Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397VD16

Protein Details
Accession A0A397VD16    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
218-249PYITVHRSKKYCSKKYKRHDQSSKCSKKYKKKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
244-249KKYKKK
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 12.5, cyto 6, mito 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004302  Cellulose/chitin-bd_N  
Pfam View protein in Pfam  
PF03067  LPMO_10  
Amino Acid Sequences MTAGPTTIQPCSGFEAGPIVATYQPGQLIPISWTIFTAHQGSCSVQLSSNGNDTDFQELKSYSNCADEIGTFNDNVQLPAGVACDKCTLRWVWNSALNGELYLQCSDIKIENISNKSTTTVSPMTTIPTSTTISSTLKTTMTSTSTIFPTYTSLIATPTKSHKPCTSSIATPTKSHKPCTTPTKSPKPCTSSTSSIATPIKSHKPCTTSTRSSNNHRPYITVHRSKKYCSKKYKRHDQSSKCSKKYKKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.2
3 0.18
4 0.17
5 0.16
6 0.11
7 0.11
8 0.12
9 0.13
10 0.11
11 0.12
12 0.11
13 0.12
14 0.11
15 0.11
16 0.12
17 0.16
18 0.15
19 0.14
20 0.15
21 0.16
22 0.16
23 0.17
24 0.2
25 0.15
26 0.16
27 0.17
28 0.18
29 0.19
30 0.2
31 0.18
32 0.15
33 0.18
34 0.2
35 0.2
36 0.24
37 0.2
38 0.19
39 0.2
40 0.19
41 0.23
42 0.21
43 0.2
44 0.18
45 0.18
46 0.19
47 0.19
48 0.2
49 0.14
50 0.15
51 0.15
52 0.13
53 0.13
54 0.12
55 0.14
56 0.15
57 0.15
58 0.13
59 0.13
60 0.16
61 0.15
62 0.15
63 0.12
64 0.09
65 0.08
66 0.09
67 0.1
68 0.08
69 0.07
70 0.08
71 0.12
72 0.12
73 0.12
74 0.14
75 0.15
76 0.17
77 0.2
78 0.22
79 0.22
80 0.26
81 0.27
82 0.25
83 0.24
84 0.21
85 0.17
86 0.15
87 0.12
88 0.09
89 0.08
90 0.09
91 0.07
92 0.08
93 0.08
94 0.09
95 0.09
96 0.08
97 0.1
98 0.14
99 0.16
100 0.17
101 0.16
102 0.16
103 0.16
104 0.16
105 0.14
106 0.15
107 0.14
108 0.13
109 0.14
110 0.14
111 0.15
112 0.14
113 0.14
114 0.1
115 0.11
116 0.12
117 0.1
118 0.11
119 0.11
120 0.12
121 0.12
122 0.12
123 0.11
124 0.11
125 0.11
126 0.11
127 0.11
128 0.12
129 0.12
130 0.12
131 0.13
132 0.14
133 0.14
134 0.13
135 0.12
136 0.12
137 0.11
138 0.11
139 0.09
140 0.08
141 0.1
142 0.12
143 0.12
144 0.13
145 0.17
146 0.25
147 0.26
148 0.3
149 0.32
150 0.35
151 0.37
152 0.41
153 0.4
154 0.34
155 0.4
156 0.44
157 0.42
158 0.41
159 0.44
160 0.48
161 0.46
162 0.49
163 0.46
164 0.42
165 0.48
166 0.55
167 0.58
168 0.58
169 0.65
170 0.72
171 0.75
172 0.78
173 0.78
174 0.74
175 0.69
176 0.65
177 0.62
178 0.57
179 0.52
180 0.49
181 0.41
182 0.41
183 0.4
184 0.35
185 0.3
186 0.3
187 0.36
188 0.35
189 0.4
190 0.4
191 0.41
192 0.45
193 0.51
194 0.54
195 0.52
196 0.57
197 0.62
198 0.63
199 0.69
200 0.75
201 0.75
202 0.73
203 0.65
204 0.59
205 0.56
206 0.6
207 0.61
208 0.6
209 0.6
210 0.62
211 0.65
212 0.7
213 0.74
214 0.74
215 0.74
216 0.75
217 0.79
218 0.8
219 0.88
220 0.93
221 0.94
222 0.94
223 0.95
224 0.93
225 0.93
226 0.94
227 0.94
228 0.9
229 0.89