FuNGI

A0A395T604

Protein Details

Accession

A0A395T604

Localization Confidence

High

Confidence Score

23.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
17-51	HPNGSSRNKKANPLRPMRKKPVNPLVSRRPPPRPA	Hydrophilic
182-208	APVAKDTNPKRPKKQKEEKTTFNRAPK	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
22-51	SRNKKANPLRPMRKKPVNPLVSRRPPPRPA
190-200	PKRPKKQKEEK
483-505	PSGKKPESSKKGKSLKRAGSPAL
512-520	ESSRKKLKK

Subcellular Location(s)

nucl 24, mito 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003743 F:translation initiation factor activity GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MSAPPPPGNPSANAPAHPNGSSRNKKANPLRPMRKKPVNPLVSRRPPPRPAAPSGSGAQNGTKPNIEEIRRQNGGWSEPPPAAYSDIPIMTTKKALLDGIRYHMMKFTQSKVGDKSIDPTDQDDFARPVTLHRRDARQPPPGRAVKVEAPEAPQPDEQEAERMAQIKAEKEAQRAIDQAKIAPVAKDTNPKRPKKQKEEKTTFNRAPKTDAAKKESDLRYEEALPWHLEDADGKKVWVGNYVSALSESNVAFMIDQSVFRMVPLEKWYRFTSKPPFQPYTIDEAEALMVKKVDLGRWVMKDQEKREGQKDVEATRRMFYGGGQMVKTESATFKAASRSEKLEHDDIDFSGDEFQDDDETPMFEKNNDDEDEKDAKERIRREQLGANLFGEGDEQEVDKELDEQLQEEELRQKLGKTTKKALIKRDQENIYESDDSEENPWSSSSDDNSSDEEEDEEKKDEEKKEAGKDDKTQSGSGSKGTNTPSGKKPESSKKGKSLKRAGSPALSESSGNESSRKKLKKNVTSAAASRSGTPLPRGAAARRAMGAGSGSDGEATAGEMSDGAAAKRKKLKLVSHSARGTPSASRAGSPNPQGAASPGSPVAASLVEPSEILDKIPDEGIVIGELIKTFQHRLGDLPGQMPKKDWIQLVKTLCEFGPDKRLRRRN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.39
2	0.38
3	0.39
4	0.38
5	0.34
6	0.33
7	0.41
8	0.49
9	0.51
10	0.58
11	0.59
12	0.68
13	0.76
14	0.78
15	0.78
16	0.8
17	0.84
18	0.84
19	0.9
20	0.91
21	0.91
22	0.89
23	0.89
24	0.89
25	0.87
26	0.84
27	0.83
28	0.84
29	0.84
30	0.85
31	0.82
32	0.8
33	0.77
34	0.76
35	0.77
36	0.72
37	0.69
38	0.69
39	0.64
40	0.59
41	0.55
42	0.52
43	0.43
44	0.38
45	0.33
46	0.3
47	0.29
48	0.28
49	0.27
50	0.24
51	0.29
52	0.35
53	0.36
54	0.4
55	0.44
56	0.5
57	0.5
58	0.49
59	0.47
60	0.44
61	0.46
62	0.42
63	0.37
64	0.32
65	0.31
66	0.32
67	0.28
68	0.26
69	0.24
70	0.2
71	0.19
72	0.19
73	0.18
74	0.18
75	0.19
76	0.19
77	0.17
78	0.18
79	0.17
80	0.15
81	0.16
82	0.17
83	0.17
84	0.22
85	0.24
86	0.27
87	0.32
88	0.31
89	0.3
90	0.32
91	0.3
92	0.29
93	0.3
94	0.29
95	0.32
96	0.33
97	0.38
98	0.38
99	0.43
100	0.4
101	0.36
102	0.37
103	0.33
104	0.34
105	0.3
106	0.29
107	0.26
108	0.25
109	0.26
110	0.24
111	0.21
112	0.18
113	0.2
114	0.17
115	0.2
116	0.28
117	0.33
118	0.38
119	0.41
120	0.48
121	0.52
122	0.62
123	0.64
124	0.65
125	0.64
126	0.63
127	0.68
