185	0.3
1186	0.23
1187	0.2
1188	0.17
1189	0.18
1190	0.18
1191	0.16
1192	0.16
1193	0.13
1194	0.13
1195	0.13
1196	0.15
1197	0.2
1198	0.18
1199	0.2
1200	0.28
1201	0.3
1202	0.29
1203	0.29
1204	0.28
1205	0.22
1206	0.22
1207	0.24
1208	0.23
1209	0.27
1210	0.34
1211	0.37
1212	0.39
1213	0.4
1214	0.41
1215	0.38

A0A397VHD9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer