Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397U9F9

Protein Details
Accession A0A397U9F9    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
136-160VGFVDFQKTKKRRRNKDVISREMTSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
145-149KKRRR
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 12.5, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Amino Acid Sequences MSNLSVSKDNSFNNFNNSGETIISVNDIVKYSLEKKCDISTIFINHNVKYLPTLSVQELVETSVKNNRMKNTNKTCNAFFIFRTEFSNEAKKLGYNSGQISIHASLCWKRFPEHVKDIYKNISKEVNIAFKQRVPVGFVDFQKTKKRRRNKDVISREMTSSYNLIGGESIQQEHSINLSHLDLDFTNLHLPLNDPYYQELKLTYEAIINSIPDFNNS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.34
3 0.33
4 0.32
5 0.28
6 0.22
7 0.21
8 0.15
9 0.13
10 0.13
11 0.1
12 0.1
13 0.1
14 0.1
15 0.1
16 0.1
17 0.13
18 0.18
19 0.22
20 0.24
21 0.25
22 0.27
23 0.29
24 0.33
25 0.3
26 0.28
27 0.29
28 0.31
29 0.32
30 0.36
31 0.36
32 0.32
33 0.32
34 0.28
35 0.24
36 0.21
37 0.2
38 0.15
39 0.14
40 0.16
41 0.15
42 0.19
43 0.18
44 0.17
45 0.16
46 0.15
47 0.15
48 0.13
49 0.13
50 0.15
51 0.2
52 0.23
53 0.27
54 0.3
55 0.37
56 0.43
57 0.52
58 0.57
59 0.62
60 0.64
61 0.64
62 0.61
63 0.57
64 0.54
65 0.45
66 0.35
67 0.31
68 0.27
69 0.24
70 0.25
71 0.22
72 0.21
73 0.22
74 0.28
75 0.22
76 0.22
77 0.21
78 0.19
79 0.19
80 0.2
81 0.2
82 0.15
83 0.16
84 0.18
85 0.18
86 0.17
87 0.18
88 0.16
89 0.14
90 0.12
91 0.12
92 0.12
93 0.13
94 0.15
95 0.13
96 0.13
97 0.18
98 0.23
99 0.29
100 0.33
101 0.4
102 0.43
103 0.44
104 0.46
105 0.47
106 0.47
107 0.4
108 0.34
109 0.3
110 0.24
111 0.25
112 0.25
113 0.26
114 0.23
115 0.25
116 0.24
117 0.23
118 0.25
119 0.24
120 0.22
121 0.17
122 0.17
123 0.19
124 0.22
125 0.22
126 0.26
127 0.26
128 0.29
129 0.37
130 0.42
131 0.48
132 0.52
133 0.62
134 0.68
135 0.76
136 0.83
137 0.84
138 0.89
139 0.89
140 0.88
141 0.83
142 0.74
143 0.65
144 0.56
145 0.46
146 0.36
147 0.27
148 0.18
149 0.14
150 0.12
151 0.11
152 0.09
153 0.08
154 0.1
155 0.1
156 0.11
157 0.09
158 0.1
159 0.11
160 0.11
161 0.11
162 0.1
163 0.09
164 0.1
165 0.1
166 0.1
167 0.1
168 0.11
169 0.1
170 0.12
171 0.12
172 0.12
173 0.14
174 0.13
175 0.14
176 0.12
177 0.14
178 0.13
179 0.16
180 0.17
181 0.16
182 0.2
183 0.22
184 0.23
185 0.22
186 0.2
187 0.19
188 0.2
189 0.2
190 0.17
191 0.17
192 0.16
193 0.18
194 0.17
195 0.15
196 0.14
197 0.16