Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A395SB88

Protein Details
Accession A0A395SB88    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
105-127DESEKWDKRLKKKAARRDNNAFAHydrophilic
215-234RAEEQRLKKRKERMAQNGDDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
112-120KRLKKKAAR
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 13, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013260  mRNA_splic_SYF2  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF08231  SYF2  
Amino Acid Sequences MAPGTPPKDLPVEKTDDTQQSAPDNASKAQDRMARFKALQARAKTSSEKNLQEATLESQRLATDPSQLTAIHRKHAIASHKLLKADVEESGGDFERKRAWDWTVDESEKWDKRLKKKAARRDNNAFADFTQEANKIYKRQLKNIDTNMEQYEKDKQALIEKAAASGGLDIVETEDGELIAVDKDGSFYSTADSTTFAQNKPDKAAVDRLVADLQRAEEQRLKKRKERMAQNGDDGDVTYINEKNKQFNQKLSRFYNQYTAEIRDSFERGTMI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.44
3 0.41
4 0.44
5 0.4
6 0.37
7 0.33
8 0.33
9 0.31
10 0.28
11 0.26
12 0.24
13 0.27
14 0.27
15 0.25
16 0.3
17 0.33
18 0.34
19 0.39
20 0.41
21 0.41
22 0.39
23 0.44
24 0.48
25 0.51
26 0.54
27 0.51
28 0.54
29 0.52
30 0.55
31 0.54
32 0.49
33 0.5
34 0.5
35 0.49
36 0.46
37 0.44
38 0.41
39 0.37
40 0.34
41 0.3
42 0.28
43 0.25
44 0.21
45 0.2
46 0.2
47 0.19
48 0.2
49 0.15
50 0.16
51 0.16
52 0.17
53 0.17
54 0.17
55 0.2
56 0.27
57 0.28
58 0.25
59 0.25
60 0.25
61 0.26
62 0.31
63 0.34
64 0.31
65 0.36
66 0.4
67 0.41
68 0.41
69 0.39
70 0.34
71 0.29
72 0.25
73 0.19
74 0.13
75 0.1
76 0.1
77 0.11
78 0.11
79 0.1
80 0.09
81 0.1
82 0.12
83 0.13
84 0.15
85 0.16
86 0.17
87 0.22
88 0.25
89 0.29
90 0.3
91 0.3
92 0.28
93 0.29
94 0.35
95 0.31
96 0.31
97 0.32
98 0.33
99 0.41
100 0.51
101 0.57
102 0.6
103 0.68
104 0.76
105 0.81
106 0.83
107 0.83
108 0.81
109 0.8
110 0.74
111 0.66
112 0.56
113 0.44
114 0.4
115 0.32
116 0.24
117 0.18
118 0.13
119 0.13
120 0.15
121 0.17
122 0.14
123 0.19
124 0.27
125 0.27
126 0.34
127 0.42
128 0.45
129 0.5
130 0.53
131 0.52
132 0.44
133 0.45
134 0.39
135 0.31
136 0.26
137 0.2
138 0.22
139 0.19
140 0.19
141 0.17
142 0.16
143 0.2
144 0.22
145 0.22
146 0.19
147 0.18
148 0.18
149 0.17
150 0.16
151 0.1
152 0.08
153 0.07
154 0.04
155 0.03
156 0.03
157 0.04
158 0.04
159 0.04
160 0.03
161 0.03
162 0.03
163 0.03
164 0.03
165 0.03
166 0.03
167 0.04
168 0.04
169 0.03
170 0.04
171 0.05
172 0.06
173 0.06
174 0.06
175 0.08
176 0.08
177 0.09
178 0.08
179 0.1
180 0.11
181 0.16
182 0.19
183 0.18
184 0.25
185 0.28
186 0.3
187 0.32
188 0.33
189 0.28
190 0.29
191 0.35
192 0.31
193 0.3
194 0.29
195 0.27
196 0.26
197 0.25
198 0.23
199 0.16
200 0.15
201 0.17
202 0.17
203 0.19
204 0.23
205 0.29
206 0.39
207 0.48
208 0.53
209 0.56
210 0.65
211 0.71
212 0.75
213 0.79
214 0.8
215 0.8
216 0.78
217 0.77
218 0.69
219 0.6
220 0.5
221 0.4
222 0.3
223 0.2
224 0.16
225 0.12
226 0.14
227 0.15
228 0.22
229 0.23
230 0.29
231 0.37
232 0.47
233 0.49
234 0.56
235 0.64
236 0.65
237 0.72
238 0.72
239 0.72
240 0.67
241 0.65
242 0.64
243 0.57
244 0.55
245 0.5
246 0.48
247 0.44
248 0.39
249 0.38
250 0.33
251 0.32
252 0.27