FuNGI

A0A397VRD6

Protein Details

Accession

A0A397VRD6

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
99-119	GVLPTRPHRNFKKKLDLNVGA	Hydrophilic
161-183	LKELMIRKYRKNRLENRKNLVFF	Hydrophilic
376-423	AWTGRDKIENKRKKNPKNLKKDWPEKELLSEKEKKKLRQEIKEKESAE	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
382-419	KIENKRKKNPKNLKKDWPEKELLSEKEKKKLRQEIKEK

Subcellular Location(s)

nucl 20.5, cyto_nucl 12.5, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf
Gene Ontology	GO:0003676 F:nucleic acid binding

Amino Acid Sequences

MQRQESKVVYISREGALKEERSKEVKEEFVAGPVNKLAMKVKLRSVEEDQKKKQWLLVAKENSCWDIRRVVRKEQETILTEHWTVQSCKEQTERSDIVGVLPTRPHRNFKKKLDLNVGAILRWGKRREVEDDDKLELPQRLKEVQDLGIEIIRNQKLSSELKELMIRKYRKNRLENRKNLVFFTDVSLARSSVRKEETDMMGASWVQLELDKEARAADYLLSLIKVKGHSGVIWNEVADQLAKKGSKVTDRQRCVTELPPSSERRIVLEEQEGRTARPQDKDMKFKWSLLWNRIKRQNGIRCTSMRKNRRLGGLFKCLQEKLPVLETLVQHRKDIYSDSNCISCKNRKEENQDHLSECSKYKDLWNNLEETAIQAAWTGRDKIENKRKKNPKNLKKDWPEKELLSEKEKKKLRQEIKEKESAEKCRREKLLEEAIELLIAKATTSYQSIGYITCSLGTISRIGAFGRSLLETGPGELNYKDLWRRRSTNLATRVVPEEKDLYYGSRYQGKKNHMAPNTRARCKYAVLAALGSWRMSTLEGFLKWSHLISNKVTPKGAANGKSSWRWKFKAELGWLDLVGGI

