Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397VCU6

Protein Details
Accession A0A397VCU6    Localization Confidence High Confidence Score 15.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
183-226SELMNPHKRKGKGRPKGTNRIRCASEPSKKTKHKLHCKICGGAGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
189-204HKRKGKGRPKGTNRIR
209-212PSKK
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 12.5, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007527  Znf_SWIM  
Gene Ontology GO:0008270  F:zinc ion binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50966  ZF_SWIM  
Amino Acid Sequences MWGVRQITSNEIKHFVLLLDDGTHLCSCFDHCNRGIVCRHFFQIMLCTRAATFHIQLIQSRWYNDNVTSNSTEEPFLVAQKFEIEQSITMGWNGPVPYFNVLVNEVRDVNHKVINEQKLYEKAWGKARAALMVAVLRNDYKFITIFDKYINDRQEPLSDSDIDLSDSSNEDEIEIDNESLDPSELMNPHKRKGKGRPKGTNRIRCASEPSKKTKHKLHCKICGGAGHNQITCSQRQK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.25
3 0.19
4 0.15
5 0.13
6 0.1
7 0.11
8 0.11
9 0.12
10 0.12
11 0.11
12 0.11
13 0.1
14 0.12
15 0.2
16 0.23
17 0.27
18 0.28
19 0.35
20 0.36
21 0.41
22 0.45
23 0.43
24 0.44
25 0.4
26 0.41
27 0.34
28 0.34
29 0.29
30 0.31
31 0.29
32 0.27
33 0.24
34 0.23
35 0.22
36 0.23
37 0.23
38 0.19
39 0.16
40 0.15
41 0.18
42 0.18
43 0.2
44 0.21
45 0.25
46 0.23
47 0.24
48 0.24
49 0.23
50 0.24
51 0.24
52 0.28
53 0.24
54 0.26
55 0.26
56 0.25
57 0.24
58 0.23
59 0.21
60 0.15
61 0.15
62 0.11
63 0.12
64 0.11
65 0.1
66 0.09
67 0.1
68 0.11
69 0.09
70 0.09
71 0.08
72 0.07
73 0.09
74 0.09
75 0.08
76 0.08
77 0.08
78 0.07
79 0.09
80 0.09
81 0.07
82 0.07
83 0.08
84 0.1
85 0.1
86 0.1
87 0.09
88 0.11
89 0.11
90 0.11
91 0.11
92 0.1
93 0.09
94 0.12
95 0.13
96 0.13
97 0.15
98 0.14
99 0.15
100 0.21
101 0.24
102 0.22
103 0.21
104 0.21
105 0.21
106 0.22
107 0.26
108 0.22
109 0.22
110 0.28
111 0.3
112 0.29
113 0.3
114 0.29
115 0.25
116 0.23
117 0.2
118 0.13
119 0.11
120 0.11
121 0.08
122 0.08
123 0.07
124 0.07
125 0.07
126 0.07
127 0.06
128 0.07
129 0.08
130 0.12
131 0.12
132 0.13
133 0.14
134 0.17
135 0.19
136 0.24
137 0.25
138 0.22
139 0.23
140 0.24
141 0.25
142 0.25
143 0.25
144 0.22
145 0.19
146 0.18
147 0.18
148 0.17
149 0.15
150 0.13
151 0.1
152 0.08
153 0.08
154 0.09
155 0.08
156 0.08
157 0.07
158 0.07
159 0.07
160 0.08
161 0.08
162 0.07
163 0.07
164 0.07
165 0.07
166 0.07
167 0.07
168 0.05
169 0.05
170 0.08
171 0.1
172 0.15
173 0.24
174 0.27
175 0.32
176 0.4
177 0.45
178 0.5
179 0.6
180 0.66
181 0.68
182 0.76
183 0.81
184 0.83
185 0.89
186 0.91
187 0.9
188 0.86
189 0.83
190 0.76
191 0.67
192 0.67
193 0.65
194 0.64
195 0.61
196 0.63
197 0.67
198 0.7
199 0.76
200 0.77
201 0.78
202 0.8
203 0.84
204 0.85
205 0.85
206 0.84
207 0.8
208 0.75
209 0.7
210 0.63
211 0.59
212 0.57
213 0.52
214 0.46
215 0.42
216 0.42
217 0.38