Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397VSJ1

Protein Details
Accession A0A397VSJ1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
467-494SEVSTKAAVKNKKKREAAKKKKEEAILAHydrophilic
545-564LSETDKKIRNLTKKLRQITEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
474-488AVKNKKKREAAKKKK
Subcellular Location(s) mito 11.5, mito_nucl 11.166, nucl 9.5, cyto_nucl 8.833, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011387  TIF2A  
IPR013979  TIF_beta_prop-like  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
Gene Ontology GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF08662  eIF2A  
Amino Acid Sequences MTTVSPTQLTYRSFNNLSLVSGHPIYQTVKNFQDGNIKTFQYSKDGRYISLASPEIVKIIDSNNAEPRSEIEKKNIVEIGFSPKGTYISTWERPVKLGENLVHKNLIVWETATAQMLIQFTQKSQANWNVQWTEDESFFSRMVTGEVHFYDSKRIEKGIHTKLRLENIVDFSLSPGKNPSIAVFIPEKNGAPASVRIYSITNFNSPLAQKTFFKADKVRMHWNDLGTNLLVLTQTEVDKTNKSYYGESNLYFLSVAGNYDCCVQLKKDGPIHDVAWSPNSKEFIVVYGYMPANATLFDHRANPIHEFGVNPPGFGNLAGTIDIWDRENLKKISTIEAPNSSECFWSPDGRYIMTATLSPRLRVDNGYKIWHYTGVLVHDESIQELLQVQWRPASVELYPMRTLSPPPKVSENSAALAAKPSPKKVGAYRPPHARGTATPDMFKREDEASKRLHVHGHGNKPTPVGVSEVSTKAAVKNKKKREAAKKKKEEAILASENSGAASPLPPSSVPVQQATNDGIIDVTESVKEPIASITSTNGISQGGSLSETDKKIRNLTKKLRQITELKERQQKGDKLELTQLQKIATEAALRKELDMLKP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.36
3 0.32
4 0.29
5 0.29
6 0.27
7 0.24
8 0.23
9 0.22
10 0.19
11 0.2
12 0.23
13 0.26
14 0.28
15 0.31
16 0.33
17 0.36
18 0.37
19 0.37
20 0.43
21 0.4
22 0.4
23 0.39
24 0.37
25 0.34
26 0.37
27 0.36
28 0.34
29 0.36
30 0.35
31 0.38
32 0.38
33 0.38
34 0.38
35 0.4
36 0.34
37 0.36
38 0.33
39 0.25
40 0.26
41 0.25
42 0.21
43 0.18
44 0.16
45 0.1
46 0.11
47 0.17
48 0.17
49 0.21
50 0.28
51 0.29
52 0.29
53 0.28
54 0.3
55 0.33
56 0.37
57 0.36
58 0.35
59 0.41
60 0.41
61 0.46
62 0.45
63 0.37
64 0.32
65 0.31
66 0.33
67 0.29
68 0.28
69 0.24
70 0.22
71 0.23
72 0.22
73 0.21
74 0.18
75 0.24
76 0.29
77 0.35
78 0.39
79 0.39
80 0.4
81 0.42
82 0.4
83 0.35
84 0.36
85 0.33
86 0.38
87 0.4
88 0.41
89 0.38
90 0.33
91 0.31
92 0.28
93 0.24
94 0.16
95 0.13
96 0.12
97 0.13
98 0.14
99 0.14
100 0.11
101 0.1
102 0.12
103 0.12
104 0.11
105 0.12
106 0.12
107 0.11
108 0.18
109 0.2
110 0.19
111 0.25
112 0.33
113 0.37
114 0.38
115 0.44
116 0.39
117 0.37
118 0.37
119 0.34
120 0.28
121 0.21
122 0.22
123 0.18
124 0.19
125 0.19
126 0.17
127 0.15
128 0.13
129 0.13
130 0.12
131 0.1
132 0.11
133 0.12
134 0.15
135 0.16
136 0.16
137 0.21
138 0.23
139 0.25
140 0.23
141 0.24
142 0.23
143 0.29
144 0.37
145 0.42
146 0.46
147 0.46
148 0.5
149 0.52
150 0.55
151 0.5
152 0.43
153 0.36
154 0.32
155 0.31
156 0.25
157 0.22
158 0.18
159 0.24
160 0.21
161 0.18
162 0.17
163 0.17
164 0.18
165 0.18
166 0.17
167 0.14
168 0.14
169 0.17
170 0.18
171 0.18
172 0.19
173 0.2
174 0.19
175 0.16
176 0.16
177 0.13
178 0.12
179 0.14
180 0.15
181 0.15
182 0.16
183 0.16
184 0.17
185 0.17
186 0.19
187 0.18
188 0.16
189 0.16
190 0.16
191 0.18
192 0.17
193 0.2
194 0.19
195 0.2
196 0.19
197 0.2
198 0.27
199 0.26
200 0.29
201 0.29
202 0.35
203 0.4
204 0.44
205 0.52
206 0.46
207 0.51
208 0.5
209 0.48
210 0.4
211 0.33
212 0.3
213 0.2
214 0.17
215 0.11
216 0.09
217 0.07
218 0.06
219 0.06
220 0.05
221 0.06
222 0.07
223 0.09
