Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397VQP2

Protein Details
Accession A0A397VQP2    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
441-462EMVKHVKLRRTRGQNPNRHSSEHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 14, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR022018  GIT1_C  
IPR013724  GIT_SHD  
IPR039892  Spa2/Sph1  
Gene Ontology GO:0110165  C:cellular anatomical entity  
Pfam View protein in Pfam  
PF12205  GIT1_C  
PF08518  GIT_SHD  
Amino Acid Sequences RTNARDKLTRLTKQQFQELSTDVYDELSRRLLGSNAVPFLPVCDDFHPKRNQARQKLATLPKNRFKDLASDVYYELERRYPELKDMDFSNPTYGTPSPYNNASLYNKNNPPQQSSIDGAASGQAESNTIVPETSTLRQEVISVDFRIQKPNIRPDNSNVNTNADSSPKPYSSNNSSNHSLSNNFPPLPDGMPPEYGSPKSLRNLENQLDEKEKINQQQALKIEKLEQDFEKLNENYRQQQEIANDVQKEASKLLEEIKSLSIKNDDLYSEKEQSIAKIKSLSEEVNEWKSKYEKVKTELRNLKATSSFFKETPKVDIVNDSSLAPTPDGAIDESRIVAYQVAIDDLLRAGRSEVSSNVLVAMKSIVIACKGITEEVDIYEQHKGSLMKAEDKEKLNTLKTKFSATLTNLMTAAKNHATGYGISPVSLLDAAASHLTASVVEMVKHVKLRRTRGQNPNRHSSEHHPVPSRENMSNASPNFQNDLNSSNTRPNSNSNDFLERQTESIVQSIQTLLTAIRNGSFGKELTDNINTITTIVLNVIAVCRDSFRTDDVPQSVRGNVILKELEDSIDKLDEMRESITDNSEDFLNNRAAKQRLASASFEIAKYTKELVGLFD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.73
2 0.66
3 0.59
4 0.56
5 0.48
6 0.44
7 0.36
8 0.32
9 0.23
10 0.21
11 0.2
12 0.17
13 0.17
14 0.15
15 0.15
16 0.14
17 0.16
18 0.15
19 0.17
20 0.21
21 0.24
22 0.24
23 0.24
24 0.24
25 0.22
26 0.23
27 0.23
28 0.19
29 0.17
30 0.19
31 0.28
32 0.31
33 0.4
34 0.45
35 0.48
36 0.57
37 0.64
38 0.71
39 0.72
40 0.8
41 0.77
42 0.76
43 0.79
44 0.79
45 0.78
46 0.77
47 0.77
48 0.75
49 0.75
50 0.71
51 0.63
52 0.54
53 0.53
54 0.5
55 0.49
56 0.43
57 0.4
58 0.38
59 0.38
60 0.37
61 0.3
62 0.25
63 0.2
64 0.17
65 0.18
66 0.21
67 0.21
68 0.26
69 0.31
70 0.31
71 0.3
72 0.32
73 0.34
74 0.34
75 0.34
76 0.31
77 0.25
78 0.24
79 0.25
80 0.23
81 0.22
82 0.23
83 0.25
84 0.24
85 0.26
86 0.28
87 0.25
88 0.3
89 0.3
90 0.34
91 0.37
92 0.43
93 0.47
94 0.49
95 0.55
96 0.52
97 0.53
98 0.49
99 0.46
100 0.41
101 0.38
102 0.35
103 0.3
104 0.26
105 0.21
106 0.19
107 0.16
108 0.12
109 0.1
110 0.07
111 0.08
112 0.08
113 0.09
114 0.08
115 0.08
116 0.07
117 0.07
118 0.08
119 0.12
120 0.13
121 0.14
122 0.15
123 0.15
124 0.15
125 0.16
126 0.16
127 0.17
128 0.18
129 0.17
130 0.19
131 0.25
132 0.26
133 0.31
134 0.31
135 0.34
136 0.37
137 0.47
138 0.52
139 0.5
140 0.52
141 0.51
142 0.61
143 0.56
144 0.54
145 0.45
146 0.4
147 0.37
148 0.36
149 0.32
150 0.24
151 0.22
152 0.21
153 0.23
154 0.2
155 0.22
156 0.22
157 0.27
158 0.33
159 0.4
160 0.41
161 0.43
162 0.46
163 0.44
164 0.44
165 0.39
166 0.33
167 0.27
168 0.31
169 0.29
170 0.26
171 0.25
172 0.24
173 0.24
174 0.23
175 0.22
176 0.19
177 0.16
178 0.18
179 0.19
180 0.2
181 0.21
182 0.2
183 0.21
184 0.19
185 0.2
186 0.22
187 0.28
188 0.27
189 0.3
190 0.36
191 0.37
192 0.41
193 0.4
194 0.39
195 0.36
196 0.35
197 0.32
198 0.3
199 0.31
200 0.29
201 0.3
202 0.33
203 0.3
204 0.34
205 0.37
206 0.36
207 0.33
208 0.29
209 0.28
210 0.27
211 0.28
212 0.26
213 0.22
214 0.21
215 0.22
216 0.22
217 0.25
218 0.22
219 0.25
220 0.27
221 0.29
222 0.33
223 0.34
224 0.35
225 0.29
226 0.32
227 0.28
228 0.27
229 0.28
230 0.25
231 0.22
232 0.21
233 0.21
234 0.18
235 0.18
236 0.14
237 0.11
238 0.08
