FuNGI

A0A395SSD2

Protein Details

Accession

A0A395SSD2

Localization Confidence

Low

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
457-483	RTQIQEKAERERRRRRKVKFTGDQAEA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
465-474	ERERRRRRKV

Subcellular Location(s)

mito 24.5, cyto_mito 13

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR024075 DNA-dir_RNA_pol_helix_hairp_sf IPR046950 DNA-dir_Rpol_C_phage-type IPR002092 DNA-dir_Rpol_phage-type IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR037159 RNA_POL_N_sf IPR029262 RPOL_N
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005739 C:mitochondrion GO:0003677 F:DNA binding GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF00940 RNA_pol PF14700 RPOL_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS00900 RNA_POL_PHAGE_1 PS00489 RNA_POL_PHAGE_2

Amino Acid Sequences

MLLRQSRKGISALRLLSRPSHIATTGRRQGRHLATAVDDFQFGNNYGSVHEQLARSGLQPFQAPPQPYTELRALDPATNILTLPEPEEARTYGKINNKGIPGDVEEMIPVFDACVRVGKLERAAMVLKRLGTTGLIPGEEMIILHNSYLRATLDQLRTSPDRKQAEMLHKWYELQIRNQNVPQTAETIACMLKASLLSERGARLERLVNRYMSMAPGESGLRVLSMADILSDQDLGVITEICPTYSFAADSEDTQYVTMAEDESPEMDEIDENTARYANEEYPEIRPTPQRGEGLNSLKKNLNLISELQNVDISKLSVEEQREFQTRLEKDSIDIAIAKWRNAKKNLDKMGINTALNSKHEETSLAACLQNWLTAMEARLQEEILKVEESEEAEHKSEEDLERCIYGPILRLGDPTRLAAVTILTLLNTSAIQGVDKGVIIQRLLNDVARVAQEDIRTQIQEKAERERRRRRKVKFTGDQAEAEAEAAEGKIIVDAQEPIDARDPALSVWSIHVRARVGSILIKSLIETAKVKVVKEHPISKEKISQLQPAFSHMHAPRKGRKVGMLFINADLVERLKREPMGDFLAKHLPMVAEPQPWRRINEGGFLSSKATLVRLKSGDVEQKLYTKAAIKRGDMDQVFKGLDVLGKTPWRINNNVLDVMVEAWNSGDAIANMPTLTPNLTTPPEPTNSDPLLRRAWIRAVKAVENERAALHSQRCYMNLQLEIARAFRKQVIYFPHNMDYRGRAYPLPTYLNHMGADHTRALLKFADGKELGEQGLRWLKIHFANLYGFDKASFSEREAFATENLHNIRESVENPLNGSRWWLKAEDPWQCLAACFELKAAHDLEDPTKYVSSLPVHQDGTCNGLQHYAALGGDTWGAQQVNLVPGDRPADVYMAVANLVKESIAKEAESGNQLGKNCLGKITRKVVKQTVMTNVYGVTFSGAKQQVCKQLDALYPNMMKETGIPNLVTATYIAKHIFAALGTMFRGAHDIQYWLGEIGARACRALTPAQIDQLAEDNKPSASMKKELDELTSQFRSTIVWTTPLRMPVVQPYRKASTREIRTCLQAITYPTQGRTEPVDRRKQLQGFPPNFIHSLDASHMLLSALKCNELGLNFAAVHDSFWTHAADVDVLNGVLREAFIRIHEEDVVGRLAAEFQARYKGAVYLASIPTESPAGNAIRDFRKKSKLSQKEELLLEHKRNTLLRSGNPWDLEAASKIVTPASIYEDLEPSEEDLEVDHDPENTGGGLGEVPKSEASLNSAVKEAVQEMDPEGTDTNELSAQLLERLKHTNFETQVINPKKEVKQVAKKVISFWRPLTFPKLPEKGDFNVASLRESQYFFS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.45
2	0.45
3	0.44
4	0.42
5	0.4
6	0.34
7	0.32
8	0.3
9	0.33
10	0.38
11	0.45
12	0.5
13	0.53
14	0.52
15	0.52
16	0.59
17	0.6
18	0.59