224 0.1
225 0.12
226 0.14
227 0.16
228 0.18
229 0.2
230 0.21
231 0.2
232 0.25
233 0.26
234 0.24
235 0.23
236 0.2
237 0.18
238 0.16
239 0.14
240 0.09
241 0.06
242 0.06
243 0.05
244 0.05
245 0.05
246 0.06
247 0.07
248 0.07
249 0.08
250 0.08
251 0.13
252 0.16
253 0.21
254 0.24
255 0.26
256 0.27
257 0.28
258 0.29
259 0.25
260 0.23
261 0.19
262 0.18
263 0.17
264 0.16
265 0.15
266 0.16
267 0.14
268 0.13
269 0.13
270 0.11
271 0.11
272 0.11
273 0.09
274 0.11
275 0.11
276 0.1
277 0.1
278 0.09
279 0.08
280 0.07
281 0.07
282 0.05
283 0.07
284 0.07
285 0.08
286 0.09
287 0.11
288 0.12
289 0.13
290 0.13
291 0.13
292 0.12
293 0.12
294 0.12
295 0.2
296 0.18
297 0.17
298 0.15
299 0.15
300 0.15
301 0.14
302 0.14
303 0.05
304 0.05
305 0.05
306 0.05
307 0.06
308 0.06
309 0.06
310 0.06
311 0.07
312 0.08
313 0.09
314 0.16
315 0.15
316 0.16
317 0.19
318 0.19
319 0.22
320 0.25
321 0.26
322 0.23
323 0.26
324 0.27
325 0.24
326 0.24
327 0.21
328 0.17
329 0.15
330 0.15
331 0.13
332 0.15
333 0.15
334 0.2
335 0.2
336 0.2
337 0.2
338 0.18
339 0.17
340 0.14
341 0.15
342 0.1
343 0.16
344 0.16
345 0.16
346 0.16
347 0.17
348 0.18
349 0.2
350 0.23
351 0.24
352 0.26
353 0.29
354 0.28
355 0.28
356 0.28
357 0.25
358 0.21
359 0.15
360 0.15
361 0.13
362 0.14
363 0.13
364 0.13
365 0.12
366 0.12
367 0.1
368 0.09
369 0.07
370 0.05
371 0.06
372 0.06
373 0.1
374 0.11
375 0.11
376 0.11
377 0.12
378 0.13
379 0.14
380 0.15
381 0.1
382 0.17
383 0.19
384 0.21
385 0.22
386 0.21
387 0.21
388 0.2
389 0.23
390 0.21
391 0.28
392 0.27
393 0.28
394 0.34
395 0.34
396 0.37
397 0.41
398 0.37
399 0.3
400 0.3
401 0.28
402 0.22
403 0.23
404 0.2
405 0.21
406 0.2
407 0.21
408 0.22
409 0.23
410 0.27
411 0.32
412 0.41
413 0.44
414 0.51
415 0.56
416 0.62
417 0.65
418 0.63
419 0.58
420 0.49
421 0.42
422 0.42
423 0.43
424 0.35
425 0.34
426 0.33
427 0.38
428 0.36
429 0.34
430 0.28
431 0.24
432 0.29
433 0.31
434 0.33
435 0.31
436 0.36
437 0.38
438 0.37
439 0.36
440 0.32
441 0.38
442 0.43
443 0.49
444 0.51
445 0.52
446 0.52
447 0.49
448 0.47
449 0.38
450 0.3
451 0.23
452 0.17
453 0.16
454 0.18
455 0.18
456 0.18
457 0.17
458 0.17
459 0.18
460 0.25
461 0.32
462 0.39
463 0.49
464 0.58
465 0.67
466 0.75
467 0.81
468 0.85
469 0.87
470 0.88
471 0.9
472 0.9
473 0.88
474 0.87
475 0.81
476 0.74
477 0.68
478 0.64
479 0.58
480 0.48
481 0.41
482 0.34
483 0.3
484 0.25
485 0.2
486 0.11
487 0.07
488 0.07
489 0.07
490 0.08
491 0.09
492 0.09
493 0.12
494 0.15
495 0.19
496 0.21
497 0.22
498 0.23
499 0.23
500 0.26
501 0.25
502 0.23
503 0.18
504 0.16
505 0.13
506 0.11
507 0.11
508 0.09
509 0.07
510 0.07
511 0.08
512 0.09
513 0.1
514 0.1
515 0.1
516 0.11
517 0.12
518 0.12
519 0.12
520 0.13
521 0.14
522 0.15
523 0.14
524 0.14
525 0.12
526 0.11
527 0.11
528 0.1
529 0.08
530 0.08
531 0.08
532 0.11
533 0.16
534 0.18
535 0.22
536 0.27
537 0.3
538 0.38
539 0.47
540 0.54
541 0.59
542 0.68
543 0.74
544 0.78
545 0.83
546 0.79
547 0.77
548 0.75
549 0.73
550 0.74
551 0.72
552 0.71
553 0.72
554 0.7
555 0.71
556 0.73
557 0.7
558 0.65
559 0.67
560 0.61
561 0.55
562 0.6
563 0.6
564 0.55
565 0.54
566 0.49
567 0.4
568 0.37
569 0.34
570 0.28
571 0.22
572 0.23
573 0.22
574 0.25
575 0.29
576 0.29
577 0.29
578 0.33