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.3
2	0.29
3	0.31
4	0.33
5	0.37
6	0.39
7	0.43
8	0.44
9	0.46
10	0.47
11	0.47
12	0.46
13	0.41
14	0.41
15	0.35
16	0.35
17	0.39
18	0.33
19	0.29
20	0.26
21	0.25
22	0.2
23	0.22
24	0.21
25	0.23
26	0.29
27	0.31
28	0.37
29	0.42
30	0.45
31	0.49
32	0.53
33	0.56
34	0.61
35	0.67
36	0.67
37	0.67
38	0.7
39	0.66
40	0.6
41	0.57
42	0.55
43	0.53
44	0.57
45	0.58
46	0.55
47	0.58
48	0.57
49	0.52
50	0.46
51	0.4
52	0.31
53	0.31
54	0.36
55	0.43
56	0.46
57	0.53
58	0.6
59	0.62
60	0.65
61	0.6
62	0.6
63	0.53
64	0.52
65	0.45
66	0.39
67	0.35
68	0.32
69	0.3
70	0.27
71	0.25
72	0.24
73	0.3
74	0.28
75	0.31
76	0.34
77	0.35
78	0.35
79	0.42
80	0.4
81	0.33
82	0.35
83	0.31
84	0.28
85	0.3
86	0.27
87	0.21
88	0.23
89	0.26
90	0.32
91	0.35
92	0.43
93	0.48
94	0.58
95	0.66
96	0.72
97	0.78
98	0.76
99	0.81
100	0.82
101	0.76
102	0.68
103	0.65
104	0.56
105	0.44
106	0.4
107	0.34
108	0.27
109	0.28
110	0.27
111	0.24
112	0.28
113	0.31
114	0.36
115	0.42
116	0.47
117	0.48
118	0.5
119	0.5
120	0.46
121	0.43
122	0.4
123	0.35
124	0.29
125	0.24
126	0.24
127	0.23
128	0.23
129	0.26
130	0.25
131	0.24
132	0.24
133	0.22
134	0.19
135	0.19
136	0.18
137	0.16
138	0.2
139	0.18
140	0.17
141	0.16
142	0.16
143	0.19
144	0.23
145	0.26
146	0.25
147	0.25
148	0.27
149	0.32
150	0.33
151	0.35
152	0.4
153	0.4
154	0.43
155	0.52
156	0.6
157	0.64
158	0.72
159	0.76
160	0.79
161	0.86
162	0.86
163	0.84
164	0.83
165	0.75
166	0.66
167	0.57
168	0.47
169	0.37
170	0.31
171	0.28
172	0.2
173	0.21
174	0.21
175	0.19
176	0.19
177	0.21
178	0.18
179	0.18
180	0.2
181	0.19
182	0.22
183	0.26
184	0.26
185	0.26
186	0.25
187	0.2
188	0.18
189	0.17
190	0.14
191	0.09
192	0.07
193	0.05
194	0.05
195	0.06
196	0.07
197	0.08
198	0.08
199	0.08
200	0.09
201	0.09
202	0.08
203	0.08
204	0.07
205	0.05
206	0.06
207	0.06
208	0.06
209	0.07
210	0.06
211	0.08
212	0.08
213	0.08
214	0.1
215	0.1
216	0.1
217	0.13
218	0.14
219	0.15
220	0.14
221	0.14
222	0.12
223	0.12
224	0.11
225	0.08
226	0.07
227	0.06
228	0.09
229	0.09
230	0.09
231	0.12
232	0.14
233	0.2
234	0.28
235	0.37
236	0.44
237	0.47
238	0.5
239	0.49
240	0.49
241	0.45
242	0.42
243	0.39
244	0.32
245	0.33
246	0.34
247	0.35
248	0.35
249	0.35
250	0.3
251	0.25
252	0.26
253	0.22
254	0.19
255	0.23
256	0.24
257	0.22
258	0.26
259	0.24
260	0.21
261	0.23
262	0.25
263	0.23
264	0.22
265	0.25
266	0.31
267	0.35
268	0.42
269	0.41
270	0.44
271	0.42
272	0.4
273	0.4
274	0.38
275	0.38
276	0.39
277	0.47
278	0.44
279	0.51
280	0.56
281	0.56
282	0.52
283	0.56
284	0.57
285	0.53
286	0.52
287	0.48
288	0.45
289	0.49
290	0.53
291	0.53
292	0.54
293	0.54
294	0.57
295	0.57
296	0.61
297	0.58
298	0.56
299	0.52
300	0.52
301	0.49
302	0.44
303	0.43
304	0.36
305	0.33
306	0.29
307	0.24
308	0.17
309	0.16
310	0.15
311	0.13
312	0.17
313	0.17
314	0.22
315	0.28
316	0.27
317	0.25
318	0.25
319	0.25
320	0.22
321	0.24
322	0.23
323	0.2
324	0.22
325	0.23
326	0.25
327	0.25
328	0.26
329	0.28
330	0.28
331	0.31
332	0.36
333	0.41
334	0.45
335	0.55
336	0.61
337	0.64
338	0.64
339	0.6
340	0.55
341	0.5
342	0.45
343	0.37
344	0.3
345	0.25
346	0.19
347	0.18
348	0.22
349	0.28
350	0.32
351	0.36
352	0.37
353	0.36
354	0.35
355	0.34
356	0.28
357	0.21
358	0.17
359	0.1
360	0.08
361	0.07
362	0.07
363	0.08
364	0.1
365	0.1
366	0.09
367	0.16
368	0.19
369	0.29
370	0.39
371	0.47
372	0.53
373	0.62
374	0.73
375	0.76
376	0.85
377	0.85
378	0.85
379	0.87
380	0.89
381	0.89
382	0.89
383	0.9
384	0.85
385	0.8
386	0.73
387	0.63
388	0.6
389	0.56
390	0.49
391	0.47
392	0.49
393	0.45
394	0.5
395	0.56
396	0.55
397	0.57
398	0.64
399	0.67
400	0.68
401	0.76
402	0.78
403	0.79
404	0.81
405	0.73
406	0.71
407	0.68
408	0.67
409	0.65
410	0.64
411	0.6
412	0.61
413	0.62
414	0.57
415	0.54
416	0.52
417	0.53
418	0.44
419	0.43
420	0.36
421	0.33
422	0.3
423	0.26
424	0.18
425	0.09
426	0.07
427	0.06
428	0.05
429	0.05
430	0.06
431	0.07
432	0.09
433	0.08
434	0.1
435	0.11
436	0.11
437	0.12
438	0.12
439	0.11
440	0.1
441	0.1
442	0.09
443	0.1
444	0.1
445	0.09
446	0.09
447	0.1
448	0.1
449	0.1
450	0.11
451	0.1
452	0.1
453	0.11
454	0.1
455	0.1
456	0.09
457	0.12
458	0.11
459	0.13
460	0.14
461	0.13
462	0.14
463	0.13
464	0.15
465	0.13
466	0.17
467	0.22
468	0.26
469	0.33
470	0.38
471	0.44
472	0.47
473	0.57
474	0.6
475	0.63
476	0.66
477	0.64
478	0.59
479	0.56
480	0.57
481	0.49
482	0.42
483	0.35
484	0.29
485	0.24
486	0.25
487	0.23
488	0.2
489	0.2
490	0.23
491	0.23
492	0.29
493	0.31
494	0.36
495	0.42
496	0.47
497	0.54
498	0.59
499	0.65
500	0.64
501	0.69
502	0.69
503	0.73
504	0.75
505	0.74
506	0.68
507	0.63
508	0.59
509	0.54
510	0.52
511	0.46
512	0.41
513	0.35
514	0.33
515	0.29
516	0.3
517	0.28
518	0.23
519	0.17
520	0.13
521	0.11
522	0.11
523	0.11
524	0.11
525	0.16
526	0.16
527	0.2
528	0.2
529	0.22
530	0.22
531	0.22
532	0.23
533	0.22
534	0.26
535	0.28
536	0.38
537	0.42
538	0.45
539	0.45
540	0.41
541	0.41
542	0.45
543	0.48
544	0.43
545	0.41
546	0.43
547	0.48
548	0.55
549	0.59
550	0.6
551	0.6
552	0.58
553	0.58
554	0.6
555	0.62
556	0.63
557	0.63
558	0.6
559	0.56
560	0.55
561	0.5

A0A397VRD6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer