Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397UJA3

Protein Details
Accession A0A397UJA3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
12-31CMLRLANKRRLNNSNQTRNQHydrophilic
54-97KKLIKIIKDLKKKNEILKKKVQEFEKCEQEKRKHQDKHETPSDHBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
54-72KKLIKIIKDLKKKNEILKK
Subcellular Location(s) nucl 16, mito_nucl 12.833, cyto_nucl 9.333, mito 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR031642  VPS13_mid_RBG  
Pfam View protein in Pfam  
PF16910  VPS13_mid_rpt  
Amino Acid Sequences MNHIYEPHPLICMLRLANKRRLNNSNQTRNQLSQDNYYDIQLTASEKLVNKEIKKLIKIIKDLKKKNEILKKKVQEFEKCEQEKRKHQDKHETPSDHQDESETALGSLSVHDCSTEGTLYPQIVREAVGNMFEGLRAQTRAVLEMKLDDIKLLIEADYKRLESLMYDCFSVQLSSTQLLVGQSVDRCLAQICNSELKYGLNVIDRINLQFLVGMSILPRAPNHTKFRVSGHLPLLKTNFSDRKKNNDSIIETVTSSSPKEESPKMDSTEKLSFAKVANDLLKENKNVKGKGESSDEEAPEEHNEEFYDAQDTELSNAKMNQRMFEFEFRVDKFTTTFKQADSNPDKPDVVLVDMVLEHIGLTYVLRPFDMSAEVGYRNVQVDIKYTRVDKKSPEYMSKFEGISQSVDIEMSTKIIVTHTFTTPAAPSSPQSSVETESPILPESQKPQPSQTSTMLVKETFLMAGSNTDESLRQLLTLQGEILYWISKTNLLEEPIRLLLDFGSKFAQMKGLYDSAHGNNSYLTRITAGLQKIRLTSNFTIPKTTALQIHQIINDIDINFNISYAEQVEGLEKRCQELAPLSDELAVITDRVSDSNEIIRTIEDLLEQSRETSRFIQEELSPFKLQTTLGFFLHGVADQHKPTVTTSQKEKPFWCRPIMRPTVTAFTTRFAYGEPFHFTKQVVPAISQREIDSINCPNKDDIPEYEHTMRNVIPFIDAIIRDEPDFHCAVSNQKTLKCDFPSKDLNSSHILIESTLDATATRRNFERDPLERSRIGYKVDAFFKFCGLHRTPEIGSGELRDMWVLAQEQLNGVDASNLVMWGFKVVGRKIRIHALAAAGGFYHLIHEAPMPSSRFDLQNIKVAYCATLGFQEAIDLPSVINTPEKKSDR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.34
3 0.4
4 0.49
5 0.56
6 0.62
7 0.67
8 0.73
9 0.73
10 0.75
11 0.79
12 0.8
13 0.79
14 0.79
15 0.76
16 0.71
17 0.68
18 0.64
19 0.57
20 0.53
21 0.5
22 0.48
23 0.43
24 0.4
25 0.37
26 0.29
27 0.26
28 0.2
29 0.18
30 0.15
31 0.15
32 0.18
33 0.19
34 0.22
35 0.29
36 0.35
37 0.34
38 0.41
39 0.47
40 0.5
41 0.51
42 0.56
43 0.56
44 0.57
45 0.64
46 0.65
47 0.68
48 0.71
49 0.76
50 0.78
51 0.8
52 0.79
53 0.8
54 0.81
55 0.81
56 0.79
57 0.81
58 0.82
59 0.81
60 0.81
61 0.8
62 0.78
63 0.76
64 0.76
65 0.76
66 0.71
67 0.7
68 0.73
69 0.74
70 0.74
71 0.77
72 0.79
73 0.77
74 0.81
75 0.84
76 0.84
77 0.85
78 0.84
79 0.8
80 0.73
81 0.75
82 0.7
83 0.6
84 0.51
85 0.42
86 0.33
87 0.31
88 0.3
89 0.2
90 0.15
91 0.14
92 0.14
93 0.12
94 0.13
95 0.1
96 0.09
97 0.08
98 0.08
99 0.08
100 0.1
101 0.11
102 0.1
103 0.1
