Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397U0H5

Protein Details
Accession A0A397U0H5    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
66-93EESGKPKTIKARSKKKRKIETSVNRTLSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
70-83KPKTIKARSKKKRK
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13.333, mito_nucl 12.666, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021027  Transposase_put_HTH  
Pfam View protein in Pfam  
PF12323  HTH_OrfB_IS605  
Amino Acid Sequences MMSVQTSDSADSHLTSLNLCSHYTLRNSWFSSTNQVLTNMKYHKISLQSTPSLSVEYKEEDQLCTEESGKPKTIKARSKKKRKIETSVNRTLSIKTYPNHSQKKILKRWLGLMRYAYNTVVRWNKNRRFCNSSKNFEWIKPYTLNEKLKLYTDIKEGKDLNEKDKKLRRSCVWGERKFLRTVVWLELRLKGLYDKVPANIIDESIDDALIARKNIIQKNLKDTKKSFLSFKSKKDLRQTMTIRAQNFSKKDWNHFY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.13
3 0.15
4 0.17
5 0.18
6 0.17
7 0.19
8 0.19
9 0.23
10 0.26
11 0.29
12 0.29
13 0.34
14 0.36
15 0.36
16 0.37
17 0.35
18 0.39
19 0.38
20 0.36
21 0.31
22 0.32
23 0.31
24 0.29
25 0.35
26 0.3
27 0.3
28 0.28
29 0.27
30 0.28
31 0.32
32 0.33
33 0.33
34 0.36
35 0.36
36 0.36
37 0.37
38 0.34
39 0.3
40 0.27
41 0.22
42 0.18
43 0.18
44 0.19
45 0.2
46 0.21
47 0.19
48 0.2
49 0.2
50 0.19
51 0.16
52 0.16
53 0.16
54 0.19
55 0.22
56 0.25
57 0.25
58 0.27
59 0.35
60 0.42
61 0.48
62 0.55
63 0.63
64 0.69
65 0.79
66 0.86
67 0.88
68 0.89
69 0.88
70 0.87
71 0.87
72 0.87
73 0.84
74 0.85
75 0.76
76 0.67
77 0.6
78 0.52
79 0.43
80 0.35
81 0.31
82 0.21
83 0.25
84 0.32
85 0.41
86 0.47
87 0.47
88 0.52
89 0.55
90 0.65
91 0.67
92 0.67
93 0.62
94 0.56
95 0.62
96 0.6
97 0.54
98 0.46
99 0.41
100 0.35
101 0.32
102 0.31
103 0.24
104 0.18
105 0.16
106 0.19
107 0.22
108 0.23
109 0.29
110 0.38
111 0.44
112 0.52
113 0.57
114 0.57
115 0.59
116 0.59
117 0.63
118 0.61
119 0.6
120 0.53
121 0.54
122 0.5
123 0.44
124 0.47
125 0.37
126 0.33
127 0.29
128 0.28
129 0.27
130 0.34
131 0.35
132 0.32
133 0.32
134 0.29
135 0.29
136 0.32
137 0.28
138 0.22
139 0.25
140 0.29
141 0.27
142 0.31
143 0.29
144 0.28
145 0.35
146 0.34
147 0.37
148 0.39
149 0.39
150 0.44
151 0.51
152 0.58
153 0.55
154 0.61
155 0.57
156 0.58
157 0.64
158 0.66
159 0.69
160 0.64
161 0.64
162 0.63
163 0.63
164 0.55
165 0.48
166 0.39
167 0.32
168 0.31
169 0.3
170 0.28
171 0.27
172 0.26
173 0.28
174 0.29
175 0.25
176 0.23
177 0.18
178 0.18
179 0.17
180 0.2
181 0.19
182 0.18
183 0.2
184 0.2
185 0.21
186 0.19
187 0.17
188 0.14
189 0.12
190 0.13
191 0.11
192 0.1
193 0.07
194 0.07
195 0.1
196 0.11
197 0.11
198 0.1
199 0.12
200 0.2
201 0.24
202 0.32
203 0.37
204 0.39
205 0.49
206 0.59
207 0.61
208 0.61
209 0.6
210 0.6
211 0.61
212 0.6
213 0.55
214 0.55
215 0.61
216 0.61
217 0.65
218 0.67
219 0.64
220 0.68
221 0.74
222 0.74
223 0.68
224 0.71
225 0.69
226 0.68
227 0.72
228 0.7
229 0.61
230 0.55
231 0.56
232 0.54
233 0.52
234 0.48
235 0.48
236 0.48