19	0.5
20	0.44
21	0.41
22	0.43
23	0.42
24	0.33
25	0.27
26	0.22
27	0.2
28	0.2
29	0.17
30	0.15
31	0.14
32	0.13
33	0.14
34	0.17
35	0.18
36	0.18
37	0.2
38	0.19
39	0.19
40	0.21
41	0.21
42	0.18
43	0.19
44	0.19
45	0.17
46	0.2
47	0.2
48	0.25
49	0.31
50	0.33
51	0.32
52	0.36
53	0.38
54	0.37
55	0.41
56	0.38
57	0.34
58	0.32
59	0.37
60	0.32
61	0.29
62	0.29
63	0.26
64	0.22
65	0.2
66	0.19
67	0.14
68	0.15
69	0.13
70	0.14
71	0.16
72	0.15
73	0.16
74	0.19
75	0.2
76	0.21
77	0.23
78	0.23
79	0.26
80	0.33
81	0.4
82	0.42
83	0.46
84	0.46
85	0.45
86	0.44
87	0.4
88	0.36
89	0.31
90	0.27
91	0.21
92	0.18
93	0.17
94	0.16
95	0.13
96	0.09
97	0.06
98	0.07
99	0.08
100	0.08
101	0.13
102	0.13
103	0.16
104	0.18
105	0.22
106	0.24
107	0.25
108	0.25
109	0.23
110	0.27
111	0.26
112	0.28
113	0.27
114	0.24
115	0.22
116	0.22
117	0.2
118	0.17
119	0.17
120	0.17
121	0.16
122	0.15
123	0.14
124	0.14
125	0.14
126	0.13
127	0.11
128	0.08
129	0.08
130	0.08
131	0.08
132	0.1
133	0.1
134	0.1
135	0.12
136	0.12
137	0.11
138	0.15
139	0.23
140	0.26
141	0.27
142	0.28
143	0.32
144	0.35
145	0.37
146	0.4
147	0.41
148	0.41
149	0.41
150	0.46
151	0.48
152	0.54
153	0.59
154	0.58
155	0.54
156	0.5
157	0.49
158	0.47
159	0.47
160	0.42
161	0.42
162	0.45
163	0.45
164	0.5
165	0.52
166	0.52
167	0.47
168	0.46
169	0.38
170	0.33
171	0.28
172	0.24
173	0.21
174	0.18
175	0.16
176	0.13
177	0.12
178	0.09
179	0.09
180	0.09
181	0.1
182	0.12
183	0.13
184	0.14
185	0.16
186	0.17
187	0.19
188	0.21
189	0.2
190	0.19
191	0.25
192	0.3
193	0.34
194	0.36
195	0.34
196	0.33
197	0.34
198	0.32
199	0.26
200	0.21
201	0.16
202	0.13
203	0.13
204	0.13
205	0.11
206	0.11
207	0.09
208	0.08
209	0.07
210	0.07
211	0.05
212	0.05
213	0.05
214	0.05
215	0.05
216	0.05
217	0.06
218	0.06
219	0.05
220	0.05
221	0.05
222	0.05
223	0.06
224	0.06
225	0.06
226	0.09
227	0.09
228	0.09
229	0.1
230	0.11
231	0.12
232	0.13
233	0.13
234	0.1
235	0.14
236	0.14
237	0.15
238	0.17
239	0.16
240	0.16
241	0.15
242	0.15
243	0.11
244	0.11
245	0.1
246	0.07
247	0.07
248	0.07
249	0.08
250	0.08
251	0.09
252	0.08
253	0.08
254	0.08
255	0.08
256	0.08
257	0.12
258	0.13
259	0.12
260	0.12
261	0.13
262	0.13
263	0.14
264	0.16
265	0.13
266	0.14
267	0.16
268	0.18
269	0.19
270	0.22
271	0.22
272	0.22
273	0.25
274	0.27
275	0.31
276	0.35
277	0.35
278	0.34
279	0.38
280	0.43
281	0.47
282	0.5
283	0.45
284	0.43
285	0.42
286	0.41
287	0.39
288	0.33
289	0.27
290	0.22
291	0.24
292	0.26
293	0.27
294	0.27
295	0.25
