Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397TS78

Protein Details
Accession A0A397TS78    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
223-247VNNPNITKHRGRPPKRLKSNVEVEYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
232-238RGRPPKR
Subcellular Location(s) nucl 12, cyto_nucl 9, mito 7, cyto 4, golg 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007527  Znf_SWIM  
Gene Ontology GO:0008270  F:zinc ion binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50966  ZF_SWIM  
Amino Acid Sequences MPKVLKIFYCLQTNNDNAESILGPREYEQDIQYVLFKSLIKNVNQTILKVWNIRATGIAEIGHYVTLLSDGSHLCTCLLLLNKGIICCHFFHVATYSNLATFHIILISSRWYLEPNISQEVLLNQFPFIQVCNASNSENLPPISNFIFEHLFAVRSISGNSRSTTKNAKTVYAELFGLSKKVIDSAIKANVSQKLFDTLKLFLYDMQNQTGKSQQVDDSNVVVNNPNITKHRGRPPKRLKSNVEVEYPSSKSKQILRETNINVSNNKNINAKSSNNGDKIYMKGRTCGRYKQVGHYAKTC
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.38
3 0.34
4 0.26
5 0.26
6 0.23
7 0.18
8 0.19
9 0.14
10 0.14
11 0.14
12 0.18
13 0.18
14 0.2
15 0.19
16 0.18
17 0.18
18 0.19
19 0.21
20 0.19
21 0.17
22 0.17
23 0.17
24 0.16
25 0.24
26 0.28
27 0.27
28 0.31
29 0.32
30 0.38
31 0.38
32 0.37
33 0.33
34 0.32
35 0.34
36 0.31
37 0.31
38 0.28
39 0.27
40 0.27
41 0.25
42 0.21
43 0.19
44 0.17
45 0.16
46 0.11
47 0.11
48 0.11
49 0.09
50 0.07
51 0.06
52 0.05
53 0.05
54 0.05
55 0.04
56 0.06
57 0.06
58 0.09
59 0.1
60 0.1
61 0.09
62 0.09
63 0.09
64 0.11
65 0.12
66 0.11
67 0.11
68 0.14
69 0.15
70 0.15
71 0.15
72 0.13
73 0.13
74 0.14
75 0.16
76 0.15
77 0.14
78 0.15
79 0.17
80 0.19
81 0.18
82 0.19
83 0.16
84 0.15
85 0.15
86 0.14
87 0.12
88 0.09
89 0.08
90 0.06
91 0.06
92 0.05
93 0.06
94 0.08
95 0.07
96 0.08
97 0.08
98 0.09
99 0.09
100 0.12
101 0.14
102 0.16
103 0.18
104 0.18
105 0.17
106 0.16
107 0.17
108 0.17
109 0.14
110 0.11
111 0.09
112 0.09
113 0.09
114 0.09
115 0.08
116 0.07
117 0.07
118 0.07
119 0.1
120 0.11
121 0.11
122 0.12
123 0.13
124 0.13
125 0.14
126 0.14
127 0.12
128 0.11
129 0.12
130 0.12
131 0.12
132 0.1
133 0.1
134 0.1
135 0.09
136 0.11
137 0.09
138 0.09
139 0.08
140 0.09
141 0.07
142 0.07
143 0.08
144 0.09
145 0.11
146 0.12
147 0.13
148 0.16
149 0.17
150 0.19
151 0.26
152 0.26
153 0.29
154 0.29
155 0.31
156 0.29
157 0.31
158 0.3
159 0.24
160 0.22
161 0.16
162 0.16
163 0.14
164 0.12
165 0.09
166 0.07
167 0.06
168 0.06
169 0.07
170 0.07
171 0.09
172 0.13
173 0.18
174 0.18
175 0.18
176 0.21
177 0.25
178 0.25
179 0.23
180 0.19
181 0.21
182 0.21
183 0.23
184 0.22
185 0.18
186 0.19
187 0.19
188 0.19
189 0.15
190 0.18
191 0.22
192 0.21
193 0.23
194 0.23
195 0.23
196 0.24
197 0.25
198 0.23
199 0.19
200 0.19
201 0.19
202 0.21
203 0.24
204 0.24
205 0.21
206 0.22
207 0.21
208 0.19
209 0.18
210 0.14
211 0.14
212 0.14
213 0.15
214 0.16
215 0.22
216 0.27
217 0.33
218 0.43
219 0.51
220 0.58
221 0.66
222 0.75
223 0.8
224 0.85
225 0.87
226 0.83
227 0.81
228 0.84
229 0.77
230 0.71
231 0.61
232 0.54
233 0.5
234 0.46
235 0.4
236 0.32
237 0.3
238 0.28
239 0.33
240 0.38
241 0.43
242 0.49
243 0.51
244 0.59
245 0.6
246 0.64
247 0.64
248 0.58
249 0.51
250 0.46
251 0.49
252 0.42
253 0.42
254 0.39
255 0.34
256 0.38
257 0.4
258 0.39
259 0.37
260 0.42
261 0.47
262 0.45
263 0.46
264 0.42
265 0.4
266 0.42
267 0.43
268 0.42
269 0.35
270 0.39
271 0.45
272 0.5
273 0.52
274 0.57
275 0.57
276 0.59
277 0.62
278 0.65
279 0.69
280 0.69