128	0.66
129	0.61
130	0.54
131	0.52
132	0.47
133	0.45
134	0.41
135	0.33
136	0.32
137	0.33
138	0.33
139	0.31
140	0.26
141	0.24
142	0.23
143	0.23
144	0.19
145	0.18
146	0.17
147	0.15
148	0.15
149	0.16
150	0.14
151	0.16
152	0.17
153	0.16
154	0.18
155	0.24
156	0.25
157	0.26
158	0.29
159	0.29
160	0.29
161	0.3
162	0.29
163	0.25
164	0.23
165	0.22
166	0.19
167	0.2
168	0.18
169	0.16
170	0.16
171	0.16
172	0.18
173	0.27
174	0.29
175	0.38
176	0.47
177	0.54
178	0.63
179	0.7
180	0.78
181	0.79
182	0.87
183	0.87
184	0.89
185	0.9
186	0.9
187	0.88
188	0.87
189	0.82
190	0.79
191	0.75
192	0.64
193	0.6
194	0.56
195	0.56
196	0.54
197	0.53
198	0.51
199	0.47
200	0.47
201	0.52
202	0.49
203	0.43
204	0.38
205	0.35
206	0.32
207	0.31
208	0.31
209	0.24
210	0.23
211	0.2
212	0.17
213	0.16
214	0.13
215	0.11
216	0.12
217	0.12
218	0.15
219	0.15
220	0.14
221	0.14
222	0.16
223	0.16
224	0.2
225	0.18
226	0.14
227	0.16
228	0.17
229	0.16
230	0.15
231	0.15
232	0.1
233	0.11
234	0.1
235	0.08
236	0.08
237	0.08
238	0.07
239	0.07
240	0.09
241	0.06
242	0.07
243	0.07
244	0.08
245	0.08
246	0.08
247	0.1
248	0.08
249	0.1
250	0.16
251	0.21
252	0.21
253	0.25
254	0.28
255	0.3
256	0.32
257	0.36
258	0.41
259	0.43
260	0.49
261	0.53
262	0.53
263	0.49
264	0.51
265	0.47
266	0.44
267	0.36
268	0.3
269	0.22
270	0.19
271	0.18
272	0.16
273	0.14
274	0.07
275	0.06
276	0.06
277	0.08
278	0.08
279	0.08
280	0.09
281	0.12
282	0.15
283	0.18
284	0.19
285	0.21
286	0.26
287	0.3
288	0.31
289	0.36
290	0.37
291	0.38
292	0.4
293	0.4
294	0.36
295	0.34
296	0.36
297	0.31
298	0.33
299	0.33
300	0.31
301	0.27
302	0.27
303	0.23
304	0.2
305	0.16
306	0.15
307	0.15
308	0.15
309	0.14
310	0.14
311	0.14
312	0.14
313	0.14
314	0.09
315	0.07
316	0.07
317	0.08
318	0.09
319	0.1
320	0.13
321	0.15
322	0.16
323	0.18
324	0.19
325	0.21
326	0.22
327	0.24
328	0.23
329	0.22
330	0.21
331	0.2
332	0.16
333	0.16
334	0.14
335	0.1
336	0.1
337	0.09
338	0.07
339	0.07
340	0.07
341	0.06
342	0.06
343	0.07
344	0.06
345	0.07
346	0.07
347	0.08
348	0.08
349	0.07
350	0.08
351	0.09
352	0.13
353	0.14
354	0.14
355	0.14
356	0.19
357	0.22
358	0.21
359	0.21
360	0.19
361	0.2
362	0.24
363	0.26
364	0.29
365	0.35
366	0.37
367	0.38
368	0.41
369	0.43
370	0.42
371	0.4
372	0.32
373	0.23
374	0.21
375	0.18
376	0.14
377	0.09
378	0.05
379	0.05
380	0.04
381	0.04
382	0.05
383	0.06
384	0.05
385	0.06
386	0.06
387	0.07
388	0.07
389	0.08
390	0.07