296	0.25
297	0.22
298	0.21
299	0.19
300	0.13
301	0.09
302	0.09
303	0.1
304	0.13
305	0.15
306	0.17
307	0.19
308	0.23
309	0.27
310	0.27
311	0.27
312	0.32
313	0.3
314	0.33
315	0.33
316	0.29
317	0.26
318	0.28
319	0.27
320	0.19
321	0.19
322	0.14
323	0.19
324	0.2
325	0.2
326	0.24
327	0.29
328	0.36
329	0.42
330	0.51
331	0.53
332	0.62
333	0.68
334	0.65
335	0.61
336	0.56
337	0.58
338	0.53
339	0.43
340	0.34
341	0.3
342	0.27
343	0.27
344	0.28
345	0.22
346	0.19
347	0.19
348	0.19
349	0.18
350	0.18
351	0.19
352	0.17
353	0.15
354	0.14
355	0.16
356	0.15
357	0.14
358	0.11
359	0.09
360	0.09
361	0.09
362	0.1
363	0.13
364	0.13
365	0.14
366	0.14
367	0.13
368	0.13
369	0.13
370	0.13
371	0.1
372	0.1
373	0.09
374	0.09
375	0.1
376	0.1
377	0.11
378	0.12
379	0.13
380	0.13
381	0.13
382	0.13
383	0.12
384	0.14
385	0.15
386	0.15
387	0.14
388	0.14
389	0.15
390	0.15
391	0.15
392	0.12
393	0.11
394	0.12
395	0.13
396	0.14
397	0.13
398	0.15
399	0.16
400	0.19
401	0.19
402	0.17
403	0.15
404	0.13
405	0.13
406	0.11
407	0.1
408	0.07
409	0.07
410	0.06
411	0.05
412	0.05
413	0.05
414	0.05
415	0.05
416	0.05
417	0.05
418	0.05
419	0.05
420	0.06
421	0.06
422	0.06
423	0.06
424	0.07
425	0.07
426	0.08
427	0.08
428	0.09
429	0.09
430	0.11
431	0.12
432	0.12
433	0.1
434	0.1
435	0.11
436	0.1
437	0.11
438	0.1
439	0.11
440	0.11
441	0.12
442	0.15
443	0.15
444	0.15
445	0.15
446	0.18
447	0.2
448	0.25
449	0.26
450	0.33
451	0.41
452	0.49
453	0.58
454	0.65
455	0.72
456	0.78
457	0.85
458	0.84
459	0.86
460	0.88
461	0.89
462	0.87
463	0.85
464	0.81
465	0.74
466	0.66
467	0.55
468	0.45
469	0.34
470	0.25
471	0.16
472	0.08
473	0.06
474	0.05
475	0.04
476	0.03
477	0.03
478	0.03
479	0.03
480	0.03
481	0.04
482	0.05
483	0.05
484	0.08
485	0.08
486	0.09
487	0.12
488	0.12
489	0.11
490	0.12
491	0.11
492	0.09
493	0.1
494	0.09
495	0.06
496	0.08
497	0.1
498	0.11
499	0.12
500	0.14
501	0.13
502	0.13
503	0.14
504	0.12
505	0.11
506	0.12
507	0.12
508	0.11
509	0.11
510	0.1
511	0.09
512	0.11
513	0.11
514	0.1
515	0.11
516	0.1
517	0.16
518	0.17
519	0.17
520	0.19
521	0.23
522	0.29
523	0.33
524	0.39
525	0.39
526	0.44
527	0.46
528	0.44
529	0.47
530	0.41
531	0.43
532	0.39
533	0.42
534	0.36
535	0.38
536	0.35
537	0.33
538	0.33
539	0.25
540	0.3
541	0.25
542	0.32
543	0.32
544	0.37
545	0.41
546	0.45
547	0.48
548	0.41
549	0.44
550	0.39
551	0.39
552	0.39
553	0.35
554	0.29
555	0.27
556	0.26
557	0.21
558	0.18
559	0.13
560	0.09
561	0.07
562	0.07