104 0.11
105 0.13
106 0.14
107 0.15
108 0.16
109 0.15
110 0.15
111 0.15
112 0.13
113 0.14
114 0.13
115 0.13
116 0.12
117 0.12
118 0.11
119 0.11
120 0.1
121 0.09
122 0.11
123 0.12
124 0.11
125 0.14
126 0.14
127 0.18
128 0.19
129 0.18
130 0.16
131 0.16
132 0.18
133 0.17
134 0.16
135 0.13
136 0.11
137 0.11
138 0.11
139 0.1
140 0.08
141 0.11
142 0.12
143 0.15
144 0.17
145 0.17
146 0.17
147 0.16
148 0.16
149 0.13
150 0.15
151 0.17
152 0.16
153 0.16
154 0.16
155 0.16
156 0.17
157 0.16
158 0.13
159 0.1
160 0.11
161 0.11
162 0.11
163 0.11
164 0.11
165 0.11
166 0.11
167 0.1
168 0.1
169 0.1
170 0.11
171 0.12
172 0.1
173 0.1
174 0.11
175 0.12
176 0.12
177 0.15
178 0.17
179 0.23
180 0.24
181 0.24
182 0.24
183 0.23
184 0.21
185 0.19
186 0.18
187 0.14
188 0.15
189 0.15
190 0.18
191 0.18
192 0.18
193 0.18
194 0.16
195 0.12
196 0.12
197 0.12
198 0.1
199 0.09
200 0.09
201 0.08
202 0.1
203 0.1
204 0.1
205 0.1
206 0.14
207 0.21
208 0.29
209 0.35
210 0.39
211 0.42
212 0.44
213 0.48
214 0.49
215 0.46
216 0.44
217 0.44
218 0.44
219 0.41
220 0.43
221 0.41
222 0.34
223 0.32
224 0.33
225 0.35
226 0.33
227 0.43
228 0.43
229 0.51
230 0.57
231 0.61
232 0.58
233 0.56
234 0.55
235 0.49
236 0.48
237 0.39
238 0.32
239 0.28
240 0.24
241 0.19
242 0.15
243 0.13
244 0.11
245 0.11
246 0.16
247 0.18
248 0.21
249 0.27
250 0.31
251 0.33
252 0.35
253 0.35
254 0.36
255 0.36
256 0.35
257 0.3
258 0.26
259 0.25
260 0.22
261 0.24
262 0.2
263 0.19
264 0.18
265 0.18
266 0.19
267 0.22
268 0.24
269 0.25
270 0.27
271 0.3
272 0.34
273 0.34
274 0.35
275 0.37
276 0.35
277 0.36
278 0.39
279 0.33
280 0.32
281 0.36
282 0.33
283 0.27
284 0.26
285 0.23
286 0.18
287 0.19
288 0.13
289 0.1
290 0.1
291 0.1
292 0.1
293 0.09
294 0.11
295 0.09
296 0.09
297 0.09
298 0.09
299 0.1
300 0.14
301 0.14
302 0.12
303 0.15
304 0.17
305 0.21
306 0.22
307 0.22
308 0.19
309 0.23
310 0.24
311 0.26
312 0.26
313 0.23
314 0.27
315 0.26
316 0.28
317 0.24
318 0.22
319 0.19
320 0.21
321 0.21
322 0.22
323 0.22
324 0.19
325 0.24
326 0.25
327 0.34
328 0.37
329 0.39
330 0.36
331 0.37
332 0.36
333 0.31
334 0.31
335 0.21
336 0.15
337 0.11
338 0.08
339 0.07
340 0.07
341 0.07
342 0.05
343 0.05
344 0.03
345 0.03
346 0.03
347 0.03
348 0.03
349 0.05
350 0.06
351 0.06
352 0.06
353 0.07
354 0.07
355 0.08
356 0.09
357 0.07
358 0.06
359 0.08
360 0.08
361 0.09
362 0.09
363 0.09
364 0.08
365 0.09
366 0.09
367 0.08
368 0.11
369 0.13
370 0.14
371 0.15
372 0.17
373 0.23
374 0.24
375 0.26
376 0.27
377 0.31
378 0.37
379 0.39
380 0.44
381 0.41
382 0.41
383 0.41
384 0.39
385 0.33
386 0.27
387 0.25
388 0.19
389 0.16
390 0.14
391 0.11
392 0.09
393 0.09
394 0.07
395 0.07
396 0.06
397 0.05
398 0.05
399 0.05
400 0.05
401 0.05
402 0.06
403 0.07
404 0.1
405 0.1
406 0.12
407 0.11
408 0.12
409 0.12
410 0.13
411 0.11
412 0.09
413 0.09
414 0.11
415 0.12
416 0.13
417 0.14
418 0.14
419 0.15
420 0.15
421 0.16
422 0.14
423 0.13
424 0.12
425 0.11
426 0.1
427 0.09
428 0.09
429 0.12
430 0.17
431 0.21
432 0.21
433 0.24
434 0.28
435 0.3
436 0.33
437 0.31
438 0.3
439 0.26
440 0.27
441 0.25
442 0.21
443 0.18
444 0.14
445 0.12
446 0.08
447 0.07
448 0.05
449 0.04
450 0.05
451 0.06
452 0.05
453 0.05
454 0.06
455 0.06
456 0.06
457 0.07
458 0.06
459 0.06
460 0.06
461 0.07
462 0.08
463 0.08
464 0.07
465 0.06
466 0.06
467 0.06
468 0.06
469 0.05
470 0.04
471 0.05
472 0.05
473 0.07
474 0.07
475 0.1
476 0.11
477 0.13
478 0.14
479 0.14
480 0.15
481 0.14
482 0.14
483 0.11
484 0.09
485 0.07
486 0.1
487 0.1
488 0.09
489 0.1
490 0.1
491 0.11
492 0.11
493 0.14
494 0.11
495 0.12
496 0.14
497 0.14
498 0.14
499 0.15
500 0.17
501 0.14
502 0.16
503 0.15
504 0.12
505 0.12
506 0.13
507 0.12
508 0.1
509 0.09
510 0.08
511 0.08
512 0.1
513 0.13
514 0.15
515 0.16
516 0.18
517 0.19
518 0.19
519 0.2
520 0.2
521 0.21
522 0.21
523 0.27
524 0.32
525 0.31
526 0.32
527 0.31
528 0.32
529 0.29
530 0.29
531 0.23
532 0.18
533 0.23
534 0.23
535 0.25
536 0.22
537 0.21
538 0.19
539 0.17
540 0.17
541 0.12
542 0.1
543 0.08
544 0.1
545 0.09
546 0.09
547 0.08
548 0.06
549 0.06
550 0.07
551 0.07
552 0.05
553 0.06
554 0.08
555 0.1
556 0.12
557 0.15
558 0.14
559 0.15
560 0.15
561 0.15
562 0.14
563 0.16
564 0.16
565 0.17
566 0.17
567 0.16
568 0.16
569 0.16
570 0.14
571 0.12
572 0.1
573 0.06
574 0.05
575 0.06
576 0.05
577 0.06
578 0.07
579 0.07
580 0.08
581 0.12
582 0.13
583 0.13
584 0.13
585 0.13
586 0.12
587 0.12
588 0.11
589 0.08
590 0.08
591 0.08
592 0.09
593 0.09
594 0.1
595 0.12
596 0.12
597 0.14
598 0.16
599 0.18
600 0.18
601 0.19
602 0.2
603 0.2
604 0.24
605 0.27
606 0.28
607 0.26
608 0.25
609 0.24
610 0.23
611 0.2
612 0.18
613 0.19
614 0.17
615 0.17
616 0.18
617 0.17
618 0.17
619 0.17
620 0.16
621 0.1
622 0.1
623 0.13
624 0.12
625 0.14
626 0.13
627 0.13
628 0.14
629 0.22
630 0.24
631 0.26
632 0.33
633 0.4
634 0.47
635 0.5
636 0.53
637 0.54
638 0.59
639 0.59
640 0.6
641 0.59
642 0.59
643 0.65
644 0.68
645 0.61
646 0.54
647 0.52
648 0.49
649 0.43
650 0.4
651 0.31
652 0.25
653 0.25
654 0.22
655 0.19
656 0.15
657 0.17
658 0.16
659 0.18
660 0.21
661 0.22
662 0.23
663 0.24
664 0.24
665 0.24
666 0.26
667 0.27
668 0.23
669 0.22
670 0.26
671 0.3
672 0.32
673 0.29
674 0.25
675 0.23
676 0.23
677 0.22
678 0.22
679 0.25
680 0.29
681 0.28
682 0.29
683 0.29
684 0.31
685 0.33
686 0.32
687 0.27
688 0.27
689 0.28
690 0.33
691 0.36
692 0.36
693 0.33
694 0.32
695 0.29
696 0.25
697 0.24
698 0.18
699 0.14
700 0.12
701 0.13
702 0.14
703 0.13
704 0.15
705 0.15
706 0.16
707 0.15
708 0.17
709 0.16
710 0.17
711 0.17
712 0.14
713 0.14
714 0.14
715 0.21
716 0.25
717 0.3
718 0.3
719 0.33
720 0.36
721 0.37
722 0.43
723 0.42
724 0.44
725 0.41
726 0.44
727 0.5
728 0.51
729 0.56
730 0.51
731 0.48
732 0.44
733 0.42
734 0.36
735 0.29
736 0.25
737 0.17
738 0.17
739 0.15
740 0.11
741 0.09
742 0.09
743 0.07
744 0.09
745 0.15
746 0.15
747 0.17
748 0.19
749 0.24
750 0.26
751 0.32
752 0.4
753 0.4
754 0.46
755 0.51
756 0.55
757 0.52
758 0.53
759 0.51
760 0.45
761 0.43
762 0.39
763 0.36
764 0.37
765 0.42
766 0.41
767 0.39
768 0.36
769 0.36
770 0.34
771 0.31
772 0.32
773 0.29
774 0.32
775 0.32
776 0.36
777 0.34
778 0.38
779 0.38
780 0.32
781 0.29
782 0.26
783 0.25
784 0.21
785 0.2
786 0.14
787 0.12
788 0.11
789 0.13
790 0.11
791 0.11
792 0.13
793 0.13
794 0.14
795 0.14
796 0.16
797 0.13
798 0.12
799 0.1
800 0.08
801 0.09
802 0.09
803 0.08
804 0.06
805 0.07
806 0.07
807 0.07
808 0.08
809 0.09
810 0.15
811 0.19
812 0.27
813 0.31
814 0.36
815 0.38
816 0.46
817 0.46
818 0.42
819 0.41
820 0.35
821 0.33
822 0.29
823 0.25
824 0.17
825 0.15
826 0.13
827 0.1
828 0.08
829 0.06
830 0.06
831 0.07
832 0.09
833 0.1
834 0.13
835 0.18
836 0.18
837 0.19
838 0.23
839 0.25
840 0.25
841 0.28
842 0.34
843 0.32
844 0.39
845 0.39
846 0.36
847 0.34
848 0.33
849 0.29
850 0.22
851 0.19
852 0.12
853 0.12
854 0.13
855 0.13
856 0.12
857 0.12
858 0.12
859 0.13
860 0.13
861 0.11
862 0.09
863 0.1
864 0.11
865 0.11
866 0.16
867 0.18
868 0.22