391	0.08
392	0.08
393	0.08
394	0.12
395	0.11
396	0.13
397	0.13
398	0.13
399	0.17
400	0.25
401	0.31
402	0.33
403	0.39
404	0.44
405	0.53
406	0.57
407	0.61
408	0.62
409	0.64
410	0.64
411	0.65
412	0.61
413	0.54
414	0.52
415	0.45
416	0.39
417	0.31
418	0.26
419	0.2
420	0.17
421	0.16
422	0.15
423	0.15
424	0.11
425	0.11
426	0.11
427	0.09
428	0.1
429	0.11
430	0.12
431	0.14
432	0.15
433	0.16
434	0.17
435	0.18
436	0.18
437	0.17
438	0.16
439	0.14
440	0.14
441	0.14
442	0.15
443	0.14
444	0.15
445	0.21
446	0.21
447	0.24
448	0.27
449	0.31
450	0.35
451	0.42
452	0.45
453	0.43
454	0.48
455	0.49
456	0.49
457	0.47
458	0.41
459	0.35
460	0.34
461	0.31
462	0.26
463	0.24
464	0.18
465	0.2
466	0.22
467	0.26
468	0.26
469	0.31
470	0.35
471	0.41
472	0.43
473	0.43
474	0.49
475	0.53
476	0.6
477	0.64
478	0.65
479	0.67
480	0.75
481	0.76
482	0.78
483	0.77
484	0.76
485	0.75
486	0.73
487	0.66
488	0.6
489	0.56
490	0.48
491	0.41
492	0.33
493	0.25
494	0.2
495	0.23
496	0.22
497	0.21
498	0.22
499	0.22
500	0.27
501	0.36
502	0.41
503	0.4
504	0.47
505	0.57
506	0.63
507	0.7
508	0.72
509	0.69
510	0.67
511	0.65
512	0.61
513	0.54
514	0.45
515	0.37
516	0.32
517	0.28
518	0.24
519	0.24
520	0.22
521	0.19
522	0.22
523	0.24
524	0.23
525	0.28
526	0.29
527	0.29
528	0.27
529	0.26
530	0.22
531	0.2
532	0.18
533	0.11
534	0.1
535	0.09
536	0.08
537	0.07
538	0.07
539	0.07
540	0.06
541	0.06
542	0.05
543	0.04
544	0.04
545	0.04
546	0.05
547	0.06
548	0.07
549	0.06
550	0.14
551	0.15
552	0.21
553	0.29
554	0.32
555	0.37
556	0.45
557	0.53
558	0.56
559	0.67
560	0.69
561	0.7
562	0.71
563	0.66
564	0.61
565	0.53
566	0.46
567	0.37
568	0.33
569	0.3
570	0.27
571	0.25
572	0.26
573	0.3
574	0.34
575	0.36
576	0.36
577	0.3
578	0.3
579	0.29
580	0.28
581	0.28
582	0.21
583	0.2
584	0.16
585	0.16
586	0.15
587	0.15
588	0.14
589	0.09
590	0.09
591	0.09
592	0.09
593	0.09
594	0.09
595	0.1
596	0.12
597	0.12
598	0.12
599	0.11
600	0.11
601	0.12
602	0.13
603	0.12
604	0.1
605	0.1
606	0.1
607	0.09
608	0.08
609	0.07
610	0.07
611	0.07
612	0.07
613	0.08
614	0.1
615	0.12
616	0.15
617	0.18
618	0.18
619	0.21
620	0.27
621	0.32
622	0.31
623	0.34
624	0.38
625	0.38
626	0.38
627	0.38
628	0.35
629	0.35
630	0.38
631	0.38
632	0.39
633	0.41
634	0.48
635	0.5
636	0.51
637	0.47
638	0.45
639	0.39
640	0.37
641	0.34
642	0.3
643	0.36
644	0.39
645	0.47

A0A395T604

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer