FuNGI

A0A397VHM3

Protein Details

Accession

A0A397VHM3

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
93-116	IYIEAPSKDKEKKKKGQLEFVEDQ	Hydrophilic
219-238	NWQKEFQKFKKSQRRVEKDI	Hydrophilic
450-498	GIPRSKTESREEKKQRKASVKTERKNRRLEKKSFKQAFAKEHRRQNKIF	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
104-106	KKK
455-493	KTESREEKKQRKASVKTERKNRRLEKKSFKQAFAKEHRR

Subcellular Location(s)

nucl 16.5, mito_nucl 12.166, cyto_nucl 10.333, mito 6.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MRITFIYTVIVIIFGRSQRDPLFNDSNAPSKVLVEVIPPNLRGKAYQVSDDLDQNRKHESRVGQAALYGIYYDDTDYDYLQHLKPIGEDQGAIYIEAPSKDKEKKKKGQLEFVEDQNHQESGTSKKDKKVTIVLPDEVLPSREEMPIEFFNQSYIPDDIQGFQPDMDPRLRETLEALDDDAYVENELNDDFFSALNAEELPEELSEEQDYEEGEAEESNWQKEFQKFKKSQRRVEKDIDEYSDDIRSRTTGNYSMSSSIMHRNDKLRLLDDQFEKIEKEYMEDDDDDDSDVESTSSSQVRQDFSQILDEFLCKYEISGRKIVPKLGDTEQDQLEIIRQELGQVCLDEKGSKMVTKTDKEYVEIESEPLTKRQAWDCQSILSTYSNLENHPTLIREKPREKLSTEKQIGLSTVECTQEYNSDDSQKNEKLDSERQIEIVENENGQIRVNLGIPRSKTESREEKKQRKASVKTERKNRRLEKKSFKQAFAKEHRRQNKIFQNLEKNFVNAVHLE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.12
2	0.17
3	0.17
4	0.21
5	0.24
6	0.29
7	0.32
8	0.36
9	0.41
10	0.38
11	0.43
12	0.42
13	0.45
14	0.4
15	0.38
16	0.31
17	0.24
18	0.25
19	0.21
20	0.18
21	0.15
22	0.19
23	0.23
24	0.26
25	0.26
26	0.28
27	0.29
28	0.29
29	0.25
30	0.26
31	0.29
32	0.28
33	0.3
34	0.3
35	0.31
36	0.32
37	0.38
38	0.37
39	0.37
40	0.36
41	0.35
42	0.41
43	0.39
44	0.38
45	0.39
46	0.38
47	0.39
48	0.45
49	0.46
50	0.38
51	0.37
52	0.36
53	0.3
54	0.25
55	0.17
56	0.09
57	0.07
58	0.07
59	0.07
60	0.06
61	0.08
62	0.08
63	0.08
64	0.09
65	0.12
66	0.15
67	0.15
68	0.17
69	0.17
70	0.17
71	0.18
72	0.19
73	0.2
74	0.17
75	0.17
76	0.15
77	0.18
78	0.18
79	0.17
80	0.14
81	0.12
82	0.13
83	0.14
84	0.16
85	0.13
86	0.19
87	0.27
88	0.36
89	0.45
90	0.54
91	0.63
92	0.72
93	0.81
94	0.82
95	0.84
96	0.82
97	0.8
98	0.73
99	0.68
100	0.63
101	0.53
102	0.48
103	0.39
104	0.32
105	0.23
106	0.2
107	0.17
108	0.17
109	0.26
110	0.32
111	0.34
112	0.4
113	0.46
114	0.48
115	0.51
116	0.54
117	0.5
118	0.51
119	0.52
120	0.47
121	0.42
122	0.4
123	0.37
124	0.29
125	0.24
126	0.16
127	0.13
128	0.13
129	0.13
130	0.13
131	0.11
132	0.16
133	0.17
134	0.18
135	0.17
136	0.15
137	0.15
138	0.15
139	0.15
140	0.13
141	0.13
142	0.11
143	0.12
144	0.12
145	0.13
146	0.14
147	0.15
148	0.13
149	0.11
150	0.14
151	0.13
152	0.15
153	0.16
154	0.15
155	0.15
156	0.19
157	0.19
158	0.17
159	0.17
160	0.18
161	0.17
162	0.16
163	0.15
164	0.11
165	0.11
166	0.11
167	0.1
168	0.07
169	0.06
170	0.06
171	0.05
172	0.05
173	0.05
174	0.05
175	0.04
176	0.04
177	0.04
178	0.04
179	0.05
180	0.05
181	0.05
182	0.05
183	0.05
184	0.05
185	0.04
186	0.05
187	0.05
188	0.05
189	0.06
190	0.05
191	0.06
192	0.06
193	0.06
194	0.06
195	0.05
196	0.06
197	0.05
198	0.06
199	0.05
200	0.05
201	0.05
202	0.05
203	0.08
204	0.09
205	0.09
206	0.09
207	0.1
208	0.13
209	0.18
210	0.27
211	0.3
212	0.39
213	0.46
214	0.56
215	0.67
216	0.72
217	0.76
218	0.78
219	0.8
220	0.77
221	0.77
222	0.72
223	0.66
224	0.6
225	0.52
226	0.42
227	0.35
228	0.29
229	0.25
230	0.2
231	0.15
232	0.12
233	0.11
234	0.11
235	0.11
236	0.12
237	0.12
238	0.14
239	0.16
240	0.16
241	0.17
242	0.16
243	0.16
244	0.15
245	0.18
246	0.19
247	0.19
248	0.2
249	0.22
250	0.24
251	0.27
252	0.27
253	0.23
254	0.22
255	0.23
256	0.27
257	0.25
258	0.25
259	0.22
260	0.21
261	0.2
262	0.17
263	0.17
264	0.12
265	0.13
266	0.12
267	0.12
268	0.13
269	0.12
270	0.13
271	0.11
272	0.11
273	0.09
274	0.08
275	0.07
276	0.06
277	0.06
278	0.05
279	0.04
280	0.05
281	0.06
282	0.07
283	0.07
284	0.09
285	0.11
286	0.13
287	0.14
288	0.16
289	0.15
290	0.16
291	0.21
292	0.19
293	0.18
294	0.16
295	0.16
296	0.14
297	0.14
298	0.14
299	0.08
300	0.08
301	0.14
302	0.2
303	0.23
304	0.27
305	0.28
306	0.35
307	0.36
308	0.38
309	0.33
310	0.29
311	0.29
312	0.27
313	0.29
314	0.24
315	0.26
316	0.24
317	0.23
318	0.21
319	0.17
320	0.16
321	0.13
322	0.11
323	0.09
324	0.08
325	0.1
326	0.11
327	0.13
328	0.11
329	0.11
330	0.11
331	0.11
332	0.12
333	0.1
334	0.09
335	0.11
336	0.11
337	0.13
338	0.13
339	0.19
340	0.25
341	0.28
342	0.32
343	0.35
344	0.34
345	0.35
346	0.35
347	0.31
348	0.27
349	0.24
350	0.21
351	0.16
352	0.18
353	0.17
354	0.17
355	0.18
356	0.16
357	0.18
358	0.22
359	0.29
360	0.3
361	0.35
362	0.34
363	0.34
364	0.33
365	0.31
366	0.28
367	0.21
368	0.18
369	0.13
370	0.16
371	0.15
372	0.15
373	0.17
374	0.16
375	0.16
376	0.17
377	0.18
378	0.18
379	0.24
380	0.31
381	0.37
382	0.41
383	0.46
384	0.52
385	0.54
386	0.54
387	0.57
388	0.58
389	0.6
390	0.6
391	0.56
392	0.51
393	0.48
394	0.46
395	0.37
396	0.3
397	0.2
398	0.2
399	0.17
400	0.15
401	0.15
402	0.15
403	0.17
404	0.18
405	0.2
406	0.19
407	0.25
408	0.27
409	0.3
410	0.36
411	0.37
412	0.36
413	0.34
414	0.36
415	0.35
416	0.4
417	0.44
418	0.41
419	0.38
420	0.37
421	0.36
422	0.34
423	0.29
424	0.27
425	0.22
426	0.17
427	0.17
428	0.19
429	0.19
430	0.18
431	0.16
432	0.12
433	0.12
434	0.14
435	0.16
436	0.16
437	0.21
438	0.23
439	0.27
440	0.33
441	0.36
442	0.36
443	0.43
444	0.51
445	0.52
446	0.62
447	0.68
448	0.71
449	0.78
450	0.83
451	0.84
452	0.83
453	0.85
454	0.85
455	0.85
456	0.86
457	0.85
458	0.87
459	0.89
460	0.87
461	0.9
462	0.89
463	0.89
464	0.88
465	0.89
466	0.9
467	0.9
468	0.92
469	0.89
470	0.86
471	0.84
472	0.81
473	0.81
474	0.81
475	0.81
476	0.79
477	0.81
478	0.84
479	0.82
480	0.79
481	0.79
482	0.78
483	0.77
484	0.77
485	0.76
486	0.77
487	0.73
488	0.76
489	0.66
490	0.58
491	0.5
492	0.42

A0A397VHM3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer