Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397VCD1

Protein Details
Accession A0A397VCD1    Localization Confidence Low Confidence Score 9.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
67-86ETNNKRKRFEHNLDNRQGRAHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 13, mito 4, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR041078  Plavaka  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
Pfam View protein in Pfam  
PF18759  Plavaka  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50157  ZINC_FINGER_C2H2_2  
Amino Acid Sequences MLKCSSCNKVFKDQQVLGNHRRIYLNDSDEDISLFSRAISQNLVEITSQVLNNQNISKKETMSEKAETNNKRKRFEHNLDNRQGRAIFNEDESIEVQNLGVPFSTFTSNIEIYNKFTERKNIKSFNYSDSQSDVSNEEYYSDSQSKPKDPKDIFQVFPLKEYAEFMNIITRFHVQNTLANAFIKFFNRYSNRNDCPLPSTSKAGRTFIENLNLPNFGWRKEVIFEYEGLEYALEFRTVLNGIHQILLNNSITEEFVIEFKISTDKVSGERQYSDMFDSDWWRNVEQNIPIGAHVIPIIIYSDATQCDRLGKTSKHPVFMKLGNIPLTRHNKVDAKVLLGYIPNLEHHSTSEKYSAKFRAVTCKLFHQAFAAMLRPLRSLCNTGFHLYVNSNLKWFYPYLALVISDWPEACSICAIYESPNCSCPSHFCLVDRNAMNNVLIEKKYNHPQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.67
2 0.69
3 0.72
4 0.69
5 0.69
6 0.63
7 0.56
8 0.53
9 0.47
10 0.44
11 0.43
12 0.41
13 0.34
14 0.36
15 0.34
16 0.32
17 0.31
18 0.26
19 0.18
20 0.14
21 0.12
22 0.08
23 0.13
24 0.13
25 0.14
26 0.15
27 0.15
28 0.18
29 0.18
30 0.19
31 0.14
32 0.13
33 0.14
34 0.15
35 0.15
36 0.14
37 0.2
38 0.2
39 0.23
40 0.27
41 0.3
42 0.3
43 0.35
44 0.35
45 0.31
46 0.33
47 0.37
48 0.37
49 0.37
50 0.39
51 0.36
52 0.41
53 0.48
54 0.53
55 0.57
56 0.61
57 0.62
58 0.66
59 0.66
60 0.68
61 0.7
62 0.71
63 0.72
64 0.74
65 0.77
66 0.79
67 0.81
68 0.72
69 0.64
70 0.57
71 0.46
72 0.39
73 0.33
74 0.25
75 0.22
76 0.23
77 0.2
78 0.2
79 0.2
80 0.18
81 0.13
82 0.12
83 0.1
84 0.1
85 0.1
86 0.09
87 0.08
88 0.07
89 0.07
90 0.09
91 0.11
92 0.09
93 0.1
94 0.15
95 0.15
96 0.16
97 0.19
98 0.19
99 0.2
100 0.26
101 0.26
102 0.24
103 0.25
104 0.34
105 0.36
106 0.43
107 0.49
108 0.51
109 0.52
110 0.57
111 0.58
112 0.53
113 0.52
114 0.45
115 0.38
116 0.33
117 0.31
118 0.24
119 0.23
120 0.19
121 0.16
122 0.15
123 0.14
124 0.12
125 0.13
126 0.13
127 0.16
128 0.17
129 0.16
130 0.2
131 0.23
132 0.29
133 0.35
134 0.38
135 0.43
136 0.43
137 0.46
138 0.51
139 0.54
140 0.48
141 0.47
142 0.51
143 0.41
144 0.41
145 0.37
146 0.28
147 0.22
148 0.23
149 0.17
150 0.11
151 0.12
152 0.1
153 0.15
154 0.15
155 0.15
156 0.14
157 0.15
158 0.14
159 0.15
160 0.18
161 0.13
162 0.16
163 0.19
164 0.19
165 0.18
166 0.18
167 0.18
168 0.15
169 0.16
170 0.15
171 0.13
172 0.12
173 0.19
174 0.23
175 0.26
176 0.32
177 0.4
178 0.4
179 0.42
180 0.43
181 0.36
182 0.36
183 0.35
184 0.33
185 0.26
186 0.28
187 0.26
188 0.33
189 0.33
190 0.31
191 0.29
192 0.27
193 0.29
194 0.27
195 0.29
196 0.22
197 0.21
198 0.21
199 0.21
200 0.17
201 0.18
202 0.17
203 0.14
204 0.15
205 0.14
206 0.14
207 0.15
208 0.16
209 0.13
210 0.14
211 0.13
212 0.13
213 0.13
214 0.12
215 0.1
216 0.09
217 0.06
218 0.06
219 0.06
220 0.04
221 0.04
222 0.04
223 0.05
224 0.06
225 0.06
226 0.06
227 0.07
228 0.08
229 0.09
230 0.09
231 0.08
232 0.08
233 0.11
234 0.1
235 0.08
236 0.08
237 0.07
238 0.07
239 0.07
240 0.07
241 0.05
242 0.05
243 0.05
244 0.05
245 0.05
246 0.05
247 0.07
248 0.07
249 0.07
250 0.08
251 0.09
252 0.12
253 0.16
254 0.18
255 0.18
256 0.19
257 0.2
258 0.2
259 0.2
260 0.19
261 0.15
262 0.13
263 0.12
264 0.15
265 0.15
266 0.18
267 0.19
268 0.18
269 0.19
270 0.2
271 0.22
272 0.2
273 0.21
274 0.18
275 0.17
276 0.16
277 0.16
278 0.15
279 0.11
280 0.09
281 0.07
282 0.05
283 0.05
284 0.06
285 0.05
286 0.05
287 0.05
288 0.07
289 0.08
290 0.09
291 0.1
292 0.1
293 0.13
294 0.14
295 0.16
296 0.21
297 0.22
298 0.28
299 0.39
300 0.41
301 0.45
302 0.46
303 0.46
304 0.45
305 0.46
306 0.43
307 0.36
308 0.36
309 0.34
310 0.34
311 0.31
312 0.34
313 0.39
314 0.37
315 0.34
316 0.36
317 0.36
318 0.37
319 0.43
320 0.36
321 0.31
322 0.3
323 0.29
324 0.26
325 0.21
326 0.2
327 0.13
328 0.13
329 0.11
330 0.12
331 0.13
332 0.12
333 0.14
334 0.18
335 0.19
336 0.2
337 0.26
338 0.27
339 0.27
340 0.34
341 0.35
342 0.34
343 0.38
344 0.38
345 0.42
346 0.44
347 0.47
348 0.43
349 0.47
350 0.49
351 0.44
352 0.43
353 0.34
354 0.3
355 0.27
356 0.26
357 0.21
358 0.17
359 0.18
360 0.19
361 0.18
362 0.17
363 0.18
364 0.19
365 0.21
366 0.21
367 0.26
368 0.28
369 0.29
370 0.29
371 0.26
372 0.26
373 0.23
374 0.28
375 0.28
376 0.25
377 0.24
378 0.24
379 0.24
380 0.24
381 0.23
382 0.19
383 0.16
384 0.16
385 0.16
386 0.17
387 0.17
388 0.15
389 0.17
390 0.16
391 0.14
392 0.14
393 0.13
394 0.13
395 0.12
396 0.12
397 0.11
398 0.1
399 0.09
400 0.1
401 0.1
402 0.14
403 0.19
404 0.22
405 0.23
406 0.27
407 0.29
408 0.29
409 0.3
410 0.31
411 0.34
412 0.36
413 0.36
414 0.34
415 0.4
416 0.42
417 0.5
418 0.46
419 0.43
420 0.39
421 0.38
422 0.37
423 0.3
424 0.29
425 0.26
426 0.24
427 0.25
428 0.25