239 0.09
240 0.12
241 0.12
242 0.12
243 0.13
244 0.14
245 0.16
246 0.15
247 0.16
248 0.14
249 0.13
250 0.13
251 0.13
252 0.11
253 0.11
254 0.16
255 0.18
256 0.19
257 0.19
258 0.2
259 0.19
260 0.2
261 0.26
262 0.22
263 0.19
264 0.19
265 0.19
266 0.19
267 0.21
268 0.2
269 0.13
270 0.15
271 0.17
272 0.2
273 0.21
274 0.19
275 0.19
276 0.2
277 0.23
278 0.27
279 0.31
280 0.3
281 0.34
282 0.43
283 0.46
284 0.54
285 0.58
286 0.54
287 0.54
288 0.49
289 0.47
290 0.4
291 0.38
292 0.3
293 0.28
294 0.27
295 0.21
296 0.24
297 0.25
298 0.23
299 0.25
300 0.24
301 0.2
302 0.18
303 0.21
304 0.19
305 0.18
306 0.17
307 0.14
308 0.12
309 0.11
310 0.12
311 0.09
312 0.07
313 0.06
314 0.05
315 0.06
316 0.06
317 0.06
318 0.06
319 0.06
320 0.06
321 0.06
322 0.06
323 0.05
324 0.05
325 0.05
326 0.05
327 0.04
328 0.04
329 0.04
330 0.04
331 0.04
332 0.04
333 0.05
334 0.04
335 0.04
336 0.04
337 0.06
338 0.06
339 0.07
340 0.08
341 0.11
342 0.11
343 0.11
344 0.11
345 0.11
346 0.1
347 0.09
348 0.09
349 0.06
350 0.06
351 0.06
352 0.05
353 0.05
354 0.05
355 0.05
356 0.06
357 0.06
358 0.06
359 0.06
360 0.07
361 0.07
362 0.07
363 0.08
364 0.08
365 0.09
366 0.11
367 0.11
368 0.1
369 0.13
370 0.12
371 0.12
372 0.18
373 0.18
374 0.22
375 0.24
376 0.28
377 0.3
378 0.33
379 0.34
380 0.32
381 0.34
382 0.32
383 0.36
384 0.35
385 0.36
386 0.35
387 0.36
388 0.34
389 0.31
390 0.33
391 0.29
392 0.33
393 0.27
394 0.27
395 0.24
396 0.23
397 0.22
398 0.17
399 0.18
400 0.12
401 0.12
402 0.11
403 0.12
404 0.12
405 0.13
406 0.14
407 0.16
408 0.15
409 0.14
410 0.14
411 0.13
412 0.12
413 0.11
414 0.09
415 0.04
416 0.04
417 0.05
418 0.05
419 0.05
420 0.04
421 0.05
422 0.05
423 0.05
424 0.05
425 0.07
426 0.08
427 0.08
428 0.09
429 0.1
430 0.12
431 0.17
432 0.19
433 0.22
434 0.29
435 0.37
436 0.45
437 0.54
438 0.62
439 0.69
440 0.77
441 0.8
442 0.8
443 0.82
444 0.76
445 0.69
446 0.63
447 0.59
448 0.59
449 0.57
450 0.56
451 0.52
452 0.51
453 0.53
454 0.56
455 0.53
456 0.44
457 0.39
458 0.36
459 0.35
460 0.4
461 0.35
462 0.31
463 0.28
464 0.28
465 0.28
466 0.26
467 0.23
468 0.18
469 0.2
470 0.22
471 0.24
472 0.24
473 0.29
474 0.3
475 0.31
476 0.32
477 0.36
478 0.4
479 0.42
480 0.45
481 0.41
482 0.46
483 0.45
484 0.45
485 0.41
486 0.33
487 0.28
488 0.25
489 0.23
490 0.18
491 0.18
492 0.16
493 0.14
494 0.14
495 0.13
496 0.11
497 0.1
498 0.09
499 0.08
500 0.09
501 0.1
502 0.09
503 0.1
504 0.11
505 0.12
506 0.13
507 0.14
508 0.13
509 0.15
510 0.16
511 0.17
512 0.19
513 0.21
514 0.2
515 0.19
516 0.2
517 0.16
518 0.15
519 0.14
520 0.1
521 0.08
522 0.08
523 0.07
524 0.06
525 0.06
526 0.07
527 0.07
528 0.07
529 0.07
530 0.09
531 0.11
532 0.13
533 0.14
534 0.18
535 0.23
536 0.24
537 0.31
538 0.33
539 0.34
540 0.35
541 0.36
542 0.32
543 0.28
544 0.28
545 0.24
546 0.21
547 0.22
548 0.2
549 0.18
550 0.2
551 0.19
552 0.18
553 0.17
554 0.17
555 0.15
556 0.15
557 0.14
558 0.13
559 0.14
560 0.14
561 0.14
562 0.14
563 0.12
564 0.14
565 0.16
566 0.18
567 0.18
568 0.17
569 0.17
570 0.17
571 0.17
572 0.15
573 0.17
574 0.21
575 0.22
576 0.24
577 0.3
578 0.31
579 0.33
580 0.35
581 0.39
582 0.39
583 0.41
584 0.41
585 0.37
586 0.41
587 0.41
588 0.38
589 0.33
590 0.27
591 0.25
592 0.25
593 0.24
594 0.2
595 0.19