Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397W670

Protein Details
Accession A0A397W670    Localization Confidence Low Confidence Score 9.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
228-247SGSSGKKKEARKKAAICALEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
233-240KKKEARKK
Subcellular Location(s) cyto 13.5, cyto_nucl 10.5, nucl 6.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR014720  dsRBD_dom  
IPR011907  RNase_III  
IPR000999  RNase_III_dom  
IPR036389  RNase_III_sf  
Gene Ontology GO:0004525  F:ribonuclease III activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF00035  dsrm  
PF14622  Ribonucleas_3_3  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50137  DS_RBD  
PS50142  RNASE_3_2  
CDD cd00593  RIBOc  
Amino Acid Sequences MGEFKFEKWMFKDESLKIEAITHKSFASENPADGPHNERLEWIGDTIITTVVSDYLFFRFPYHKEGALTKLRSKIVCKETLAKFARKLGLENDLRLGIGALKSGDRSNERLLEDTFEAYIGAVYLDSGRDLNEVNKFLEPIIKLFVDELAENEHNNNNGSPPRDSGPVYGPINKIIEPSDPNGMLQNWAQSRGFEIPDYKWATPERKDENNKPIFDCEVIIDGKVFGSGSSGKKKEARKKAAICALESFGIFNYNSSPI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.48
2 0.45
3 0.42
4 0.36
5 0.36
6 0.36
7 0.34
8 0.33
9 0.28
10 0.25
11 0.26
12 0.26
13 0.23
14 0.27
15 0.22
16 0.21
17 0.23
18 0.24
19 0.25
20 0.25
21 0.29
22 0.27
23 0.27
24 0.26
25 0.24
26 0.23
27 0.24
28 0.24
29 0.19
30 0.13
31 0.11
32 0.11
33 0.11
34 0.1
35 0.07
36 0.06
37 0.06
38 0.06
39 0.06
40 0.06
41 0.07
42 0.08
43 0.1
44 0.1
45 0.12
46 0.15
47 0.17
48 0.23
49 0.25
50 0.25
51 0.26
52 0.29
53 0.33
54 0.37
55 0.39
56 0.37
57 0.39
58 0.4
59 0.4
60 0.41
61 0.43
62 0.41
63 0.43
64 0.41
65 0.43
66 0.43
67 0.5
68 0.51
69 0.45
70 0.41
71 0.4
72 0.42
73 0.34
74 0.34
75 0.26
76 0.31
77 0.29
78 0.28
79 0.25
80 0.21
81 0.2
82 0.18
83 0.16
84 0.08
85 0.07
86 0.07
87 0.06
88 0.06
89 0.07
90 0.08
91 0.1
92 0.11
93 0.14
94 0.16
95 0.2
96 0.2
97 0.21
98 0.21
99 0.21
100 0.19
101 0.17
102 0.14
103 0.1
104 0.09
105 0.07
106 0.06
107 0.04
108 0.03
109 0.03
110 0.03
111 0.03
112 0.03
113 0.03
114 0.03
115 0.03
116 0.04
117 0.05
118 0.07
119 0.09
120 0.1
121 0.11
122 0.11
123 0.11
124 0.11
125 0.14
126 0.12
127 0.1
128 0.11
129 0.1
130 0.1
131 0.1
132 0.1
133 0.08
134 0.08
135 0.07
136 0.09
137 0.1
138 0.1
139 0.11
140 0.12
141 0.12
142 0.13
143 0.12
144 0.1
145 0.13
146 0.15
147 0.15
148 0.16
149 0.17
150 0.19
151 0.2
152 0.19
153 0.2
154 0.24
155 0.25
156 0.27
157 0.25
158 0.25
159 0.26
160 0.24
161 0.22
162 0.16
163 0.17
164 0.15
165 0.17
166 0.18
167 0.17
168 0.17
169 0.18
170 0.17
171 0.16
172 0.15
173 0.19
174 0.16
175 0.18
176 0.18
177 0.16
178 0.19
179 0.2
180 0.21
181 0.16
182 0.18
183 0.17
184 0.24
185 0.29
186 0.26
187 0.27
188 0.3
189 0.35
190 0.37
191 0.44
192 0.44
193 0.49
194 0.58
195 0.62
196 0.68
197 0.7
198 0.67
199 0.61
200 0.57
201 0.49
202 0.41
203 0.34
204 0.24
205 0.2
206 0.18
207 0.16
208 0.14
209 0.12
210 0.11
211 0.1
212 0.09
213 0.05
214 0.08
215 0.12
216 0.18
217 0.27
218 0.29
219 0.33
220 0.4
221 0.5
222 0.57
223 0.64
224 0.68
225 0.69
226 0.75
227 0.8
228 0.82
229 0.75
230 0.67
231 0.6
232 0.53
233 0.44
234 0.36
235 0.27
236 0.19
237 0.19
238 0.16
239 0.13