Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A395SVB4

Protein Details
Accession A0A395SVB4    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
95-119ERITARAPRKKGQRKSKKPIHSLISHydrophilic
283-310RIRGPKEVTKLLKKPRRTKKAIAAEAEAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
100-113RAPRKKGQRKSKKP
286-302GPKEVTKLLKKPRRTKK
Subcellular Location(s) mito 19, cyto_mito 13, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000305  GIY-YIG_endonuc  
IPR035901  GIY-YIG_endonuc_sf  
IPR027520  Slx1  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0033557  C:Slx1-Slx4 complex  
GO:0017108  F:5'-flap endonuclease activity  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF01541  GIY-YIG  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50164  GIY_YIG  
Amino Acid Sequences MSQVQRPIPALYAVYVLRSSVRHASFYIGSTPHPPRRLNQHNGVSRGGAVRTAKDTLRPWEAIIVITGFPSSIAALKFEWALTNPHLTLSISPQERITARAPRKKGQRKSKKPIHSLISVVSNLHLLTGVPSFARWPLTLHFFAEDAKKKWDNWLKTKDTTPREGIRITTDYKPAGDSVEPWGIHALPLDYAILKPYVEKAHNVVSFEREGDCVHCHEPLQSGRGLHPICPHEGCEAMGHLDCWGKHALQSENKGVVVPLSCTCPSCGGKINWIDMMKELTLRIRGPKEVTKLLKKPRRTKKAIAAEAEAEEDI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.16
3 0.15
4 0.15
5 0.15
6 0.18
7 0.23
8 0.24
9 0.24
10 0.25
11 0.29
12 0.28
13 0.3
14 0.3
15 0.23
16 0.23
17 0.29
18 0.36
19 0.4
20 0.44
21 0.44
22 0.45
23 0.54
24 0.63
25 0.64
26 0.65
27 0.67
28 0.68
29 0.7
30 0.66
31 0.56
32 0.47
33 0.41
34 0.32
35 0.26
36 0.2
37 0.19
38 0.2
39 0.23
40 0.22
41 0.25
42 0.28
43 0.3
44 0.34
45 0.32
46 0.3
47 0.3
48 0.29
49 0.24
50 0.21
51 0.17
52 0.12
53 0.11
54 0.1
55 0.07
56 0.06
57 0.06
58 0.06
59 0.07
60 0.07
61 0.08
62 0.09
63 0.1
64 0.1
65 0.1
66 0.11
67 0.09
68 0.12
69 0.13
70 0.16
71 0.15
72 0.15
73 0.15
74 0.15
75 0.15
76 0.16
77 0.21
78 0.19
79 0.19
80 0.19
81 0.21
82 0.21
83 0.24
84 0.24
85 0.27
86 0.34
87 0.42
88 0.46
89 0.51
90 0.61
91 0.68
92 0.74
93 0.76
94 0.79
95 0.82
96 0.88
97 0.91
98 0.9
99 0.87
100 0.84
101 0.78
102 0.69
103 0.59
104 0.5
105 0.44
106 0.34
107 0.27
108 0.2
109 0.15
110 0.12
111 0.1
112 0.08
113 0.04
114 0.05
115 0.05
116 0.05
117 0.05
118 0.05
119 0.06
120 0.06
121 0.08
122 0.07
123 0.08
124 0.1
125 0.15
126 0.16
127 0.15
128 0.15
129 0.14
130 0.15
131 0.19
132 0.22
133 0.19
134 0.23
135 0.24
136 0.24
137 0.32
138 0.38
139 0.39
140 0.43
141 0.5
142 0.5
143 0.51
144 0.56
145 0.55
146 0.51
147 0.49
148 0.45
149 0.39
150 0.37
151 0.35
152 0.31
153 0.26
154 0.25
155 0.25
156 0.22
157 0.21
158 0.19
159 0.19
160 0.19
161 0.15
162 0.14
163 0.11
164 0.1
165 0.11
166 0.15
167 0.15
168 0.15
169 0.15
170 0.13
171 0.13
172 0.13
173 0.09
174 0.05
175 0.05
176 0.05
177 0.05
178 0.05
179 0.06
180 0.06
181 0.06
182 0.06
183 0.08
184 0.13
185 0.13
186 0.14
187 0.16
188 0.23
189 0.25
190 0.26
191 0.24
192 0.22
193 0.22
194 0.22
195 0.2
196 0.13
197 0.12
198 0.13
199 0.13
200 0.14
201 0.14
202 0.14
203 0.14
204 0.14
205 0.19
206 0.18
207 0.19
208 0.18
209 0.18
210 0.18
211 0.25
212 0.25
213 0.22
214 0.26
215 0.26
216 0.27
217 0.27
218 0.28
219 0.22
220 0.22
221 0.21
222 0.16
223 0.15
224 0.13
225 0.12
226 0.11
227 0.1
228 0.12
229 0.11
230 0.13
231 0.14
232 0.12
233 0.14
234 0.19
235 0.25
236 0.28
237 0.34
238 0.36
239 0.36
240 0.36
241 0.34
242 0.29
243 0.24
244 0.19
245 0.16
246 0.13
247 0.16
248 0.16
249 0.17
250 0.18
251 0.23
252 0.23
253 0.24
254 0.31
255 0.27
256 0.34
257 0.37
258 0.38
259 0.37
260 0.37
261 0.34
262 0.28
263 0.3
264 0.23
265 0.2
266 0.19
267 0.17
268 0.2
269 0.21
270 0.27
271 0.27
272 0.31
273 0.36
274 0.42
275 0.45
276 0.5
277 0.57
278 0.59
279 0.65
280 0.72
281 0.75
282 0.78
283 0.82
284 0.85
285 0.87
286 0.85
287 0.86
288 0.86
289 0.89
290 0.86
291 0.81
292 0.74
293 0.66
294 0.58