563	0.08
564	0.08
565	0.09
566	0.1
567	0.11
568	0.13
569	0.17
570	0.18
571	0.17
572	0.19
573	0.22
574	0.21
575	0.2
576	0.18
577	0.13
578	0.11
579	0.15
580	0.14
581	0.15
582	0.17
583	0.21
584	0.28
585	0.29
586	0.31
587	0.29
588	0.3
589	0.26
590	0.31
591	0.27
592	0.22
593	0.22
594	0.2
595	0.19
596	0.16
597	0.16
598	0.1
599	0.1
600	0.1
601	0.1
602	0.14
603	0.13
604	0.14
605	0.15
606	0.17
607	0.21
608	0.2
609	0.22
610	0.19
611	0.2
612	0.2
613	0.19
614	0.17
615	0.18
616	0.2
617	0.25
618	0.27
619	0.26
620	0.28
621	0.29
622	0.34
623	0.28
624	0.27
625	0.2
626	0.19
627	0.18
628	0.15
629	0.14
630	0.09
631	0.09
632	0.07
633	0.08
634	0.08
635	0.09
636	0.1
637	0.12
638	0.16
639	0.17
640	0.19
641	0.21
642	0.24
643	0.25
644	0.25
645	0.23
646	0.19
647	0.17
648	0.15
649	0.13
650	0.08
651	0.05
652	0.04
653	0.04
654	0.04
655	0.04
656	0.03
657	0.03
658	0.04
659	0.05
660	0.05
661	0.05
662	0.05
663	0.05
664	0.05
665	0.05
666	0.05
667	0.05
668	0.07
669	0.08
670	0.09
671	0.11
672	0.13
673	0.15
674	0.16
675	0.17
676	0.2
677	0.2
678	0.23
679	0.22
680	0.22
681	0.22
682	0.21
683	0.2
684	0.16
685	0.21
686	0.22
687	0.22
688	0.24
689	0.24
690	0.25
691	0.27
692	0.29
693	0.26
694	0.22
695	0.22
696	0.17
697	0.16
698	0.16
699	0.16
700	0.15
701	0.14
702	0.16
703	0.17
704	0.18
705	0.18
706	0.19
707	0.18
708	0.17
709	0.16
710	0.14
711	0.14
712	0.13
713	0.13
714	0.13
715	0.1
716	0.1
717	0.11
718	0.13
719	0.13
720	0.16
721	0.22
722	0.25
723	0.28
724	0.3
725	0.33
726	0.32
727	0.32
728	0.29
729	0.25
730	0.25
731	0.22
732	0.21
733	0.16
734	0.16
735	0.18
736	0.2
737	0.2
738	0.17
739	0.22
740	0.22
741	0.23
742	0.22
743	0.2
744	0.18
745	0.16
746	0.18
747	0.12
748	0.11
749	0.1
750	0.1
751	0.11
752	0.1
753	0.1
754	0.13
755	0.13
756	0.17
757	0.16
758	0.16
759	0.16
760	0.16
761	0.16
762	0.11
763	0.11
764	0.1
765	0.14
766	0.14
767	0.13
768	0.13
769	0.15
770	0.17
771	0.19
772	0.17
773	0.14
774	0.15
775	0.17
776	0.19
777	0.16
778	0.14
779	0.12
780	0.12
781	0.11
782	0.13
783	0.1
784	0.1
785	0.14
786	0.14
787	0.15
788	0.16
789	0.17
790	0.14
791	0.16
792	0.15
793	0.15
794	0.16
795	0.15
796	0.14
797	0.14
798	0.14
799	0.13
800	0.14
801	0.16
802	0.18
803	0.17
804	0.19
805	0.2
806	0.19
807	0.17
808	0.2
809	0.16
810	0.15
811	0.16
812	0.16
813	0.16
814	0.2
815	0.27
816	0.31
817	0.3
818	0.29
819	0.29
820	0.28
821	0.27
822	0.23
823	0.18
824	0.11
825	0.09
826	0.09
827	0.09
828	0.1
829	0.12
830	0.11
831	0.1
832	0.11
833	0.12
834	0.13
835	0.13
836	0.13
837	0.13
838	0.12
839	0.12
840	0.11
841	0.13
842	0.14
843	0.17
844	0.2
845	0.22
846	0.23
847	0.23
848	0.24
849	0.21
850	0.23
851	0.2
852	0.17
853	0.13
854	0.13
855	0.13
856	0.12
857	0.12
858	0.08
859	0.06
860	0.06
861	0.06
862	0.05
863	0.05
864	0.05
865	0.04
866	0.06
867	0.06
868	0.05
869	0.06
870	0.07
871	0.09
872	0.09
873	0.1
874	0.08
875	0.1
876	0.12
877	0.11
878	0.11
879	0.1
880	0.1
881	0.09
882	0.09
883	0.08
884	0.07
885	0.07
886	0.07
887	0.06
888	0.05
889	0.05
890	0.05
891	0.05
892	0.06
893	0.08
894	0.08
895	0.08
896	0.09
897	0.1
898	0.12
899	0.14
900	0.14
901	0.13
902	0.15
903	0.15
904	0.16
905	0.17
906	0.17
907	0.15
908	0.19
909	0.2
910	0.22
911	0.28
912	0.36
913	0.39
914	0.41
915	0.46
916	0.47
917	0.5
918	0.49
919	0.47
920	0.45
921	0.43
922	0.39
923	0.34
924	0.29
925	0.24
926	0.2
927	0.16
928	0.1
929	0.07
930	0.07
931	0.14
932	0.17
933	0.17
934	0.2
935	0.25
936	0.33
937	0.35
938	0.35
939	0.29
940	0.31
941	0.34
942	0.33
943	0.3
944	0.26
945	0.25
946	0.24
947	0.24
948	0.18
949	0.15
950	0.15
951	0.16
952	0.13
953	0.14
954	0.13
955	0.13
956	0.13
957	0.14
958	0.11
959	0.09
960	0.08
961	0.08
962	0.1
963	0.1
964	0.09
965	0.09
966	0.09
967	0.09
968	0.07
969	0.08
970	0.06
971	0.07
972	0.07
973	0.08
974	0.07
975	0.07
976	0.1
977	0.08
978	0.09
979	0.1
980	0.1
981	0.1
982	0.11
983	0.11
984	0.09
985	0.09
986	0.08
987	0.07
988	0.09
989	0.12
990	0.11
991	0.11
992	0.11
993	0.11
994	0.13
995	0.15
996	0.14
997	0.17
998	0.18
999	0.2
1000	0.21
1001	0.2
1002	0.18
1003	0.22
1004	0.21
1005	0.16
1006	0.15
1007	0.14
1008	0.13
1009	0.15
1010	0.15
1011	0.14
1012	0.16
1013	0.22
1014	0.23
1015	0.25
1016	0.29
1017	0.28
1018	0.31
1019	0.3
1020	0.28
1021	0.3
1022	0.29
1023	0.27
1024	0.23
1025	0.22
1026	0.19
1027	0.18
1028	0.2
1029	0.14
1030	0.19
1031	0.2
1032	0.24
1033	0.26
1034	0.28
1035	0.28
1036	0.24
1037	0.24
1038	0.28
1039	0.37
1040	0.38
1041	0.38
1042	0.41
1043	0.46
1044	0.5
1045	0.52
1046	0.5
1047	0.51
1048	0.56
1049	0.6
1050	0.59
1051	0.55
1052	0.55
1053	0.53
1054	0.45
1055	0.36
1056	0.3
1057	0.27
1058	0.26
1059	0.29
1060	0.27
1061	0.26
1062	0.28
1063	0.27
1064	0.26
1065	0.28
1066	0.31
1067	0.35
1068	0.43
1069	0.52
1070	0.52
1071	0.57
1072	0.63
1073	0.62
1074	0.61
1075	0.61
1076	0.63
1077	0.56
1078	0.59
1079	0.57
1080	0.51
1081	0.47
1082	0.42
1083	0.34
1084	0.24
1085	0.22
1086	0.18
1087	0.18
1088	0.15
1089	0.14
1090	0.14
1091	0.12
1092	0.14
1093	0.12
1094	0.16
1095	0.14
1096	0.14
1097	0.14
1098	0.14
1099	0.16
1100	0.13
1101	0.15
1102	0.11
1103	0.13
1104	0.12
1105	0.12
1106	0.13
1107	0.11
1108	0.12
1109	0.1
1110	0.1
1111	0.08
1112	0.1
1113	0.11
1114	0.09
1115	0.1
1116	0.1
1117	0.11
1118	0.1
1119	0.1
1120	0.09
1121	0.08
1122	0.08
1123	0.07
1124	0.06
1125	0.05
1126	0.05
1127	0.05
1128	0.06
1129	0.06
1130	0.07
1131	0.12
1132	0.13
1133	0.15
1134	0.15
1135	0.15
1136	0.15
1137	0.16
1138	0.16
1139	0.11
1140	0.1
1141	0.08
1142	0.09
1143	0.09
1144	0.1
1145	0.09
1146	0.1
1147	0.16
1148	0.16
1149	0.17
1150	0.17
1151	0.18
1152	0.17
1153	0.18
1154	0.19
1155	0.19
1156	0.2
1157	0.2
1158	0.19
1159	0.17
1160	0.17
1161	0.17
1162	0.15
1163	0.09
1164	0.12
1165	0.12
1166	0.13
1167	0.14
1168	0.19
1169	0.27
1170	0.33
1171	0.39
1172	0.42
1173	0.51
1174	0.53
1175	0.62
1176	0.68
1177	0.7
1178	0.72
1179	0.75
1180	0.75
1181	0.72
1182	0.71
1183	0.65
1184	0.6
1185	0.56
1186	0.52
1187	0.47
1188	0.42
1189	0.39
1190	0.39
1191	0.37
1192	0.39
1193	0.39
1194	0.38
1195	0.43
1196	0.46
1197	0.47
1198	0.46
1199	0.44
1200	0.38
1201	0.33
1202	0.3
1203	0.23
1204	0.19
1205	0.14
1206	0.14
1207	0.13
1208	0.12
1209	0.11
1210	0.1
1211	0.1
1212	0.14
1213	0.16
1214	0.16
1215	0.18
1216	0.19
1217	0.2
1218	0.2
1219	0.19
1220	0.15
1221	0.13
1222	0.12
1223	0.1
1224	0.09
1225	0.11
1226	0.11
1227	0.12
1228	0.11
1229	0.11
1230	0.11
1231	0.11
1232	0.12
1233	0.09
1234	0.08
1235	0.07
1236	0.07
1237	0.07
1238	0.08
1239	0.09
1240	0.09
1241	0.1
1242	0.1
1243	0.11
1244	0.12
1245	0.11
1246	0.15
1247	0.21
1248	0.22
1249	0.22
1250	0.23
1251	0.22
1252	0.21
1253	0.22
1254	0.18
1255	0.13
1256	0.12
1257	0.12
1258	0.12
1259	0.14
1260	0.14
1261	0.14
1262	0.14
1263	0.13
1264	0.13
1265	0.12
1266	0.12
1267	0.11
1268	0.11
1269	0.1
1270	0.11
1271	0.11
1272	0.15
1273	0.18
1274	0.17
1275	0.19
1276	0.25
1277	0.25
1278	0.3
1279	0.32
1280	0.35
1281	0.34
1282	0.37
1283	0.38
1284	0.36
1285	0.46
1286	0.48
1287	0.47
1288	0.42
1289	0.48
1290	0.48
1291	0.53
1292	0.58
1293	0.58
1294	0.62
1295	0.69
1296	0.77
1297	0.76
1298	0.73
1299	0.72
1300	0.73
1301	0.68
1302	0.63
1303	0.58
1304	0.54
1305	0.48
1306	0.51
1307	0.53
1308	0.49
1309	0.48
1310	0.53
1311	0.56
1312	0.52
1313	0.55
1314	0.56
1315	0.51
1316	0.54
1317	0.49
1318	0.41
1319	0.39
1320	0.37
1321	0.34
1322	0.31
1323	0.31
1324	0.26

A0A395SSD2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer